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Schistosoma mansoni
cluster # 8409 cluster # 8409       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8409#0 length = 1171 sequences # 6  

consensusID : consensus_8409#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1171
fasta sequence
                              [GGATGTGACGGACTTTTATCCAGCTATTTGTCTTGTAAAACTCGTTATGTCGCTGGATCCAAGCAAGGAAGTCCTCGTTAAGCCATCAAACATATTTTTTCACTATTCAACTGAAGGCACTTGCAACACATGCCAAGTGTTGATTGTTAATAAATCAGCAAGAATACTACGCTTCAAAGTTTTATCTACAGCACGTTCCAAGTATTTACTATCAGTATGCAAGGGCGTTTTAAAGTCTGGTGAATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTTTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCAACTATTGCACGTAACCCGTCTCATAATGTTGCCATTCAAGATTCAGACTCATGCAGCACCTGGCCCAGTCGTTATCATGATGTTGGTTTGTCTACCTCAAGCTTAAGAACAGCATCTTTATCACGAGCTTTTGGAAGCCTTATTGGGTCAGAAAAGCGCCCTATTGCCTCTAAAACATACTCATCATTGGATCGTACGAAATGTGTGGGTCTCTCCAACGTATTCTCTACAGTCAAAGCACATAAAAATAGATCGAATTCAAGTACGTTAACAATCTGTCGTGGCACCAGTGATAGTCAATCAGAAAACTCCAGAACAAGCATCATTCTGCTTCATAATCTACTTTATAATTCCTTATTTATTCTAAGTTTGATTGTTTGTTTATTTGGAATTTTATTACCGTTCCTTCCATATGATTGTAAATTATGGTTATTGTCAAAAGTACTTCATGAGCGATGGAAGATTAATTATATTACCACTACTCCAAGTTCATTGACTTCTCCATATCATTCACAAAACGTTCATGACCATTCTCAATCTTATAAGCAAAGTTCTGGGGCCACTTATTCATCGACAACTGAATGTCCTACAGGGGAAAATCCACCAAAAGATGAGTTTAATCGTCACACTCGTCTGGCATTTTTTGCTTTCAAGAGTGCATTGCGTAGTATTTGCAGAGCAATAATTGCTTTAGATCCGTTAGTCGCAGTCGCTAATATGTCATGGTTTTGCTTAGGTTTGTTACTTATGTATCATTGGATAAAAAGAAAGTANAGCCGAAC-AGAAATGCACAACTGATACCTT]

[+] EMBL AI975503             [GGATGTGACGGACTTTTATCCAGCTATTTGTCTTGTAAAACTCGTTATGTCGCTGGATCCAAGCAAGGAAGTCCTCGTTAAGCCATCAAACATATTTTTTCACTATTCAACTGAAGGCACTTGCAACACATGCCAAGTGTTGATTGTTAATAAATCAGCAAGAATACTACGCTTCAAAGTTTTATCTACAGCACGTTCCAAGTATTTACTATCAGTATGCAAGGGCGTTTTAAAGTCTGGTGAATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTTTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCAACTATTGCACGTAACCCGTCTCATAATGTTGCCATTCAAGATTCAGACTCATGCAGCACCTGGCCCAGTCGTTATCATGATGTTGGTTTGTCTACCTCAAGCTTAAGAACAGCATCTTTATCACGAGCTTTTGGAAGCCTTATTGGGTCAGAAAAGCGCCCTATTGCCTCTAAAACATACTCATCATTGGATCGTACGAAATGTGTGGGTCTCTCCAACGTATTCTCTACAGTCAAAGCACATAAAAATAGATCGAATTCAAGTACGTTAACAATCTGTCGTGGCACCAGTGATAGTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BF936128             [GGATGTGACGGACTTTTATCCAGCTATTTGTCTTGTAAAACTCGTTATGTCGCTGGATCCAAGCAAGGAAGTCCTCGTTAAGCCATCAAACATATTTTTTCACTATTCAACTGAAGGCACTTGCAACACATGCCAAGTGTTGATTGTTAATAAATCAGCAAGAATACTACGCTTCAAAGTTTTATCTACAGCACGTTCCAAGTATTTACTATCAGTATGCAAGGGCGTTTTAAAGTCTGGTGAATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTTTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCAACTATTGCACGTAACCCGTCTCATAATGTTGCCATTCAAGATTCAGACTCATGCAGCACCTGGCCCAGTCGTTATTATGATGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD157630             [                                                                                                                     CACTTGCAACACATGCCAAGTGTTGATTGTTAATAAATCAGCAAGAATACTACGCTTCAAAGTTTTATCTACAGCACGTTCCAAGTATTTACTATCAGTATGCAAGGGCGTTTTAAAGTCTGGTGAATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTTTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD178414             [                                                                                                                                                                                                                                          GTCTGGTG ATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGACTTTTTCAAGATCCAGTTTNTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATATATGTTCAACTATTGCACGTAACCCGTCTCATAATGTTGCCATTCAAGATTCAGACTCATGCAGCACCTGGCCCAGTCGTTATCATGATGTTGGTTTGTCTACCTCAAGCTTAAGAACAGCATCTTTATCACGAGCTTTTGGAAGCCTTATTGGGTCAGAAAAGCGCCCTATTGCCTCTAAAACATACTCATCATTGGATCGTACGAAATGTGTGGGTCTCTCCAACGTATTCTCTACAGTCAAAGCACATAAAAATAGATCGAATTCAAGTACGTTAACAATCTGTCGTGGCACCAGTGATAGTCAATCAGAAAACTCCAGAACAAGCATCATTCTGCTTCATAATCTACTTTATAATTCCTTATTTATTCTAAGTTTGATTGTTTGTTTATTTGGAATTTTATTACCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD201363             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACGTTAACAATCTGTCGTGGCACCAGTGATAGTCAATCAGAAAACTCCAGAACAAGCATCATTCTGCTTCATAATCTACTTTATAATTCCTTATTTATTCTAAGTTTGATTGTTTGTTTATTTGGAATTTTATTACCGTTCCTTCCATATGATTGTAAATTATGGTTATTGTCAAAAGTACTTCATGAGCGATGGAAGATTAATTATATTACCACTACTCCAAGTTCATTGACTTCTCCATATCATTCACAAAACGTTCATGACCATTCTCAATCTTATAAGCAAAGTTCTGGGGCCACTTATTCATCGACAACTGAATGTCCTACAGGGGAAAATCCACCAAAAGATGAGTTTAATCGTCACACTCGTCTGGCATTTTTTGCTTTCAAGAGTGCATTGCGTAGTATTTGCAGAGCAATAATTGCTTTAGATCCGTTAGTCGCAGTCGCTAATATGTCATGGTTTTGCTTAGGTTTGTTACTTATGTATCATTGGATAAAAAGAAAGTANAGCCGAAC AGAAATGCACAACTGATAC   ]
[+] EMBL CD192485             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTGCGTAGTATTTGCAGAGCAATAATTGCTTTAGATCCGTTAGTCGCAGTCGCTAATATGTCATGGTTTTGCTTAGGTTTGTTACTTATGTATCATTGGATAAAAAGAAGGTAAAGCCGAACAAGAAATGCACAACTGATACCTT]


