These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8528#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1090 fasta sequence [GGCAACTGCATCACAAGAAGAAGTACTTGTAGTAGCATGTGAACTCGAGTAGTGTATGTTAAGCTGTTGCGTCAAAGTTTCTAACAGGCGCATTTGTGCGTCAAGTTGTGCTTGCTGTTGCTGTAGTATTCGGCTGAGCTGGTCATCTGATATAGGCATTTTGAATGAATTTTCCTTTTTCCTCGTCGCCACTGTTATAATTG--TGTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTCTTATACGATGACACTCGACAAGACCCCAAAATCAGAACACTTTCAACAGGAATGAAATTGTATTCAAGATAATAATGATAAGTGAACATCAATCACTAGTTTGAATAACGTTCATATATTTATAGTATATACATAAGAAGCTTCTAGATTTTTCTCCAATAATATGCCCGGGCTGATCGGTTTAGAATTAGCCAATCAGCGCGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA-GGGGCTTTGAAACACAACA-TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCATTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTTTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGAGTAATGTCGCTCATATTAACAATCTTACGAAGGTTCACACCATCAGTGTTCGGTCATACGTATGTGATTCACTGCAAGCTTGATTGCATTCGTATATTCAAAGTATTATCACCATATCATATGAATTTAATTATATGGCTTTAATGCTATTAAACTTTGGTTTGTGATTTTTGTCTTCAGGTTTTAGATGAAGAGGCAGAAGTATTTGTAGTAAAAATGTGGCGTCTGTTAATATATGTGATTGCAGAGAAAAAAGCTGGACTAAGTGCTTAAATAACATACTCAGATGACTTACTTTTGTACAAATGTTTTTTATTCTGATTTGTATAAATAAATTGTAT] [+] EMBL CD199310 [GGCAACTGCATCACAAGAAGAAGTACTTGTAGTAGCATGTGAACTCGAGTAGTGTATGTTAAGCTGTTGCGTCAAAGTTTCTAACAGGCGCATTTGTGCGTCAAGTTGTGCTTGCTGTTGCTGTAGTATTCGGCTGAGCTGGTCATCTGATATAGGCATATTGAATGAATTTTCCTTTTTCCCCGTCGCCACTGTTATAATTGTATTTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTC ] [+] EMBL CD114860 [ TTTGAATGAATTTTCCTTTTTCCTCGTCGCCACTGTTATAATTG TGTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTCTTATACGATGACACTCGACAAGACCCCAAAATCAGAACACTTTCAACAGGAATGAAATTGTATTCAAGATAATAATGATAAGTGAACATCAATCACTAGTTTGAATAACGTTCATATATTTATAGTATATACATAAGAAGCTTCTAGATTTTTCTCCAATAATATGCCCGGGCTGATCGGTTTAGAATTAGCCAATCAGCGCGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA GGGGCTTTGAAACACAACA TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCATTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTTTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGAGTAATGTCGCTCATATTAACAATCTTACGAAGGTTCACACCA ] [+] EMBL CD114861 [ TTTGAATGAATTTTCCTTTTTCCTCGTCGCCACTGTTATAATTG TGTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTCTTATACGATGACACTCGACAAGACCCCAAAATCAGAACACTTTCAACAGGAATGAAATTGTATTCAAGATAATAATGATAAGTGAACATCAATCACTAGTTTGAATAACGTTCATATATTTATAGTATATACATAAGAAGCTTCTAGATTTTTCTCCAATAATATGCCCGGGCTGATCGGTTTAGAATTAGCCAATCAGCGCGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA GGGGCTTTGAAACACAACA TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCATTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTNTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGAGTAAT ] [+] EMBL CD114939 [ TTTGAATGAATTTTCCTTTTTCCTCGTCGCCACTGTTATAATTG TGTTTTGCTATATAAACGACCCAGCTATTCCTATTGCTTAGTATTCTTATACGATGACACTCGACAAGACCCCAAAATCAGAACACTTTCAACAGGAATGAAATTGTATTCAAGATAATAATGATAAGTGAACATCAATCACTAGTTTGAATAACGTTCATATATTTATAGTATATACATAAGAAGCTTCTAGATTTTTCTCCAATAATATGCCCGGGCTGATCGGTTTAGAATTAGCCAATCAGCGCGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATANGGGGCTTTGAAACACAACATTTTTTGGTCACTT ] [-] EMBL CD115079 [ CGCAGCAACACCATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA GGGGCTTTGAAACACAACA TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCACTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTTTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGAGTAATGTCGCTCATATTAACAATCTTACGAAGGTTCACACCATCAGTGTTCGGTCATACGTATGTGATTCACTGCAAGCTTGATTGCATTCGTATATTCAAAGTATTATCACCATATCATATGAATTTAATTATATGGCTTTAATGCTATTAAACTTTGGTTTGTGATTTTTGTCTTCAGGTTTTAGATGAAGAAGCAGAAGTATTTGTAGTAAAAATGTGGCGTCTGTTAATATATGTGATTGCAGAGAAAAAAGCTGGACTAAGTGCTTAA ] [-] EMBL CD115011 [ CATCATGCATGAAACATGCTTTAATCCAATCTATGTCCCACTAACATA GGGGCTTTGAAACACAACA TTTTTGGTCACTTTAGTTATGGTTGTAACTGACGCTCACTTTTCGGAGCACTTGCAAAGTTTACAATGATCGTGAAAGGATTACTTTGAAGAATCATGCTTAGACACTTTTGAGCTTCGAGCTACATTAGACAAACAGATTATGGTTTCTGAAAATATGTCCAACCTATCATTTTAGTGATCATTAATTGTCTACTGAGTGGAAAACTACTAGTTTTTTGGGTAATGTCGCTCATATTAACAATCTTACGAAGGTTCACACCATCAGTGTTCGGTCATACGTATGTGATTCACTGCAAGCTTGATTGCATTCGTATATTCAAAGTATTATCACCATATCATATGAATTTAATTATATGGCTTTAATGCTATTAAACTTTGGTTTGTGATTTTTGTCTTCAGGTTTTAGATGAAGAGGCAGAAGTATTTGTAGTAAAAATGTGGCGTCTGTTAATATATGTGATTGCAGAGAAAAAAGCTGGACTAAGTGCTTAA ] [-] EMBL AI975974 [ ttgccatGGTTTTAGATGAAGAGGCAGAAGTATTTGTAGTAAAAATGTGGCGTCTGTTAATATATGTGATGGCAGAAAAAAAAGCTGGAATAAGTGCTTAAATAACATACTCAGATGACTTACTTTTGTACAAATGTTTTTTATTCTGATTTGTATAAATAAATTGTAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||