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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8367#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1130 fasta sequence
[ACAATTTGGATAGTAGATTAATACGTCGCACCAATAAGTGGTGATACTATAATTAAATAAAAAAGATTGCATAATCAGTAAGTAAATGAATAAATCTGTATTTGATAGAAGCAAAATACTATCACTTCTGATTCATTCTTTAGTTTGATAATCCAGTTTTTTAATTATCCACGTTTTCTCGGTCATTATTTTACAATTTAAAACCCTGTCCAGAGGAAGCTGCTGCAAGCACTGGAGTTTGGCCTCCAAAGGGTTTAGAACCAGAACAAACCGGAGGTGGTAATACCAAACCTCGTGCTCTCCCCGCTTGGC-TTC-GTGATG-AATTA-GAAAAATTGGAAAAGAAAAAAGCTAAAGAATTGGCTGCTGTATCTGGAGCTACTGTTTTAGGGGCTGCTCCTGATGCTAAAAGGGATGATGAAGGTGATATCGTTATGGAGGATGAAGCTAAAACTGATGTCCAAACAATAAAATCTCTATTGAACAATAATGAAGAATTAGATGGTGATGTCAAGGAACAGGAAAGCCCTTTTGATATCTCAAGTAATCCTGTTGGTGACCTCCAGTCCCCGTTTTCATCTCGAAGTCAACCTCCTACGGAATTAGAGGAAATCTCAAACCCTGAAACTGCGGTAAAACAACTAACTACAGATAGTTCTCAAAGTATTTTACCCAACATTCCTGCATCATTAACGGTAAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGCTTAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCAAAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTTTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGGGAAGAGTAGGATTTGAAGCAATTTAAAGCTTTTTAGTTTATGAGATTTTAAAAGGGAATTTTTGTGGAAAGTATCAGATAAAGCTAGCTGAACTTTCCAAAGATTAACTCTTGTATTGTCTAGCGCTTTGAACAGTTGACGCATATTGTCATTAAATATGACTTTATTGAAGTTGATGCTACCTCACACTCATTCTCTGCCACATGTTTGATATGTATTTGGTTTTGCGAATGTTGGAACTACCGTATTCGGACTGGTGCACAACAGCCTACACA]
[+] EMBL CD192866 [ACAATTTGGATAGTAGATTAATACGTCGCACCAATAAGTGGTGATACTATAATTAAATAAAAAAGATTGCATAATCAGTAAGTAAATGAATAAATCTGTATTTGATAGAAGCAAAATACTATCACTTCTGATTCATTCTTTAGTTTGATAATCCAGTTTTTTAATTATCCACGTTTTCTCGGTCATTATTTTACAATTTAAAACCCTGTCCAGAGGAAGCTGCTGCAAGCACTGGAGTTTGGCCTCCAAAGGGTTTAGAACCAGAACAAACCGGAGGTGGTAATACCAAACCTCGTGCTCTCCCCGCTTGGC TTC GTGATG AATTA GAAAAATTGGAAAAGAAAAAAGCTAAAGAATTGGCTGCTGTATCTGGAGCTACTGTTTTAGGGGCTGCTCCTGATGCTAAAAGGGATGATGAAGGTGATATCGTTATGGAGGATGA ]
[+] EMBL CD192180 [ AGGTGGTAATACCAAACCTCGTGCTTTCCCCGCTTGGC TTC GTGATG AATTA GAAAAATTGGAAAAGAAAAAAGCTAAAGAATTGGCTGCTGTATCTGGAGCTACT GGGGCTGCTCCTGATGCTAAAAGGGATGATGAAGGTGATATCGTTATGGAGGATGA ]
[+] EMBL CD092939 [ cCTTGGCTTTCTGTGATGTAATTACTAAAAATTGGAAAAGAAAAAAGCTAAAGAATTGGCTGCTGTATCTGGAGCTACTGTTTTAGGGGCTGCTCCTGATGCTAAAAGGGATGATGAAGGTGATATCGTTATGGAGGATGAAGCTAAAACTGATGTCCAAACAATAAAATCTCTATTGAACAATAATGAAGAATTAGATGGTGATGTCAAGGAACAGGAAAGCCCTTTTGATATCTCAAGTAATCCTGTTGGTGACCTCCAGTCCCCGTTTTCATCTCGAAGTCAACCTCCTACGGAATTAGAGGAAATCTCAAACCCTGAAACTGCGGTAAAACAACTAACTACAGATAGTTCTCAAAGTATTTTACCCAACATTCCTGCATCATTAACGGTAAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGCTTAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCANAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTTTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGCGAAGAGTACGATTTGAAGCAATTTANAGCTTT ]
[+] EMBL CD202139 [ TCTCAAGTAATCCTGTTGGTGACCTCCAGTCCCCGTTTTCATCTCGAAGTCAACCTCCTACGGAATTAGAGGAAATCTCAAACCCTGAAACTGCGGTAAAACAACTAACTACAGATAGTTCTCAAGGTATTTTACCCAACATTCCTGCATCATTAACGGTAAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGCTTAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCAAAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTTTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGGGAAGAGTAGGATTTGAAGCAATTTAAAGCTTTTTAGTTTATGAGATTTTAAAAGGGAATTTTTGTGGAAGGTATCAGATAAAGCTAGCTGAACTTTCCAAAGATTAACTCTTGTATTGTCTAGCGCTTTGAACAGTTGACGCATATTGTCATTAAATATGACTTTATTGAAGTTGATGCTACCTCACACTCATTCTCTGCCACATGTTTGATATGTATTTGGGTT ]
[+] EMBL CD178424 [ ATCATTAACGGTAAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGCTTAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCAAAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTCTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGGGAAGAGTAGGATTTGAAGCAATTTAAAGCTTTTTAGTTTATGAGATTTTAAAAGGGAATTTTTGTGGAAAGTATCAGATAAAGCTAGCTGAACTTTCCAAAGATTAACTCTTGTATTGTCTAGCGCTTTGAACAGTTGACGCATATTGTCATTAAATATGACTTTATTGAAGTTGATGCTACCTCACACTCATTCTCTGCCACATGTTTGATATGTATNTGGTTTTGCGAATGTTGGAACTACCGTATTCGGACTGGTGCACAACAGCCTACAC ]
[-] EMBL CD178801 [ AAGCTCATTGAAGCTTGTAAGCAAATTTCAGTGC TAGTCGTCAAGCTACTGTATGGTGATTTGACTTCTCGTAGCTATATTCTACATTTGAACCAAAAGTCCCCGATATTCCATTAATACATTCGTTTGACACTTTCATCAAATCGCTTCATTGTATTGGGAAGAGTAGGATTTGAAGCAATTTAAAGCTTTTTAGTTTATGAGATTTTAAAAGGGAATTTTTGTGGAAAGTATCAGATAAAGCTAGCTGAACTTTCCAAAGATTAACTCTTGTATTGTCTAGCGCTTTGAACAGTTGACGCATATTGTCATTAAATATGACTTTATTGAAGTTGATGCTACCTCACACTCATTCTCTGCCACATGTTTGATATGTATTTGGTTTTGTGAATGTTGGAACTACCGTATTCGGACTGGTGCACAACAGCCTACACA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||