These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8367#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1130 fasta sequence [ACAATTTGGATAGTAGATTAATACGTCGCACCAATAAGTGGTGATACTATAATTAAATAAAAAAGATTGCATAATCAGTAAGTAAATGAATAAATCTGTATTTGATAGAAGCAAAATACTATCACTTCTGATTCATTCTTTAGTTTGATAATCCAGTTTTTTAATTATCCACGTTTTCTCGGTCATTATTTTACAATTTAAAACCCTGTCCAGAGGAAGCTGCTGCAAGCACTGGAGTTTGGCCTCCAAAGGGTTTAGAACCAGAACAAACCGGAGGTGGTAATACCAAACCTCGTGCTCTCCCCGCTTGGC-TTC-GTGATG-AATTA-GAAAAATTGGAAAAGAAAAAAGCTAAAGAATTGGCTGCTGTATCTGGAGCTACTGTTTTAGGGGCTGCTCCTGATGCTAAAAGGGATGATGAAGGTGATATCGTTATGGAGGATGAAGCTAAAACTGATGTCCAAACAATAAAATCTCTATTGAACAATAATGAAGAATTAGATGGTGATGTCAAGGAACAGGAAAGCCCTTTTGATATCTCAAGTAATCCTGTTGGTGACCTCCAGTCCCCGTTTTCATCTCGAAGTCAACCTCCTACGGAATTAGAGGAAATCTCAAACCCTGAAACTGCGGTAAAACAACTAACTACAGATAGTTCTCAAAGTATTTTACCCAACATTCCTGCATCATTAACGGTAAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGCTTAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCAAAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTTTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGGGAAGAGTAGGATTTGAAGCAATTTAAAGCTTTTTAGTTTATGAGATTTTAAAAGGGAATTTTTGTGGAAAGTATCAGATAAAGCTAGCTGAACTTTCCAAAGATTAACTCTTGTATTGTCTAGCGCTTTGAACAGTTGACGCATATTGTCATTAAATATGACTTTATTGAAGTTGATGCTACCTCACACTCATTCTCTGCCACATGTTTGATATGTATTTGGTTTTGCGAATGTTGGAACTACCGTATTCGGACTGGTGCACAACAGCCTACACA] [+] EMBL CD192866 [ACAATTTGGATAGTAGATTAATACGTCGCACCAATAAGTGGTGATACTATAATTAAATAAAAAAGATTGCATAATCAGTAAGTAAATGAATAAATCTGTATTTGATAGAAGCAAAATACTATCACTTCTGATTCATTCTTTAGTTTGATAATCCAGTTTTTTAATTATCCACGTTTTCTCGGTCATTATTTTACAATTTAAAACCCTGTCCAGAGGAAGCTGCTGCAAGCACTGGAGTTTGGCCTCCAAAGGGTTTAGAACCAGAACAAACCGGAGGTGGTAATACCAAACCTCGTGCTCTCCCCGCTTGGC TTC GTGATG AATTA GAAAAATTGGAAAAGAAAAAAGCTAAAGAATTGGCTGCTGTATCTGGAGCTACTGTTTTAGGGGCTGCTCCTGATGCTAAAAGGGATGATGAAGGTGATATCGTTATGGAGGATGA ] [+] EMBL CD192180 [ AGGTGGTAATACCAAACCTCGTGCTTTCCCCGCTTGGC TTC GTGATG AATTA GAAAAATTGGAAAAGAAAAAAGCTAAAGAATTGGCTGCTGTATCTGGAGCTACT GGGGCTGCTCCTGATGCTAAAAGGGATGATGAAGGTGATATCGTTATGGAGGATGA ] [+] EMBL CD092939 [ cCTTGGCTTTCTGTGATGTAATTACTAAAAATTGGAAAAGAAAAAAGCTAAAGAATTGGCTGCTGTATCTGGAGCTACTGTTTTAGGGGCTGCTCCTGATGCTAAAAGGGATGATGAAGGTGATATCGTTATGGAGGATGAAGCTAAAACTGATGTCCAAACAATAAAATCTCTATTGAACAATAATGAAGAATTAGATGGTGATGTCAAGGAACAGGAAAGCCCTTTTGATATCTCAAGTAATCCTGTTGGTGACCTCCAGTCCCCGTTTTCATCTCGAAGTCAACCTCCTACGGAATTAGAGGAAATCTCAAACCCTGAAACTGCGGTAAAACAACTAACTACAGATAGTTCTCAAAGTATTTTACCCAACATTCCTGCATCATTAACGGTAAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGCTTAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCANAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTTTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGCGAAGAGTACGATTTGAAGCAATTTANAGCTTT ] [+] EMBL CD202139 [ TCTCAAGTAATCCTGTTGGTGACCTCCAGTCCCCGTTTTCATCTCGAAGTCAACCTCCTACGGAATTAGAGGAAATCTCAAACCCTGAAACTGCGGTAAAACAACTAACTACAGATAGTTCTCAAGGTATTTTACCCAACATTCCTGCATCATTAACGGTAAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGCTTAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCAAAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTTTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGGGAAGAGTAGGATTTGAAGCAATTTAAAGCTTTTTAGTTTATGAGATTTTAAAAGGGAATTTTTGTGGAAGGTATCAGATAAAGCTAGCTGAACTTTCCAAAGATTAACTCTTGTATTGTCTAGCGCTTTGAACAGTTGACGCATATTGTCATTAAATATGACTTTATTGAAGTTGATGCTACCTCACACTCATTCTCTGCCACATGTTTGATATGTATTTGGGTT ] [+] EMBL CD178424 [ ATCATTAACGGTAAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGCTTAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCAAAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTCTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGGGAAGAGTAGGATTTGAAGCAATTTAAAGCTTTTTAGTTTATGAGATTTTAAAAGGGAATTTTTGTGGAAAGTATCAGATAAAGCTAGCTGAACTTTCCAAAGATTAACTCTTGTATTGTCTAGCGCTTTGAACAGTTGACGCATATTGTCATTAAATATGACTTTATTGAAGTTGATGCTACCTCACACTCATTCTCTGCCACATGTTTGATATGTATNTGGTTTTGCGAATGTTGGAACTACCGTATTCGGACTGGTGCACAACAGCCTACAC ] [-] EMBL CD178801 [ AAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGC TAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCAAAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTTTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGGGAAGAGTAGGATTTGAAGCAATTTAAAGCTTTTTAGTTTATGAGATTTTAAAAGGGAATTTTTGTGGAAAGTATCAGATAAAGCTAGCTGAACTTTCCAAAGATTAACTCTTGTATTGTCTAGCGCTTTGAACAGTTGACGCATATTGTCATTAAATATGACTTTATTGAAGTTGATGCTACCTCACACTCATTCTCTGCCACATGTTTGATATGTATTTGGTTTTGTGAATGTTGGAACTACCGTATTCGGACTGGTGCACAACAGCCTACACA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||