These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8387#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 667 fasta sequence [TAGTCAGGAGAGTTGAATGCTCTAATAAAGAGCAAGAGATTTGGAATAAGTTTGGTGCCAACGTAATCATTGCACTTAAACTTAATTGTGCAGCATGTTGATCAGCCAAATCTTTGGGATCTGGTCCACTAGTTGTTCGTCTTAGACGTCTTGGACTAAGACTTACACCTTGAGTAGGTAAAGATGATGGCTTAATTAATCGATATAAGGATGGTGCAAAACAAACAGCTAAATTACTAGCACTCATCTCAGTTACATCACTATGACGTGATAAATGATTGAGTAAATACAATAATTTCTGTAGAACAAGACGATTTTCATCTGGTAAACTAATTAATATCCAACGGAGTAAATCAATTTGTACTGAATTTGGAACACATATATAAACATTGACAAGTACTGTAGCTAATTTACTGGTAAATAAACATTCTGGTAATTCACGAAAGAATTGTTTCAGTAAGTCTGCTATATCATATGGTTGCCAATCATCGAATTTCCTCCAGTTTATATCACGTTCAATCTCTTCTCTCAATGCTAATATTCTTGATTTACCGCCTGGACGTCGAAACAGTCCATGAGCTGTAGTACCATTTAATTCTAAATGATCCATCATATGCACAATAGCTGGTGGGAGAAGATAACCTANACGACGTTGCCAACTTGANTA] [+] EMBL CD121120 [TAGTCAGGAGAGTTGAATGCTCTAATAAAGAGCAAGAGATTTGGAATAAGTTTGGTGCCAACGTAATCATTGCACTTAAACTTAATTGTGCAGCATGTTGATCAGCCAAATCTTTGGGATCTGGTCCACTAGTTGTTCGTCTTAGACGTCTTGGACTAAGACTTACACCTTGAGTAGGTAAAGATGATGGCTTAATTAATCGATATAAGGATGGTGCAAAACAAACAGCTAAATTACTAGCACTCATCTCAGTTACATCACTATGACGTGATAAATGATTGAGTAAATACAATAATTTCTGTAGAACAAGACGATTTTCATCTGGTAAACTAATTAATATCCAACGGAGTAAATCAATTTGTACTGAATTTGGAACACATATATAAACATTGACAAGTACTGTAGCTAATTTACTGGTAAATAAACATTCTGGTAATTCACGAAAGAATTGTTTCAGTAAGTCTGCTATATCATATGGTTGCCAATCATCGAATTTCCTCCAGTTTATATCACGTTCAATCTCTTCTCTCAATGCTAATATTCTTGATTTACCGCCTGGACGTCGAAACAGTCCATGAGCTGTAGCACCATTTAATTCTAAATGATCCATCATATGCACAATAGCTGGTGGGAGAAGATAACCTANACGACGTTGCCAACTTGANTA] [-] EMBL CD121025 [ CATTGCACTTAAACTTAATGNTGCAGCATGTTGAGCAGCCAAATCTTTGGGATCTGGTCCACTAGTTGTTCGTCTTAGACGTCTTGGACTAAGACTTACACCTTGAGTAGGTAAAGATGATGGCTTAATTAATCGATATAAGGATGGTGCAAAACAAACAGCTAAATTACTAGCACTCATCTCAGTTACATCACTATGACGTGATAAATGATTGAGTAAATACAATAATTTCTGTAGAACAAGACGATTTTCATCTGGTAAACTAATTAATATCCAACGGAGTAAATCAATTTGTACTGAATTTGGAACACATATATAAACATTGACAAGTACTGTAGCTAATTTACTGGTAAATAAACATTCTGGTAATTCACGAAAGAATTGTTTCAGTAAGTCTGCTATATCATATGGTTGCCAATCAACGAATTTCCTCCAGTTTATATCACGTTCAATCTCTTCTCTCAATGCTAATATTCTTGATTTACCGCCTGGACGTCGAAACAGTCCATGAGCTGTAGTACCATTTAATTCTAAATGATCCATCATATGCACAATAGCTGGTGGAAGAGGATAACCTAAACGACGTTGCCAACTTGAta ] [+] EMBL CD197695 [ TGGGATCTGGTCCACTAGTTGTTCGTCTTAGACGTCTTGGACTAAGACTTACACCTTGAGTAGGTAAAGATGATGGCTTAATTAATCGATATAAGGATGGTGCAAAACAAACAGCTAAATTACTAGCACTCATCTCAGTTACATCACTATGACGTGATAAATGATTGAGTAAATACAATAATTTCTGTAGAACAAGACGATTTTCATCTGGTAAACTAATTAATATCCAACGGAGTAAATCAATTTGTACTGAATTTGGAACACATATATAAACATTGACAAGTACTGTAGCTAATTTACTGGTAAATAAACATTCTGGTAATTCACGAAAGAATTGTTTCAGTAAGTCTGCTATATCATATGGTTGCCAATCATCGAATTTCCTCCAGTTTATATCACGTTCAATCTCTTCTCTCAATGCTAATATTCTTGATTTACCGCCTGGA ] [+] EMBL CD197547 [ TGGGATCTGGTCCACTAGTTGTTCGTCTTAGACGTCTTGGACTAAGTCTTACACCTTGAGTAGGTAAAGATGATGGCTTAATTAATCGATATAAGGACGGTGCAAAACAAACAGCTAAATTACTAGCACTCATCTCAGTTACATCACTATGACGTGATAAATGATTGAGTAAATACAATAATTTCTGTAGAACAAGACGATTTTCATCTGGTAAACTAATTAATATCCAACGGAGTAAATCAATTTGTACTGAATTTGGAACACATATATNAACATTGACAAGTACTGTAGCTAATTTACTGGTAAATAAACATTCTGGTAATTCACGAAAGAATTGTTTCAGTAAGTCTGCTATATCATATGGTTGCCAATCATCGAATTTCCTCCAGTTTATATCACGT ] [+] EMBL CD117991 [ TCTTATACGTCTTGGACTAAGACTTACACCTTGAGTAGGTAAAGATGATGGCTTAATTAATCGATATAAGGATGGTGCAAAACAAACAACT ] [-] EMBL CD197766 [ TTCACGAAAGAATTGTTTCAGTAAGTCTGCTATATCATATGGTGCCCAATCATCGAATTTCCTCCAGTTTATATCACGTTCAATCTCTTCTCTCAATGCTAATATTCTTGATTTACCGCCTGGACGTCGAAACAGTCCATGAGCTGTAGTACCATT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||