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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8529#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1136 fasta sequence
[TCGAAGTATTCGGAGCCTGTGTTACTCATTAGTATCGCTCCTTTTATCATATTGTGCCTGATACCAGATTTGAACAAACACCGTGGCTTCCTCAAGGTTCTCCTCGCATTTGCAGCTGGCGGTTTACTGGGAGATGCATTTCTTCACTTGATTCCTCATGCACTGGAGAGTGGACATTCTAATCCTAACCACACTCACGAGGAAAATATTAAAGACGAACATGGTCACAAGCGTCACTCCTACGTTGGGCTTTATGTTGTTGGTGGAATTTTCGCGTTCTTGTGTGTCGAAAAATGTATCCGACTTTTTAGAAATGACCATTGTGGAGGGCACACTCATCATGCAGTGTCTAATGTTGATGGTGAAAATAAAGGAAAGAATAAGAAAAAAGGGGAAGATAACAAAAGTGGAGCTAAAACTAAACCTACTGACTTCAAAGTCGCTGGATATCTTAACTTGGCAGCAGATTTTACGCACAATTTTACTGATGGGTTAGCTATTGGCGGATCCTTTCTGGTTAGTAGGAATGTTGGTTTTCTGACCACTTTTACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCTTCACGTAAAGCTATGCTTCTTCAGTTGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCACGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGCTAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATCTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTACTAATACACCAAAAACACGAAACAATGGATTCAAATCATTCGTCCAAAGTTTACTTGAAATAATTTCTTTAATTGGCGGCGTTGCAATGATGGCTGCTATCGGAACATTGGAATAAAATGTGAACAAGTATATAATTTATCTCTGTAGAGAAAAAAAAACTAGGTTGATATGACTAATGTATTATAGTTCATCTTTCTGTTTGTGCATGCTGGTACTTTTTTGCTGCAATCTAGTCCTCGTATCCTGATTTNCCACCCTTGCCCAGGGTACCGA]
[-] EMBL CD168727 [TCGAAGTATTCGGAGCCTGTGTTACTCATTAGTATCGCTCCTTTTATCATATTGTGCCTGATACCAGATTTGAACAAACACCGTGGCTTCCTCAAGGTTCTCCTCGCATTTGCAGCTGGCGGTTTACTGGGAGATGCATTTCTTCACTTGATTCCTCATGCACTGGAGAGTGGACATTCTAATCCTAACCACACTCACGAGGAAAATATTAAAGACGAACATGGTCACAAGCGTCACTCCTACGTTGGGCTTTATGTTGTTGGTGGAATTTTCGCGTTCTTGTGTGTCGAAAAATGTATCCGACTTTTTAGAAATGACCATTGTGGAGGGCACACTCATCATGCAGTGTCTAATGTTGATGGTGAAAATAAAGGAAAGAATAAGAAAAAAGGGGAAGATAACAAAAGTGGAGCTAAAACTAAACCTACTGACTTCAAAGTCGCTGGATA ]
[+] EMBL CD131242 [ CATTGTGGAGGGCACACTCATCATGCAGTGTCTAATGTTGATGGTGAAAATAAAGGAAAGAATAAGAAAAAAGGGGAAGATAACAAAAGTGGAGCTAAAACTAAACCTACTGACTTCAAAGTCGCTGGATATCTTAACTTGGCAGCAGATTTTACGCACAATTTTACTGATGGGTTAGCTATTGGCGGATCCTTTCTGGTTAGTAGGAATGTTGGTTTTCTGACCACTTTTACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCTTCACGTAAAGCTATGCTTCTTCAGTTGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCATGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGCTAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATCTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTACTAATACACC AAAACACGAAACAATGGATTC AATCATTCGTCCAAAGTT ]
[+] EMBL CD130482 [ tgtgACTAAACCTACTGACTTCAAAGTCACTGGATATCTTAACTTGGCAGCAGATTTTACGCACAATTTTACTGATGGGTTAGCTATTGGCGGATCCTTTCTGGTTAGTAGGAATGTTGGTTTTCTGACCACTTTTACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCTTCACGTAAAGCTATGCTTCTTCAGTTAGTCAC ]
[+] EMBL CD130450 [ CTTCAAAGTCACTGGATATCTTAACTTGGCAGCAGATTTTACGCACAATTTTACTGATGGGTTAGCTATTGGCGGATCCTTTCTGGTTAGTAGGAATGTTGGTTTTCTGACCACTTTTACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCTTCACGTAAAGCTAT ]
[-] EMBL CD129504 [ TACAGTTCTGTTACATGAACTTCCACATGAGATCGGAGACTATGCAATACTTATACAATCCGGATTTTCCTCACGTAAAGCTATGCTTCTTCAGTTGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCACGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGCTAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATCTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTACTAATACACCAAAAACACGAAACAATGGATTCAAATCATTCGTCCAAAGTTTACTTGAAATAATTTCTTTAATTGGCGGCGTTGCAATGATGGCTGCTATCGGAACATTGGAATAAAATGTGAACAAGTATATAATTTATCTCTGTAGAGAAAAAAAAACTAGGTTGATATGACTAATGTATTATAGTTCATCTTTCTGTTTGTGCATGCTGGTACTTTTTTGCTGCAATCTAGTCCTCGTATCCTGATTTNCCACCCTTGCCCAGGGTACCGA]
[+] EMBL CD156165 [ TTGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCACGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGCTAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATCTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTACTAATACACCAAAAACACGAAACAATGGATTCAAATCATTCGTCCAAAGTTTACTTGAAATAATTTCTTTGATTGGCGGCGTTGCAATGATGGCTGCTATCGGAACATTGGAATAAAATGTGAACAAGTATATA ]
[-] EMBL CD156386 [ TGGTCACTGCTGTTGGTGCACTTCTGGGTTCATCTGTCAGCTTACTTGCTGCACGTGTTAGTATTGGTCCTATTGTTTTTGATGATAATATACTACCAGTTGTAACAGATGATATTGTTATTGGTTGCATTTTACCATTTACTGCCGGTGGTTTTATGTACATAGCTATGACTTCTGTGTTACCCGACCTGTTGGCAGCTAATAATAACACCAGTACTAGTAATACACCAAAAACACGAAACAATGGATTCAAATCATTCGTCCAAAGTTTACTTGAAATAATTTCTTTAATTGGCGGCGTTGCAATGATGGCTGCTATCGGAACATTGGAATAAAATGTGAACAAGTATATAA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||