These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8450#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1110 fasta sequence [GATGAGTCATATTTAGAAGAGGCCTGAATAAGGGACATAGATGTTGGAATACTCTTTTCAGTTGAATTGCTANATACGCTATTAGGATTATTTGATCCCACANAACTACGCACAGGAATTACACCTATTTCAGTGAGTTGAGCTTCAACCAACTGACGCAAACGAACTTCTTCACCTAAATTTTGCTCAATTGTGTTTAAATTAATTCGTTCAGTACGGCATTTATTAGTAAGCTTTGAAATACGTGATGAAATACCCTCGTTCTCTTGACGCTGGTTGGACAGACTGAGTCGATTGAGGTGATCGTCATGTTGAAGACTGTTTAACTGGTTACGCAATTGTGTTTCCAGTCCACGCATGGACTGTAATTCGGAACGGAGACGTCTAACGTTACTCTCTAATCTTGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCTGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGTCGACCAGCATCAGTAACATATGTATTTGATATTACTCCATTTACTATCGTAGTCGAGGAATGGTTAAAACGTGCAGTTCGACTGTCAAAATCCAAGTATTGTTTATCAATAGATCTAAAATAGCTGAAAGTCCATCGAGCTAAACGATCAAAACACGACTGACCAAAGCGAAAAAGTATGAATACCGACCGACTAGAAAAATCTGATGAGAAGTCATTGGACAATGCAACTTCGTGAACTTCTAGGGAATCCTTATGAAAATAATCAAGACTATGTTGAACGTAAGCGTTGTCATTTACCGATGAAGGTGGGAGAGCTTCATAAAGTATTCGAAAATGCATGTAATTTTGTCTTCTGACATTCATCCTTTTAAAATCTCGATAGTTTATATCAGGTACCGTTTTACAGAANATCCCACACAAACTACCGAATAACCAATGCTGTGTGCTGCAAATGGACGGAAAACACAAATGCTGTGAGTGGATTTCGTTGCTTTTGAGTAGAGACTAAATTCGAATATAT] [-] EMBL AI974963 [GATGAGTCATATTTAGAAGAGGCCTGAATAAGGGACATAGATGTTGGAATACTCTTTTCAGTTGAATTGCTANATACGCTATTAGGATTATTTGATCCCACANAACTACGCACAGGAATTACACCTATTTCAGTGAGTTGAGCTTCAACCAACTGACGCAAACGAACTTCTTCACCTAAATTTTGCTCAATTGTGTTTAAATTAATTCGTTCAGTACGGCATTTATTAGTAAGCTTTGAAATACGTGATGAAATACCCTCGTTCTCTTGACGCTGGTTGGACAGACTGAGTCGATTGAGGTGATCGTCATGTTGAAGACTGTTTAACTGGTTACGCAATTGTGTTTCCAGTCCACGCATGGACTGTAATTCGGAACGGAGACGTCTAACGTTACTCTCTAATCTTGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCTGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGT ] [-] EMBL BF936224 [ GCTATTAGGATTATTTGATCCCACAAAACTACGCACAGGAATTACACCTATTTCAGTGAGTTGAGCTTCAACCAACTGACGCAAACGAACTTCTTCACCTAAATTTTGCTCAATTGTGTTTAAATTAATTCGTTCAGTACGGCATTTATTAGTAAGCTTTGAAATACGTGATGAAATACCCTCGTTCTCTTGACGCTGGTTGGACAGACTGAGTCGATTGAGGTGATCGTCATGTTGAAGACTGTTTAACTGGTTACGCAATTGTGTTTCCAGTCCACGCATGGACTGTAATTCGGAACGGAGACGTCTAACGTTACTCTCTAATCTTGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCTGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGT ] [-] EMBL AI975028 [ GAATTACACCTATTTCAGTGAGTTGAGCTTCAACCAACTGACGCAAACGAACTTCTTCACCTAAATTTTGCTCAATTGTGTTTAAATTAATTCGTTCAGTACGGCATTTATTAGTAAGCTTTGAAATACGTGATGAAATACCCTCGTTCTCTTGACGCTGGTTGGACAGACTGAGTCGATTGAGGTGATCGTCATGTTGAAGACTGTTTAACTGGTTACGCAATTGTGTTTCCAGTCCACGCATGGACTGTAATTCGGAACGGAGACGTCTAACGTTACTCTCTAATCTTGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCTGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGT ] [-] EMBL CD119476 [ CTAATCATGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGTACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCCGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGTCGACCAGCATCAGTAACATATGTATTTGATATTACTCCATTTACTATCGTAGTCGAGGAATGGTTAAAACGTGCAGTTCGACTGTCAAAATCCAAGTATTGTTTATCAATAGATCTAAAATAGCTGAATGT ] [-] EMBL CD119292 [ CTAATCATGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCCGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGTCGACCAGCATCAGTAACATATGTATTTGATATTACTCCATTTACTATCGTAGTCGAGGAATGGTTAAAACGTGCAGTTCGACTGTCAAAATCCAAGTATTGTTTATCAACAGATCTAAAATAGCTGAAAGT ] [+] EMBL CD116504 [ CTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCCGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGTCGACCAGCATCAGTAACATATGTATTTGATATTACTCCATTTACTATCGTAGTCGAGGAATGGTTAAAACGTGCAGTTCGACTGTCAAAATCCAAGTATTGTTTATCAATAGATCTAAAATAGCTGAAAGTCCATCGAGCTAAACGATCAAAACACGACTGACCAAAGCGAAAAAGTATGAATACCGACCGACTAGAAAAATCTGATGAGAAGTCATTGGACAATGCAACTTCGTGAACTTCTAGGGAATCCTTATGAAAATAATCAAGACTATGTTGAACGTAAGCGTTGTCATTTACCGATGAAGGTGGGAGAGCTTCATAAAGTATTCGAAAATGCATGTAATTTTGTCTTCTGACATTCATCCTTTTAAAATCTCGATAGTTTATATCAGGTACCGTTTTACAGAANATCCCACACAAACTACCGAATAACCAATGCTGTGTGCTGCAAATGGACGGAAAACACAAATGCTGTGAGTGGATTTCGTTGCTTTTGAGTAGAGACTAAATTCGAATATAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||