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Schistosoma mansoni
cluster # 8367 cluster # 8367       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8367#0 length = 1130 sequences # 6  

consensusID : consensus_8367#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1130
fasta sequence
                              [ACAATTTGGATAGTAGATTAATACGTCGCACCAATAAGTGGTGATACTATAATTAAATAAAAAAGATTGCATAATCAGTAAGTAAATGAATAAATCTGTATTTGATAGAAGCAAAATACTATCACTTCTGATTCATTCTTTAGTTTGATAATCCAGTTTTTTAATTATCCACGTTTTCTCGGTCATTATTTTACAATTTAAAACCCTGTCCAGAGGAAGCTGCTGCAAGCACTGGAGTTTGGCCTCCAAAGGGTTTAGAACCAGAACAAACCGGAGGTGGTAATACCAAACCTCGTGCTCTCCCCGCTTGGC-TTC-GTGATG-AATTA-GAAAAATTGGAAAAGAAAAAAGCTAAAGAATTGGCTGCTGTATCTGGAGCTACTGTTTTAGGGGCTGCTCCTGATGCTAAAAGGGATGATGAAGGTGATATCGTTATGGAGGATGAAGCTAAAACTGATGTCCAAACAATAAAATCTCTATTGAACAATAATGAAGAATTAGATGGTGATGTCAAGGAACAGGAAAGCCCTTTTGATATCTCAAGTAATCCTGTTGGTGACCTCCAGTCCCCGTTTTCATCTCGAAGTCAACCTCCTACGGAATTAGAGGAAATCTCAAACCCTGAAACTGCGGTAAAACAACTAACTACAGATAGTTCTCAAAGTATTTTACCCAACATTCCTGCATCATTAACGGTAAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGCTTAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCAAAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTTTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGGGAAGAGTAGGATTTGAAGCAATTTAAAGCTTTTTAGTTTATGAGATTTTAAAAGGGAATTTTTGTGGAAAGTATCAGATAAAGCTAGCTGAACTTTCCAAAGATTAACTCTTGTATTGTCTAGCGCTTTGAACAGTTGACGCATATTGTCATTAAATATGACTTTATTGAAGTTGATGCTACCTCACACTCATTCTCTGCCACATGTTTGATATGTATTTGGTTTTGCGAATGTTGGAACTACCGTATTCGGACTGGTGCACAACAGCCTACACA]

