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Schistosoma mansoni
cluster # 8442 cluster # 8442       Sequences # 6       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8442#0 length = 974 sequences # 6  
consensusID : consensus_8442#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 974
fasta sequence 
                              [TTTGTTGCTNTGTTAAACATGCATTATGAATATCATCAAGAATACGAGGTAGTTCATTAATAAGGGAATCCATGGGTACATTTACTCTTTCACCAGTATGTCGAAGGACTAAACAAACTTTTCTATCAGCTACTTCTTGTGGACCAATTTCTAAGCGAATAGGAACCCCTTTTAATTCCCAATGATTAAATTTCCATCCAGGTGATACATTATCACGATCATCACAGTGTACACGAAATTGTTTATTAGACTTATTTAATAATTCGAATACAGAATGAGCAGCGGACAAGAGAGTTTCTCGC-TCTTGTACAGTTGTTTTTGCAGTAATACCACAAGGAACAATAACAATCTGATATGGTGCAACTCTCGGTGGTAATACAAGACCTTTGTCATCACTATGTACCATAATTAAAACACCTAGTGTACGAGTGGTAAGACCCCAAGAATTTTGATAGACGTAGGCAGGTTTACCAGTCACTGGATGATCATATGTCACATCAAACATACGACTAAAGTTCTGACCTAAATGATGTGATGTAGCACCTTGAATTGCACGTCCATTCCCATCAATATAAATTTCCACAGTTGTCGTATAATCTGCACCGGCGAATTTTTCACGTTCAGTTTTACGCCCTTTAACCACAGGAACTGCAAGTAAATATTCGTTAACTTCAGCATACAGATCCAATATTACACGAACCTCTGCTTCAGCATCGGCTTTTTCTGCAAAAGCGGTATGTTCTTCTTGCCAAAGGAATTCACGTGTACCTAAAAAAGGTTGTGGATGTTTAAATTCCCACCGGACAAATTACTCCACTGATTTATTCGAAGTGCTAAATTGGGATGAGATTGAATCCATCCCGCAAACTTTGGTTACATAATTTGTCTTACTGGTTGGTCGCAAAATGAATGGGTCTTGCTAAATCTCGTTAACTGACTTCGTCCACATTCCTCTTTAGGTGTCAATATATGCA]

[-] EMBL AI975894             [TTTGTTGCTNTGTTAAACATGCATTATGAATATCATCAAGAATACGAGGTAGTTCATTAATAAGGGAATCCATGGGTACATTTACTCTTTCACCAGTATGTCGAAGGACTAAACAAACTTTTCTATCAGCTACTTCTTGTGGACCAATTTCTAAGCGAATAGGAACCCCTTTTAATTCCCAATGATTAAATTTCCATCCAGGTGATACATTATCACGATCATCACAGTGTACACGAAATTGTTTATTAGACTTATTTAATAATTCGAATACAGAATGAGCAGCGGACAAGAGAAGTTCTTGCTTCTTGTACAGTTGTTTTTGCAGTAATACCACAAGGAACAATAACAATCTGATATGGTGCAACTCTCGGTGGTAATACAAGACCTTTGTCATCACTATGTACCATAATTAAAACACCTAGTGTACGAGTGGTAAGACCCCAAGAATTTTGATAGACGTAGGCAGGTTTACCAGTCACTGGATGATCATATGTCACATCAAACATACGACTAAAGTTCTGACCTAAATGATGTGATGTAGCACCTTGAATTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD090080             [                                        cATACGAGGTAGTTCATTAATAAGGGAATCCATGGGTACATTTACTCTTTCACCAGTATGTCGAAGGACTAAACAAACTTTTCTATCAGCTACTTCTTGTGGACCAATTTCTAAGCGAATAGGAACCCCTTTTAATTCCCAATGATTAAATTTCCATCCAGGTGATACATTATTACGATCATCACAGTGTACACGATATTGTTTATTAGACTTATTTAATAATTCGAATACCGAATGAGCAGCGGACAAGAGAGTTTCTCGC TCTTGTACAGTTGTTTTTGCAGTAATACCACAAGGAACAATAACAATCTGATATGGTGCAACTCTCGGTGGTAATACAAGACCTTTGTCATCACTATGTACCACAATTAAAACACCTAGTGTACGAGTGGTAAGACCCCAAGAATTTTGATAGACGTAGGCAGGTTTACCAGTCACTGGATGATCATATGTCACATCAAACATACGACTAAAGTTCTGACCTAAATGATGTGATGTAGCACCTTGAATTGCACGTCCATTCCCATCAATATAAATTTCCACAGTTGTCGTATAATCTGCACCGGCGAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD064479             [                                                           ATAAGGGAATCCATGGGTACATTTACTCTTTCACCAGTATGTCGAAGGACTAAACAAACTTTTCTATCAGCTACTTCTTGTGGACCAATTTCTAAGCGAATAGGAACCCCTTTTAATTCCCAATGATTAAATTTCCATCCAGGTGATACATTATCACGATCATCACAGTGTACACGAAATTGTTTATTAGACTTATTTAATAATTCGAATACAGAATGAGCAGCGGACAAGAGAGTTTCTCGC TCTTGTACAGTTGTTTTTGCAGTAATACCACAAGGAACAATAACAATCTGATATGGTGCAACTCTCGGTGGTAATACAAGACCTTTGTCATCACTATGTACCATAATTAAAACACCTAGTGTACGAGTGGTAAGACCCCAAGAATTTTGATAGACGTAGGCAGGTTTACCAGTCACTGGATGATCATATGTCACATCAAACATACGACTAAAGTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL