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Schistosoma mansoni
cluster # 8317 cluster # 8317       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8317#0 length = 905 sequences # 6  

consensusID : consensus_8317#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 905
fasta sequence
                              [CAAAAATTTATTACATAAGTATGTAATAAAAGATTGTAGATCATACTACTGATTAATTATTTGAATAGTTAACGTTTAACTAAACAGAAGTTATACATAGAAGAAAAGAAAGATTGTCATATTGGGTTCAACATTTTTGTCACGATTATATGTCATGAGGATAAAGAAGATAACCAGATAGGCTGCTATACATATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT-TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA-ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTA-TTCTCAATACTTTTTGATAAACCTGTATAAAAAGCTATTTGATATTCTACTGGTCTAGGAATCCATATAGGTTGTAATTGTGTTGTTTCTCCGCGAGGACCTGGTGGTCCAGGATTTCCTTGTTCCCCTGTTGGTCCAGCTGGCCCTCGAGCTGATCGAACAGGTATGCGTACACGACCATATCCAGATGAACTAGCTCCGATACATTCTAGTTGTAATTGGCACGTAGATGAACTTTGAGAAATGTTTTTTTGAATATGTGTTGTATTACAAGGTAGTAATAATAATGATAATAACAGAGGGGCTACAAAAATTACGTTTAAATTTAACTTCTTAGTTTTGTTCATTTTTTCGAGTGAATTTATGAAACTTTTAAAATCCTCGTGCCGAATTTTGGCTCGA]

[+] EMBL CD074411             [CAAAAATTTATTACATAAGTATGTAATAAAAGATTGTAGATCATACTACTGATTAATTATTTGAATAGTTAACGTTTAACTAAACAGAAGTTATACATAGAAGAAAAGAAAGATTGTCATATTGGGTTCAACATTTTTGTCACGATTATATGTCATGAGGATAAAGAAGATAACCAGATAGGCTGCTATACATATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTA TTCTCAATACTTTTTGATAAACCTGTATAAAAAGCTATTTGATATTCTACTGGTCTAGGAATCCATATAGGTTGTAATTGTGTTGTTTCTCCGCGAGGACCTGGTGGTCCAGGATTTCCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD198793             [                                                                                                                                                                          TAACCAGATAGGCTGCTATACGTATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGNTTA TTCTCAATACTTTTTGATAAACCTGTAT AAAAGCTATTTGATATTCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD198743             [                                                                                                                                                                          TAACCAGATAGGCTGCTATACATATGTCCACGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTNCAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTA TTCTCAATACTTTTTGAT AACCTGTAT AAAAGCTATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD198688             [                                                                                                                                                                          TAACCAGATAGGCCGCTATACATATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACGACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGANACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTATTTCTCAt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD198741             [                                                                                                                                                                          TAACCAGATAGGCTGCTATACATATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATANACTGATTC AAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGNTTA TTCTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD080501             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCACACCATGAAAGTAACAC ACTTNTACCATTNTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTA TTCTCAATACTTTTTGATAAACCTGTATAAAAAGCTATTTGATATTCTACTGGTCTAGGAATCCATATAGGTTGTAATTTTGTTGTTTCTCCGCGAGGACCTGGTGGTCCAGGATTTCCTTGTTCCCCTGTTGGTCCAGCTGGCCCTCGAGCTGATCGAACAGGTATGCGTACACGACCATATCCAGATGAACTAGCTCCGATACATTCTAGTTGTAATTGGCACGTAGATGAACTTTGAGAAATGTTTTTTTGAATATGTGTTGTATTACAAGGTAGTAATAATAATGATAATAACAGAGGGGCTACAAAAATTACGTTTAAATTTAACTTCTTAGTTTTGTTCATTTTTTCGAGTGAATTTATGAAACTTTTAAAATCCTCGTGCCGAATTTTGGCTCGA]


>consensus_8317#0 CAAAAATTTATTACATAAGTATGTAATAAAAGATTGTAGATCATACTACTGATTAATTAT TTGAATAGTTAACGTTTAACTAAACAGAAGTTATACATAGAAGAAAAGAAAGATTGTCAT ATTGGGTTCAACATTTTTGTCACGATTATATGTCATGAGGATAAAGAAGATAACCAGATA GGCTGCTATACATATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTT GATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTT CACACCATGAAAGTAACACAACTTTACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCAT AACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATA TACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATAACTGATTCAAAAATTAATT GACAATTTTTGTTCACTGGTTTATTCTCAATACTTTTTGATAAACCTGTATAAAAAGCTA TTTGATATTCTACTGGTCTAGGAATCCATATAGGTTGTAATTGTGTTGTTTCTCCGCGAG GACCTGGTGGTCCAGGATTTCCTTGTTCCCCTGTTGGTCCAGCTGGCCCTCGAGCTGATC GAACAGGTATGCGTACACGACCATATCCAGATGAACTAGCTCCGATACATTCTAGTTGTA ATTGGCACGTAGATGAACTTTGAGAAATGTTTTTTTGAATATGTGTTGTATTACAAGGTA GTAATAATAATGATAATAACAGAGGGGCTACAAAAATTACGTTTAAATTTAACTTCTTAG TTTTGTTCATTTTTTCGAGTGAATTTATGAAACTTTTAAAATCCTCGTGCCGAATTTTGG CTCGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)