|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8702#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1051 fasta sequence
[AACCACCACAGCACAATGTCTTGATGT-CACCTGG--TGGTGTCAATAATAATACTAATCATGGAAGCGTGTATTATGACGGTCATTATCGTGAAGGTCAAGCATAAATTTATTTCTTCTGAGACCTATTACTAATGATTCTGCTTGTTCATTAATTTTCCTGTAGAAAATAACAGCTTCTGTATTATAATACACAATCATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTCTAACCAGCATTTCTTCTTGTTTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTTTAAACAATTTAATCTCTGTCCACATCATGATCAATCAGTTACGGTATATATACACCATACATGTTTGTATTTTATATGTGAATAAGTTATGTAAGAAAATCCACACTTATTACTCTGTGTTTCGTCCTAATCTTTCTCTCTACATATATACATGGCTAGCTTATCGGCTTGTTCCTTCTCCTGCCTTTGATCATCTCATATGTGTGTGTTTTAACTAGGAAAAACACATAAATCGATCGCGTATTACAATGAT-TTTATCAT-TATGTTATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATTTATTTGTTTTAATATTGAAAAAGTTGCCCACTTTTTGAAATCTATATAATTGTTTTTCTCCTAATTATTCGAGTTTGATTTATGCGCCTTTTTCTTTTTCTATTCAAAAGGAATTTGACCCATACACAATCGCTCTAATTAGGATGTATTATTAAATGTAGGAGTAGTATAGCAATACTACTACTACTACCAGTAGTAGTAGTATTAGTCGAAATCAACATCTTATTTACATCGTATTGTACAGGTATTATTTATTTTTTTCCAACTATATCATCTTTTCAAGCCTATTTCATACGTTTGTATCATATAATTAGCATGTTTTGTG]
[+] EMBL CD112144 [AACCACCACAGCACAATGTCTTGATGT CACCTGG TGGTGTCAATAATAATACTAATCATGGAAGCGTGTATTATGACGGTCATTATCGTGAAGGTCAAGCATAAATTTATTTCTTCTGAGACCTATTACTAATGATTCTGCTTGTTCATTAATTTTCCTGTAGAAAATAACAGCTTCTGTATTATAATACACAATCATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTCTAACCAGCATTTCTTCTTGTTTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTTTAAACAATTTAATCTCTGTCCACATCATGATCAATCAGTTACGGTA ]
[+] EMBL CD180275 [AACCACCACAGCACAATGTTTTGATTTCCACATAGACTCTTGTCAATAATAATACTAATCATGGAAGCGTGTATTATGACGGTCATTATCGTGAAGGTCAAGCATAAATTTATTTCTTCTGAGACCTATTACTAATGATTCTGCTTGTTCATTAATTTTCCTGTAGAAAATAACAGCTTCTGTATTATAATACACAATCATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTCTAACCAGCATTTCTTCTTGTCTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTT ]
[-] EMBL CD112399 [ CATTATCGTGAAGGTCAAGCATAAATTTATGTCTTCTGTGACCTATTACTAATGATTCTGCTTGTTCATTAATTTTCCTGTAGAAAATAACAGCTTCTGTATTATAATACACAATCATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTCTAACCAGCATTTCTTCTTGTTTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTTTAAACAATTTAATCTCTGTCCACATCATGATCAATCAGTTACGGTATATATACACCATACATGTTTGTATTTTATATGTGAATAAGTTATGTAAGAAAATCCACACTTATTACTCTGTGTTTCGTCCTAATCTTTCTCT ]
[+] EMBL AI977123 [ CATAATTCATTGATCTACATCATATTGCTTTTTCGATCATTGATTAGTATGATTATCATTCGAATTTATTCTACATCATAATGTATTGTCATTTATCTTCACTGTTATTCTTCTAATTGAGTTAATGATGTTGATTCGTTTAACCAGCATTTCTTTTTGTTTGTTTACTTTTTTCTCTCTCCTCTCGCTTGATACGCTTTTGTAATGTGTTTATCCTTTAAACAATTTAATCTCTGTCCACATCATGATCAATCAGTTACGGTATATATACACCATACATGTTTGTATTTTATATGTGAATAAGTTATGTAAGAAAATCCACACTTATTACTCTGTGTTTCGTCCTAATCTTTCTCTCTACATATATACATGGCTAGCTTATCGGCTTGTTCCTTCTCCTCCCTTTGATCATCTCATATGTGTGTGTTCTAACTAGGGAAAACACATAAATCGATCGCGTACTACAATGAT TTTATCAT TATGTTATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATCTATTTGTTTTAATA ]
[-] EMBL CD169757 [ GGCTTGTTCCTTCTCCTGCCTTTGATCATCTCATATGTGTGTGTTTTAACTAGGAAAAACACATAAATCGATCGCGTATTACAATGAT TTTATCAT TATGTTATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATTTATTTGTTTTAATATTGAAAAAGTTGCCCACTTTTTGAAATCTATATAATTGTTTTTCTCCTAATTATTCGAGTTTGATTTATGCGCCTTTTTCTTTTTCTATTCAAAAGGAATTTGACCCATACACAATCGCTCTAATTAGGATGTATTATTAAATGTAGGAGTAGTATAGCAATACTACTACTACTACCAGTAGTAGTAGTATTAGTCGAAATCAACATCTTATTTACATCGTATTGTACAGGTATTATTTATTTTTTTCCAACTATATCATCTTTTCAAGCCTATTTCATACGTTTGTATCATATAATTAGCATGTTTTGTG]
[-] EMBL CD169107 [ GGCTTGTTCCTTCTCCTGCCTTTGATCATCTCATATGTGTGTGTTTTAACTAGGAAAAACACATAAATCGATCGCGTATTACAATGAT TTTATCAT TATGTTATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATTTATTTGTTTTAATATTGAAAAAGTTGCCCACTTTTTGAAATCTATATAATTGTTTTTCTCCTAATTATTCGAGTTTGATTTATGCGCCTTTTTCTTTTTCTATTCAAAAGGAATTTGACCCATACACAATCGCTCTAATTAGGATGTATTATTAAATGTAGGAGTAGTATAGCAATACTACTACTACTACCAGTAGTAGTAGTATTAGTCGAAATCAACATCTTATTTACATCGTATTGTACAGGTATTATTTATTTTTTTCCAACTATATCATCTTTTCAAGCCTATTTCATACGTTTGTATCATATAATTAGCATGTTTTGTG]
[+] EMBL CD068644 [ GTATTACAATGATGTTTATCATCTATGTGATGTTTCTATTCATAATCTCATTTATGTTCAGCGGGTCCATCAATTTATTTGTTTTAATATTGAAAAAGTTGCCCACTTTTTGAAATCTATATAATTGTTTTTCTCCTAATTATTCGAGTTTGATTTATGCGCCTTTTTCTTTTTCTATTCAAAAGGAATTTGACCCATACACAATCGCTCTAATTAGGATGTATTATTAAATGTAGGAGTAGTATAGCAATACTACTACTACTACCAGTAGTAGTAGTATTAGTCGAAATCAACATCTTATTTACATCGTATTGTACAGGTATTATTTATTTTTTTCCAACTATATCATCTTTTCAAGCCTATTTCATACGTTTGTATCATATAATTAGCATGTTATGT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||