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Schistosoma mansoni
cluster # 8756 cluster # 8756       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8756#0 length = 903 sequences # 7  

consensusID : consensus_8756#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 903
fasta sequence
                              [CATAATTGTTATTATCAATTTTGGGCAATCAGTAATATATACATATATATGTATACGCATGGAGATGTGAATAAATCACTGTCCTAATTCTACTTGAGATCTGCCTATTAGTTTGTTTTTTTGTTCATTTCCTTATTATCTTCACGTTTATTCTTTATTTGTGCTCATTTATTGTCTTCTTCCATCATTACCATTGTCTTTCATTTCTTAAAATAGAATAATTTGTCTAGAATGATGTATGTATTCTTAATTTCTTTTGTTCAGCGCTTTTTTTAAAAATAAAATGTCAACATGGAAACTAAGTATTTATTGTTCAGAGCATGAATTCTAGTTTTATAATATATACTTTTTGCCATACATCATGCATTTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATATATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAAAAACAAATTACAATACAAAGAAACAAAATTTCAATCATATTTAAATGATTTGGTATGTTTTTTTGTTCAGGGTTTCATTGATTTCATTGTATCTATGTATGATTACGTAATGTTCAATTATTCTCTAAAAAATTTTTATTACTTTTTTTGACATGATTTATGATTGACTAGTAAATCAGTTGTCTTCCGTGATTAAATTGAATGTTGTTGAAAAGTATTTTATCATGATGATGATAATGAACACACACACACACACGTACATTTATATACATACATGCATAAATTGTGTGCATGTTTATGTATTTCAAAGAAAAGATCTGGACAAAGTCTGTGATAAGAGAGTTTCTTCCAGTCTTCCT]

