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Schistosoma mansoni
cluster # 8387 cluster # 8387       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8387#0 length = 667 sequences # 6  

consensusID : consensus_8387#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 667
fasta sequence
                              [TAGTCAGGAGAGTTGAATGCTCTAATAAAGAGCAAGAGATTTGGAATAAGTTTGGTGCCAACGTAATCATTGCACTTAAACTTAATTGTGCAGCATGTTGATCAGCCAAATCTTTGGGATCTGGTCCACTAGTTGTTCGTCTTAGACGTCTTGGACTAAGACTTACACCTTGAGTAGGTAAAGATGATGGCTTAATTAATCGATATAAGGATGGTGCAAAACAAACAGCTAAATTACTAGCACTCATCTCAGTTACATCACTATGACGTGATAAATGATTGAGTAAATACAATAATTTCTGTAGAACAAGACGATTTTCATCTGGTAAACTAATTAATATCCAACGGAGTAAATCAATTTGTACTGAATTTGGAACACATATATAAACATTGACAAGTACTGTAGCTAATTTACTGGTAAATAAACATTCTGGTAATTCACGAAAGAATTGTTTCAGTAAGTCTGCTATATCATATGGTTGCCAATCATCGAATTTCCTCCAGTTTATATCACGTTCAATCTCTTCTCTCAATGCTAATATTCTTGATTTACCGCCTGGACGTCGAAACAGTCCATGAGCTGTAGTACCATTTAATTCTAAATGATCCATCATATGCACAATAGCTGGTGGGAGAAGATAACCTANACGACGTTGCCAACTTGANTA]

