These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8171#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1563 fasta sequence [TTGTGTTGTTGACCGATACGTCAAGTGTGTAGTCGAGCGCTTCTATGCTTATCATCATCTTGATGAACTGTGTTCAATGCTCAAGAAATCAAATAGTAATAGTTTGAGCAGTAAAAGACATGATTCATCAGCTCAGTCGATCAATAGAGATAAAATATTGGATTCAAGCGAATTAGGATCGGATCGCGTATTAGTCATTGAGCCTATAATTGTTGAAACGCTCCAGATCATTACTTGTTCAGAACTTTATTTGAGATTTATACAGAGGCGAATTTCTGCTGATATTAAACAGTGCAATCTCGCAGAAGATGATTTTAAAAAGAAAAGCAATAAGGTCTCCAAATTTTTTGAAAATTCTCAACTTGTTTGTCAAGTACAAGATTTACTCAGC-AAATATCTTAATTTAGAACAATATTATCTCCGTGT-AACAATTATGAAGGCATTAAGTTCAGATGAAGTCGACAAATCTGGTAATGTATGGTGTTTTATTGACGATGTATTTTTCATCACCAAAAAAAGTCTTATTCGATCTCTTTCATCTGGTAATGTGGATACTATTTGTGCTATGGTGAATCATAGTTGTTCAATACTAATTGATCTTATGGTAAATGATTTTCTGGGCAACATTATTCGTACAGGGTTTCCTTCAGGTTGGGTGCAAGATGCATACAGTTATGTTCAGAATAGTGTTGCTGTGGCTGGTTCACTTAGTTCTTCTTCATCCATTGTCAATGTTCCAACAGTATCATCATTCAATATGATTGGACCTAATTCACTTGCAAGATATCATTTTCTAGTTACTCTTAATAGTATTGAAGCATCTCAGAAGAATTTACTGTCTCTTGTTAATCATCTTGAAAGTGAATTAAATTTACTTTATCAAAATCAAGAAATCAATTCACAGAAACTTGATATGTGTATCACGGAATTAAAAGTTTCTATCTCAGATCAACTTCAAGCATTACTTGATTCTGCCTTCGAGCATCTTTCAACTAGTGTTATTCAAAGTCAAGTAAAAACATTGTTAAATGTTTTCAAGTCATTGAAATATGATTTACTTGAGGAGGATTTAGATGTTTTCGCTGCTAATGATAGATGGATTGAATCATGTATAGCTCATACAGAGGATTTTCTCAGACCATTTAGGTCTGTCTTATCAACTGAGAATAACGATCGATTTGTATTGATTCTCATAAACGAAATTTTGCATCAACTTGATCAATTTATTCAAAGGAAATCATTCAGTAGATTTGGAGCTATTCAACTAGAGAAAGAATATCATAATTTGTTTGCCTATTTAACATCGATATCTTACAGTTCTTTGCGTGATTATTTCACGCGTAGTTTACAGATCTGTAGACTNTTAAATTGGNATCGAGTTGAAAGAAGTCATTATTTTTGGATAGTTCTAATTGGCGTCTACTGCACACAGGTCAGAGTATCTTCTCTAGACGTGATTCGCGTCAGAAAATCAGCCTTAACTACATGACTCATCTATCAGTATCTTTCTTCTTTTATNTCTGAATGAATGAACAAATGGGTTTTGTTTTTCTATTTACATAA] [+] EMBL CD196685 [TTGTGTTGTTGACCGATACGTCAAGTGTGTAGTCGAGCGCTTCTATGCTTATCATCATCTTGATGAACTGTGTTCAATGCTCAAGAAATCAAATAGTAATAGTTTGAGCAGTAAAAGACATGATTCATCAGCTCAGTCGATCAATAGAGATAAAATATTGGATTCAAGCGAATTAGGATCGGATCGCGTATTAGTCATTGAGCCTATAATTGTTGAAACGCTCCAGATCATTACTTGTTCAGAACTTTATTTGAGATTTATACAGAGGCGAATTTCTGCTGATATTAAACAGTGCAATCTCGCAGAAGATGATTTTAAAAAGAAAAGCAATAAGGTCTCCAAATTTTTTGAAAATTCTCAACTTGTTTGTCAAGTACAAGATTTACCCAGC AAATATCTTAATTTAGAACAATATTATCTCCGTGT AACAATTATGAAGG ] [+] EMBL CD184890 [ TGCTGATATCAAACAGTGCAATCTCGCAGAAGATGATTTTAAAAAGAAAAGCAATGAGATCTCCAAATTTTTTGAAAGTTCTCAACTTGTTTGTCAAGTACAAGATTTACTCAGT