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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8372#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1180 fasta sequence
[ATAAGTCTGTCGACATCAATGGAGTTTCCACCCGTTTAAAATGGTGTGTCACATGTGAATTTTACAGACCTCCTCGCTGTTCTCATTGCTCTATTTGCAAACATTGCATTGATGTAAGTTGTTCAGTCTGCCAAAAGATTTTTAGACGTTTGATCATCATTGTCCTTGGCTGAACAATTGTATTGGGAAACGGAACTATCGATATTTTTTCTCGTTCCTACTCACATTAACTCTTCATATGATAATTGTTTTTGGCGTGTCCATGACGTATGTCCTGATGCGTACAAATGAGCTCTCTCACTACAAAGTCATTATTGCCATTGGTGTGTTAATTTTGGTAGGCTTATTGCTGCTTCCTGTGCTAGGTCTGACAGGATTTCACATTTTTCTAGTCAGCAAAGGACGAACTACAAATG-CACAGGTCACTTCAAAATATGATCTTGATATGAACCCTTATGATCGCGGCATTTGCAAGAACTGGCTACACATTTTTTGTACCTCCCAACCACCTATATTGAATCGACCAAATGTAGCAGAAATTGATATGTGGGAAATATCTTATAATGGCAAACCTATCAAACACCGTCAGACATCAAATTTGCGCTCTGGATCCAATAATTACAAACTTCCTGATACTTTTAAATCATCTAAAAACCCGGTTGATATTGTTAAACAGAAAGAAGTCGTTTGTGAAAAAGTGGATTTGGAAAATATAGTCAATCACTCTTTTGATCCACGAAACACATCCGAATTAATATCAAGTGTTCATCATGAACTAAACAATTCTCTTTCACCCAACCCACAATCAAAAGTTTTATCCCTTAAAGAGTTTTCAAATGCAACCTCCACCAATGAAAACCTTATGTCTAGATCTCAATCTCCTGTTTTTGGAAGGACTGGAGAATTAAATAAGACAAATTCAAGTCTTGCTTTAGGAGGAACAAAGTCAAAGTCTTTAGGTAACAAAGATCAAGGTAAAAGTCTACTATTCGGGACAAATGCACCAAAATATATATCAAGTGAAAATAGTGCTGGCTTTAATTCTAATATCAATTCTGTTGTAACAGCTACTAATGTTCCCGCAAAAACTGTATCTGATAGAGATCGTTTAGGCACAAAAAGTGATCATTTAACTCCACTTCTATGATCTCAAGCGTATTCGGACGTTGATTTAATTCGG]
[-] EMBL CD167191 [ATAAGTCTGTCGACATCAATGGAGTTTCCACCCGTTTAAAATGGTGTGTCACATGTGAATTTTACAGACCTCCTCGCTGTTCTCATTGCTCTATTTGCAAACATTGCATTGATGTAAGTTGTTCAGTCTGCCAAAAGATTTTTAGACGTTTGATCATCATTGTCCTTGGCTGAACAATTGTATTGGGAAACGGAACTATCGATATTTTTTCTCGTTCCTACTCACATTAACTCTTCATATGATAATTGTTTTTGGCGTGTCCATGACGTATGTCCTGATGCGTACAAATGAGCTCTCTCACTACAAAGTCATTATTGCCATTGGTGTGTTAATTTTGGTAGGCTTATTGCTGCTTCCTGTGCTAGGTCTGACAGGATTTCACATTTTTCTAGTCAGCAAAGGACGAACTACAAACC CACAGGTCACTTCAAAATATGATCTTGATATGAAC ]
