These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8623#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1280 fasta sequence [ACAATACGGATAAAATTGTAGCTACAAAAACAAAGGAAGAGATATCTCTCGACAAAAAGTCACCCGACAGTGAAGTAATCCTTAGACACGGTCATGTTAGAACAATTCCTGCTACTGAGTTAGTACAACAACAGTTTATTGGCTCAGGAGCATTTGGAAAAGTTTATCGAGGTCTTTGGCGTGAACAAGATATTGCACTAAAAGTATTTGATCTAGCTACAAATCAGGTAGACAATGAAGCTTTGCATCTGTGCAGATTATCTCATCGGAACATTGTGAGATTTTATGGGATCTGTAGGTTAGACAACTCTAATTCCCCAGCACTTGTAATGGAATATGCTTATGGTGGTTCGCTGAACATGGTTCTCAACCAACGACCTTTATTAGGTCCCCTTGTTTTACTTGACTGGGCATTACAGATCGCTAGTGGAATGGCATATTTACATACAGATGCCAGAATTTGTCATCGAGATTTAAAATCATCTAACATTCTTATCAGAGAAGCTGTTCANAAACCATTTTCTCTAAATGAACTTCANAGGTGTACCCTATTGATAACTGATTTCGGAATGGCTTGTCGTTCTAGTCAACTTGCACCACAACAATCTAAATTAGGCACTGTTGCATATGCAGCTCCAGAAGTTTGTCGTCAAGAGGGATTTTCTTTCAAATCGGATATTTGGTCATATGGTGTTGTGTTATGGGAGTTGCTTACATTAGATATACCATTTCGTGCAATGGAGCAACCTAGATTATTGTTTATTATTGCAATGTATAATTATACTCTGTACGTACCACCAGGTGTTCCAGATCTCTTTGTCCAATTACTTAAAGATTGCTGGTCACCTACTCCTGATAGTAGACCTAAATTTGAAAATATTATGGCTCGACTTAAATCATGCAAAGATTGCAGTTTCGTCGATTTAGAACCTAGTGAATTAGCTCAAATTCAACAGAATTGGCGTGAACTTATAGCAGTCCACTATAAAGAAGAACAACAGACTGTAGCTGAAGCACTATCATCATCGTTCAGAAGTGGAAGTTTAGATTTTTCAACAGAACTTTTAACACAGCTGGAAATGTTACGTGATTATCGCGAATCTCTGGATAGGGTCAGAGCAGATTTAGTGGAAAAAGCCCATCAGCTTCATATAAAAGAAGAATTTGTAT-ATCGAGTGGCTGACACCATGGGTCAACATTTTATGTTTTTGGCTGTACTGGCTGCTAATCATTTTAAAGATCCTACTCATAAAATTCAAACTGCTCAACCTAAACCTCCT] [+] EMBL CD170629 [ACAATACGGATAAAATTGTAGCTACAAAAACAAAGGAAGAGATATCTCTCGACAAAAAGTCACCCGACAGTGAAGTAATCCTTAGACACGGTCATGTTAGAACAATTCCTGCTACTGAGTTAGTACAACAACAGTTTATTGGCTCAGGAGCATTTGGAAAAGTTTATCGAGGTCTTTGGCGTGAACAAGATATTGCACTAAAAGTATTTGATCTAGCTACAAATCAGGTAGACAATGAAGCTTTGCATCTGTGCAGATTATCTCATCGGAACATTGTGAGATTTTATGGGATCTGTAGGTTAGACAACTCTAATTCCCCAGCACTTGTAATGGAATATGCTTATGGTGGTTCGCTGAACATGGTTCTCAACCAACGACCTTTATTAGGTCCCCTTGTTTTACTTGACTGGGCATTACAGATCGCTAGTGGAATGGCATATTTACATACAGATGCCAGAATTTGTCATCGAGATTTAAAATCATCTAACATTCTTATCAGAGAAGCTGTTCANAAACCATTTTCTCTAAATGAACTTCANAGGTGTACCCTATTGATAACTGATTTCGGAATGGCTTGTCGTTCTAGTCAACTTGCACCACAACAATCTAAATTAGGCACTGTTGCATATGCAGCTCCAGA ] [+] EMBL CD170577 [ACAATACGGATAAAATTGTAGCTACAAAAACAAAGGAAGAGATATCTCTCGACGAAAAGTCACCCGACAGTGAAGTAATCCTTAGACACGGTCATGTTAGAACAATTCCTGCTACTGAGTTAGTACAACAACAGTTTATTGGCACAGGAGCATTTGGAAAAGTTTATCGAGGTCTTTGGCGTGAACAAGATATCGCACTAAAAGTATTTGATCTAGCTACAAATCAGGTAGACAATGAAGCTTTGCATCTGTGCAGATTATCTCATCGGAACATTGTGAGATTTTATGGGATCTGTAGGTTAGACAACTCTAATTCCCCAGCACTTGTAATGGAATATGCTTATGGTGGTTCGCTGAACATGGTTCTCAACCAACGACCTTTATTAGGTCCCCTTGTTTTACTTGACTGGGCATTACAGATCGCTAGTGGAATGGCATATTTACATACAGATGCCAGAATTTGTCATCGAGATTTAAAATCATCTAACATTCTTATCAGAGAAGCTGTTCAAAAACCATTNTCTCTAAATGAACTTCAAAGGTGTACCCTATTGATAACTGATTTCGGAATGGCTCGTCGNTCTAGCCAACTTGCACCACAACAATCT AATTANGCACTGTTGCATATGCAGCTCCAGA ] [+] EMBL CD170656 [ACAATACGGATAAAATTGTAGCTACAAAAACAAAGGAAGAGATATCTCTCGACAAAAAGTCACCCGACAGAGAAGTAATCCTTAGACACGGTCATGTTAGAACAATTCCTGTTACTGAGTTAGTACAACAACAGTTTATTGGTTCAGGAGCATTTGGAAAAGTTTATCGAGGCCTTTGGCGTGAACAAGATATTGCACTAAAAGTATTTGATCTAACTACAAATCAGGTAGACAATGAAGCTCTGCATCTGTGCATATTATCTCATCGGAACATTGCGAGA ] [+] EMBL CD161721 [ ACAACAATCTAAATTAGGCACTGTTGCATATGCAGCTCCAGAAGTTTGTCGTCAAGAGGGATTTTCTTTCAAATCGGATATTTGGTCATATGGTGTTGTGTTATGGGAGTTGCTTACATTAGATATACCATTTCGTGCAATGGAGCAACCTAGATTATTGTTTATTATTGCAATGTATAATTATACTCTGTACGTACCACCAGGTGTTCCAGATCTCTTTGTCCAATTACTTAAAGATTGCTGGTCACCTACTCCTGATAGTAGACCTAAATTTGAAAATATTATGGCTCGACTTAAATCATGCAAAGATTGCAGTTTCGTCGATTTAGAACCTAGTGAATTAGCTCAAATTCAACAGAATTGGCGTGAACTTATAGCAGTCCACTATAAAGAAGAACAACAGACTGTAGCTGAAGCACTATCATCATCGTTCAGAAGTGGAAGTTTAGATTTTTCAACAGAACTTTTAACACAGCTGGAAATGTTACGTGATTATCGCGAATCTCTGGATAGGGTCAGAGCAGATTTAGTGGAAAAAGCCCATCAGCTTCATATAAAAGAAGAATTTGTAT ATCGA ] [+] EMBL CD181793 [ TATTGTTTATTATTGCAATGTATAATTATACTCTGTACGTACCACCAGGTGTTCCAGATCTCTTTGTCCAATTACTTAAAGATTGCTGGTCACCTACTCCTGATAGTAGACCTAAATTTGAAAATATTATGGCTCGACTTAAATCATGCAAAGATTGCAGTTTCGTCGATTTAGAACCTAGTGAATTAGCTCANATTCAACAGAATTGGCGTGAACTTATAGCAGTCCACTATTAAGAAGAAACACAGACTGTAGCTGAAGCACTATCATCATCGTTCAGAAGTGGAAGTTTAGATTTTTC ACAGAACTTTT ACACAGCTGGAAATG TACGTGA TATCGCGA ] [+] EMBL CD066546 [ CCAGATCTCTTTGTTCAATTACTTAAAGATTGATGGTCACCTACTCCTGATAGTACACCTAAATTTGAACATATTATGGCTCGACTTAGATCATGCAAAGAT ] [+] EMBL CD191866 [ CCTAGTGAATTAGCTCAAATTCAACAGAATTGGCGTGAACTTATAGCAGTCCACTATAAAGAAGAACAACAGACTGTAGCTGAAGCACTATCATCATCGTTCAGAAGTGGAAGTTTAGATTGTTCAACAGAACTTTTAACACAGCTGGAAATGTTACGTGATTATCGCGAATCTCTGGATAGGGTCAGAGCAGATTTAGTGGAAAAAGCCCATCAGCTTCATATAAAAGAGGAA TTGTATAATCGAGTGGCTGACACCATGGGTCAACATTTTATGTTTTTGGCTGTACTGGCTGCTAATCATTTTAAAGATCCTACTCATAAAATTCAAACTGCTCAACCTAAACCTCCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||