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Schistosoma mansoni
cluster # 8640 cluster # 8640       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8640#0 length = 888 sequences # 7  
consensusID : consensus_8640#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 888
fasta sequence 
                              [GAAGCAAATAATTTCAAATTCCAATCAGAAAAATCTCAAGAAGAAGTTACACGTTTACGTGAAGAATTAGAGAATAAAACTACACGATTGGAAACATTAGAGAAAACTACAGAGAAACGTGAACAAGCAAAAGAAGATTTACGCGGTTTAGAAGAGACTGTTATTAAAGAATTACAAACATTGCATAATCTACGACGTTTATTCATACAAGATCTTAATTGTCGAATTAAAAAGTCTGCCAATCGTGTAAATGCGTTAACTGCAGCTGAAAAAGCCACTGTTAATAATAATAATAATAATAGTAATAATAATACTAACCAAGGTGGTAATACACCGAACGCTGCTGGTGGTATACCAGGACAACAACAAATCTCTGAAAGTCTACTTATGGATGATGACGATGATGATGAACCAATTCAAGTTGGTACATTAGCACAACGCGAAAAAATTGCATTTCTTGAAAATAATTTAGATAAATTAACAAAAGTACATAAACAACTTGTTCATGATAATGCAGAATTACGTTGTGAATTACCGAAAATGGAAAAACGTTTAAAGAGTACCTTGGAACGTGTACGTAGTTTAGAATTATCATTGAAAGAAGCTAAAGAAGGTGCTATGCGTGATCGTAAACGTTATCAAGTTGAAGTGGAACGAATAAAAGAAGTTGTACGTCAACGTAATGTTACAGCACGT-CGTGGTCAATCACAAATAGCTAAACCAATACGTGCAGGACATGCTCCAATTACTAATCTTCATGGTGTTAGTGGTGTTGGTGGTGCATCAATTAATTCACAACCAGTTGTACGACCAGATCTTCTCGGTGCACCATGATCATAATGCTGATATTATTTTTTTTGTCTGTGTTTAACCTTTCTCTCTATCTGT]

[+] EMBL AI976425             [GAAGCAAATAATTTCAAATTCCAATCAGAAAAATCTCAAGAAGAAGTTACACGTTTACGTGAAGAATTAGAGAATAAAACTACACGATTGGAAACATTAGAGAAAACTACAGAGAAACGTGAACAAGCAAAAGAAGATTTACGCGGTTTAGAAGAGACTGTTATTAAAGAATTACAAACATTGCATAATCTACGACGTTTATTCATACAAGATCTTAATTGTCGAATTAAAAAGTCTGCCAATCGTGTAAATGCGTTAACTGCAGCTGAAAAAGCCACTGTTAATAATAATAATAATAATAGTAATAATAATACTAACCAAGGTGGTAATACACCGAACGCTGCTGGTGGTATACCAGGACAACAACAAATCTCTGAAAGTCTACTTATGGATGATGACGATGATGATGAACCAATTCAAGTTGGTACATTAGCACAACGCGAAAAAATTGCATTTCTTGAAAATAATTTAGATAAATTAACANAAGTACATAAACAACTTGTTCATGATAATGCAGAATTACGTTGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD188797             [                                                                                TACACGATTGGAAACATTAGAGAAAACTACAGAGAAACGTGAACAAGCAAAAGAAGATTTACGCGGTTTAGAAGAGACTGTTATTAAAGAATTACAAACATTGCATAATCTACGACGTTTATTCATACAAGATCTTAATTGTCGAATTAAAAAGTCTGCCAATCGTGTAAATGCGTTAACTGCAGCTGAAAAAGCCACTGT   TAATAATAATAATAATAGTAATAATAATACTAACCAAGGTGGTAATACACCGAACGCTGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD189008             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AACGCTGCTGGTGGTATACCAGGACAACAACAAATCTCTGAAAGTCTACTTATGGATGATGACGATGATGATGAACCAATTCAAGTTGGTACATTAGCACAACGCGAAAAAATTGCATTTCTTGAAAATAATCTAGATAAATTAACAAAAGTACATAAACAACTTGTTCATGATAATGCAGAATTACGTTGTGAATTACCGAAAATGGAAAAACGTTTAAAGAGTACCTTGGAACGTGTACGTAGTTTAGAATTATCATTGAAAGAAGCTAAAGAAGGTGCTATGCGTGATCGTAAACGTTATCAAGTTGAAGTGGAACGAATAAAAGAAGTTGTACGTCAACGTAATGTTACAGCACGT