>consensus_8409#0 GGATGTGACGGACTTTTATCCAGCTATTTGTCTTGTAAAACTCGTTATGTCGCTGGATCC AAGCAAGGAAGTCCTCGTTAAGCCATCAAACATATTTTTTCACTATTCAACTGAAGGCAC TTGCAACACATGCCAAGTGTTGATTGTTAATAAATCAGCAAGAATACTACGCTTCAAAGT TTTATCTACAGCACGTTCCAAGTATTTACTATCAGTATGCAAGGGCGTTTTAAAGTCTGG TGAATTTGTTGAAACAGATATTTCAGTTTCCGGAGTTTCAATAACGGATGATACAAAGGA CTTTTTCAAGATCCAGTTTTTCGATTCATACGATGGCTCCGCTTTTTGCGAGCACTATAT ATGTTCAACTATTGCACGTAACCCGTCTCATAATGTTGCCATTCAAGATTCAGACTCATG CAGCACCTGGCCCAGTCGTTATCATGATGTTGGTTTGTCTACCTCAAGCTTAAGAACAGC ATCTTTATCACGAGCTTTTGGAAGCCTTATTGGGTCAGAAAAGCGCCCTATTGCCTCTAA AACATACTCATCATTGGATCGTACGAAATGTGTGGGTCTCTCCAACGTATTCTCTACAGT CAAAGCACATAAAAATAGATCGAATTCAAGTACGTTAACAATCTGTCGTGGCACCAGTGA TAGTCAATCAGAAAACTCCAGAACAAGCATCATTCTGCTTCATAATCTACTTTATAATTC CTTATTTATTCTAAGTTTGATTGTTTGTTTATTTGGAATTTTATTACCGTTCCTTCCATA TGATTGTAAATTATGGTTATTGTCAAAAGTACTTCATGAGCGATGGAAGATTAATTATAT TACCACTACTCCAAGTTCATTGACTTCTCCATATCATTCACAAAACGTTCATGACCATTC TCAATCTTATAAGCAAAGTTCTGGGGCCACTTATTCATCGACAACTGAATGTCCTACAGG GGAAAATCCACCAAAAGATGAGTTTAATCGTCACACTCGTCTGGCATTTTTTGCTTTCAA GAGTGCATTGCGTAGTATTTGCAGAGCAATAATTGCTTTAGATCCGTTAGTCGCAGTCGC TAATATGTCATGGTTTTGCTTAGGTTTGTTACTTATGTATCATTGGATAAAAAGAAAGTA NAGCCGAACAGAAATGCACAACTGATACCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)