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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8748#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 628 fasta sequence
[GGAGAGCATGATGGAATGATGAAATTTGCTGATGCTGTTGATATACATGAGGAGAATGAGTTAAATTTGAAGTATTATGGGAGCTTCTAAGCATAACGTTAGGAAGGTTTTCTTGGCAATCAGTCGGTAATAACTGTTGCTGACTCGATGAATTAAGACTGGGATTGTCAGGCTGAATATTAGGAGTTAAAACATGTACGGGTGAAGCACTAGTTAACGGCAGGCTGTTCGATACAACCGGGACGTAGGAGTTTGGACGACTAGCAGGTTCATGGTGGCTGCTAACTAAGCTTGTTAGACTTCCTGGTGGAGTCCACTCACTAGGTGCCTCAGTAATTTTCAGTAAAGCACAAATTCCTTTTACTGGAGTAACATTATCTGCCGAGGATATAGACAATGTTGTTCTCGAAGGGATAACGGTACAAGTAGGCTTGGCATTAAGAGATTGATGAGATGTGAGTGTATCCATTCGATACCCTTGAGGTATGAAGGTATTAAATCCAGTAATAAGATCGGGATGACCCTCGAACAATTCACGTACCCGACGAATAACAACCTCCGTCCCAATGGTTTGTGCCTTGAAATCACGCATAACATCAAGAAAGTCCATATAGATAGCCCCCTGGCC]
[-] EMBL CD130288 [GGAGAGCATGATGGAATGATGAAATTTGCTGATGCTGTTGATATACATGAGGAGAATGAGTTAAATTTGAAGTATTATGGGAGCTTCTAAGCATAACGTTAGGAAGGTTTTCTTGGCAATCAGTCGGTAATAACTGTTGCTGACTCGATGAATTAAGACTGGGATTGTCAGGCTGAATATTAGGAGTTAAAACATGTACGGGTGAAGCACTAGTTAACGGCAGGCTGTTCGATACAACCGGGACGTAGGAGTTTGGACGACTAGCAGGTTCATGGTGGCTGC ]
[-] EMBL CD140969 [ GATTGAATTAGCTGATGCTGTTGATATACATGAGGAGAATGAGTTAAATTTGAAGTATTATGAGAGCTTCTAAGCATAACGTTAGGAAGGTTTTCTTGGCAATCAGTCGGTAATCACTGTTGCTGACTCGATGAATTAAGTCTGGGATTGTCAGGCTGAATATTAGGAGTTAAAACATGTGCGGGTGAAGCTCTAGTTAGCGGCAGGCTGTTCGATACATCCGGGTCGTAGG ]
[-] EMBL CD142436 [ CTGATGCTGTTGATATACATGAGGAGAATGAGTTAAATTTGAAGTATTATGGGAGCTTCTAAGCATAACGTTAGGAAGGTTTTCTTGGCAATCAGTCGGTAATAACTGTTGCTGACTCGATGAATTAAGACTGGGATTGTCAGGCTGAATATTAGGAGTTAAAACATGTACGGGTGAAGCACTAGTTAACGGCAGGCTGTTCGATACAACCGGGACGTAGGAGTTTGGACGACTAGCAGGTTCATGGTGGCTGCTAACTAAGCTTGTTAGACTTCCT ]
[+] EMBL CD160163 [ GAGTTAAAACATGTACGGGTGAAGCACTAGTTAACGGCAGGCTGTTCGATACAACCGGGACGTAGGAGTTTGGACGACTAGCAGGTTCATGGTGGCTGCTAACTAAGCTTGTTAGACTTCCTGGTGGAGTCCACTCACTAGGTGCCTCAGTAATTTTCAGTAAAGCACAGATTCCTTTTACTGGAGTAACATTATCTGCCGAGGATATAGACAATGTTGTTCTCGAAGGGATAACGGTACAAGTAGGCTTGGCATTAAGAGATTGATGAGATGTGAGTGTATCCATTCGATACCCTTGAGGTATGAAGGTATTAAATCCAGTAATAAGATCGGGATGACCCTCGAACAATTCACGTACCCGACGAATAACAACCTCCGTCCCAATGGTTTGTGCCTTGAAATCACGCATAACATCAAGAAAGTCCATATAGATTGCCCCCT ]
[-] EMBL CD177792 [ AGTTAAAACATGTACGGGTGGAGCACTAGTTAACGGCAGGCTGTTCGATACAACCGGGACGTAGGAGTTTGGACGACTAGCAGGTTCATGGTGGCTGCTAACTAAGCTTGTTAGACTTCCTGGTGGAGTCCACTCACTAGGTGCCTCAGTAATTTTCAGTAAAGCACAAATTCCTTTTA ]
[+] EMBL CD160159 [ AACCGGGACGTAGGAGTTTGGACGACTAGCAGGTTCATGGTGGCTGCTAACTAAGCTTGTTAGACTTCCTGGTGGAGTCCACTCACTAGGTGCCTCAGTAATTTTCAGTAAAGCACAAATTCCTTTTACTGGAGTAACATTATCTGCCGAGGATATAGACAATGTTGTTCTCGAAGGGATAATGGTACAAGTAGGCTTGGCATTAAGAGATTGATGAGATGTGAGTGTATCCATTCGATACCCTTGAGGTATGAAGGTATTAAATCCAGTAATAAGATCGGGATGACCCTCGAACAATTCACGTACCCGACGAATAACAACCTCCGTCCCAATGGTTTGTGCCTTGAAATCACGCATAACATCAAGAAAGTCCATATAGATAGCCCCCTGGC ]
[-] EMBL CD159979 [ AACTAAGCTTGTTAGACTTCCTGGTGGAGTCCACTCACTAGGTGCCTCAGTAATTTTCAGTAAAGCACAAATTCCTTTTACTGGAGTAACATGATCTGCCGAGGATATAGACAATGTTGTTCTCGAAGGGATAACGGTACAAGTAGGCTTGGCATTAAGAGATTGATGAGATGTGAGTGTATCCATTCGATACCCTTGAGGTATGAAGGTATTAAATCCAGTAATAAGATCGGGATGACCCTCGAACAATTCACGTACCCGACGAATAACAACCTCCGTCCCAATGGTTTGTGCCTTGAAATCACGCATAACATCAAGAAAGTCCATATAGATAGCCCCCTGGCC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||