cluster # 8424

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Schistosoma mansoni
cluster # 8424 cluster # 8424 Sequences # 6 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_8424#0 length = 574 sequences # 6

consensusID : consensus_8424#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 574
fasta sequence

                              [TGTTTGCAGCCATTTTACAGCTGG-TCAATCAGCTG-TTCGTGAACGTAATGATGATTTTCAAGAGATTTGTCGTCGTCTTAGTTTACCTAACGGTCGTAATATTCTTAGTCATGATTATGTATTTTGGTGTGGAGACTTCAATTATCGTATTAATTTGTCAGGTAATGAGGTCAAACGACTAGCTACACAGTCTTCTTGGCTTGATCTCCTACGTTACGATCAGTTGACAATTGAGAAACTAGCTGGTAATGTTTTTCGTGGTTTCGAAGAAGGCCCCATCCGATTTGCACCGACATACAAATATGATTTATTTTGTGATGACTATGATACATCTGAGAAAGCACGTTCGCCTGCTTGGACTGATCGTATATTATGGCGTCGCGTAAAATTAACATTTCCCAAAACGGACGAAAATGGCATTGTTTGTATGCAGAATAATTCTCCAGATAAAAAATGGAATCCTGGTCGTTTGTTACTGTACAATCGGGCTGAGTTGAAAACAAGTGACCATCGACCCGTGGGAGCGATATTCAATATAGAAGTTCA-GGTGATTTCACGACAATCTCGACGTAAA]