AI067422             [                                                                                                                                                              ATAGG ACNCCTNTTAATTCCCAATGATTAAATTTCCATCCAGGTGATACATTATCACGATCATCACAGTGTACACGAAATTGTTTATTAGACTTATTTAATAATTCGAATACAGAATGAGCAGCGGACAAGAGAGTTTCTCGC TCTTGTACAGTTGTTTTTGCAGTAATACCACAAGGAACAATAACAATCTGATATGGTGCAACTCTCGGTGGTAATACAAGACCTTTGTCATCACTATGTACCATAATTAAAACACCTAGTGTACGAGTGGTAAGACCCCAAGAATTTTGATAGACGTAGGCAGGTTTACCAGTCACTGGATGATCATATGTCACATCAAACATACGACTAAAGTTCTGACCTAAATGATGTGATGTAGCACCTTGAATTGCACGTCCATTCCCATCAATATAAATTTCCACAGTTGTCGTATAATCTGCACCGGCGAATTTTTCACGTTCAGTTTTACGCCCTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD113571             [                                                                                                                                                                                                                                            AATTCGATATTAGACTTATTTAATAATTCGAATACAGAATGAGCAGCGGACAAGAGAGTTTCTCGC TCTTGTACAGTTGTTTTTGCAGTAATACCACATGGAACAATAACAATCTGATATGGTGCAACTCTCGGTGGTTATACAAGACCTTTGTCATCACTATGTACCATAATTAAAACACCTAGTGTACGAGTGGTAAGACCCCAAGATTTTTGATAGACGTAGGCAGGTTTACCAGTCACTGGATGATCATATGTCACATCAAACATACGACTAAAGTTCTGACCTAAATGATGTGATGTAGCACCTTGAATTGCACGTCCATTCCCATCAATATAAATTTCCACAGTTGTCGTATAATCTGCACCGGCGAATTTTTCACGTTCAGTGTTACGCCCTTTAACCACAGGAACTGCAAGTAAATATTCGTTAACTTCAGCATACAGATCCAATATTACACGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD128830             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATTAAAACACCTAGTGTACGAGTGGTAAGACCCCAAGAATTTTGATAGACGTAGGCAGGATTACCAGTCACTGGATGATCATATGTCACATCAAACATACGACTAAAGTTCTGACCTAAATGATGTGATGTAGCACCTTGAATTGCACGTCCATTCCCATCAATATAAATTTCCACAGTTGTCGTATAATCTGCACCGGCGAATTTTTCACGTTCAGTTTTACGCCCTTTAACCACAGGAACTGCAAGTAAATATTCGTGAACTTCAGCATACAGATCCAATATTACACGAACCTCTGCTTCAGCATCGGCTTTTTCTGCAAAAGCGGTATGTTCTTCTTGCCAAAGGAATTCACGTGTACCTAAAAAAGGTTGTGGATGTTTAAATTCCCACCGGACAAATTACTCCACTGATTTATTCGAAGTGCTAAATTGGGATGAGATTGAATCCATCCCGCAAACTTTGGTTACATAATTTGTCTTACTGGTTGGTCGCAAAATGAATGGGTCTTGCTAAATCTCGTTAACTGACTTCGTCCACATTCCTCTTTAGGTGTCAATATATGCA]




>consensus_8442#0
TTTGTTGCTNTGTTAAACATGCATTATGAATATCATCAAGAATACGAGGTAGTTCATTAA
TAAGGGAATCCATGGGTACATTTACTCTTTCACCAGTATGTCGAAGGACTAAACAAACTT
TTCTATCAGCTACTTCTTGTGGACCAATTTCTAAGCGAATAGGAACCCCTTTTAATTCCC
AATGATTAAATTTCCATCCAGGTGATACATTATCACGATCATCACAGTGTACACGAAATT
GTTTATTAGACTTATTTAATAATTCGAATACAGAATGAGCAGCGGACAAGAGAGTTTCTC
GCTCTTGTACAGTTGTTTTTGCAGTAATACCACAAGGAACAATAACAATCTGATATGGTG
CAACTCTCGGTGGTAATACAAGACCTTTGTCATCACTATGTACCATAATTAAAACACCTA
GTGTACGAGTGGTAAGACCCCAAGAATTTTGATAGACGTAGGCAGGTTTACCAGTCACTG
GATGATCATATGTCACATCAAACATACGACTAAAGTTCTGACCTAAATGATGTGATGTAG
CACCTTGAATTGCACGTCCATTCCCATCAATATAAATTTCCACAGTTGTCGTATAATCTG
CACCGGCGAATTTTTCACGTTCAGTTTTACGCCCTTTAACCACAGGAACTGCAAGTAAAT
ATTCGTTAACTTCAGCATACAGATCCAATATTACACGAACCTCTGCTTCAGCATCGGCTT
TTTCTGCAAAAGCGGTATGTTCTTCTTGCCAAAGGAATTCACGTGTACCTAAAAAAGGTT
GTGGATGTTTAAATTCCCACCGGACAAATTACTCCACTGATTTATTCGAAGTGCTAAATT
GGGATGAGATTGAATCCATCCCGCAAACTTTGGTTACATAATTTGTCTTACTGGTTGGTC
GCAAAATGAATGGGTCTTGCTAAATCTCGTTAACTGACTTCGTCCACATTCCTCTTTAGG
TGTCAATATATGCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)