[-] EMBL CD167164 [ CATCAATGGAGTTTCCACCCGTTTAANATGGTGTGTCACATGTGAATTTTACAGACCTCCTCGCTGTTCTCATTGCTCTATTTGCAAACATTGCATTGATGTAAGTTGTTCAGTCTGCCAAAAGATTTTTAGACGTTTGATCATCATTGTCCTTGGCTGAACAATTGTATTGGGAAACGGAACTATCGATATTTTTTCTCGTTCCTACTCACATTAACTCTTCATATGATAATTGTTTTTGGCGTGTCCATGACGTATGTCCTGATGCGTACAAATGAGCTCTCTCACTACAAAGTCATTATTGCCATTGGTGTGTTAATTTTGGTAGGCTTATTGCTGCTTCCTGTGCTAGGTCTGACAGGATTTCACATTTTTCTAGTCAGCAAAGGACGAACTACAAATG AACAGCTCACTTCAAAATATGATCTTGATATGAACCCTTATGATCGCGGCATTTGCAAGAACTG ]
[-] EMBL CD167166 [ AAAATGGTGTGTCACATGTGAATTTTACAGACCTCCTCGCTGTTCTCATTGCTCTATTTGCAAACATTGCATTGATGTAAGTTGTTCAGTCTGCCAAAAGATTTTTAGACGTTTGATCATCATTGTCCTTGGCTGAACAATTGTATTGGGAAACGGAACTATCGATATTTTTTCTCGTTCCTACTCACATTAACTCTTCATATGATAATTGTTTTTGGCGTGTCCATGACGTATGTCCTGATGCGTACAAATGAGCTCTCTCACTACAAAGTCATTATTGCCATTGGTGTGTTAATTTTGGTAGGCTTATTGCTGCTTCCTGTGCTAGGTCTGACAGGATTTCACATTTTTCTAGTCAGCAAAGGACGAACTACAAATGCCAC GGTCA ]
[-] EMBL CD200875 [ GGACGAACTCCAAATG AACAGGTCACTTCAAAATATGATCTTGATATGAACCCTTATGATCCGGGCATTTGCAAGAACTGGCTACACATTTTTTGTACCTCCCAACCACCTATATTGAATCGACCAAATGTAGCAGAAATTGATATGTGGGAAATATCTTATAATGGCAAACCTATCAAACACCGTCAGACATCAAATTTGCGCTCTGGATCCAATAATTACAAACTTCCTGATACTTTTAAATCATCTAAAAACCCGGTTGATATTGTTAAACAGAAAGAAGTCGTTTGTGAAAAAGTGGATTTGGAAAATATAGTCAATCACTCTTTTGATCCACGAAACACATCCGAATTAATATCAAGTGTTCATCATGAACTAAACAAT ]
[+] EMBL AI067521 [ TTTGGAAAATATAGTCAATCACTCTTCTGATCAACGAAACACATCCGAATTAATATCAAGTGTTCATCATGAACTAAACAATTCTCTTTCACCCAACCCACAATCAAAAGTTTTATCCCTTAAAGAGTTTTCAAATGCAACCTCCACCAATGAAAACCTTATGTCTAGATCTCAATCTCCTGTTTTTGGAAGGACTGGAGAATTAAATAAGACAAATTCAAGTCTTGCTTTAGGAGGAACAAAGTCAAAGTCTTTAGGTAACAAAGATCAAGGTAAAAGTCTACTATTCGGGACAAATGCACCAAAATATATATCAAGTGAAAATAGTGCTGGCTTTAATTCTAATATCAATTCTGTTGTAACAGCTACTAATGTTCCCGCAAAAACTGTATCTGATAGAGATCGTTTAGGCACAAAAAGTGATCATTTAACTCCACTTCTATGATCTCAAGCGTATTCGGACGTTGATTTAATTCGG]
[-] EMBL CD167160 [ AAGGTAAAAGTCTACTATTCGGGACAAATGCACCAAAATATATATCAAGTGAAAATAGTGCTGGCTTTAATTCTAATATCAATTCTGTTGTAACAGCTACTAATGTTCCCGCAAAAACTGTATCTGATAGAGATCGTTTAGGCACAACCAGCGATCATTTAACTCCACTTCTA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||