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Schistosoma mansoni
cluster # 8404 cluster # 8404       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8404#0 length = 1176 sequences # 6  

consensusID : consensus_8404#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1176
fasta sequence
                              [ACTNNNTCATATCCTAATGACATTTCTCACCATCGCAGTCTCTTCCAGTCAGACTTTTAGGGGAAAAATTCATAATGGGTACTGGTTGTGGAAAGTGTTCTTTATTGTCAGTTTGTGGTTTACTGCTTACTTTTTCCCATACCTAGAAACCCTCACTAGAGTGTGGATGATTGTGGGAATCGTTGGTGGGATTTTATTTGTCTATGTACAACACATAACGCTTATCGACTTTGCTTATGAAATAAATGGAAACTGGCATAATAAATCGAAAACTTCAGTTTTTTATACACTAGCTATATATATTGTTACCTTGTCACTGTATGCTGTGGCTATTTGTGCTTATACTGCCTTTGTACTCTTTTATGGTTTACCTCGTCAATGTACATTAAATCTAACTGTCACGGGTATTAATGGAGGTCTTACATTATTATTTGCTATATGTTCTGCATTTTCCACCATATTAAGAAAAGGTCAAATGTGGTTACCAGGTGCAATCACTTCTGCATTTGTAGCTTTTCTAACATGGTCAGCTTTAGGTAGTCAACCGAGAATTTTATCATCGAATTTTCCGTGGCAAAAACAAACAGTAAAAAAGATGAACGATGTACAACAAGAGCGAAATCTTACTGTTCACCCGCTAGTTGTTGTTGCTGATCAGTTGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAATAAAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTCACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTTTGAAAGCTCTCCTACCACCTATTCATGAAAATAGCCAATTTAATGAATCTACTCTACAAGCTTCCAATAATAACAAACCTACTCAGTCTTCCAATTCAGTTGTAACCGATAACTTGAATAAATCTCCAATACGTTTTATGAATTATAAGGATGTGAAGCGACAAGAGCATGCATTAAATCTTCTTGCTGACGCTGTGGCTGATTTACCTAATCCAAAGGTTNTTCGCAGACCTTCAGCACGTCA]

[-] EMBL CD200418             [ACTNNNTCATATCCTAATGACATTTCTCACCATCGCAGTCTCTTCCAGTCAGACTTTTAGGGGAAAAATTCATAATGGGTACTGGTTGTGGAAAGTGTTCTTTATTGTCAGTTTGTGGTTTACTGCTTACTTTTTCCCATACCTAGAAACCCTCACTAGAGTGTGGATGATTGTGGGAATCGTTGGTGGGATTTTATTTGTCTATGTACAACACATAACGCTTATCGACTTTGCTTATGAAATAAATGGAAACTGGCATAATAAATCGAAAACTTCAGTTTTTTATACACTAGCTATATATATTGTTACCTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI975025             [                                                                                                                                                                              GGGAATCGTTGGTGGGATTTTATTTGTCTATGTACAACACATAACGCTTATCGACTTTGCTTATGAAATAAATGGAAACTGGCATAATAAATCGAAAACTTCAGTTTTTTATACACTAGCTATATATATTGTTACCTTGTCACTGTATGCTGTGGCTATTTGTGCTTATACTGCCTTTGTACTCTTTTATGGTTTACCTCGTCAATGTACATTAAATCTAACTGTCACGGGTATTAATGGAGGTCTTACATTATTATTTGCTATATGTTCTGCATTTTCCACCATATTAAGAAAAGGTCAAATGTGGTTACCAGGTGCAATCACTTCTGCATTTGTAGCTTTTCTAACATGGTCAGCTTTAGGTAGTCAACCGAGAATTTTATCATCGAATTTTCCGTGGCAAAAACAAACAGTAAAAAAGATGAACGATGTACAACAAGAGCGAAATCTTACTGTTCACCCGCTAGTTGTTGTTGCTGATCAGTTGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD179099             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTGTAGCTTTTCTAACATGGTCAGCTTTAGGTAGTCAACCGAGAATTTTATCATCGAATTTTCCGTGGCAAAAACAAACAGTAAAAAAGATGAACGATGTACAACAAGAGCGAAATCTTACTGTTCACCCGCTAGTTGTTGTTGCTGATCAGTTGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAATAAAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTCACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTT                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD178439             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTGTAGCTTTTCTAACATGGTCAGCTTTAGGTAGTCAACCGAGAATTTTATCATCGAATTTTCCGTGGCAAAAACAAACAGTAAAAAAGATGAACGATGTACAACAAGAGCGAAATCTTACTGTTCACCCGCTAGTTGTTGTTGCTGATCAGTTGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAATAAAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTCACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTTT                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI976334             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAAT AAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTTACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTTTGAAAGCTCTCCTACCACCTATTCATGAAAATAGCCAATTTAATGAATCTACTCTACAAGCTTCCAATAATAACAAACCTACTCAGTCTTCCAATTCAGTTGTAACCGATAACTTGAATAAATCTCCAATACGTTTTATGAATTATAAGGATGTGAAGCGACAAGAGCATGCATTAAATCTTCTTGCTGACGCTGTGGCTGATTTACCTAATCCAAAGGTTNTTCGCAGACCTTCAGCACGTCA]
[+] EMBL AW016997             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAATAAAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTTACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTTTGAAAGCTCTCCTACCACCTATTCATGAAAATAGCCAATTTAATGAATCTACTCTACAAGCTTCCAATAATAACAAACCTACTCAGTCTTCCAATTC                                                                                                                                                   ]


>consensus_8404#0 ACTNNNTCATATCCTAATGACATTTCTCACCATCGCAGTCTCTTCCAGTCAGACTTTTAG GGGAAAAATTCATAATGGGTACTGGTTGTGGAAAGTGTTCTTTATTGTCAGTTTGTGGTT TACTGCTTACTTTTTCCCATACCTAGAAACCCTCACTAGAGTGTGGATGATTGTGGGAAT CGTTGGTGGGATTTTATTTGTCTATGTACAACACATAACGCTTATCGACTTTGCTTATGA AATAAATGGAAACTGGCATAATAAATCGAAAACTTCAGTTTTTTATACACTAGCTATATA TATTGTTACCTTGTCACTGTATGCTGTGGCTATTTGTGCTTATACTGCCTTTGTACTCTT TTATGGTTTACCTCGTCAATGTACATTAAATCTAACTGTCACGGGTATTAATGGAGGTCT TACATTATTATTTGCTATATGTTCTGCATTTTCCACCATATTAAGAAAAGGTCAAATGTG GTTACCAGGTGCAATCACTTCTGCATTTGTAGCTTTTCTAACATGGTCAGCTTTAGGTAG TCAACCGAGAATTTTATCATCGAATTTTCCGTGGCAAAAACAAACAGTAAAAAAGATGAA CGATGTACAACAAGAGCGAAATCTTACTGTTCACCCGCTAGTTGTTGTTGCTGATCAGTT GAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGC ATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCT ACCTGGTGGTGTGAATAAAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTCACATTGTTAGG AATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAG ACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTTTGAAAGCTCTCCTACCACCTATTCATGA AAATAGCCAATTTAATGAATCTACTCTACAAGCTTCCAATAATAACAAACCTACTCAGTC TTCCAATTCAGTTGTAACCGATAACTTGAATAAATCTCCAATACGTTTTATGAATTATAA GGATGTGAAGCGACAAGAGCATGCATTAAATCTTCTTGCTGACGCTGTGGCTGATTTACC TAATCCAAAGGTTNTTCGCAGACCTTCAGCACGTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)