[+] EMBL CD192282             [TGTTTGCAGCCATTTTACAGCTGG TCAATCAGCTG TTCGTGAACGTAATGATGATTTTCAAGAGATTTGTCGTCGTCTTAGTTTACCTAACGGTCGTAATATTCTTAGTCATGATTATGTATTTTGGTGTGGAGACTTCAATTATCGTATTAATTTGTCAGGTAATGAGGTCAAACGACTAGCTACACAGTCTTCTTGGCTTGATCTCCTACGTTACGATCAGTTGACAATTGAGAAACTAGCTGGTAATGTTTTTCGTGGTTTCGAAGAAGGCCCCATCCGATTTGCACCGACATACAAATATGATTTATTTTGTGATGACTATGATACATCTGAGAAAGCACGTTCGCCTGCTTGGACTGATCGTATATTATGGCGTCGCGTAAAATTAACATTTCCCAAAACGGACGAAAATGGCATTGTTTGTATGCAGAATAATTCTCCAGATAAAAAATGGAATCCTGGTCGTTTGTTACTGTACAATCGGGCTGAGTTGAAAACAAGTGACCATCGACCCGTGGGAGCGATATTCAATATAGAAGTTCA GGTGATTTCACGACAATCTCGACGTAA ]
[+] EMBL CD192877             [TGTTTGCAGCCATTTTACAGCTGG TCAATCAGCTG TTCGTGAACGTAATGATGATTTTCAAGAGATTTGTCGTCGTCTTAGTTTACCTAACGGTCGTAATATTCTTAGTCATGATTATGTATTTTGGTGTGGAGACTTCAATTATCGTATTAATTTGTCAGGTAATGAGGTCAAACGACTAGCTACACAGTCTTCTTGGCTTGATCTCCTACGTTACGATCAGTTGACAATTGAGAAACTAGCTGGTAATGTTTTTCGTGGTTTCGAAGAAGGCCCCATCCGATTTGCACCGACATACAAATATGATTTATTTTGTGATGACTATGATACATCTGAGAAAGCACGTTCGCCTGCTTGGACTGATCGTATATTATGGCGTCGCGTAAAATTAACATTTCCCAAAACGGACGAAAATGGCATTGTTTGTATGCAGAATAATTCTCCAGATAAAAAATGGAATCCTGGTCGTTTGTTACTGTACAATCGGGCTGAGTTG AAACAAGTGACCATCGACCCGTGGGAGCGATATTCNATATAGAAAGTCANGGTGA TTCACGANCATCTCGACGTna ]
[+] EMBL CD192273             [TGTTTGCAGCCATTTTACAGCTGG TCAATCAGCTG TTCGTGAACGTAATGATGATTTTCAAGAGATTTGTCGTCGTCTTAGTTTACCTAACGGTCGTAATATTCTTAGTCATGATTATGTATTTTGGTGTGGAGACTTCAATTATCGTATTAATTTGTCAGGTAATGAGGTCAAACGACTAGCTACACAGTCTTCTTGGCTTGATCTCCTACGTTACGATCAGTTGACAATTGAGAAACTAGCTGGTAATGTTTTTCGTGGTTTCGAAGAAGGCCCCATCCGATTTGCACCGACATACAAATATGATTTATTTTGTGATGACTATGATACATCTGAGAAAGCACGTTCGCCTGCTTGGACTGATCGTATATTATGGCGTCGCGTAAAATTAACATTTCCCAAAACGGACGAAAATGGCATTGTTTGTATGCAGAATAATTCTCCAGATAAAAAATGGAATCCTGGTCGTTTGTTACTGTACAATCGG                                                                                        ]
[+] EMBL CD192690             [TGTTTGCAGCCATTTTACAGCTGG TCAATCAGCTG TTCGTGAACGTAATGATGATTTTCAAGAGATTTGTCGTCGTCTTAGTTTACCTAACGGTCGTAATATTCTTAGTCATGATTATGTATTTTGGTGTGGAGACTTCAATTATCGTATTAATTTGTCAGGTAATGAGGTCAAACGACTAGCTACACAGTCTTCTTGGCTTGATCTCCTACGTTACGATCAGTTGACAATTGAGAAACTAGCTGGTAATGTTTTTCGTGGTTTCGAAGAAGGCCCCATCCGATTTGCACCGACATACAAATATGATTTATTTTGTGATGACTATGATACATCTGAGAAAGCACGTTCGCCTGCTTGGACTGAT                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD118947             [TGTTTGCAGCCATTTTACAGCTGGCTCAATCAGCTGCTTCGTGAACGTAATGATGATTTTCAAGAGATTTGTCGTCGTCTTAGTTTACCTAACGGTCGTAATATTCTTAGTCATGATTATGTATTTTGGTGTGGAGACTTCAATTATCGTATTAATTTGTCAGGTAATGAGGTCAAACGACTAGCTACACAGTCTTCTTGGGTTGATCTCCTACGTTACGATCAGTTGACAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD157140             [                                                                                                                           TTTTGGTGTGGAGACTTCAATTATCGTATTAATTTGTCAGGTAATGAGGTCAAACGACTAGCTACACAGTCTTCTTGGCTTGATCTCCTACGTTACGATCAGTTGACAATTGAGAAACTAGCTGGTAATGTTTTTCGTGGTTTCGAAGAAGGCCCCATCCGATTTGCACCGACATACAAATATGATTTATTTTGTGATGACTATGATACATCTGAGAAAGCACGTTCGCCTGCTTGGACTGATCGTATATTATGGCGTCGCGTAAAATTAACATTTCCCAAAACGGACGAAAATGGCATTGTTTGTATGCAGAATAATTCTCCAGATAAAAAATGGAATCCTGGTCGTTTGTTACTGTACAATCGGGCTGAGTTGAAAACAAGTGACCATCGACCCGTGGGAGCGATATTCAATATAGAAGTTCA GGTGATTTCACGACAATCTCGACGTAAA]




>consensus_8424#0
TGTTTGCAGCCATTTTACAGCTGGTCAATCAGCTGTTCGTGAACGTAATGATGATTTTCA
AGAGATTTGTCGTCGTCTTAGTTTACCTAACGGTCGTAATATTCTTAGTCATGATTATGT
ATTTTGGTGTGGAGACTTCAATTATCGTATTAATTTGTCAGGTAATGAGGTCAAACGACT
AGCTACACAGTCTTCTTGGCTTGATCTCCTACGTTACGATCAGTTGACAATTGAGAAACT
AGCTGGTAATGTTTTTCGTGGTTTCGAAGAAGGCCCCATCCGATTTGCACCGACATACAA
ATATGATTTATTTTGTGATGACTATGATACATCTGAGAAAGCACGTTCGCCTGCTTGGAC
TGATCGTATATTATGGCGTCGCGTAAAATTAACATTTCCCAAAACGGACGAAAATGGCAT
TGTTTGTATGCAGAATAATTCTCCAGATAAAAAATGGAATCCTGGTCGTTTGTTACTGTA
CAATCGGGCTGAGTTGAAAACAAGTGACCATCGACCCGTGGGAGCGATATTCAATATAGA
AGTTCAGGTGATTTCACGACAATCTCGACGTAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case