These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8363#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 683 fasta sequence [TTTTCAAGGACACTACTAATGATTAGATTTATTCTTATACAAAATAGAGCCGGCAAAACACGCTTGGCTAAATGGTATATGAATCTTGATGATGAGGAGAAACAAAAACTAACTGAAGAAGTCCATGCTTTGGTCACCGTACGAGATGCCAAGCATACTAACTTTGTTGAATTTCGAAATTTTAAGATAGTTTATCGTCGTTATGCTGGCTTGTATTTTTGCATGTGTATTGACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG-TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGTCGTTGATTTCTTTGGTTTCTTACTTTGTTGTGTATTTTTCGACCAAAAGTTATTCAATAATTCATCTC] [+] EMBL CD197009 [TTTTCAAGGACACTACTAATGATTAGATTTATTCTTATACAAAATAGAGCCGGCAAAACACGCTTGGCTAAATGGTATATGAATCTTGATGATGAGGAGAAACAAAAACTAACTGAAGAAGTCCATGCTTTGGTCACCGTACGAGATGCCAAGCATACTAACTTTGTTGAATTTCGAAATTTTAAGATAGTTTATCGTCGTTATGCTGGCTTGTATTTTTGCATGTGTATTGACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCCAACCAAAGTTTTAAAGCAGGT ] [+] EMBL CD081955 [ GGCTAAATGGTATATGAATCTTGATGATGAGGAGAAACAAAAACTAATTGAAGAAGTCCATGCTTTGGTCACCGTACGAGATGCCAAGCATACTAACTTTGTTGAATTTCGAAATTTTAAGATAGTTTATCGTCGTTATGCTGGCTTGTATTTTTGCATGTGTATTGACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGTCGTTGATTTCTTTGGTTTCTTACTTTGTTGTGTATTTTTCGACCAAAAGTTATTCAATAATTCATCTC] [-] EMBL CD188268 [ GTCACCGTACGAGATGCCAAGCATACTAACTTTGTTGAATTTCGTAATTTTAAGATAGTTNATCGTCGTTATGCTGGCTTGTATTTTTGCATGTGTATTGACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTTAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCACTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTG ] [-] EMBL CD154927 [ GACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAGATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTAGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGT ] [-] EMBL CD155011 [ GACCTAATGGACAATAGTCTCGCATATTTAGAGGCGATCCATAATTTTGTAGAAGTCTTAAATGAACTGTTCCACAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCG TTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCAAACCAAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGT ] [-] EMBL CD196364 [ CAATGTTTGTGAATTGGACCTCGTCTTTAACTTCTATAAAGTTTACAGCGTTTGTTGATGAAATGTTTCTGGCCGGAGAAATTCGTGAGACAAGTCATACCTAAGTTTTAAAGCAGGTCATTATGTACTCAGCTTTGGAGTGACGTCAATTACGTCTTTTCCTTAGGACAAGCTCACTGCAAATCACAGGTGCGATATTTTAGACTTCAATAACTGTTATGTTTCTGTTTTGCATATTCATTTAATTATGTAGCCAATTTAAATTTTATCCTTCACTTCTCAGAGGTTTTATTCTGGGATTATATCCAAGTCGTTGATTTCTTTGGTTTCTTACTTTGTTGTGTATTTTTCGACCACAAGTTATTCAAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||