[+] EMBL CD192866             [ACAATTTGGATAGTAGATTAATACGTCGCACCAATAAGTGGTGATACTATAATTAAATAAAAAAGATTGCATAATCAGTAAGTAAATGAATAAATCTGTATTTGATAGAAGCAAAATACTATCACTTCTGATTCATTCTTTAGTTTGATAATCCAGTTTTTTAATTATCCACGTTTTCTCGGTCATTATTTTACAATTTAAAACCCTGTCCAGAGGAAGCTGCTGCAAGCACTGGAGTTTGGCCTCCAAAGGGTTTAGAACCAGAACAAACCGGAGGTGGTAATACCAAACCTCGTGCTCTCCCCGCTTGGC TTC GTGATG AATTA GAAAAATTGGAAAAGAAAAAAGCTAAAGAATTGGCTGCTGTATCTGGAGCTACTGTTTTAGGGGCTGCTCCTGATGCTAAAAGGGATGATGAAGGTGATATCGTTATGGAGGATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD192180             [                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGGTGGTAATACCAAACCTCGTGCTTTCCCCGCTTGGC TTC GTGATG AATTA GAAAAATTGGAAAAGAAAAAAGCTAAAGAATTGGCTGCTGTATCTGGAGCTACT      GGGGCTGCTCCTGATGCTAAAAGGGATGATGAAGGTGATATCGTTATGGAGGATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD092939             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cCTTGGCTTTCTGTGATGTAATTACTAAAAATTGGAAAAGAAAAAAGCTAAAGAATTGGCTGCTGTATCTGGAGCTACTGTTTTAGGGGCTGCTCCTGATGCTAAAAGGGATGATGAAGGTGATATCGTTATGGAGGATGAAGCTAAAACTGATGTCCAAACAATAAAATCTCTATTGAACAATAATGAAGAATTAGATGGTGATGTCAAGGAACAGGAAAGCCCTTTTGATATCTCAAGTAATCCTGTTGGTGACCTCCAGTCCCCGTTTTCATCTCGAAGTCAACCTCCTACGGAATTAGAGGAAATCTCAAACCCTGAAACTGCGGTAAAACAACTAACTACAGATAGTTCTCAAAGTATTTTACCCAACATTCCTGCATCATTAACGGTAAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGCTTAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCANAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTTTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGCGAAGAGTACGATTTGAAGCAATTTANAGCTTT                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD202139             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCTCAAGTAATCCTGTTGGTGACCTCCAGTCCCCGTTTTCATCTCGAAGTCAACCTCCTACGGAATTAGAGGAAATCTCAAACCCTGAAACTGCGGTAAAACAACTAACTACAGATAGTTCTCAAGGTATTTTACCCAACATTCCTGCATCATTAACGGTAAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGCTTAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCAAAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTTTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGGGAAGAGTAGGATTTGAAGCAATTTAAAGCTTTTTAGTTTATGAGATTTTAAAAGGGAATTTTTGTGGAAGGTATCAGATAAAGCTAGCTGAACTTTCCAAAGATTAACTCTTGTATTGTCTAGCGCTTTGAACAGTTGACGCATATTGTCATTAAATATGACTTTATTGAAGTTGATGCTACCTCACACTCATTCTCTGCCACATGTTTGATATGTATTTGGGTT                                                  ]
[+] EMBL CD178424             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATCATTAACGGTAAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGCTTAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCAAAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTCTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGGGAAGAGTAGGATTTGAAGCAATTTAAAGCTTTTTAGTTTATGAGATTTTAAAAGGGAATTTTTGTGGAAAGTATCAGATAAAGCTAGCTGAACTTTCCAAAGATTAACTCTTGTATTGTCTAGCGCTTTGAACAGTTGACGCATATTGTCATTAAATATGACTTTATTGAAGTTGATGCTACCTCACACTCATTCTCTGCCACATGTTTGATATGTATNTGGTTTTGCGAATGTTGGAACTACCGTATTCGGACTGGTGCACAACAGCCTACAC ]
[-] EMBL CD178801             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGC TAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCAAAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTTTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGGGAAGAGTAGGATTTGAAGCAATTTAAAGCTTTTTAGTTTATGAGATTTTAAAAGGGAATTTTTGTGGAAAGTATCAGATAAAGCTAGCTGAACTTTCCAAAGATTAACTCTTGTATTGTCTAGCGCTTTGAACAGTTGACGCATATTGTCATTAAATATGACTTTATTGAAGTTGATGCTACCTCACACTCATTCTCTGCCACATGTTTGATATGTATTTGGTTTTGTGAATGTTGGAACTACCGTATTCGGACTGGTGCACAACAGCCTACACA]


>consensus_8367#0 ACAATTTGGATAGTAGATTAATACGTCGCACCAATAAGTGGTGATACTATAATTAAATAA AAAAGATTGCATAATCAGTAAGTAAATGAATAAATCTGTATTTGATAGAAGCAAAATACT ATCACTTCTGATTCATTCTTTAGTTTGATAATCCAGTTTTTTAATTATCCACGTTTTCTC GGTCATTATTTTACAATTTAAAACCCTGTCCAGAGGAAGCTGCTGCAAGCACTGGAGTTT GGCCTCCAAAGGGTTTAGAACCAGAACAAACCGGAGGTGGTAATACCAAACCTCGTGCTC TCCCCGCTTGGCTTCGTGATGAATTAGAAAAATTGGAAAAGAAAAAAGCTAAAGAATTGG CTGCTGTATCTGGAGCTACTGTTTTAGGGGCTGCTCCTGATGCTAAAAGGGATGATGAAG GTGATATCGTTATGGAGGATGAAGCTAAAACTGATGTCCAAACAATAAAATCTCTATTGA ACAATAATGAAGAATTAGATGGTGATGTCAAGGAACAGGAAAGCCCTTTTGATATCTCAA GTAATCCTGTTGGTGACCTCCAGTCCCCGTTTTCATCTCGAAGTCAACCTCCTACGGAAT TAGAGGAAATCTCAAACCCTGAAACTGCGGTAAAACAACTAACTACAGATAGTTCTCAAA GTATTTTACCCAACATTCCTGCATCATTAACGGTAAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAAT TTCAGTGCTTAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTAC ATTTGAACCAAAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTTTCATCAAATC GCTTCATTGTATTGGGAAGAGTAGGATTTGAAGCAATTTAAAGCTTTTTAGTTTATGAGA TTTTAAAAGGGAATTTTTGTGGAAAGTATCAGATAAAGCTAGCTGAACTTTCCAAAGATT AACTCTTGTATTGTCTAGCGCTTTGAACAGTTGACGCATATTGTCATTAAATATGACTTT ATTGAAGTTGATGCTACCTCACACTCATTCTCTGCCACATGTTTGATATGTATTTGGTTT TGCGAATGTTGGAACTACCGTATTCGGACTGGTGCACAACAGCCTACACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)