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Schistosoma mansoni
cluster # 8569 cluster # 8569       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8569#0 length = 754 sequences # 7  
consensusID : consensus_8569#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 754
fasta sequence 
                              [CAGAGATTTACTTTACATGAAAATAACTATTAAAACTAT----TATATATATATATATATATATATATATATATATGAAGCAAGCTTTAAAATAATGGAAAATGAAAGGCTATCGATTTCGGATCAACTATGAGTGAGAAGGGTTCAACTTGAATTTAAAAAGTTAGATTGGTTTCAGTGCAACAGAACAACGATACTGTCTTGAAAATAATAAAAAAATTGTAAAT-GTTTAGTTATTTACAAGCATAACATTTTAACATATGTCAGCGGCTTATTTTACTATCATTAACAATAGTAATAATCTACTGACTGTCTGATACACAGTACAAAGGAACTATAATACTAGTCATAAGTTAAAATTAGATTCAAACTTATGACTACTATACAAAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTAGTCTTTGTATGATATAATTAAGAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTGTGAACTGAGTTGTAGATGAAGAAC-CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTTTATTAGCAAAACTTTCTAAATTGATATGACGTAATAAGTTTGCGCTGGCTAATAGAATTGCTGTTGGATTAGCCATGTTTTTGCCTGATGCCAAATTGAATGAATGCCTAGTGCCTGGTTCAAAAACTGCGAATTCATGACTATATGATACACCCGGTACAACCCCAGCACCACCGACCAGAAGC]

[+] EMBL CD073462             [CAGAGATTTAATTTACATGAAAATAACTATTAAAACTAT    TATATATATATATATATATATATATATATATATGAAGCAAGCTTTAAAATAATGGAAAATGAAAGGCTATCGATTTCGGATCAACTATGAGTGAGAAGGGTTCAACTTGAATTTAAAAAGTTAGATTGGTTTCAGTGCAACAGAACAACGATACTGTCTTGAAAATAATAAAAAAATTGTAAAT GTTTAGTTATTTACAAGCATAACATTTTAACATATGTCAGCGGCTTATTTTACTATCATTAACAATAGTAATAATCTACTGACTGTCTGATACACAGTACAAAGGAACTATAATACTAGTCATAAGTTAAAATTAGATTCAAACTTATGACTACTATACAAAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTAGTCTTTGTATGATATAATTAAAAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTGTGAACTGAGTTGTAAATGAAGAAC CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTTTATTAGCAAAACTTTCTAAATTGATATGACGTAATAAGTTTGCGCTGGC                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD077295             [CAGAGATTAACTTTACATGAAAATAACTATTAAAACTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATGAAGCAAGCTTTAAAATAATGGAAAATGAAAGGCTATCGATTTCGGATCAACTATGAGTGAGAAGGGTTCAACTTGAATTTAAAAAGTTAGATTGGTTTCAGTGCAACAGAACAACGATACTGTCTTGAAAATAATAAAAAAATTGTAAAT GTTTAGTTATTTACAAGCATAACATTTTAACATATGTCAGCGGCTTATTTTACTATCATTAACAATAGTAATAATCTACTGACTGTCTGATACACAGTACAAAGGAACTATAATACTAGTCATAAGTTAAAATTAGATTCAAACTTATGACTACTATACAAAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTAGTCTTTGTATGATATAATTAAGAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTGTGAACTGAGTTGTAGATGAAGAAC CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTNTAAGTAAAGCTGTTTCAATTNTATTAGCAAAACTTTCTAAATTGATATGACGTAATAAGTTTG                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD076976             [CAAAGATTTCCTTTACATGAAAATAACTATTAAAACTAT    TATATATATATATATATATATATATATATATATGAAGCAAGCTTTAAAATAATGGAAAATGAAAGGCTATCGATTTCGGATCAACTATGAGTGAGAAGGGTTCAACTTGAATTTAAAAAGTTAGATTGGTTTCAGTGCAACAGAACAACGATACTGTCTTGAAAATAATAAAAAAATTGTAAATCGCTTAGTTATTTACAAGCATAACATTTTAACATATGTCAGCGGCTTATTTTACTATCATTAACAATAGTAATAATCTACTGACTGTCTGATACACAGTACAAAGGAACTATAATACTAGTCATAAGTTAAAATTAGATTCAAACTTATGACTACTATACAAAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTACTCTTTGTATGATATAATTAAGAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTGTGAACTGAGTTGTANATGAAGAAC CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTACACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTCTATTAGCAAAACTTTCTAAATTGATATGACGTAATAAGTTTGCG                