cluster # 8338

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8338 cluster # 8338 Sequences # 6 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8338#0 length = 548 sequences # 6

consensusID : consensus_8338#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 548
fasta sequence

                              [GTAAGATGCGGGGGGGGCTCATATGATTTAACATAA-TATGCAAGA-TCATTTTCCCGAATTTCTTTTTTATTTAAATGAATTTAATTCATCAATATAAAAGTAGACAATATCGCTTTTATTGTTT-TCATTATTGTTCATATCCATTTCAGGCGTTATTGTTTTAATATTAGAATTACATTATAATCATTCTTTTGTCCCCTATTGGTATGAATGTATATGCTTGTGAATGAACGGCTATATAAATTTTCCTTATTCATTATTATCATCTTAATAAAGATCAAAACGGGGTTTATCTTACTTTATCTTCAAATTGAATCTTCTTTATTTTGTTTTGTTCGTATTATGT-ATATGGTTGTTTTCATTGTGTCTCAAGGGCATCATTGTTACTTTTCTCCTCCCCCCC--CTCTCTCTCTCTCCATATTCCCTATTGCATAACAACTGTGAATGAACGGCTATATAAATTTTCTATTCATTTTGTGTTATAGTTTACAATCATATTTATTTAGTCTTTTTATTGCCTCTCAAGTCATCATTGTTACTTTTCTCTC]

