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Schistosoma mansoni
cluster # 8325 cluster # 8325       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8325#0 length = 632 sequences # 6  

consensusID : consensus_8325#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 632
fasta sequence
                              [ACTGGTACTCGTGATGGTGGAATTTATTCTTACGTTGTAAATTTTTTAATTGAAGATACTAAAGTGTATTCACCCGTATGGTTTTTGAAATCATGTCATCAATCTGGTGGGTGTACATCGATGCTTGTGATAAAAGGACAGTCAGATTGTCATCTATTATCGTGTGGTCGAACATACGGTGATGTTAAATACTGGTCCATCCAATCAAATGGTTCATTAAATCTTTTGGCAACAATCTTAAGATCTGATCATTTAACATGGATTGAGAAATTGTATCTGTCAATTGATAATCGAATTTATGCTTTAGGGTTTCAATCTAAGTACTTCAAAGCTATCTCACTAAATCACAAGTGTTTACAAGCAGCTAACCAATTGGATTGGTCGTTTACCTGTCCAGTACGTCAGGACGGTTGTTTCATTGTCGATTGTGGTGGTGGTAATCATTACTGGGATTGGTTTTTGCCCAGTGATACTATAAAAACAAATAAACTGGGTAATTGTGAAAATGACACTTATAGTTACAATGCTGGCATTGTTGTTGATAATAGTGAGTCTATCGAAATGGAGAGCAGTTCATCGTATCCTGTCTTTGCAAGTATCAATAAAGGCAAAGTTGTAATTCAGTCAGCGCC]