CGTGGTCAATCACAAATAGCTAAAC                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD132370             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CATTTCTTGAAAATAATTTAGATAAATTAACAAAAGTACATAAACAACTTGTTCATGATAATGCAGAATTACGTTGTGAATTACCGAAAATGGAAAAACGTTTAAAGAGTACCTTGGAACGTGTACGTAGTTTAGAATCATCATTGAAAGAAGCTAAAGAAGGTGCTATGCGTGATCGTAAACGTTATCAAGTTGAAGTGGAACGAATAAAAGAAGTTGTACGTCAACGTAATGTTACAGCACGTACGTGGTCAATCACAAATAGCTAAAC                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD178887             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CGTTGTGAATTACCGAAAATGGAAAAACGTTTAAAGAGTACCTTGGAACGTGTACGTAGTTTAGAATTATCATTGAAAGAAGCTAAAGAAGGTGCTATGCGCGATCGTAAACGTTATCAAGTTGAAGTGGAACGAATAAAAGAAGTTGTACGTCAACGTAATGTTACGGCACGT CGTGGTCAATCACAAATAGCTAAACCAATACGTGCAGGACATGCTCCAATTACTAATCTTCATGGTGTTAGTGGTGTTGGTGGTGCATCAATTAATTCACAACCAGTTGTACGACCAGATCTTCTCGGTGCACCATGATCATAATGCTGATATTATTTTTTTTGT                           ]
[+] EMBL CD201834             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CGTTGTGAATTACCGAAAATGGAAAAACGTTTAAAGAGTACCTTGGAACGTGTACGTAGTTTAGAACTATCATTGAAAGAAGCTAAAGAAGGTGCTATGCGTGATCGTAAACGTTATCAAGTTGAAGTGGAACGAATAAAAGAAGTTGTACGTCAACGTAATGTTACAGCACGT CGTGGTCAATCACAAATAGCTAAACCAATACGTGCAGGACATGCTCCAATTACTAATCTTCATGGTGTTAGTGGTGTTGGTGGTGCATCAATTAATTCACAACCAGTTGTACGACCAGATCTTCTCGGTGCACCATGATCATAATGCTGATATTA                                     ]
[-] EMBL CD177718             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACAGCACGT CGTGGTCAATCACAAATAGCTAAACCAATACGTGCAGGACATGCTCCAATTACTAATCTTCATGGTGTTAGTGGTGTTGGTGGTGCATCAATTAATTCACAACCAGTTGTACGACCAGATCTTCTCGGTGCACCATGATCATAAAGCTGATATTATTTTTTTTGTCTGTGTTTAACCTTTCTCTCTATCTGT]




>consensus_8640#0
GAAGCAAATAATTTCAAATTCCAATCAGAAAAATCTCAAGAAGAAGTTACACGTTTACGT
GAAGAATTAGAGAATAAAACTACACGATTGGAAACATTAGAGAAAACTACAGAGAAACGT
GAACAAGCAAAAGAAGATTTACGCGGTTTAGAAGAGACTGTTATTAAAGAATTACAAACA
TTGCATAATCTACGACGTTTATTCATACAAGATCTTAATTGTCGAATTAAAAAGTCTGCC
AATCGTGTAAATGCGTTAACTGCAGCTGAAAAAGCCACTGTTAATAATAATAATAATAAT
AGTAATAATAATACTAACCAAGGTGGTAATACACCGAACGCTGCTGGTGGTATACCAGGA
CAACAACAAATCTCTGAAAGTCTACTTATGGATGATGACGATGATGATGAACCAATTCAA
GTTGGTACATTAGCACAACGCGAAAAAATTGCATTTCTTGAAAATAATTTAGATAAATTA
ACAAAAGTACATAAACAACTTGTTCATGATAATGCAGAATTACGTTGTGAATTACCGAAA
ATGGAAAAACGTTTAAAGAGTACCTTGGAACGTGTACGTAGTTTAGAATTATCATTGAAA
GAAGCTAAAGAAGGTGCTATGCGTGATCGTAAACGTTATCAAGTTGAAGTGGAACGAATA
AAAGAAGTTGTACGTCAACGTAATGTTACAGCACGTCGTGGTCAATCACAAATAGCTAAA
CCAATACGTGCAGGACATGCTCCAATTACTAATCTTCATGGTGTTAGTGGTGTTGGTGGT
GCATCAATTAATTCACAACCAGTTGTACGACCAGATCTTCTCGGTGCACCATGATCATAA
TGCTGATATTATTTTTTTTGTCTGTGTTTAACCTTTCTCTCTATCTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)