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Schistosoma mansoni
cluster # 8187 cluster # 8187       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8187#0 length = 977 sequences # 6  
consensusID : consensus_8187#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 977
fasta sequence 
                              [CTCCAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGATTTACTGTAAACCAAAATCGATGTCATACAATTTGATGGAAATGATAGTATGTACATCTCATTTAGTTTGATTAATCTCAGGTAAATTCCACTATAACATAAGCGTTAAAATTTGTGCTTAATTTGAACTTTGATTAATATACTAAAGGTCACAAGTATAAGTGACATAATGATAAAATAATAGAATAACTCATCTATTCAAAAGTCAGAATGAATCACATGGACATGTAACAATATTAACGATAAAACACGACTTCCACTGATTTAA--CTCTGTCAGTTGCTTGTCGATAATGCTAATGTGTTGTGTAGTGATCTATTCTAATGCATTCATCCTTCGTTNTACCGCCTAGTCTTATTATTCTCGTGATCGATTCTCAGTANAAAGAANAAAAACATTCAAAGTTTGATTCGATGCATAAGTATTTAACACTTGGTGTTTGTGATTCCAAAATTCCATAAAAATCTGCCCACTTATCATTCTAGAAGTACTAGGTTGTATTTTTTTCAATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGATGATGATTGCTTGCTTAATTATAGTGCAATATATTGTAGAATGCCGATTTCTTTGTTTGTTTTAAGTGATTTTTATAATAGAAGAATGAGACACACTATGACACAACTAGTGATTTGTCATTTCAATTGATTTTTAAACATTTTGATGCATTTGTTTTATTCTGTCTATTGGATCAGATCAAAATTTATCCAACTGGTGAGCAGATTAAGAAGTTGGTCACTTTCAATAAAGATCCTGTGAAAATTATGTGTTGCCTGCAAAGTGGTCAAATTGATTTCTATACAATAAAACTGTAGTACTTGTCTTTCAATTATCCCTGTAACCATTATCTGGGATGATGTATTTGATAGTTTTTATCTTCAATTCTCTTGTTTTGTTTCATGTTGTTAATTTAACCGATGAATAAAATAAACTCTTTTA]

[+] EMBL CD080208             [CTCCAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGATTTACTGTAAACCAAAATCGATGTCATACAATTTGATGGAAATGATAGTATGTACATCTCATTTAGTTTGATTAATCTCAGGTAAATTCCACTATAACATAAGCGTTAAAATTTGTGCTTAATTTGAACTTTGATTAATATACTAAAGGTCACAAGTATAAGTGACATAATGATAAAATAATAGAATAACTCATCTATTCAAAAGTCAGAATGAATCACATGGACATGTAACAATATTAACGATAAAACACGACTTCCACTGATTTAA  CTCTGTCAGTTGCTTGTCGATAATGCTAATGTGTTGTGTAGTGATCTATTCTAATGCATTCATCCTTCGTTNTACCGCCTAGTCTTATTATTCTCGTGATCGATTCTCAGTANAAAGAANAAAAACATTCANAGTTTGATTCGATGCATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD191409             [                                                                                                                                                                                                                                                 ATCACATAGACATGTAACAGTATTAACGATAAAACACGACTTCCACTGATTTAACTCTCTGTCAGTTGCTTGTCGATAATGCTAATGTGTTGTGTAGTGATCTATTCTAATGCATTCATCCTTCGTTTTACCGCCTAGTCTCATTATTCTCGTGATCGATTCTCAGTGAAAAGAA AAAAACATTCAAAGTTTGATTCGATGCATAAGTATTTAACACTTGGTGTTTGTGATTCCAAAATTCCATAAAAATCTGCCCACTTATCATTCTAGAAGTACTAGGTTGTATTTTTTTCAATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGATGATGATTGCTTGCTTAATTATAGTGCAATATATTGTAGAATGCCGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD140641             