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Schistosoma mansoni
cluster # 8363 cluster # 8363       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8363#0 length = 683 sequences # 6  

consensusID : consensus_8363#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 683
fasta sequence
                              [TTTTCAAGGACACTACTAATGATTAGATTTATTCTTATACAAAATAGAGCCGGCAAAACACGCTTGGCTAAATGGTATATGAATCTTGATGATGAGGAGAAACAAAAACTAACTGAAGAAGTCCATGCTTTGGTCACCGTACGAGATGCCAAGCATACTAACTTTGTTGAATTTCGAAATTTTAAGATAGTTTATCGTCGTTATGCTGGCTTGTATTTTTGCATGTGTATTGACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG-TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGTCGTTGATTTCTTTGGTTTCTTACTTTGTTGTGTATTTTTCGACCAAAAGTTATTCAATAATTCATCTC]

[+] EMBL CD197009             [TTTTCAAGGACACTACTAATGATTAGATTTATTCTTATACAAAATAGAGCCGGCAAAACACGCTTGGCTAAATGGTATATGAATCTTGATGATGAGGAGAAACAAAAACTAACTGAAGAAGTCCATGCTTTGGTCACCGTACGAGATGCCAAGCATACTAACTTTGTTGAATTTCGAAATTTTAAGATAGTTTATCGTCGTTATGCTGGCTTGTATTTTTGCATGTGTATTGACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCCAACCAAAGTTTTAAAGCAGGT                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD081955             [                                                                 GGCTAAATGGTATATGAATCTTGATGATGAGGAGAAACAAAAACTAATTGAAGAAGTCCATGCTTTGGTCACCGTACGAGATGCCAAGCATACTAACTTTGTTGAATTTCGAAATTTTAAGATAGTTTATCGTCGTTATGCTGGCTTGTATTTTTGCATGTGTATTGACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGTCGTTGATTTCTTTGGTTTCTTACTTTGTTGTGTATTTTTCGACCAAAAGTTATTCAATAATTCATCTC]
[-] EMBL CD188268             [                                                                                                                                    GTCACCGTACGAGATGCCAAGCATACTAACTTTGTTGAATTTCGTAATTTTAAGATAGTTNATCGTCGTTATGCTGGCTTGTATTTTTGCATGTGTATTGACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTTAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCACTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTG                                                                                   ]
[-] EMBL CD154927             [                                                                                                                                                                                                                                       GACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAGATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTAGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGT                                                                    ]
[-] EMBL CD155011             [                                                                                                                                                                                                                                       GACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGT                                                                    ]
[-] EMBL CD196364             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCGTTTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCATACCTAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGTCGTTGATTTCTTTGGTTTCTTACTTTGTTGTGTATTTTTCGACCACAAGTTATTCAAT          ]


>consensus_8363#0 TTTTCAAGGACACTACTAATGATTAGATTTATTCTTATACAAAATAGAGCCGGCAAAACA CGCTTGGCTAAATGGTATATGAATCTTGATGATGAGGAGAAACAAAAACTAACTGAAGAA GTCCATGCTTTGGTCACCGTACGAGATGCCAAGCATACTAACTTTGTTGAATTTCGAAAT TTTAAGATAGTTTATCGTCGTTATGCTGGCTTGTATTTTTGCATGTGTATTGACCTAATG GACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTG TTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCGTTGTT GATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTAAAGCAG GTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCA CTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATA TTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTG GGATTATATCCAAGTCGTTGATTTCTTTGGTTTCTTACTTTGTTGTGTATTTTTCGACCA AAAGTTATTCAATAATTCATCTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)