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Schistosoma mansoni
cluster # 8223 cluster # 8223       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8223#0 length = 927 sequences # 6  
consensusID : consensus_8223#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 927
fasta sequence 
                              [CATGAATAAAGGAACAAAAACAGAACAGACAATAAACATTCACACATACAAAAAAAGAGAAAAATATATAAATAAACAAAATTAAGCTGAATAACATAAGTAATATGTTACTTAATGGCCTAAACACAAATACAAATGGTTGTTTTTATTGTTGTTGATGGTGGTGGTATTTTCGTAACTACCACCATGAAAATAAACAAAAAAATCATTAAAACAAAACACATAATATCCAAGAATATAAAACATTCAACAATAGTGACTGAATTGAGAAATAGTGATCATACAAAAACAACCATGAAATATGTAAATGGTTTATTACTCAAATGGATATTTTGTGTGTTTAGTTTGGACAAGGTTATTTGGATTTGTACATGGCGATAACAGTTAAATGGTTATGATGATAAGAGAGAAACAGCTGATTTACTTTACGTTTTTTTTATTACCTTCAGAAAGAGAGTTACTACATCTCTAGCTGATTGTCAATAGATTGATATTGATAGAATTATAATGTTCGAATAGAGATAACTTACTGAATGACAGCAAACATACTAGTAATGCTAGTAGTAGTGAAATTCAAAGAGAAAAGGATATTAACAACGAATTACAGATGTATATATGGTATACAAAGAACATCAACGTAAAGGTGATGTGGTCGGTGCACAATTAGTCATGGGTAATGCACCAACTGTGACAGCAAATTTATTATTCACTTCTGATGATGGATCATTTAAACTAGGATTGGGTAAACTATCTGATGGTAAAATATTTGTAGGATTATTATTGGAACATTGAGTTGTTGTTGCTGTAGTGGTGGTTGGCATTGTTGTATCAGGTTGATAATGCATTGTTTGTAGATTCGGTTTAGTAGCAGTCGACCATAAACAAGCATAACGTTCTCTTAATAACCGCATACAATCAGATAGTAAT]

[+] EMBL CD196714             [CATGAATAAAGGAACAAAAACAGAACAGACAATAAACATTCACACATACAAAAAAAGAGAAAAATATATAAATAAACAAAATTAAGCTGAATAACATAAGTAATATGTTACTTAATGGCCTAAACACAAATACAAATGGTTGTTTTTATTGTTGTTGATGGTGGTGGTATTTTCGTAACTACCACCATGAAAATAAACAAAAAAATCATTAAAACAAAACACATAATATCCAAGAATATAAAACATTCAACAATAGTGACTGAATTGAGAAATAGTGATCATACAAAAACAACCATGAAATATGTAAATGGTTTATTACTCAAATGGATATTTTGTGTGTTTAGTTTGGACAAGGTTATTTGGATTTGTACATGGCGATAACAGTTAAATGGTTATGATGATAAGAGAGAAACAGCTGATTTACTTTACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD196590             [                                                                     tAATAAACAAAATTAAGCTGAATAACATAAGTAATATGTTACTTAATGGCCTAAACACAAATACAAATGGTTGTTTTTATTGTTGTTGTTGGTGGTGGTATTTTCGTAACTATCACCATGAAAATAAACAAAAAAATCATTAAAACAAAACACATAATATCCAAGAATATAAAACATTCAACAATAGTGACTGAATTGAGAAATAGTGATCATACAAAAACAACCATGAAATATGTAAATGGTTTATTACTCAAATGGATATTTTTTGTGTTTAGTTTGGACAAGGTTATTTGGATTTGTACATGGCGATAACAGTTAAATGGTTATGATGATAAGAGAGAAACAGCTGATTTACTTTACGTTTTTTTTATTACCTTCAGAAAGAGAGTTACTACATCTCTAGCTGATTGTCAATAGATTGATATTGATAGAATTATAATGTTCGAATAGAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD197240             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cgGCTGATTTACTTTACGTTTTTTTTATTACCTTCAGAAAGAGAGTTACTACATCTCTAGCTGATTGTCAATAGATTGATATTGATAGAATTATAATGTTCGAATAGAGATAACTTACTGAATGACAGCAAACATACTAGTAATGCTAGAAGTAGTGAAATTCAAAGAGAAAAGGATATTAACAACGAATTACAGATGTATATATGGTATACAAAGAACATCAACGTAAAGGTGATGTGGTCGGTGCACAATTAGTCATGGGTAATGCACCAACTGTGACAGCAAATTTATTATTCACTTCTGATGATGGATCATTTAAACTAGGATTGGGTTAACTATCTGATGGTAAAATATTTGTAGGATTATTATTGGAACATTGAGTTGTTGTTGCTGTAGTGGTGG                