[+] EMBL CD121120             [TAGTCAGGAGAGTTGAATGCTCTAATAAAGAGCAAGAGATTTGGAATAAGTTTGGTGCCAACGTAATCATTGCACTTAAACTTAATTGTGCAGCATGTTGATCAGCCAAATCTTTGGGATCTGGTCCACTAGTTGTTCGTCTTAGACGTCTTGGACTAAGACTTACACCTTGAGTAGGTAAAGATGATGGCTTAATTAATCGATATAAGGATGGTGCAAAACAAACAGCTAAATTACTAGCACTCATCTCAGTTACATCACTATGACGTGATAAATGATTGAGTAAATACAATAATTTCTGTAGAACAAGACGATTTTCATCTGGTAAACTAATTAATATCCAACGGAGTAAATCAATTTGTACTGAATTTGGAACACATATATAAACATTGACAAGTACTGTAGCTAATTTACTGGTAAATAAACATTCTGGTAATTCACGAAAGAATTGTTTCAGTAAGTCTGCTATATCATATGGTTGCCAATCATCGAATTTCCTCCAGTTTATATCACGTTCAATCTCTTCTCTCAATGCTAATATTCTTGATTTACCGCCTGGACGTCGAAACAGTCCATGAGCTGTAGCACCATTTAATTCTAAATGATCCATCATATGCACAATAGCTGGTGGGAGAAGATAACCTANACGACGTTGCCAACTTGANTA]
[-] EMBL CD121025             [                                                                   CATTGCACTTAAACTTAATGNTGCAGCATGTTGAGCAGCCAAATCTTTGGGATCTGGTCCACTAGTTGTTCGTCTTAGACGTCTTGGACTAAGACTTACACCTTGAGTAGGTAAAGATGATGGCTTAATTAATCGATATAAGGATGGTGCAAAACAAACAGCTAAATTACTAGCACTCATCTCAGTTACATCACTATGACGTGATAAATGATTGAGTAAATACAATAATTTCTGTAGAACAAGACGATTTTCATCTGGTAAACTAATTAATATCCAACGGAGTAAATCAATTTGTACTGAATTTGGAACACATATATAAACATTGACAAGTACTGTAGCTAATTTACTGGTAAATAAACATTCTGGTAATTCACGAAAGAATTGTTTCAGTAAGTCTGCTATATCATATGGTTGCCAATCAACGAATTTCCTCCAGTTTATATCACGTTCAATCTCTTCTCTCAATGCTAATATTCTTGATTTACCGCCTGGACGTCGAAACAGTCCATGAGCTGTAGTACCATTTAATTCTAAATGATCCATCATATGCACAATAGCTGGTGGAAGAGGATAACCTAAACGACGTTGCCAACTTGAta ]
[+] EMBL CD197695             [                                                                                                                  TGGGATCTGGTCCACTAGTTGTTCGTCTTAGACGTCTTGGACTAAGACTTACACCTTGAGTAGGTAAAGATGATGGCTTAATTAATCGATATAAGGATGGTGCAAAACAAACAGCTAAATTACTAGCACTCATCTCAGTTACATCACTATGACGTGATAAATGATTGAGTAAATACAATAATTTCTGTAGAACAAGACGATTTTCATCTGGTAAACTAATTAATATCCAACGGAGTAAATCAATTTGTACTGAATTTGGAACACATATATAAACATTGACAAGTACTGTAGCTAATTTACTGGTAAATAAACATTCTGGTAATTCACGAAAGAATTGTTTCAGTAAGTCTGCTATATCATATGGTTGCCAATCATCGAATTTCCTCCAGTTTATATCACGTTCAATCTCTTCTCTCAATGCTAATATTCTTGATTTACCGCCTGGA                                                                                                           ]
[+] EMBL CD197547             [                                                                                                                  TGGGATCTGGTCCACTAGTTGTTCGTCTTAGACGTCTTGGACTAAGTCTTACACCTTGAGTAGGTAAAGATGATGGCTTAATTAATCGATATAAGGACGGTGCAAAACAAACAGCTAAATTACTAGCACTCATCTCAGTTACATCACTATGACGTGATAAATGATTGAGTAAATACAATAATTTCTGTAGAACAAGACGATTTTCATCTGGTAAACTAATTAATATCCAACGGAGTAAATCAATTTGTACTGAATTTGGAACACATATATNAACATTGACAAGTACTGTAGCTAATTTACTGGTAAATAAACATTCTGGTAATTCACGAAAGAATTGTTTCAGTAAGTCTGCTATATCATATGGTTGCCAATCATCGAATTTCCTCCAGTTTATATCACGT                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD117991             [                                                                                                                                           TCTTATACGTCTTGGACTAAGACTTACACCTTGAGTAGGTAAAGATGATGGCTTAATTAATCGATATAAGGATGGTGCAAAACAAACAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD197766             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCACGAAAGAATTGTTTCAGTAAGTCTGCTATATCATATGGTGCCCAATCATCGAATTTCCTCCAGTTTATATCACGTTCAATCTCTTCTCTCAATGCTAATATTCTTGATTTACCGCCTGGACGTCGAAACAGTCCATGAGCTGTAGTACCATT                                                                           ]


>consensus_8387#0 TAGTCAGGAGAGTTGAATGCTCTAATAAAGAGCAAGAGATTTGGAATAAGTTTGGTGCCA ACGTAATCATTGCACTTAAACTTAATTGTGCAGCATGTTGATCAGCCAAATCTTTGGGAT CTGGTCCACTAGTTGTTCGTCTTAGACGTCTTGGACTAAGACTTACACCTTGAGTAGGTA AAGATGATGGCTTAATTAATCGATATAAGGATGGTGCAAAACAAACAGCTAAATTACTAG CACTCATCTCAGTTACATCACTATGACGTGATAAATGATTGAGTAAATACAATAATTTCT GTAGAACAAGACGATTTTCATCTGGTAAACTAATTAATATCCAACGGAGTAAATCAATTT GTACTGAATTTGGAACACATATATAAACATTGACAAGTACTGTAGCTAATTTACTGGTAA ATAAACATTCTGGTAATTCACGAAAGAATTGTTTCAGTAAGTCTGCTATATCATATGGTT GCCAATCATCGAATTTCCTCCAGTTTATATCACGTTCAATCTCTTCTCTCAATGCTAATA TTCTTGATTTACCGCCTGGACGTCGAAACAGTCCATGAGCTGTAGTACCATTTAATTCTA AATGATCCATCATATGCACAATAGCTGGTGGGAGAAGATAACCTANACGACGTTGCCAAC TTGANTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)