AAATACCTTAATTTAGAACAATATTATCTCCGTGT AACAATTATGAAGGCATTAAGTTCAGATGAAGTCGACAAATCTGGTAATGTATGGTGTTTTATTGACGATGTATTTTTCATCACCAAAAAAAGTCTTATTCGATCTCTTTCATCTGGTAATGTGGATACTATTTGTGCTATGGTGAATCATAGTTGTTCAATACTAATTGATCTTATGGTAAATGATTTTCTGGGCAACATTcgt ] [-] EMBL CD071327 [ aTTACTCAGCAAAATATCTTAATTTAGAACAATA TATCTCCGTGTNAACAATTATGAAGGCATTAAGTTCAGATGAAGTTGACAAATCTAATAATGTATGGTGTTTTATTGACGATGTATTTTTCATCACCAAAAAAAGTCTTATTCGATCTCTTCCATCTGGTAATGTGGATACTATTTGTGCTATGGTGAATCATAGTTGTTCAATACTAATTGATCTTATGGTAAATGATTTTCTGGGCAACATTATTCGTACAGGGTTTCCTTCAGGTTGGGTGCAAGATGCATACAGTTATGTTCAG ] [+] EMBL CD140734 [ ATACTAATTGATCTTATGGTAAATGATTTTCTGGGCAACATTATTCGTACAGGGTTTCCTTCAGGTTGGGTGCAAGATGCATACAGTTATGTTCAGAATAGTGTTGCTGTGGCTGGTTCACTTAGTTCTTCTTCATCCATTGTCAATGTTCCAACAGTATCATCATTCAATATGATTGGACCTAATTCACTTGCAAGATATCATTTTCTAGTTACTCTTAATAGTATTGAAGCATCTCAGAAGAATTTACTGTCTCTTGTTAATCATCTTGAAAGTGAATTAAATTTACTTTATCAAAATCAAGAAATCAATTCACAGAAACTTGATATGTGTATCACGGAATTAAAAGTTTCTATCTCAGATCAACTTCAAGCATTACTTGATTCTGCCTTCGAGCATCTTTCAACT ] [+] EMBL CD082444 [ GTTATGTTCAGAATAGTGTTGCTGTGGCTGGTTCACTTAGTTCTTCTTCATCCATTGTCAATGTTCCAACAGTATCATCATTCAATATGATTGGACCTAATTCACTTGCAAGATATCATTTTCTAGTTACTCTTAATAGTATTGAAGCATCTCAGAAGAATTTACTGTCTCTTGTTAATCATCTTGAAAGTGAATTAAATTTACTTTATCAAAATCAAGAAATCAATTCACAGAAACTTGATATGTGTATCACGGAATTAAAAGTTTCTATCTCAGATCAACTTCAAGCATTACTTGATTCTGCCTTCGAGCATCTTTCAACTAGTGTTATTCAAAGTCAAGTAAAAACATTGTTAAATGTTTTCAAGTCATTGAAATATGATTTACTTGAGGAGGATTTAGATGTTTTCGCTGCTAATGATAGATGGATTGAATCATGTATAGCTCATACAGAGGATTTTCTCAGACCATTTAGGTCTGTCTTATCAACTGAGAATAACGATCGATTTGTATTGATTCTCATAAACGAAATTTTGCATCAACTTGATCAATTTATTCAAAGGAAATCATTCAGTAGATTTGGAGCTATTCAACTAGAGAAAGAATATCATAATTTGTTTGCCTATTTAACATCGATATCTTACAGTTCTTTGCGTGATTATTTCACGCGTAGTTTACAGATCTGTAGACTNTTAAATTGGNATCGAGTTGAAAGAAGTCATTATTTTTGGATAGTTCTAATTGGCGTCTACTGCACACAGGTCAGAGTATCTTCTCTAGACGTGATTCGCGTCAGAAAATCAGCCTTAACTACATGACTCATCTATCAGTATCTTTCTTCTTTTATNTCTGAATGAATGAACAAATGGGTTTTGTTTTTCTATTTACATAA] [+] EMBL CD200270 [ ATCAATTCACAGAAACTTGATATGTGTATCACGGAATTAAAAGTTTCTATCTCAGATCAACTTCAAGCATTACTTGATTCTGCCTTCGAGCATCTTTCAACTAGTGTTATTCAAAGTCAAGTAAAAACATTGTTAAATGTTCTCAAGTCATTGAAATATGATTTACTTGAGGAGGATTTAGATGTTTTCGCTGCTAATGATAGATGGATTGAATCATGTATAGCTCATACAGAGGAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||