[+] EMBL CD069368             [GTAAGATGCGGGGGGGGCTCATATGATTTAACATAA TATGCAAGA TCATTTTCCCGAATTTCTTTTTTATTTAAATGAATTTAATTCATCAATATAAAAGTAGACAATATCGCTTTTATTGTTT TCATTATTGTTCATATCCATTTCAGGCGTTATTGTTTTAATATTAGAATTACATTATAATCATTCTTTTGTCCCCTATTGGTATGAATGTATATGCTTGTGAATGAACGGCTATATAAATTTTCCTTATTCATTATTATCATCTTAATAAAGATCAAAACGGGGTTTATCTTACTTTATCTTCAAATTGAATCTTCTTTATTTTGTATAGTTCGTATTATGTCATATGGTTGTTTTCATTG                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD197597             [                              ACATAACTATGCAAGAGTCATTTGCCCGAATTGCTTTTATATTTAAATGAATTTAATTCATCAATATAAAAGTAGACAATATCGCTTTTATTGTTTGTCATTATTGTTCATATCCATTTCAGGCGTTATTGTTTTAATATTAGAATTACATTATAATCATTCTTTTGTCCCCTATTGGTATGAATGTATATGCTTGTGAATGAACGGCTATATAAATTTTCCTTATTCATTATTATCATCTTAATAAAGATCAAAACGGGGTTTATCTTACTTTATCTTCAAATTGAATCTTCTTTATTTTGTTTTGTTCGTATTATGT ATATGGTTGTTTTCATTGGGTCTCAAGGGCATCATTGTTACTTTTCTCCTCCCCCCC  CTCTCTCTCTCTCCATATTCCCTATTGCATAACAACTGTGAATGAACGGCTATATCAATTTTCTATTCATTTTGTGT                                                                    ]
[+] EMBL CD140889             [                               CATAA TATGCAAGA TCATTTTCCCGAATTTCTTTTTTATTTAAATGAATTTAATTCATCAATATAAAAGTAGACAATATCGCTTTTATTGTTT TCATTATTGTTCATATCCATTTCAGGCGTTATTGTTTTAATATTAGAATTACATTATAATCATTCTTTTGTCCCCTATTGGTATGAATGTATATGCTTGTGAATGAACGGCTATATAAATTTTCCTTATTCATTATTATCATCTTAATAAAGATCAAAACGGGGTTTATCTTACTTTATCTTCAAATTGAATCTTCTTTATTTTGTTTTGTTCGTATTATGT ATATGGTTGTTTTCATTGTGTCTCAAGGGCATCATTGTTACTTTTCTCCTCCCCCCC  CTCTCTCTCTCTCCATATTCCCTATTGCATAACAACTGTGAATGAACGGCTATATAAATTTTCTATTCATTTTGTG                                                                     ]
[+] EMBL CD197783             [                               CATAA TATGCAAGA TCATTTTCCCGAATTTCTTTTTTATTTAAATGAATTTAATTCATCAATATAAAAGTAGACAATATCGCTTTTATTGTTT TCATTATTGTTCATATCCATTTCAGGCGTTATTGTTTTAATATTAGAATTACATTATAATCATTCTTTTGTCCCCTATTGGTATGAATGTATATGCTTGTGAATGAACGGCTATATAAATTTTCCTTATTCATTATTATCATCTTAATAAAGATCAAAACGGGGTTTATCTTACTTTATCTTCAAATTGAATCTTCTTTATTTTGTTTTGTTCGTATTATGT ATATGGTTGTTTTCATTGTGTCTCAAGGGCATCATTGTTACTTTTCTCCTCCCCCCC  CTCTCTCTCTCTCCATATTCCCTATTGCATAACAACTGTGAATGAACGGCTATATTAATT                                                                                     ]
[-] EMBL CD197524             [                                                                                                                             T TCATTATTGTTCATATCCATTTCAGGCGTTATTGTTTTAATATTAGAATTACATTATAATCATTCTTTTGTCCCCTATTGGTATGAATGTATATGCTTGTGAATGAACGGCTATATAAATTTTCCTTATTCATTATTATCATCTTAATAAAGATCAAAACGGGGTTTATCTTACTTTATCTTCAAATTGAATCTTCTTTATTTTGTTTTGTTCGTATTATGT ATATGGTTGTTTTCATTGTGTCTCAAGGGCATCATTGTTACTTTTCTCCTCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCCATATTCCCTACTGCATAACAACTGTGAATGAACGGCTATATAAATTTTCTATTCATTTTGTGCTATAGTTTACAATCATATTTATTTAGTCTTTTTATTGCCTCTCAAGTCATCATTGTTACTTTTCTCTC]
[-] EMBL CD197550             [                                                                                                                                    ATTGTTCATATCCATTTCAGGCGTTATTGTTTTAATATTAGAATTACATTATAATCATTCTTTTGTCCCCTATTGGTATGAATGTATATGCTTGTGAATGAACGGCTATATAAATTTTCCTTATTCATTATTATCATCTTAATAAAGATCAAAACGGGGTTTATCTTACTTTATCTTCAAATTGAATCTTCTTTATTTTGTTTTGTTCGTATAATGT ATATGGTTGTTTTCATTGTGTCTCAAGGGCATCATTGTTACTTTTCTCCTCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCCATATTCCCTATTGCATAACAACTGTGAATGAACGGCTATATAAATTTTCTATTCATTTTGTGTTACAGTTTACAATCATATTTATTTAGTCTTTTTATTGCCTCTCAAGTCATCATTGTTACTTTTCTCTC]




>consensus_8338#0
GTAAGATGCGGGGGGGGCTCATATGATTTAACATAATATGCAAGATCATTTTCCCGAATT
TCTTTTTTATTTAAATGAATTTAATTCATCAATATAAAAGTAGACAATATCGCTTTTATT
GTTTTCATTATTGTTCATATCCATTTCAGGCGTTATTGTTTTAATATTAGAATTACATTA
TAATCATTCTTTTGTCCCCTATTGGTATGAATGTATATGCTTGTGAATGAACGGCTATAT
AAATTTTCCTTATTCATTATTATCATCTTAATAAAGATCAAAACGGGGTTTATCTTACTT
TATCTTCAAATTGAATCTTCTTTATTTTGTTTTGTTCGTATTATGTATATGGTTGTTTTC
ATTGTGTCTCAAGGGCATCATTGTTACTTTTCTCCTCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCCATA
TTCCCTATTGCATAACAACTGTGAATGAACGGCTATATAAATTTTCTATTCATTTTGTGT
TATAGTTTACAATCATATTTATTTAGTCTTTTTATTGCCTCTCAAGTCATCATTGTTACT
TTTCTCTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case