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Schistosoma mansoni
cluster # 8674 cluster # 8674       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8674#0 length = 1481 sequences # 7  

consensusID : consensus_8674#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1481
fasta sequence
                              [AACTCTGCTAGTTGCTTCAGCTTTGAATGCAGTCGGTGGTTGTATTAAATGTATAGCGGGTGCGGTTACATATGAAACAACGTTTGGACAATCTGATATATCTATTCCATTCAGCCATAAACTTGGTTTTCCAATACTTATGTTTGGACAAACTATTTGTGGAATAGCTCAATCCGGTATATTGGGTATACCAGCCCATTTAGCAGCAGTTTGGTTTGGAGTGAATGAAGTCTCAACCGCCACTGCACTTGGTGTATTCGGGAATCAACTTGGTGTTGCATTTGGCTTTCTAGTACCACCGCTTATTTTACCATCGATACCGTATAGTTCAAATGGAACTAACCAACTTG-ATCCATCAACAGATGTAAATCAATTATTCAATAATGTTAAACACTATATGATGATTATGCTGTATTTTAGTGCGGCTTTAAATATACTTCCATTTATATTTGCATTATTTGGTTTACGTGCAAAACCTAAAACGGAACCAAGTTTAGCACAATATAAACGTAATGGTTCATCAATTAATCATAAATTACAAATCAATGATCAATTATCAATTGATAAACCTTTAAATGGTATCCATTCAATAATCAATAATAATGGTCTACATGATAAGAAAAACAATATTGATAAAGAATTCTATACTAAATCATTAGAAAGTGATAAACAATATCCAGCTCTTAGTCCAAATGAATATTCCATATCATCAACAAAACAGAATACAACTGATAAGAATGATTCAATAATAAATAATTTTGTTATCAATATTGATGAGAATAATGATATAAATAGTATAGATGATTATTCGCAACAATCATTACAAAATCATCCTAGAAATGAGAAGATATCAGCTGCATTA-AAACGTTTATTTAAAAATATTCCATTTGTTTTATTGTTTATCAGTTATGGTATACTTACTGGTGTCTACTATGCTGTTGGTACATTGTTAAACTATTTTACTAGGATATTTCACAAATTCTACTTTATCTGGTTGGGCTGGTTTCACTATGATTATTGCCGGTATATTTGGATCAGTAATAACTGGTGTAATTTTAGATAAAACAAAAAAATTTAAGATAATCACATGTATTATATATATTCTAAGTTTAATATTCATGGGAATCTTTACTGGAATATTATATCTCCGTTCAATGCCAATAGTCTTTATTGTTATGTTCTTTTTAGGTTTCTTTATGACCGGTTATTTAAGTATTGGTTTTGAATTAGCCGCTGAATTAACTTATCCAGAAAGTGAAGGTTTATCTTCTGGTTTGTTGAATACATCAGCACAGATATTTGGCCTTATATTGATTCATGTTGCAACACCATTAAGAACACATTATGGAGTTTTGCCTGGAAATTTATTCCTTACAGGATTAACATTAATTGGAACAATAATGACAGTATTAATTAAAGAGAATCTTTATCGTCAACAGGCACATGAACGTAAGAAGTTTGAAACACAAACTGTTCCCGAT]

[-] EMBL CD068152             [AACTCTGCTAGTTGCTTCAGCTTTGAATGCAGTCGGTGGTTGTATTAAATGTATAGCGGGTGCGGTTACATATGAAACAACGTTTGGACAATCTGATATATCTATTCCATTCAGCCATAAACTTGGTTTTCCAATACTTATGTTTGGACAAACTATTTGTGGAATAGCTCAATCCGGTATATTGGGTATACCAGCCCATTTAGCAGCAGTTTGGTTTGGAGTGAATGAAGTCTCAACCGCCACTGCACTTGGTGTATTCGGGAATCAACTTGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD124234             [                                                                                                                                                                                                        nAGCAGCAGTTT GTTGNNAGTG ATGAAGTCTCAACCG CACTGCAC TGGTGTA TCGGGAATCAACTTGGTG TGCATTTGGCTTTCTAGTACCACCGCTTATTTTACCATCGATACCGTATAGTTCAAATGGAACTAACCAACTTG