These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8404#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1176 fasta sequence [ACTNNNTCATATCCTAATGACATTTCTCACCATCGCAGTCTCTTCCAGTCAGACTTTTAGGGGAAAAATTCATAATGGGTACTGGTTGTGGAAAGTGTTCTTTATTGTCAGTTTGTGGTTTACTGCTTACTTTTTCCCATACCTAGAAACCCTCACTAGAGTGTGGATGATTGTGGGAATCGTTGGTGGGATTTTATTTGTCTATGTACAACACATAACGCTTATCGACTTTGCTTATGAAATAAATGGAAACTGGCATAATAAATCGAAAACTTCAGTTTTTTATACACTAGCTATATATATTGTTACCTTGTCACTGTATGCTGTGGCTATTTGTGCTTATACTGCCTTTGTACTCTTTTATGGTTTACCTCGTCAATGTACATTAAATCTAACTGTCACGGGTATTAATGGAGGTCTTACATTATTATTTGCTATATGTTCTGCATTTTCCACCATATTAAGAAAAGGTCAAATGTGGTTACCAGGTGCAATCACTTCTGCATTTGTAGCTTTTCTAACATGGTCAGCTTTAGGTAGTCAACCGAGAATTTTATCATCGAATTTTCCGTGGCAAAAACAAACAGTAAAAAAGATGAACGATGTACAACAAGAGCGAAATCTTACTGTTCACCCGCTAGTTGTTGTTGCTGATCAGTTGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAATAAAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTCACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTTTGAAAGCTCTCCTACCACCTATTCATGAAAATAGCCAATTTAATGAATCTACTCTACAAGCTTCCAATAATAACAAACCTACTCAGTCTTCCAATTCAGTTGTAACCGATAACTTGAATAAATCTCCAATACGTTTTATGAATTATAAGGATGTGAAGCGACAAGAGCATGCATTAAATCTTCTTGCTGACGCTGTGGCTGATTTACCTAATCCAAAGGTTNTTCGCAGACCTTCAGCACGTCA] [-] EMBL CD200418 [ACTNNNTCATATCCTAATGACATTTCTCACCATCGCAGTCTCTTCCAGTCAGACTTTTAGGGGAAAAATTCATAATGGGTACTGGTTGTGGAAAGTGTTCTTTATTGTCAGTTTGTGGTTTACTGCTTACTTTTTCCCATACCTAGAAACCCTCACTAGAGTGTGGATGATTGTGGGAATCGTTGGTGGGATTTTATTTGTCTATGTACAACACATAACGCTTATCGACTTTGCTTATGAAATAAATGGAAACTGGCATAATAAATCGAAAACTTCAGTTTTTTATACACTAGCTATATATATTGTTACCTTG ] [+] EMBL AI975025 [ GGGAATCGTTGGTGGGATTTTATTTGTCTATGTACAACACATAACGCTTATCGACTTTGCTTATGAAATAAATGGAAACTGGCATAATAAATCGAAAACTTCAGTTTTTTATACACTAGCTATATATATTGTTACCTTGTCACTGTATGCTGTGGCTATTTGTGCTTATACTGCCTTTGTACTCTTTTATGGTTTACCTCGTCAATGTACATTAAATCTAACTGTCACGGGTATTAATGGAGGTCTTACATTATTATTTGCTATATGTTCTGCATTTTCCACCATATTAAGAAAAGGTCAAATGTGGTTACCAGGTGCAATCACTTCTGCATTTGTAGCTTTTCTAACATGGTCAGCTTTAGGTAGTCAACCGAGAATTTTATCATCGAATTTTCCGTGGCAAAAACAAACAGTAAAAAAGATGAACGATGTACAACAAGAGCGAAATCTTACTGTTCACCCGCTAGTTGTTGTTGCTGATCAGTTGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGT ] [+] EMBL CD179099 [ ATTTGTAGCTTTTCTAACATGGTCAGCTTTAGGTAGTCAACCGAGAATTTTATCATCGAATTTTCCGTGGCAAAAACAAACAGTAAAAAAGATGAACGATGTACAACAAGAGCGAAATCTTACTGTTCACCCGCTAGTTGTTGTTGCTGATCAGTTGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAATAAAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTCACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTT ] [-] EMBL CD178439 [ TTTGTAGCTTTTCTAACATGGTCAGCTTTAGGTAGTCAACCGAGAATTTTATCATCGAATTTTCCGTGGCAAAAACAAACAGTAAAAAAGATGAACGATGTACAACAAGAGCGAAATCTTACTGTTCACCCGCTAGTTGTTGTTGCTGATCAGTTGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAATAAAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTCACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTTT ] [+] EMBL AI976334 [ TGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAAT AAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTTACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTTTGAAAGCTCTCCTACCACCTATTCATGAAAATAGCCAATTTAATGAATCTACTCTACAAGCTTCCAATAATAACAAACCTACTCAGTCTTCCAATTCAGTTGTAACCGATAACTTGAATAAATCTCCAATACGTTTTATGAATTATAAGGATGTGAAGCGACAAGAGCATGCATTAAATCTTCTTGCTGACGCTGTGGCTGATTTACCTAATCCAAAGGTTNTTCGCAGACCTTCAGCACGTCA] [+] EMBL AW016997 [ TGAATCGTTTATTATCTCACCAATTCACTCAAACCACTAATCAAGTCAAAACATCACCAGCATTACCATCTGAATTAAAACCAAATATTACTGATTCAATCGTTTTAATTAATGAATGCCTACCTGGTGGTGTGAATAAAATCAGCGAACATTTAGGCAAAGATATTGTTACATTGTTAGGAATTACAGTTGTGATTAGTGGATTTTTATATTCAAGTTTTCGTGCATCTATGCAAGCAAGACGTTTGGGTATTCGAACACGAAGAGAACGTTTGAAAGCTCTCCTACCACCTATTCATGAAAATAGCCAATTTAATGAATCTACTCTACAAGCTTCCAATAATAACAAACCTACTCAGTCTTCCAATTC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||