These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8209#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 778 fasta sequence [ATATGGGATCATGTCGTCACATTGATGACGAAATATATAGCTATTGTACAATCGAATACTGCTTTTAAACATACATTTGATCGTCTTAAAGTTGAATTTCAAACATGGTTACGTTTAGTCAATACTGAAAGTCCAAATAATAATGATTATCAGAGTTGTACTGGTCATTGCAATGAATTACGTTCAACATTTTATAATAATGTATCTATACGACCAGATACATTTATGCCTGAAATCAATTTTGCTATAGCATTGAAATTTCTAACTACTGATCGTAATCAAACTGCTGAAAGTGTACAAGCTCAGTTAAATCATGGTAAAGAATTATCTAATAGTCAACTTG-AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAATTGATAAGATCTCTATATTCATAACAAGATCTATTTCACCGAAAGTTTCTTCCACCTCCAGTCTCTTCTTAACATTGAATCTATTTTTTTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGGTGGATACCTCTATACTGAAGGTTGTCGTTATGTAAATCCTGAACAGAATGTAATCAATA] [+] EMBL CD140771 [ATATGGGATCATGTCGTCACATTGATGACGAAATATATAGCTATTGTACAATCGAATACTGCTTTTAAACATACATTTGATCGTCTTAAAGTTGAATTTCAAACATGGTTACGTTTAGTCAATACTGAAAGTCCAAATAATAATGATTATCAGAGTTGTACTGGTCATTGCAATGAATTACGTTCAACATTTTATAATAATGTATCTATACGACCAGATACATTTATGCCTGAAATCAATTTTGCTATAGCATTGAAATTTCTAACTACTGATCGTAATCAAACTGCTGAAAGTGTACAAGCTCAGTTAAATCATGGTAAAGAATTATCTAATAGTCAACTTG AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAA ] [+] EMBL CD140871 [ TTGATGACGAAATATATAGCTATTGTACAATCGAATACTGCTTTTAAACATACATTTGATCGTCTTAAAGTTGAATTTCAAACATGGTTACGTTTAGTCAATACTGAAAGTCCAAATAATAATGATTATCAGAGTCGTACTGGTCATTGCAATGAATTACGTTCAACATTTTATAATAATGTATCTATACGACCAGATACATTTATGCCTGAAATCAACTTTGCTATAGCATTGAAATTTCTAACTACTGATCGTAATCAAACTGCTGAAAGTGTACAAGCTCAGTTAAATCATGGTAAAGAATTATCTAATAGTCAACTTG AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAA ] [+] EMBL CD094972 [ GTCTTAAAGTTGAATTTCAAACATGGTTACGTTTAGTCAATACTGAAAGTCCAAATAATAATGATTAACAGAGTTGTACTGGTCATTGCAATGAATTACGTTCAACATTTTATAATAATGTATCTATACGACCAGATACATTTATGCCTGAAATCAATTTTGCTATAGCATTGAAATTTCTAACTACTGATCGTAATCAAACTGCTGAAAGTGTACAAGCTCAGTTAAAACATGGTAAAGAATTATCTAATAGTCAACTTG AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAATTGATAAGATCTCTATATTCATAACAAGATCTATTTCACCGAAAGTTTCTTCCACCTCCAGTCTCTTCTTAACATTGAATCTATTTTTTTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGATGGATACCTCTATACTG ] [-] EMBL CD197406 [ ATTATCTAATAGTCAACTTG AAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATTAATATCCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAATTGATAAGATCTCTATATTCATAACAAGATCTATTTCACCGAAAGTTTCTTCCACCTCCAGTCTCTTCTTAACATTGAATCTATTTTTTTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGGTGGATACCTCTATACTGAAGGTTGTCGTTATGTAAATCCTGAACAGAATGTAATCAATA] [-] EMBL CD197513 [ CTAATAGTCAACTTGAAAAAAACTAAAACTTTAATGGCCGAAAAGATANATATGCCTGAATCTATACGTAATATGACAAATAAACAATGGGATCAATTAGAACCTCAATTGACTAAAGCTATTGAAGAAATTGATAAGATCTCTATATTCATAACAAGATCTATTTCACCGAAAGTTTCTTCCACCTCCAGTCTCTTCTTAACATTGAATCTATTTTTTTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGGTGGATACCTCTATACTGAAGGTTGTCGTTATGTAAATCCTGAACAGAATGTAATCAATA] [-] EMBL CD197470 [ TTGGTTCTCTATTCTATTGATCACTATTGGTTTAATGTGGTTAATTATACGATATCATTTTGTACCGACAGAAATTAGTCTACATACTCGTAATCGTATTCGCCTTGGTGCTAGTATTGGATTTTGTATTCTTGCATTTAGTATTATTTTAGCTTGTTTATTCTATTTAATTGGTGGATACCTCTATACTGAAGGTTGTCGTTATGTAAATCCTGAACAGAATGTAATCAATA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||