ATCCATCAACAGATGTAAATCAATTATTCAATAATGTTAAACACTATATGATGATTATGCTGTATTTTAGTGCGGCTTTAAATATACTTCCATTTATATTTGCATTATTTGGTTTACGTGCAAAACCTAAAACGGAACCAAGTTTAGCACAATATAAACGTAATGGTTCATCAATTAATCATAAATTACAAATCAATGATCAATTATCAATTGATAAACCTTTAAATGGTATCCATTCAATAATCAATAATAATGGTCTACATGATAAGAAAAACAATATTGATAAAGAATTCTATACTAAATCATTAGAAAGTGATAAACAATATCCAGCTCTTAGTCCAAATGAATATTCCATATCATCAACAAAACAGAATACAACTGATAAGAATGATTCAATAATAAATAATTTTGTTATCAATATTGATGAGAATAATGATATAAATAGTATAGATGATTATTCGCAACAATCATTACAAAATCATCCTAGAAATGAGAAGATATCAGCTGCATTA AAACGTTTATTTAAAAATATTCCATTTGTTTTATTGTTTATCAGTTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD124288             [                                                                                                                                                                                                           CAGCAGTTTGGTTTGGAGTGAATGAAGTCTCAACCGCCACTGCACTTGGTGTATTCGGGAATCAACTTGGTGTTGCATTTGGCTTTCTAGTACCACCGCTTATTTTACCATCGATACCGTATAGTTCAAATGGAACTAACCAACTTG ATCCATCAACAGATGTAAATCAATTATTCAATAATGTTAAACACTATATGATGATTATGCTGTATTTTAGTGCGGCTTTAAATATACTTCCATTTATATTTGCATTATTTGGTTTACGTGCAAAACCTAAAACGGAACCAAGTTTAGCACAATATAAACGTAATGGTTCATCAATTAATCATAAATTACAAATCAATGATCAATTATCAATTGATAAACCTTTAAATGGTATCCATTCAATAATCAATAATAATGGTCTACATGATAAGAAAAACAATATTGATAAAGAATTCTATACTAAATCATTAGAAAGTGATAAACAATATCCAGCTCTTAGTCCAAATGAATATTCCATATCATCAACAAAACAGAATACAACTGATAAGAATGATTCAATAATAAATAATTNTGTTATCAATATTGATGAGAATAATGATATAAATAGTATAGATGATTATTCGCAACAATCATTACAAAATCATCCTAGAAATGAGAAGATATCAGCTGCATTANAAACG TTATTT AAAATATTCCATTTGTTTTATTGGTTATCAGTTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD200998             [                                                                                                                                                                                                                                   AAGTCTCAACCGCCACTGCACTTGGTGTATTCGGGAATCAACTTGGTGTTGCATTTGGCTTTCTAGTACCACCGCTTATTTTACCATCGATACCGTATAGTTCAAATGGAACTAACCAACTTG ATCCATCAACAGATGTAAATCAATTATTCAATAATGTTAAACACTATATGATGATTATGCTGTATTTTAGTGCGGCTTTAAATATACTTCCGTTTATATTTGCATTATTTGGTTTACGTGCAAAACCTAAAACGGAACCAAGTTTAGCACAATATAAACGTAATGGTTCATCAATTAATCATAAATTACAAATCAATGATCAATTATCAATTGATAAACCTTTAAATGGTATCCATTCAGTAATCAATAATAATGGTCTACATGATAAGAAAAACAATATTGATAAAGAATTCTATACTAAATCATTAGAAAGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD124298             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTTACCATCGATACCGTATAGTTCAAATGGAACTAACC ACTTGNATCCATCAACAGATGTAAATCAATTATTCAATAATGTTAAACACTATATGATGATTATGCTGTATTTTAGTGCGGCTTTAAATATACTTCCATTTATATTTGCATTATTTGGTTTACGTGCAAAACCTAAAACGGAACCAAGTTTAGCACAATATAAACGTAATGGTTCATCAATTAATCATAAATTACAAATCAATGATCAATTATCAATTGATAAACCTTTAAATGGTATCCATTCAATAATCAATAATAATGGTCTACATGATAAGAAAAACAATATTGATAAAGAATTCTATACTAAATCATTAGAAAGTGATAAACAATATCCAGCTCTTAGTCCAAATGAATATTCCATATCATCAACAAAACAGAATACAACTGATAAGAATGATTCAATAATAAATAATTTTGTTATCAATATTGATGAGAATAATGATATAAATAGTATAGATGATTATTCGCAACAATCGTTACAAAATCATCCTAGAAATGAGAAGATATCAGCTGCATTA