Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8678 cluster # 8678       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8678#0 length = 886 sequences # 7  
consensusID : consensus_8678#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 886
fasta sequence 
                              [TTTTGCCTTCTTTTCCTTATTTTCCTATTGAATAGTCCCCACAAACCTAGTGTGTAAAATTGTGTATTTCTGGTGTTTCATGGATGGTTTTATGAAAGAAAGCCTATTAAAATGGATTTCATTAATAACTGAGAGGAATGTTAGCCTCATAGACGGCGAAGTCCTCAACAATCTAATAGACCTTTC--GTGCTTTTCCATCAGTTACTACCTCAGAATGTTACAAGGAGCGAATTAGTTCGTTTTTGGATGCAATTTTTCATCCTGGAGTTTCTAATTTATTTGACGTTGAAGGGGTGATTTCTGGGAAAGCTGACGATGTGGAATTGTTTGGGTTATGCCTAACCGTTTTATTGGGATGTCTTCAATGTCCCTCCAAACAGTCATTCATGGATCCTGCTCTGGATTTGAGTTTGGATATGCAAACTGCTATATTCCATTTAATTCAAGTGCCTATGACCCAGTTATCGCTCCATCATGAGTTCACTCGGGATCTGGTCACAAGCAGAATTCTCGATTCATCACAGTGTATCCACAATGATAACTTGCCATTTCGTCATCAAACCATTACTTGTAAAGTAGAAGAAGAAATCTCAGAACCATCATCTAAGCCACCATCTTCAACAGGCATGTGTAACGGACAGAAAGTAGTTTGTACTGACAATAGAAATTTTGGTCTTTCATTGAACACATTCGGATTTGAATTCACTCGCCCTA--ATTCAC-CTACAGGATATGCTAATGGACATACAAACAAACTAAAAAATGGTCTTGATCACAGACCTAATAATCTTTCTTTGTGTAACACTCCTGATCGAAGTCTGTGCATTGCATCCAGATTGAATTTAACCGATAATTTGGAACATAATGCGAATCATACTCATCATGCACC]

[+] EMBL AI395112             [TTTTGCCTTCTTTTCCTTATTTTCCTATTGAATAGTCCCCACAAACCTAGTGTGTAAAATTGTGTATTTCTGGTGTTTCATGGATGGTTTTATGAAAGAAAGCCTATTAAAATGGATTTCATTAATAACTGAGAGGAATGTTAGCCTCATAGACGGCGAAGTCCTCAACAATCTAATAGACCTTTCAGGTGCTTTTCCATCAGTTACTACCTCAGAATGTTACAAGGAGCGAATTAGTTCGTTTTTGGATGCAATTTTTCATCCTGGAGTTTCTAATTTATTTGACGTTGAAGGGGTGATTTCTGGGAAAGCTGACGATGTGGGATTGTTTGGGTTATGCCTAACCGTTTTATTGGGATGTCCTCAATGTCCCTCCAAACAGTCAGTCATGGATCCTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI395076             [TTTTGCCTTCTTTTCCTTATTTTCCTATTGAATAGTCCCCACAAACCTAGTGTGTAAAATTGTGTATTTCTGGTGTTTCATGGATGGTTTTATGAAAGAAAGCCTATTAAAATGGATTTCATTAATAACTGAGAGGAATGTTAGCCTCATAGACGGCGAAGTCCTCAACAATCTAATAGACCTTTCAGGTGCTTTTCCATCAGTTACTACCTCAGAATGTTACAAGGAGCGAATTAGTTCGTTTTTGGATGCAATTTTTCATCCTGGAGTTTCTAATTTATTTGACGTTGAAGGGGTGATTTCTGGGAAAGCTGACGATGTGG ATTGTTTGGGTTATGCCTAACCGTTTTATTGGGATGTCTTCAATGTCCCTCCAAACAG CATTCAATGATCCTGCTCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD068195             [                                                                                                                                                                        acATCTAATAGACCTTTC  GTGCTTTTCCATCAGTTACTACCTCAGAATGTTACAAGGAGCGAATTAGTTCGTTTTTGGATGCAATTTTTCATCCTGGAGTTTCTAATTTATTTGACGTTGAAGGGGTGATTTCTGGGAAAGCTGACGATGTGGAATTGTTTGGGTTATGCCTAACCGTTTTATTGGGATGTCTTCAATGTCCCTCCAAACAGTCATTCATGGATCCTGCTCTGGATTTGAGTTTGGATATGCAAACTGCTATATTCCATTTAATTCAAGTGCCTATGACCCAGTTATCGCTCCATCATGAGTTCACTCGGGATCTGGTCACAAGCAGAATTCTCGATTCATCACAGTGTATCCACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD168930             