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD196600             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGTCAATAGATTGATATTGATAGAATTATAATGTTCGAATAGAGATAACTTACTGAATGACAGCAAACATACTAGCAATGCTAGTAGTAGTGAAATTCAAAGAGAAAAGGATATTAACAACGAATTACAGATGTATATATGGTATACAAAGAACATCAACGTAAAGGTGATGTGGTCGGTGCACAATTAGTCATGGGTAATGCACCAACTGTGACAGCAAATTTATTATTCACTTCTGATGATGGATCATTTAAACTAGGATTGGGTAAACTATCTGATGGTAAAATATTTGTAGGATTATTATTGGAACATTGAGTTGTTGTTGCTGTAGTGGTGGTTGGCATTGTTGTATCAGGTTGATAATGCATTGTTTGTAGATTCGGTTTAGTAGCAGTCGACCATAAACAAGCATAACGTTCTCTTAATAACCGCATACAATCAGATAGTAAT]
[-] EMBL CD196666             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GAATTATAATGTTCGAATAGAGATAACTTACTGAATGACAGCAAACATACTAGTAATGCTAGTAGTAGTGAAATTCAAAGAGAAAAGGATATTAACAACGAATTACAGATGTATATATGGTATACAAAGAACATCAACGTAAAGGTGATGTGGTCGGTGCACAATTAGTCATGGGTAATGCACCAACTGTGACAGCAAATTTATTATTCACTTCTGATGATGGATCATTTAAACTAGGATTGGGTAAACTATCTGATGGTAAAATATTTGTAGGATTATTATTGGAACATTGAGTTGTTGTTGCTGTAGTGGTGGTTGGCATTGTTGTATCAGGTTGATAATGCATTGTTTGTAGATCCGGTTTAGTAGCAGTCGACCATAAACAAGCACAACGTTCTCTTAATAACCGCATACAATCAGATAGTAA ]
[-] EMBL CD196556             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGCAAACATACTAGTAATGCTAGTAGTAGTGAAATTCAAAGAGAAAAGGATGTTAACAACGAATTACAGATGTATATATGGTATACAAAGAACATCAACGTAAAGGTGATGTGGTCGGTGCACAATTAGTCATGGGTAATGCACCAACTGTGACAGCAAATTTATTATTCACTTCTGATGATGGATCATTTAAACTAGGATTGGGTAAACTATCTGATGGTAAAATATTTGTAGGATTATTATTGGAACATTGAGTTGTTGTTGCTGTAGTGGTGGTTGGCATTGTTGTATCAGGTTGATAATGCATTGTTTGTAGATTCGGTTTAGTAGCAGTCGACCATAAACAAGCATAACGTTCTCTTAATAACCGCATACAATCAGATAGTAA ]




>consensus_8223#0
CATGAATAAAGGAACAAAAACAGAACAGACAATAAACATTCACACATACAAAAAAAGAGA
AAAATATATAAATAAACAAAATTAAGCTGAATAACATAAGTAATATGTTACTTAATGGCC
TAAACACAAATACAAATGGTTGTTTTTATTGTTGTTGATGGTGGTGGTATTTTCGTAACT
ACCACCATGAAAATAAACAAAAAAATCATTAAAACAAAACACATAATATCCAAGAATATA
AAACATTCAACAATAGTGACTGAATTGAGAAATAGTGATCATACAAAAACAACCATGAAA
TATGTAAATGGTTTATTACTCAAATGGATATTTTGTGTGTTTAGTTTGGACAAGGTTATT
TGGATTTGTACATGGCGATAACAGTTAAATGGTTATGATGATAAGAGAGAAACAGCTGAT
TTACTTTACGTTTTTTTTATTACCTTCAGAAAGAGAGTTACTACATCTCTAGCTGATTGT
CAATAGATTGATATTGATAGAATTATAATGTTCGAATAGAGATAACTTACTGAATGACAG
CAAACATACTAGTAATGCTAGTAGTAGTGAAATTCAAAGAGAAAAGGATATTAACAACGA
ATTACAGATGTATATATGGTATACAAAGAACATCAACGTAAAGGTGATGTGGTCGGTGCA
CAATTAGTCATGGGTAATGCACCAACTGTGACAGCAAATTTATTATTCACTTCTGATGAT
GGATCATTTAAACTAGGATTGGGTAAACTATCTGATGGTAAAATATTTGTAGGATTATTA
TTGGAACATTGAGTTGTTGTTGCTGTAGTGGTGGTTGGCATTGTTGTATCAGGTTGATAA
TGCATTGTTTGTAGATTCGGTTTAGTAGCAGTCGACCATAAACAAGCATAACGTTCTCTT
AATAACCGCATACAATCAGATAGTAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)