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAAAAAAAACATTCAAAGTTTGATTCGATGCATAAGTATTTAACACTTGGTGTTTGTGATTCCAAAATTCCATGAAAATCTGCCCACTTATCATTCTAGAAGTACTAGGTTGTATTTTTTTCAATATGTGTGTGTGTGTGTGCGATGATGATTGCTTGCTTAATTATAGTGCAATATATTGTAGAATGCCGATTTCTTTGTTTGTTTTAAGTGATTTTTATAATAGAAGAATGAGACACACTATGACACAACTAGTGATTTGTCATTTCAATTGATTTTTAAACATTTTGATGCATTTGTTTTATTCTGTCTATTGGATCAGATCAAAATTTATCCAACTGGTGAGCAGATTAAGAAGTTGGTCACTTTCAATAAAGATCCTGTGAAA                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD135951             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAAGTACTAGGTTGTATTTCTTTCAATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGATGATGATTGCTTGCTTAATTATAGTGCAATATATTGTAGAATGCCGATTTCTTTGTTTGTTTTAAGTGATTTTTATAATAGAAGAATGAGACACACTATGACACAACTAGTGATTTGTCATTTCAATTGATTTTTAAACATTTTGATGTATTTGTTTTATTCTGTCTATTGGATCAGATCAAAATTTATCCAACTGGTGAGCAGATTAAGAAGTTGGTCACTTTCAATAAGGATCCTGTGAAAATTATGTGT                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD076437             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATTGGATCAAATCAAAATTTATCCAACTGGGGAGCAAATTAAAAAGTTGGTCACTTTCAATAAAAATCCTGTGAAAATTATGTGTTGCCTGCAAAGTGGTCAAATTGATTTCTATACAATAAAACTGTAGTACTTGTCTTTCAATTATCCCTGTAACCATTATCTGGGATGATGTATTTGATAGTTTTTATCTTCAATTCTCTTGTTTTGTTTCATGTTGTTAATTTAACCGATGAATAAAATAAACTCTTTT ]
[-] EMBL CD082851             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTGGATCAGATCAAAATTTATCCAACTGGTGAGCAGATTAAGAAGTTGGTCACTTTCAATAAAGATCCTGTGAAAATTATGTGTTGCCTGCAGAGTGGTCAGATTGATTTCTATACAATAGAACTGTAGTACTTGTCTTTCAATTATCCCTGTAACCATTATCTGTGATGATGTATTTGATAGTTTTTATCTTCAATTCTCTTGTTTTGTTTCATGTTGTTAATTTAACCGATGAATAAAATAAACTCTTTTA]




>consensus_8187#0
CTCCAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGATTTACTGTAAACCAAAATCGATGTCATACAATT
TGATGGAAATGATAGTATGTACATCTCATTTAGTTTGATTAATCTCAGGTAAATTCCACT
ATAACATAAGCGTTAAAATTTGTGCTTAATTTGAACTTTGATTAATATACTAAAGGTCAC
AAGTATAAGTGACATAATGATAAAATAATAGAATAACTCATCTATTCAAAAGTCAGAATG
AATCACATGGACATGTAACAATATTAACGATAAAACACGACTTCCACTGATTTAACTCTG
TCAGTTGCTTGTCGATAATGCTAATGTGTTGTGTAGTGATCTATTCTAATGCATTCATCC
TTCGTTNTACCGCCTAGTCTTATTATTCTCGTGATCGATTCTCAGTANAAAGAANAAAAA
CATTCAAAGTTTGATTCGATGCATAAGTATTTAACACTTGGTGTTTGTGATTCCAAAATT
CCATAAAAATCTGCCCACTTATCATTCTAGAAGTACTAGGTTGTATTTTTTTCAATGTGT
GTGTGTGTGTGTGCGATGATGATTGCTTGCTTAATTATAGTGCAATATATTGTAGAATGC
CGATTTCTTTGTTTGTTTTAAGTGATTTTTATAATAGAAGAATGAGACACACTATGACAC
AACTAGTGATTTGTCATTTCAATTGATTTTTAAACATTTTGATGCATTTGTTTTATTCTG
TCTATTGGATCAGATCAAAATTTATCCAACTGGTGAGCAGATTAAGAAGTTGGTCACTTT
CAATAAAGATCCTGTGAAAATTATGTGTTGCCTGCAAAGTGGTCAAATTGATTTCTATAC
AATAAAACTGTAGTACTTGTCTTTCAATTATCCCTGTAACCATTATCTGGGATGATGTAT
TTGATAGTTTTTATCTTCAATTCTCTTGTTTTGTTTCATGTTGTTAATTTAACCGATGAA
TAAAATAAACTCTTTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)