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAAGCTGACGATGTGGAATTGTTTGGGTTATGCCTAACCGTTTTATTGGGATGTCTTCAATGTCCCTCCAAACAGTCATTCATGGATCCTGCTCTGGATTTGAGTTTGGATATGCAAACTGCTATATTCCATTTAATTCAAGTGCCTATGACCCAGTTATCGCTCCATCATGAGTTCACTCGGGATCTGGTCACAAGCAGAATTCTCGATTCATCACAGTGTATCCACAATGATAACTTGCCATTTCGTCATCAAACCATTACTTGTAAAGTAGAAGAAGAAATCTCAGAACCATCATCTAAGCCACCATCTTCAACAGGCATGTGTAACGGACAGAAAGTAGTTTGTACTGACAATAGAAATTTTGGTCTTTCATTGAACACATTCGGATTTGAATTCACTCGCCCAACCCATCACACTACTGGggg                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD149663             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGTGGAATTGTTTGGGTTATGCCTAACCGTTTTATTGGGATGTCTTCAATGTCCCTCCAAACAGTCATTCATGGATCCTGCTCTGGATTTGAGTTTGGATATGCAAACTGCTATATTCCATTTAATTCAAGTGCCTATGACCCAGTTATCGCTCCATCATGAGTTCACTCGGGATCTGGTCACAAGCAGAATTCTCGATTCATCACAGTGTATCCACAATGATAACTTGCCATTTCGTCATCAAACCATTACTTGTAAAGTAGAAGAAGAAATCTCAGAACCATCATCTAAGCCACCATCTTCAACAGGCATGTGTAACGGACAGAAAGTAGTTTGTACTGACAATAGAAATTTTGGTCTTTCATTGAACACATTCGGATTTG ATTCACTCGCCCTA  ATTCAC CTACAGAATATG                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD117192             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCGTTTTATTGGGATGTCTTCAATGTCCCTCCAAACAGTCATTCATGGATCCTGCTCTGGATTTGAGTTTGGATATGCAAACTGCTATATTCCATTTAATTCAAGTGCCTATGACCCAGTTATCGCTCCATCATGAGTTCACTCGGGATCTGGTCACAAGCAGAATTCTCGATTCATCACAGTGTATCCACAATGATAACTTGCCATTTCGTCATCAAACCATTACTTGTAAAGTAGAAGAAGAAATCTCAGAACCATCATCTAAGCCACCATCTTCAACAGGCATGTGTAACGGACAGAAAGTAGTTTGTACTGACAATAGAAATTTTGGTCTTTCATTGAACACATTCGGATTTGAATTCACTCGCCCTA  ATTCAC CTACAGGATATGCTAATGGACATACAAACAAACTAAAAAATGGTCTTGATCACAGACCTAATAATCTTTCTTTGTGTAACACTCCTGATCGAAGTCTGTGCATTGCATCCAGATTGAATT                                              ]
[-] EMBL CD121692             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTAATTCAAGTGCCTATGACCCAGTTATCGCTCCATCATGAGTTCACTCGGGATCTGGTCACAAGCAGAATTCTCGATTCATCACAGTGTATCCACAATGATAACTTGCCATTTCGTCATCAAACCATTACTTGTAAAGTAGAAGAAGAAATCTCAGAACCATCATCTAAGCCACCATCTTCAACAGGCATGTGTAACGGACAGAAAGTAGTTTGTACTGACAATAGAAATTTTGGTCTTTCATTGAACACATTCGGATTTGAATTCACTCGCCCTA  ATTCAC CTACAGAATATGCTAATGGACATACAAACAAACTAAAAAATGGTCTTGATCACAGACCTAATAATCTTTCTTTGTGTAACACTCCTGATCGAAGTCTGTGCATTGCATCCAGATTGAATTTAACCGATAATTTGGAACATAATGCGAATCATACTCATCATGCACC]




>consensus_8678#0
TTTTGCCTTCTTTTCCTTATTTTCCTATTGAATAGTCCCCACAAACCTAGTGTGTAAAAT
TGTGTATTTCTGGTGTTTCATGGATGGTTTTATGAAAGAAAGCCTATTAAAATGGATTTC
ATTAATAACTGAGAGGAATGTTAGCCTCATAGACGGCGAAGTCCTCAACAATCTAATAGA
CCTTTCGTGCTTTTCCATCAGTTACTACCTCAGAATGTTACAAGGAGCGAATTAGTTCGT
TTTTGGATGCAATTTTTCATCCTGGAGTTTCTAATTTATTTGACGTTGAAGGGGTGATTT
CTGGGAAAGCTGACGATGTGGAATTGTTTGGGTTATGCCTAACCGTTTTATTGGGATGTC
TTCAATGTCCCTCCAAACAGTCATTCATGGATCCTGCTCTGGATTTGAGTTTGGATATGC
AAACTGCTATATTCCATTTAATTCAAGTGCCTATGACCCAGTTATCGCTCCATCATGAGT
TCACTCGGGATCTGGTCACAAGCAGAATTCTCGATTCATCACAGTGTATCCACAATGATA
ACTTGCCATTTCGTCATCAAACCATTACTTGTAAAGTAGAAGAAGAAATCTCAGAACCAT
CATCTAAGCCACCATCTTCAACAGGCATGTGTAACGGACAGAAAGTAGTTTGTACTGACA
ATAGAAATTTTGGTCTTTCATTGAACACATTCGGATTTGAATTCACTCGCCCTAATTCAC
CTACAGGATATGCTAATGGACATACAAACAAACTAAAAAATGGTCTTGATCACAGACCTA
ATAATCTTTCTTTGTGTAACACTCCTGATCGAAGTCTGTGCATTGCATCCAGATTGAATT
TAACCGATAATTTGGAACATAATGCGAATCATACTCATCATGCACC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)