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Schistosoma mansoni
cluster # 8450 cluster # 8450       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8450#0 length = 1110 sequences # 6  

consensusID : consensus_8450#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1110
fasta sequence
                              [GATGAGTCATATTTAGAAGAGGCCTGAATAAGGGACATAGATGTTGGAATACTCTTTTCAGTTGAATTGCTANATACGCTATTAGGATTATTTGATCCCACANAACTACGCACAGGAATTACACCTATTTCAGTGAGTTGAGCTTCAACCAACTGACGCAAACGAACTTCTTCACCTAAATTTTGCTCAATTGTGTTTAAATTAATTCGTTCAGTACGGCATTTATTAGTAAGCTTTGAAATACGTGATGAAATACCCTCGTTCTCTTGACGCTGGTTGGACAGACTGAGTCGATTGAGGTGATCGTCATGTTGAAGACTGTTTAACTGGTTACGCAATTGTGTTTCCAGTCCACGCATGGACTGTAATTCGGAACGGAGACGTCTAACGTTACTCTCTAATCTTGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCTGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGTCGACCAGCATCAGTAACATATGTATTTGATATTACTCCATTTACTATCGTAGTCGAGGAATGGTTAAAACGTGCAGTTCGACTGTCAAAATCCAAGTATTGTTTATCAATAGATCTAAAATAGCTGAAAGTCCATCGAGCTAAACGATCAAAACACGACTGACCAAAGCGAAAAAGTATGAATACCGACCGACTAGAAAAATCTGATGAGAAGTCATTGGACAATGCAACTTCGTGAACTTCTAGGGAATCCTTATGAAAATAATCAAGACTATGTTGAACGTAAGCGTTGTCATTTACCGATGAAGGTGGGAGAGCTTCATAAAGTATTCGAAAATGCATGTAATTTTGTCTTCTGACATTCATCCTTTTAAAATCTCGATAGTTTATATCAGGTACCGTTTTACAGAANATCCCACACAAACTACCGAATAACCAATGCTGTGTGCTGCAAATGGACGGAAAACACAAATGCTGTGAGTGGATTTCGTTGCTTTTGAGTAGAGACTAAATTCGAATATAT]

[-] EMBL AI974963             [GATGAGTCATATTTAGAAGAGGCCTGAATAAGGGACATAGATGTTGGAATACTCTTTTCAGTTGAATTGCTANATACGCTATTAGGATTATTTGATCCCACANAACTACGCACAGGAATTACACCTATTTCAGTGAGTTGAGCTTCAACCAACTGACGCAAACGAACTTCTTCACCTAAATTTTGCTCAATTGTGTTTAAATTAATTCGTTCAGTACGGCATTTATTAGTAAGCTTTGAAATACGTGATGAAATACCCTCGTTCTCTTGACGCTGGTTGGACAGACTGAGTCGATTGAGGTGATCGTCATGTTGAAGACTGTTTAACTGGTTACGCAATTGTGTTTCCAGTCCACGCATGGACTGTAATTCGGAACGGAGACGTCTAACGTTACTCTCTAATCTTGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCTGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL BF936224             [                                                                             GCTATTAGGATTATTTGATCCCACAAAACTACGCACAGGAATTACACCTATTTCAGTGAGTTGAGCTTCAACCAACTGACGCAAACGAACTTCTTCACCTAAATTTTGCTCAATTGTGTTTAAATTAATTCGTTCAGTACGGCATTTATTAGTAAGCTTTGAAATACGTGATGAAATACCCTCGTTCTCTTGACGCTGGTTGGACAGACTGAGTCGATTGAGGTGATCGTCATGTTGAAGACTGTTTAACTGGTTACGCAATTGTGTTTCCAGTCCACGCATGGACTGTAATTCGGAACGGAGACGTCTAACGTTACTCTCTAATCTTGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCTGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL AI975028             [                                                                                                                   GAATTACACCTATTTCAGTGAGTTGAGCTTCAACCAACTGACGCAAACGAACTTCTTCACCTAAATTTTGCTCAATTGTGTTTAAATTAATTCGTTCAGTACGGCATTTATTAGTAAGCTTTGAAATACGTGATGAAATACCCTCGTTCTCTTGACGCTGGTTGGACAGACTGAGTCGATTGAGGTGATCGTCATGTTGAAGACTGTTTAACTGGTTACGCAATTGTGTTTCCAGTCCACGCATGGACTGTAATTCGGAACGGAGACGTCTAACGTTACTCTCTAATCTTGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCTGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD119476             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTAATCATGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGTACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCCGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGTCGACCAGCATCAGTAACATATGTATTTGATATTACTCCATTTACTATCGTAGTCGAGGAATGGTTAAAACGTGCAGTTCGACTGTCAAAATCCAAGTATTGTTTATCAATAGATCTAAAATAGCTGAATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD119292             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTAATCATGTTACTGGATCTTCCTTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCCGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGTCGACCAGCATCAGTAACATATGTATTTGATATTACTCCATTTACTATCGTAGTCGAGGAATGGTTAAAACGTGCAGTTCGACTGTCAAAATCCAAGTATTGTTTATCAACAGATCTAAAATAGCTGAAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD116504             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTAGGAACACAACCATTAACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCCGTGGTATATCGACGACCGATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGTCGACCAGCATCAGTAACATATGTATTTGATATTACTCCATTTACTATCGTAGTCGAGGAATGGTTAAAACGTGCAGTTCGACTGTCAAAATCCAAGTATTGTTTATCAATAGATCTAAAATAGCTGAAAGTCCATCGAGCTAAACGATCAAAACACGACTGACCAAAGCGAAAAAGTATGAATACCGACCGACTAGAAAAATCTGATGAGAAGTCATTGGACAATGCAACTTCGTGAACTTCTAGGGAATCCTTATGAAAATAATCAAGACTATGTTGAACGTAAGCGTTGTCATTTACCGATGAAGGTGGGAGAGCTTCATAAAGTATTCGAAAATGCATGTAATTTTGTCTTCTGACATTCATCCTTTTAAAATCTCGATAGTTTATATCAGGTACCGTTTTACAGAANATCCCACACAAACTACCGAATAACCAATGCTGTGTGCTGCAAATGGACGGAAAACACAAATGCTGTGAGTGGATTTCGTTGCTTTTGAGTAGAGACTAAATTCGAATATAT]