[+] EMBL CD188728             [ACTGGTACTCGTGATGGTGGAATTTATTCTTACGTTGTAAATTTTTTAATTGAAGATACTAAAGTGTATTCACCCGTATGGTTTTTGAAATCATGTCATCAATCTGGTGGGTGTACATCGATGCTTGTGATAAAAGGACAGTCAGATTGTCATCTATTATCGTGTGGTCGAACATACGGTGATGTTAAATACTGGTCCATCCAATCAAATGGTTCATTAAATCTTTTGGCAACAATCTTAAGATCTGATCATTTAACATGGATTGAGAAATTGTATCTGTCAATTGATAATCGAATTTATGCTTTAGGGTTTCAATCTAAGTACTTCAAAGCTATCTCACTAAATCACAAGTGTTTACAAGCAGCTAACCAATTGGATTGGTCGTTTACCT                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD162303             [                                                                                                                                         ACAGTCAGATTGTCATCTATTATCGTGTGGTCGAACATACGGTGATGTTAAATACTGGTCCATCCAATCAAATGGTTCATTAAATCTTTTGGCAACAATCTTAAGATCTGATCATTTAACATGGATTGAGAAATTGGATCTGTCAATTGATAATCGAATTTATGCTTTAGGGTTTCAATCTAAGTACTTCAAAGCTATCTCACTAAATCACAAGTGTTTACAAGCAGCTAACCAATTGGATTGGTCGTTTACCTGTCCAGTACGTCAGGACGGATGTTTCATTGTCGATTGTGGTGGTGGTAATCATTACTGGGATTGGTTTTTGCCCAGTGATACTATAAAAACAAATAAACTGGGTAATTGTGAAAATGACACTTATACTTACAATGCTGGCATTGTTGTTGATAATAGTGAGTCTATCGAAATGGAGAGCACATCATCGTATCCTGTCTTTGCAAGT                                   ]
[+] EMBL CD162245             [                                                                                                                                         ACAGTCAGATTGTCATCTATTATCGTGTGGTCGAACATACGGTGATGTTAAATACTGGTCCATCCAATCAAATGGTTCATTAAATCTTTTGGCAACAATCTTAAGATCTGATCATTTAACATGGATTGAGAAATTGTATCTGTCAATTGATAATCGAATTTATGCTTTAGGGTTTCAATCTAAGTACTTCAAAGCTATCTCACTAAATCACAAGTGTTTACAAGCAGCTAACCAATTGGATTGGTCGTTTACCTGTCCAGTACGTCAGGACGGTTGTTTCATTGTCGATTGTGGTGGTGGTAATCATTACTGGGATTGGTTTTTGCCCAGTGATACTATAAAAACAAATAAACTGGGTAATTGTGAAAATGACACTTATAGTTACAATGCTGGCATTGTTGTTGATAATAGTGAGTCTATCGCAATGGAGAGCAGTTCATCGTATCCTGTCTTAGCAAGT                                   ]
[+] EMBL CD162308             [                                                                                                                                         ACAGTCACATTGTCATCTATTATCGTGTGGTCGAACATACGGGGATGTTAAATACTGGTCCATCCAATCAAATGGTTCATTAAATCTTTTGGCAACAATCTTAAGATCTGATCATTTAACATGGATTGAGAAATTGTATCTGTCAATTGATAATCGAATTTATGCTTTAGGGTTTCAATCTAAGTACTTCAAAGCTATCTCACTAAATCACAAGTGTTTACAAGCAGCTAACCAATTGGATTGGTCGTTTACCTGTCCAGTACGTCAGGACGGATGTTTCATTGTCGATTGTGGTGGTGGTAATCATTACTGGGATTGGTTTTTGCCCAGTGATACTATAAAAACAAATAAACTGGGTAATTGTGAAAATGACACTTATACTTACAATGCTGGCATTGTTGTTGATAATAGTGAGTCTATCGAAATGGAGAGCAGTTCATCGTATCCTGTCTTTGCAAGT                                   ]
[+] EMBL CD162253             [                                                                                                                                         ACAGTCAGA TGTCATCTATTATCGTGTGGTCGAACATACGGTGATGTTAAATACTGGTCCATCCAATCAAATGGTTCATTAAATCTTTTGGCAACAATCTTAAGATCTGATCATTTAACATGGATTGAGAAATTGTATCTGTCAATTGATAATCGAATTTATGCTTTAGGGTTTCAATCTAAGTACTTCAAAGCTATCTCACTAAATCACAAGTGTTTACAAGCAGCTAACCAATTGGATTGGTCGTTTACCTGTCCAGTACGTCAGGACGGTTGTTTCATTGTCGATTGTGGTGGTGGTAATCATTACTGGGATTGGTTTTTGCCCAGTGATACTATAAAAACAAATAAACTGGGTAATTGTGAAAATGACACTTATAGTTACAATGCTGGCATTGTTGTTGATAATAGTGAGTCTATCGAAATGGAGAGCAGTTCATCGTATCCTGTCTTTGCAAGT                                   ]
[-] EMBL CD086637             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTGGATTGGTGGTTTACCTGTCCAGTACGTCAGGACGGTTGTTTCATTGTCGATTGTGGTGGTGGTAATCATCACTGGGATTGGTTTTTGCCCAGTGATACTATAAAAACAAATAAACTGGGTAATTGTGAAAATGACACTTATAGTTACAATGCTGGCATTGTTGTTGATAATAGTGAGTCTATCGAAATGGAGAGCAGTTCATCGTATCCTGTCTTTGCAAGTATCAATAAAGGCAAAGTTGTAATTCAGTCAGCGCC]


>consensus_8325#0 ACTGGTACTCGTGATGGTGGAATTTATTCTTACGTTGTAAATTTTTTAATTGAAGATACT AAAGTGTATTCACCCGTATGGTTTTTGAAATCATGTCATCAATCTGGTGGGTGTACATCG ATGCTTGTGATAAAAGGACAGTCAGATTGTCATCTATTATCGTGTGGTCGAACATACGGT GATGTTAAATACTGGTCCATCCAATCAAATGGTTCATTAAATCTTTTGGCAACAATCTTA AGATCTGATCATTTAACATGGATTGAGAAATTGTATCTGTCAATTGATAATCGAATTTAT GCTTTAGGGTTTCAATCTAAGTACTTCAAAGCTATCTCACTAAATCACAAGTGTTTACAA GCAGCTAACCAATTGGATTGGTCGTTTACCTGTCCAGTACGTCAGGACGGTTGTTTCATT GTCGATTGTGGTGGTGGTAATCATTACTGGGATTGGTTTTTGCCCAGTGATACTATAAAA ACAAATAAACTGGGTAATTGTGAAAATGACACTTATAGTTACAATGCTGGCATTGTTGTT GATAATAGTGAGTCTATCGAAATGGAGAGCAGTTCATCGTATCCTGTCTTTGCAAGTATC AATAAAGGCAAAGTTGTAATTCAGTCAGCGCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)