These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8223#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 927 fasta sequence [CATGAATAAAGGAACAAAAACAGAACAGACAATAAACATTCACACATACAAAAAAAGAGAAAAATATATAAATAAACAAAATTAAGCTGAATAACATAAGTAATATGTTACTTAATGGCCTAAACACAAATACAAATGGTTGTTTTTATTGTTGTTGATGGTGGTGGTATTTTCGTAACTACCACCATGAAAATAAACAAAAAAATCATTAAAACAAAACACATAATATCCAAGAATATAAAACATTCAACAATAGTGACTGAATTGAGAAATAGTGATCATACAAAAACAACCATGAAATATGTAAATGGTTTATTACTCAAATGGATATTTTGTGTGTTTAGTTTGGACAAGGTTATTTGGATTTGTACATGGCGATAACAGTTAAATGGTTATGATGATAAGAGAGAAACAGCTGATTTACTTTACGTTTTTTTTATTACCTTCAGAAAGAGAGTTACTACATCTCTAGCTGATTGTCAATAGATTGATATTGATAGAATTATAATGTTCGAATAGAGATAACTTACTGAATGACAGCAAACATACTAGTAATGCTAGTAGTAGTGAAATTCAAAGAGAAAAGGATATTAACAACGAATTACAGATGTATATATGGTATACAAAGAACATCAACGTAAAGGTGATGTGGTCGGTGCACAATTAGTCATGGGTAATGCACCAACTGTGACAGCAAATTTATTATTCACTTCTGATGATGGATCATTTAAACTAGGATTGGGTAAACTATCTGATGGTAAAATATTTGTAGGATTATTATTGGAACATTGAGTTGTTGTTGCTGTAGTGGTGGTTGGCATTGTTGTATCAGGTTGATAATGCATTGTTTGTAGATTCGGTTTAGTAGCAGTCGACCATAAACAAGCATAACGTTCTCTTAATAACCGCATACAATCAGATAGTAAT] [+] EMBL CD196714 [CATGAATAAAGGAACAAAAACAGAACAGACAATAAACATTCACACATACAAAAAAAGAGAAAAATATATAAATAAACAAAATTAAGCTGAATAACATAAGTAATATGTTACTTAATGGCCTAAACACAAATACAAATGGTTGTTTTTATTGTTGTTGATGGTGGTGGTATTTTCGTAACTACCACCATGAAAATAAACAAAAAAATCATTAAAACAAAACACATAATATCCAAGAATATAAAACATTCAACAATAGTGACTGAATTGAGAAATAGTGATCATACAAAAACAACCATGAAATATGTAAATGGTTTATTACTCAAATGGATATTTTGTGTGTTTAGTTTGGACAAGGTTATTTGGATTTGTACATGGCGATAACAGTTAAATGGTTATGATGATAAGAGAGAAACAGCTGATTTACTTTACGT ] [+] EMBL CD196590 [ tAATAAACAAAATTAAGCTGAATAACATAAGTAATATGTTACTTAATGGCCTAAACACAAATACAAATGGTTGTTTTTATTGTTGTTGTTGGTGGTGGTATTTTCGTAACTATCACCATGAAAATAAACAAAAAAATCATTAAAACAAAACACATAATATCCAAGAATATAAAACATTCAACAATAGTGACTGAATTGAGAAATAGTGATCATACAAAAACAACCATGAAATATGTAAATGGTTTATTACTCAAATGGATATTTTTTGTGTTTAGTTTGGACAAGGTTATTTGGATTTGTACATGGCGATAACAGTTAAATGGTTATGATGATAAGAGAGAAACAGCTGATTTACTTTACGTTTTTTTTATTACCTTCAGAAAGAGAGTTACTACATCTCTAGCTGATTGTCAATAGATTGATATTGATAGAATTATAATGTTCGAATAGAGA ] [+] EMBL CD197240 [ cgGCTGATTTACTTTACGTTTTTTTTATTACCTTCAGAAAGAGAGTTACTACATCTCTAGCTGATTGTCAATAGATTGATATTGATAGAATTATAATGTTCGAATAGAGATAACTTACTGAATGACAGCAAACATACTAGTAATGCTAGAAGTAGTGAAATTCAAAGAGAAAAGGATATTAACAACGAATTACAGATGTATATATGGTATACAAAGAACATCAACGTAAAGGTGATGTGGTCGGTGCACAATTAGTCATGGGTAATGCACCAACTGTGACAGCAAATTTATTATTCACTTCTGATGATGGATCATTTAAACTAGGATTGGGTTAACTATCTGATGGTAAAATATTTGTAGGATTATTATTGGAACATTGAGTTGTTGTTGCTGTAGTGGTGG ] [-] EMBL CD196600 [ TGTCAATAGATTGATATTGATAGAATTATAATGTTCGAATAGAGATAACTTACTGAATGACAGCAAACATACTAGCAATGCTAGTAGTAGTGAAATTCAAAGAGAAAAGGATATTAACAACGAATTACAGATGTATATATGGTATACAAAGAACATCAACGTAAAGGTGATGTGGTCGGTGCACAATTAGTCATGGGTAATGCACCAACTGTGACAGCAAATTTATTATTCACTTCTGATGATGGATCATTTAAACTAGGATTGGGTAAACTATCTGATGGTAAAATATTTGTAGGATTATTATTGGAACATTGAGTTGTTGTTGCTGTAGTGGTGGTTGGCATTGTTGTATCAGGTTGATAATGCATTGTTTGTAGATTCGGTTTAGTAGCAGTCGACCATAAACAAGCATAACGTTCTCTTAATAACCGCATACAATCAGATAGTAAT] [-] EMBL CD196666 [ GAATTATAATGTTCGAATAGAGATAACTTACTGAATGACAGCAAACATACTAGTAATGCTAGTAGTAGTGAAATTCAAAGAGAAAAGGATATTAACAACGAATTACAGATGTATATATGGTATACAAAGAACATCAACGTAAAGGTGATGTGGTCGGTGCACAATTAGTCATGGGTAATGCACCAACTGTGACAGCAAATTTATTATTCACTTCTGATGATGGATCATTTAAACTAGGATTGGGTAAACTATCTGATGGTAAAATATTTGTAGGATTATTATTGGAACATTGAGTTGTTGTTGCTGTAGTGGTGGTTGGCATTGTTGTATCAGGTTGATAATGCATTGTTTGTAGATCCGGTTTAGTAGCAGTCGACCATAAACAAGCACAACGTTCTCTTAATAACCGCATACAATCAGATAGTAA ] [-] EMBL CD196556 [ AGCAAACATACTAGTAATGCTAGTAGTAGTGAAATTCAAAGAGAAAAGGATGTTAACAACGAATTACAGATGTATATATGGTATACAAAGAACATCAACGTAAAGGTGATGTGGTCGGTGCACAATTAGTCATGGGTAATGCACCAACTGTGACAGCAAATTTATTATTCACTTCTGATGATGGATCATTTAAACTAGGATTGGGTAAACTATCTGATGGTAAAATATTTGTAGGATTATTATTGGAACATTGAGTTGTTGTTGCTGTAGTGGTGGTTGGCATTGTTGTATCAGGTTGATAATGCATTGTTTGTAGATTCGGTTTAGTAGCAGTCGACCATAAACAAGCATAACGTTCTCTTAATAACCGCATACAATCAGATAGTAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||