>consensus_8450#0 GATGAGTCATATTTAGAAGAGGCCTGAATAAGGGACATAGATGTTGGAATACTCTTTTCA GTTGAATTGCTANATACGCTATTAGGATTATTTGATCCCACANAACTACGCACAGGAATT ACACCTATTTCAGTGAGTTGAGCTTCAACCAACTGACGCAAACGAACTTCTTCACCTAAA TTTTGCTCAATTGTGTTTAAATTAATTCGTTCAGTACGGCATTTATTAGTAAGCTTTGAA ATACGTGATGAAATACCCTCGTTCTCTTGACGCTGGTTGGACAGACTGAGTCGATTGAGG TGATCGTCATGTTGAAGACTGTTTAACTGGTTACGCAATTGTGTTTCCAGTCCACGCATG GACTGTAATTCGGAACGGAGACGTCTAACGTTACTCTCTAATCTTGTTACTGGATCTTCC TTAGCACCTCGTTCACGTACTGGTTTCCCACTATTAGATTGCTTAGGAACACAACCATTA ACTGTAGGTTTAGAATTTGGGTAAAGGTTCACTGGATTCTCTGTGGTATATCGACGACCG ATTTGTGATCCAGACGGACTTGAGTCAAGGCACTGTATAGTTCGACGTCGACCAGCATCA GTAACATATGTATTTGATATTACTCCATTTACTATCGTAGTCGAGGAATGGTTAAAACGT GCAGTTCGACTGTCAAAATCCAAGTATTGTTTATCAATAGATCTAAAATAGCTGAAAGTC CATCGAGCTAAACGATCAAAACACGACTGACCAAAGCGAAAAAGTATGAATACCGACCGA CTAGAAAAATCTGATGAGAAGTCATTGGACAATGCAACTTCGTGAACTTCTAGGGAATCC TTATGAAAATAATCAAGACTATGTTGAACGTAAGCGTTGTCATTTACCGATGAAGGTGGG AGAGCTTCATAAAGTATTCGAAAATGCATGTAATTTTGTCTTCTGACATTCATCCTTTTA AAATCTCGATAGTTTATATCAGGTACCGTTTTACAGAANATCCCACACAAACTACCGAAT AACCAATGCTGTGTGCTGCAAATGGACGGAAAACACAAATGCTGTGAGTGGATTTCGTTG CTTTTGAGTAGAGACTAAATTCGAATATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)