These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8409#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1171 fasta sequence [GGATGTGACGGACTTTTATCCAGCTATTTGTCTTGTAAAACTCGTTATGTCGCTGGATCCAAGCAAGGAAGTCCTCGTTAAGCCATCAAACATATTTTTTCACTATTCAACTGAAGGCACTTGCAACACATGCCAAGTGTTGATTGTTAATAAATCAGCAAGAATACTACGCTTCAAAGTTTTATCTACAGCACGTTCCAAGTATTTACTATCAGTATGCAAGGGCGTTTTAAAGTCTGGTGAATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTTTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCAACTATTGCACGTAACCCGTCTCATAATGTTGCCATTCAAGATTCAGACTCATGCAGCACCTGGCCCAGTCGTTATCATGATGTTGGTTTGTCTACCTCAAGCTTAAGAACAGCATCTTTATCACGAGCTTTTGGAAGCCTTATTGGGTCAGAAAAGCGCCCTATTGCCTCTAAAACATACTCATCATTGGATCGTACGAAATGTGTGGGTCTCTCCAACGTATTCTCTACAGTCAAAGCACATAAAAATAGATCGAATTCAAGTACGTTAACAATCTGTCGTGGCACCAGTGATAGTCAATCAGAAAACTCCAGAACAAGCATCATTCTGCTTCATAATCTACTTTATAATTCCTTATTTATTCTAAGTTTGATTGTTTGTTTATTTGGAATTTTATTACCGTTCCTTCCATATGATTGTAAATTATGGTTATTGTCAAAAGTACTTCATGAGCGATGGAAGATTAATTATATTACCACTACTCCAAGTTCATTGACTTCTCCATATCATTCACAAAACGTTCATGACCATTCTCAATCTTATAAGCAAAGTTCTGGGGCCACTTATTCATCGACAACTGAATGTCCTACAGGGGAAAATCCACCAAAAGATGAGTTTAATCGTCACACTCGTCTGGCATTTTTTGCTTTCAAGAGTGCATTGCGTAGTATTTGCAGAGCAATAATTGCTTTAGATCCGTTAGTCGCAGTCGCTAATATGTCATGGTTTTGCTTAGGTTTGTTACTTATGTATCATTGGATAAAAAGAAAGTANAGCCGAAC-AGAAATGCACAACTGATACCTT] [+] EMBL AI975503 [GGATGTGACGGACTTTTATCCAGCTATTTGTCTTGTAAAACTCGTTATGTCGCTGGATCCAAGCAAGGAAGTCCTCGTTAAGCCATCAAACATATTTTTTCACTATTCAACTGAAGGCACTTGCAACACATGCCAAGTGTTGATTGTTAATAAATCAGCAAGAATACTACGCTTCAAAGTTTTATCTACAGCACGTTCCAAGTATTTACTATCAGTATGCAAGGGCGTTTTAAAGTCTGGTGAATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTTTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCAACTATTGCACGTAACCCGTCTCATAATGTTGCCATTCAAGATTCAGACTCATGCAGCACCTGGCCCAGTCGTTATCATGATGTTGGTTTGTCTACCTCAAGCTTAAGAACAGCATCTTTATCACGAGCTTTTGGAAGCCTTATTGGGTCAGAAAAGCGCCCTATTGCCTCTAAAACATACTCATCATTGGATCGTACGAAATGTGTGGGTCTCTCCAACGTATTCTCTACAGTCAAAGCACATAAAAATAGATCGAATTCAAGTACGTTAACAATCTGTCGTGGCACCAGTGATAGTCAA ] [+] EMBL BF936128 [GGATGTGACGGACTTTTATCCAGCTATTTGTCTTGTAAAACTCGTTATGTCGCTGGATCCAAGCAAGGAAGTCCTCGTTAAGCCATCAAACATATTTTTTCACTATTCAACTGAAGGCACTTGCAACACATGCCAAGTGTTGATTGTTAATAAATCAGCAAGAATACTACGCTTCAAAGTTTTATCTACAGCACGTTCCAAGTATTTACTATCAGTATGCAAGGGCGTTTTAAAGTCTGGTGAATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTTTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCAACTATTGCACGTAACCCGTCTCATAATGTTGCCATTCAAGATTCAGACTCATGCAGCACCTGGCCCAGTCGTTATTATGATGTTG ] [-] EMBL CD157630 [ CACTTGCAACACATGCCAAGTGTTGATTGTTAATAAATCAGCAAGAATACTACGCTTCAAAGTTTTATCTACAGCACGTTCCAAGTATTTACTATCAGTATGCAAGGGCGTTTTAAAGTCTGGTGAATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTTTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCA ] [-] EMBL CD178414 [ GTCTGGTG ATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTNTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCAACTATTGCACGTAACCCGTCTCATAATGTTGCCATTCAAGATTCAGACTCATGCAGCACCTGGCCCAGTCGTTATCATGATGTTGGTTTGTCTACCTCAAGCTTAAGAACAGCATCTTTATCACGAGCTTTTGGAAGCCTTATTGGGTCAGAAAAGCGCCCTATTGCCTCTAAAACATACTCATCATTGGATCGTACGAAATGTGTGGGTCTCTCCAACGTATTCTCTACAGTCAAAGCACATAAAAATAGATCGAATTCAAGTACGTTAACAATCTGTCGTGGCACCAGTGATAGTCAATCAGAAAACTCCAGAACAAGCATCATTCTGCTTCATAATCTACTTTATAATTCCTTATTTATTCTAAGTTTGATTGTTTGTTTATTTGGAATTTTATTACCGT ] [+] EMBL CD201363 [ ACGTTAACAATCTGTCGTGGCACCAGTGATAGTCAATCAGAAAACTCCAGAACAAGCATCATTCTGCTTCATAATCTACTTTATAATTCCTTATTTATTCTAAGTTTGATTGTTTGTTTATTTGGAATTTTATTACCGTTCCTTCCATATGATTGTAAATTATGGTTATTGTCAAAAGTACTTCATGAGCGATGGAAGATTAATTATATTACCACTACTCCAAGTTCATTGACTTCTCCATATCATTCACAAAACGTTCATGACCATTCTCAATCTTATAAGCAAAGTTCTGGGGCCACTTATTCATCGACAACTGAATGTCCTACAGGGGAAAATCCACCAAAAGATGAGTTTAATCGTCACACTCGTCTGGCATTTTTTGCTTTCAAGAGTGCATTGCGTAGTATTTGCAGAGCAATAATTGCTTTAGATCCGTTAGTCGCAGTCGCTAATATGTCATGGTTTTGCTTAGGTTTGTTACTTATGTATCATTGGATAAAAAGAAAGTANAGCCGAAC AGAAATGCACAACTGATAC ] [+] EMBL CD192485 [ ATTGCGTAGTATTTGCAGAGCAATAATTGCTTTAGATCCGTTAGTCGCAGTCGCTAATATGTCATGGTTTTGCTTAGGTTTGTTACTTATGTATCATTGGATAAAAAGAAGGTAAAGCCGAACAAGAAATGCACAACTGATACCTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||