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD075385             [                                            ATATATATATATATATATATATATATATATATGAAGCAAGCTTTAAAATAATGGAAAATGAAAGGCTATCGATTTCGGATCAACTATGAGTGAGAAGGGTTCAACTTGAATTTAAAAAGTTAGATTGGTTTCAGTGCAACAGAACAACGATACTGTCTTGAAAATAATAAAAAAATTGTAAAT GTTTAGTTATTTACAAGCATAACATTTTAACATATGTCAGCGGCTTATTTTACTATCATTAACAATAGTAATAATCTACTGACTGTCTGATACACAGTACAAAGGAACTATAATACTAGTCATAAGTTAAAATTAGATTCAAACTTATGACTACTATACAAAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTAGTCTTTGTATGATATAATTAAGAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTGTGAACTGAGTTGTAGATGAAGAAC CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTTTATTAGCAAAACTTTCTAA                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD178772             [                                                                                                                                                       GAATTTAGAAAGTTAGATTGGTTTCAGTGCAACAGAACAACGATACTGTCTTGAAAATAATAAAAAAATTGTAAAT GTTTAGTTATTTACAAGCATAACATTTTAACATATGTCAGCGGCTTATTTTACTATCATTAACAATAGTAATAATCTACTGACTGTCCGATACACAGTACAAAGGAACTATAATACTAGTCATAAGTTAAAATTAGATTCAAACTTATGACTACTATACAAAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTAGTCTTTGTATGATATAATTAAGAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTGTGAACTGAGTTGTAGATGAAGAAC CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTTTATTAGCAAAACTTTCTAAATTGATATGACGTAATAAGTTTGCGCTGGCTAATAGAATTGCTGTTGGATTAGCCATGTTTTTGCCTGATGCC                                                                                             ]
[-] EMBL AA566209             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATACTAGTCATAAGTT AAATTAGATTC AAC TATGACTACTATAC AAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAAGGTTAGAGTAGTCTTTGTATGATATAATTAAGAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTCTTGGAACTGAGTTGTAGATGAAGAACACACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTTTATTAGCAAAACTTTCTAAAT                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD131149             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGCTTCTGTGAACTGAGTTGTAGATGAAGAAC CACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTTAATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTTTATTAGCAAAACTTTCTAAATTGATATGACGTAATAAGTTTGCGCTGGCTAATAGAATTGCTGTTGGATTAGCCATGTTTTTGCCTGATGCCAAATTGAATGAATGCCTAGTGCCTGGTTCAAAAACTGCGAATTCATGACTATATGATACACCCGGTACAACCCCAGCACCACCGACCAGAAGC]




>consensus_8569#0
CAGAGATTTACTTTACATGAAAATAACTATTAAAACTATTATATATATATATATATATAT
ATATATATATATGAAGCAAGCTTTAAAATAATGGAAAATGAAAGGCTATCGATTTCGGAT
CAACTATGAGTGAGAAGGGTTCAACTTGAATTTAAAAAGTTAGATTGGTTTCAGTGCAAC
AGAACAACGATACTGTCTTGAAAATAATAAAAAAATTGTAAATGTTTAGTTATTTACAAG
CATAACATTTTAACATATGTCAGCGGCTTATTTTACTATCATTAACAATAGTAATAATCT
ACTGACTGTCTGATACACAGTACAAAGGAACTATAATACTAGTCATAAGTTAAAATTAGA
TTCAAACTTATGACTACTATACAAAAAGCATATGTCTAATAGATAACTGTTTAAGTTAAA
GGTTAGAGTAGTCTTTGTATGATATAATTAAGAAATATGAGCTTGTTCTAGAACTGCTTC
TGTGAACTGAGTTGTAGATGAAGAACCACCGATATCAGAAGTTAATGCTTTCTTAGACTT
AATAATTTTAAGTAAAGCTGTTTCAATTTTATTAGCAAAACTTTCTAAATTGATATGACG
TAATAAGTTTGCGCTGGCTAATAGAATTGCTGTTGGATTAGCCATGTTTTTGCCTGATGC
CAAATTGAATGAATGCCTAGTGCCTGGTTCAAAAACTGCGAATTCATGACTATATGATAC
ACCCGGTACAACCCCAGCACCACCGACCAGAAGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)