These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8317#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 905 fasta sequence [CAAAAATTTATTACATAAGTATGTAATAAAAGATTGTAGATCATACTACTGATTAATTATTTGAATAGTTAACGTTTAACTAAACAGAAGTTATACATAGAAGAAAAGAAAGATTGTCATATTGGGTTCAACATTTTTGTCACGATTATATGTCATGAGGATAAAGAAGATAACCAGATAGGCTGCTATACATATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT-TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA-ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTA-TTCTCAATACTTTTTGATAAACCTGTATAAAAAGCTATTTGATATTCTACTGGTCTAGGAATCCATATAGGTTGTAATTGTGTTGTTTCTCCGCGAGGACCTGGTGGTCCAGGATTTCCTTGTTCCCCTGTTGGTCCAGCTGGCCCTCGAGCTGATCGAACAGGTATGCGTACACGACCATATCCAGATGAACTAGCTCCGATACATTCTAGTTGTAATTGGCACGTAGATGAACTTTGAGAAATGTTTTTTTGAATATGTGTTGTATTACAAGGTAGTAATAATAATGATAATAACAGAGGGGCTACAAAAATTACGTTTAAATTTAACTTCTTAGTTTTGTTCATTTTTTCGAGTGAATTTATGAAACTTTTAAAATCCTCGTGCCGAATTTTGGCTCGA] [+] EMBL CD074411 [CAAAAATTTATTACATAAGTATGTAATAAAAGATTGTAGATCATACTACTGATTAATTATTTGAATAGTTAACGTTTAACTAAACAGAAGTTATACATAGAAGAAAAGAAAGATTGTCATATTGGGTTCAACATTTTTGTCACGATTATATGTCATGAGGATAAAGAAGATAACCAGATAGGCTGCTATACATATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTA TTCTCAATACTTTTTGATAAACCTGTATAAAAAGCTATTTGATATTCTACTGGTCTAGGAATCCATATAGGTTGTAATTGTGTTGTTTCTCCGCGAGGACCTGGTGGTCCAGGATTTCCTT ] [+] EMBL CD198793 [ TAACCAGATAGGCTGCTATACGTATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGNTTA TTCTCAATACTTTTTGATAAACCTGTAT AAAAGCTATTTGATATTCTA ] [+] EMBL CD198743 [ TAACCAGATAGGCTGCTATACATATGTCCACGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTNCAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTA TTCTCAATACTTTTTGAT AACCTGTAT AAAAGCTATTT ] [+] EMBL CD198688 [ TAACCAGATAGGCCGCTATACATATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACGACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGANACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTATTTCTCAt ] [+] EMBL CD198741 [ TAACCAGATAGGCTGCTATACATATGTCCATGTAAACGATAAGCTTCATCTCTACATTCCAACCATATTTGATCATTTTTATTTAATTGAATAATAGCTTGATTAGTTACAGTTGCCCAAAACGTACTTTCACACCATGAAAGTAACACAACTT TACCATTTTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATANACTGATTC AAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGNTTA TTCTCA ] [-] EMBL CD080501 [ TCACACCATGAAAGTAACAC ACTTNTACCATTNTGCAGTAATCGTACACCTGCCTTTTCATAACTTTGTGCTGATATAACTACAACAAATATATAAACACCCGAAACAGGAACAGTGAATATACCCGTAGTATTATCATATCCGCTGCCGAGATTCAACATA ACTGATTCAAAAATTAATTGACAATTTTTGTTCACTGGTTTA TTCTCAATACTTTTTGATAAACCTGTATAAAAAGCTATTTGATATTCTACTGGTCTAGGAATCCATATAGGTTGTAATTTTGTTGTTTCTCCGCGAGGACCTGGTGGTCCAGGATTTCCTTGTTCCCCTGTTGGTCCAGCTGGCCCTCGAGCTGATCGAACAGGTATGCGTACACGACCATATCCAGATGAACTAGCTCCGATACATTCTAGTTGTAATTGGCACGTAGATGAACTTTGAGAAATGTTTTTTTGAATATGTGTTGTATTACAAGGTAGTAATAATAATGATAATAACAGAGGGGCTACAAAAATTACGTTTAAATTTAACTTCTTAGTTTTGTTCATTTTTTCGAGTGAATTTATGAAACTTTTAAAATCCTCGTGCCGAATTTTGGCTCGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||