AAACGTTTATTTAAAAATATTCCATTTGTTTTATTGTTTATCAGTTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD201172             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATGAGAATAATGATATAAATAGTATAGATGATTATTCGCAACAATCATTACAAAATCATCCTAGAAATGAGAAGATATCAGCTGCATTA AAACGTTTATTTAAAAATATTCCATTTGTTTTATTGTTTATCAGTTATGGTATACTTACTGGTGTCTACTATGCTGTTGGTACATTGTTAAACTATTTTACTAGGATATTTCACAAATTCTACTTTATCTGGTTGGGCTGGTTTCACTATGATTATTGCCGGTATATTTGGATCAGTAATAACTGGTGTAATTTTAGATAAAACAAAAAAATTTAAGATAATCACATGTATTATATATATTCTAAGTTTAATATTCATGGGAATCTTTACTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AI976922             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATGTATTATATATATTCTAAGTTTAATATTCATGGGAATCTTTACTGGAATATTATATCTCCGTTCAATGCCAATAGTCTTTATTGTTATGTTCTTTTTAGGTTTCTTTATGACCGGTTATTTAAGTATTGGTTTTGAATTAGCCGCTGAATTAACTTATCCAGAAAGTGAAGGTTTATCTTCTGGTTTGTTGAATACATCAGCACAGATATTTGGCCTTATATTGATTCATGTTGCAACACCATTAAGAACACATTATGGAGTTTTGCCTGGAAATTTATTCCTTACAGGATTAACATTAATTGGAACAATAATGACAGTATTAATTAAAGAGAATCTTTATCGTCAACAGGCACATGAACGTAAGAAGTTTGAAACACAAACTGTTCCCGAT]


>consensus_8674#0 AACTCTGCTAGTTGCTTCAGCTTTGAATGCAGTCGGTGGTTGTATTAAATGTATAGCGGG TGCGGTTACATATGAAACAACGTTTGGACAATCTGATATATCTATTCCATTCAGCCATAA ACTTGGTTTTCCAATACTTATGTTTGGACAAACTATTTGTGGAATAGCTCAATCCGGTAT ATTGGGTATACCAGCCCATTTAGCAGCAGTTTGGTTTGGAGTGAATGAAGTCTCAACCGC CACTGCACTTGGTGTATTCGGGAATCAACTTGGTGTTGCATTTGGCTTTCTAGTACCACC GCTTATTTTACCATCGATACCGTATAGTTCAAATGGAACTAACCAACTTGATCCATCAAC AGATGTAAATCAATTATTCAATAATGTTAAACACTATATGATGATTATGCTGTATTTTAG TGCGGCTTTAAATATACTTCCATTTATATTTGCATTATTTGGTTTACGTGCAAAACCTAA AACGGAACCAAGTTTAGCACAATATAAACGTAATGGTTCATCAATTAATCATAAATTACA AATCAATGATCAATTATCAATTGATAAACCTTTAAATGGTATCCATTCAATAATCAATAA TAATGGTCTACATGATAAGAAAAACAATATTGATAAAGAATTCTATACTAAATCATTAGA AAGTGATAAACAATATCCAGCTCTTAGTCCAAATGAATATTCCATATCATCAACAAAACA GAATACAACTGATAAGAATGATTCAATAATAAATAATTTTGTTATCAATATTGATGAGAA TAATGATATAAATAGTATAGATGATTATTCGCAACAATCATTACAAAATCATCCTAGAAA TGAGAAGATATCAGCTGCATTAAAACGTTTATTTAAAAATATTCCATTTGTTTTATTGTT TATCAGTTATGGTATACTTACTGGTGTCTACTATGCTGTTGGTACATTGTTAAACTATTT TACTAGGATATTTCACAAATTCTACTTTATCTGGTTGGGCTGGTTTCACTATGATTATTG CCGGTATATTTGGATCAGTAATAACTGGTGTAATTTTAGATAAAACAAAAAAATTTAAGA TAATCACATGTATTATATATATTCTAAGTTTAATATTCATGGGAATCTTTACTGGAATAT TATATCTCCGTTCAATGCCAATAGTCTTTATTGTTATGTTCTTTTTAGGTTTCTTTATGA CCGGTTATTTAAGTATTGGTTTTGAATTAGCCGCTGAATTAACTTATCCAGAAAGTGAAG GTTTATCTTCTGGTTTGTTGAATACATCAGCACAGATATTTGGCCTTATATTGATTCATG TTGCAACACCATTAAGAACACATTATGGAGTTTTGCCTGGAAATTTATTCCTTACAGGAT TAACATTAATTGGAACAATAATGACAGTATTAATTAAAGAGAATCTTTATCGTCAACAGG CACATGAACGTAAGAAGTTTGAAACACAAACTGTTCCCGAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)