These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8207#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 885 fasta sequence [CTTCATCGTCTGCACGAGCGATGGGATTATCATCCGCACCTGTTAGATTGTTGTTAGATGCAG-CACCAGAACAAGA-ATGCA-CACTCGACTGTAGTTCTCATGGTGTATGTGAATATATGGATGGTTATGATCAGCCTGTATGCCGATGCTTTTCTGGTTGGACAGGTTCCGATTGTAATACAAAACGATGCGATACTCGTTGTTTTATAAATGGATATTGTACTAATGGTACATGTATTTGCAAAGTCGGTTGGAATGGAAAGTACTGTACATTAGATGGTTGCCCAGATCATTGTAATGGACACGGTCAATGCACCATGTATCCATTGTCTAGTTCTTATTATTGTCAATGTTCTCCTGGTTGGTCAGGTAGTGCGTGTCAACGACAAATCGAAACAATATGTGATGATGGAATAGATAATGATCATGATGGTCTTGTTGATTGTTTAGATCCCGATTGCTGTACATCGACACATTGTGATCGACTCATTAAACTTGGTCCAAATGCTGGTGGCGTAGCTGCTGATAACGCTCAACAAAGTTGTGCACACAGTGAATCATTTGATTGTTATTTATTAATTACACCGATTGCACCATTGGACAGTGCATTTTATGTCAATTAGAATTCCTTCTAAGACGTGAACGTATTGTTGTAGAGAACTTCGATCCCAGACGTATTTCCGTTGTTCGTGGTGTAATTCGTCAATGGGACGGAACTGTATTTTGGGGTTGTCGTGTATCCGATAGAGCTAATATGCAAAATGGATATACACTAACTGATAAAAGTGGAAGATTTGACCTACCAGTTGATGGGGGAACAATTGTTCAGTTAGAATTCCTACGGTATCCTACTGATCAATTTTCAGCCGTACATAATTTATATGT] [+] EMBL CD152516 [CTTCATCGTCTGCACGAGCGATGGGATTATCATCCGCACCTGTTATATTGTTGTTAGATGCAGCCACCAGAACAAGACATGCACCACTCGACTGTAGTTCTCATGGGGTATGTGAATATATGGATGGTTATAATCAGCCTGTATGCCGATGCTTTTCTGGTTGGACAGGTTCCGATTGTAATACAAAACGATGCGATACTCGTTGTTTTATAAATGGATATTGTACTAATGGTACATGTATTTGCAAAGTCGGTTGGAATGGAAAGTACTGTACATTAGATGGCTGCCCATATCATTGT ] [+] EMBL CD163026 [ GATTATCATCCGCACCTGTTAGATTGTTGTTAGATGCAG CACCAGAACAAGA ATGCA CACTCGACTGTAGTTCTCATGGTGTATGTGAATATATGGATGGTTATGATCAGCCTGTATGCCGATGCTTTTCTGGTTGGACAGGTTCCGATTGTAATACAAAACGATGCGATACTCGTTGTTTTATAAATGGATATTGTACTAATGGTACATGTATTTGCAAAGTCGGTTGGAATGGAAAGTACTGTACATTAGATGGTTGCCCAGATCATTGTAATGGACACGGTCAATGCACCATGTATCCATTGTCTAGTTCTTATTATTGTCAATGTTCTCCTGGTTGGTCAGGTAGTGCGTGTCAACGACAAATCGAAACAATATGTGATGATGGAATAGATAATGATCATGATGGTCTTGTTGATTGTTTAAATCCCGATTGCTGTACATCGACACATTGTGATCGACTCATTAAACTT ] [+] EMBL CD118097 [ GATTATCATCCGCACCTGTTAGATTGTTGTTAGATGCAG CACCAGAACAAGA ATGCA CACTCGACTGTAGTTCTCATGGTGTATGTGAATATATGGATGGTTATGATCAGCCTGTATGCCGATGCTTTTCTGGTTGGACAGGTTCCGATTGTAATACAAAACGATGCGATACTCGTTGTTTTATAAATGGATATTGTGCTAATGGTACATGTATTTGCAAAGTCGGTTGGAATGGAAAGTACTGTACATTAGATGGTTGCCCAGATCATTGTAATGGACACGGTCAATGCACCATGTATCCATTGTCTAGTTCTTATTATTGTCAATGTTCTCCTGGTTGGTCAGGTAATGCGTGTC ] [+] EMBL CD202234 [ TAGATGCAG CACCAGAACAAGA ATGCA CACTCGACTGTAGTTCTCATGGTGTATGTGAATATATGGATGGTTATGATCAGCCTGTATGCCGATGCTTTTCTGGTTGGACAGGTTCCGATTGTAATACAAAACGATGCGATACTCGTTGTTTTATAAATGGATATTGTACTAATGGTACATGTATTTGCAAAGTCGGTTGGAATGGAAAGTACTGTACATTAGATGGTTGCCCAGATCATTGTAATGGACACGGTCAATGCACCATGTATCCATTGTCTAGTTCTTATTATTGTCAATGTTCTCCTGGTTGGTCAGGTAGTGCGTGTCAACGACAAATCGAAACAATATGTGATGATGGAATAGATAATGATCATGATGATCTTGTTGATTGTTTAGATCCCGATTGCTGTACATCGACACATTGTGATCGACTCATTAAACTTGGTCCAAATGCTGGTGGCGTAGCTGCTGATAACGCTCAA ] [+] EMBL CD197768 [ GTTGATTGTTTAGATCCCGATTGCTGTACATCGACACATTGTGATCGACTCATTAAACTTGGTCCAAATGCTGGTGGCGTAGCCGCTGATAACGCTCAACAAAGTTGTGCACACAGTGAATCATTTGATTGTTATTTATTAATTACACCGATTGCACCATTGGACAGTGCATTTTATGTCAATTAGAATTCCTTCTAAGACGTGAACGTATTGTTGTAGAGAACTTCGATCCCAGACGTATTTCCGTTGTTCGTGGTGTAATTCGTCAATGGGACGGAACTGTATTTTGGGGTTGTCGTGTATCCGATAGAGCTAATATGCAAAATGGATATACACTAACTGATAAAAGTGGAAGATTTGACCTACCAGTTGATGGGGGAACAATTGTTCAGTTAGAATTCCTACGGTATCCTACTGATCAATTTTCAGCCGTACAT ] [-] EMBL CD152482 [ ATCCGATAGAGCTAATATGCAAAATGGATATACACTAACTGATAAAAGTGGAAGATTTGACTTACCAGTTGATGGGGGAACAATTGTTCAGTTAGAATTCATACGGTATCCTACTGATCAATCTTCAGCCGTACATAATTTATATGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||