[+] EMBL CD152430             [CATAATTGTTATTATCAATTTTGGGCAATCAGTAATATATACATATATATGTATACGCATGGAGATGTGAATAAATCACTGTCCTAATTCTACTTGAGATCTGCCTATTAGTTTGTTTTTTTGTTCATTTCCTTATTATCTTCACGTTTATTCTTTATTTGTGCTCATTTATTGTCTTCTTCCATCATTACCATTGTCTTTCATTTCTTAAAATAGAATAATTTGTCTAGAATGATGTATGTATTCTTAATTTCTTTTGTTCAGCGCTTTTTTTAAAAATAAAATGTCAACATGGAAACTAAGTATTTATTGTTCAGAGCATGAATTCTAGTTTTATAATATATACTTTTTGCCATACATCATGCATTTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATTTATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAAAAACAAATTACAATACAAAGAAACAAAATTTCAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD152423             [CATAATTGTTATTATCAATTTTGGGCAATCAGTAATATATACATATATATGTATACGCATGGAGATGTGAATAAATCACTGTCCTAATTCTACTCGAGATCTGCCTATTAGTTTGTTTTTTTGTTCATTTCCTTATTATCTTCACGTTTATTCTTTATTTGTGCTCATTTATTGTCTTCTTCCATCATTACCATTGTCTTTCATTTCTTAAAATAGAATAATTTGTCTAGAATGATGTATGTATTCTTAATTTCTTTTGTTCAGCGCTTTTTTTAAAAATAAAATGTCAACATGGAAACTAAGTATTTATTGTTCAGAGCATGAATTCTAGTTTTATAATATATACTTTTTGCCATACATCATGCATTTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATATATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAGTAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAANAACAAATTACCATACAAAGAAACCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD152444             [CATAATTGTTATTATCAATTTTGGGCAATCAGTAATATATACATATATATGTATACGCATGGAGATGTGAATAAATCACTGTCCTAATTCTACTTGAGATCTGCCTATTAGTTTGTTTTTTTGTTCATTTCCTTATTATCTTCACGTTTATTCTTTATTTGTGCTCATTTATTGTCTTCTTCCATCATTACCATTGTCTTTCATTTCTTAAAATAGAATAATTTGTCTAGAATGATGTATGTATTCTTAATTTCTTTTGTTCAGCGCTTTTTTTAAAAATAAAATGTCAACATGGAAACTAAGTATTTATTGTTCAGAGCATGAATTCTAGTTTTATAATATATACTTTTTGCCATACATCATGCATTTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATATATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATTGAAAAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD152432             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAATATATACTTTTTGCCATACATCATGCATTTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATATATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAAAAACAAATTACAATACAAAGAAACAAAATTTCAATCATATTTAAATGATTTGGTATGTTTTTTTGTTCAGGGTTTCATTGATTTCATTGTATCTATGTATGATTACGTAATGTTCAATTATTCTCTAAAAAATTTTTATTACTTTTTTTGACATGATTTATGATTGACTAGTAAATCAGTTGTCTTCCGTGATTAAATTGAATGTTGTTGAAAAGTATTTTATCATGATGATGATAATGAACACACACACACACACGTACATTTATATACATACATGCATAAATTGTGTGCATGTTTATGTATTTCAAAGAAAAGATCTGGACAAAGTCTGTGATAAGAGAGTTTCTTCCAGTCTTCCT]
[-] EMBL CD152428             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATACTTTTTGCCATACATCATGCATTTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATATATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAAAAACAAATTACAATACAAAGAAACAAAATTTCAATCATATTTAAATGATTTGGTATGTTTTTTTGTTCAGGGTTTCATTGATTTCATTGTATCTATGTATGATTACGTAATGTTCAATTATTCTCTAAAAAATTTTTATTACTTTTTTTGACATGATTTATGATTGACTAGTAAATCAGTTGTCTTCCGTGATTAAATTGAGTGTTGTTGAAAAGTATTTTATCATGATGATGATAATGAACACACACACACACACGTACATTTATATACATACATGCATAAATTGTGTGCATGTTTATGTATTTCAAAGAAAAGATCTGGACAAAGTCTGTGATAAGAGAGTTTCTTCCAGTCTTCCT]
[-] EMBL CD152454             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTATACATACATATATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAAAAACAAATTACAATACAAAGAAACAAAATTTCAATCATATTTAAATGATTTGGTATGTTTTTTTGTTCAGGGTTTCATTGATTTCATTGTATCTATGTATGATTACGTAATGTTCAATTATTCTCTAAAAAATTTTTATTACTTTTTTTGACATGATTTATGATTGACTAGTAAATCAGTTGTCTTCCGTGATTAAATTGAATGTTGTTGAAAAGTATTTTATCATGATGATGATAATGAGCACACACACACACACGTACATTTATATACATACATGCATAAATTGTGTGCATGTTTATGTATTTCAAAGAAAAGATCTGGACAAAGTCTGTGATAAGAGAGTTTCTTCCAGTCTTCCT]
[-] EMBL CD152458             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACATATATAGCCGAATGATANCATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAATATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCATAGAAAAACAAATTACAATACAAAGAAACAAAATTTCAATCATATTTAAATGATTTGGTATGTTTTTTTGTTCAGGGTTTCATTGATTTCATTGTATCTATGTATGATTACGTAATGTTCAATTATTCTCTAAAAAATTTTTATTACTTTTTTTGACATGATTTATGATTGACTAGTAAATCAGTTGTCTTCCGTGATTAAATTGAATGTTGTTGAAAAGTATTTTATCATGATGATGATAATGAACACACACACACACACGTACATTTATATACATACATGCATAAATTGTGTGCATGTTTATGTATTTCAAAGAAAAGATCTGGACAAAGTCTGTGATAAGAGAGTTTCTTCCAGTCTTCCT]


>consensus_8756#0 CATAATTGTTATTATCAATTTTGGGCAATCAGTAATATATACATATATATGTATACGCAT GGAGATGTGAATAAATCACTGTCCTAATTCTACTTGAGATCTGCCTATTAGTTTGTTTTT TTGTTCATTTCCTTATTATCTTCACGTTTATTCTTTATTTGTGCTCATTTATTGTCTTCT TCCATCATTACCATTGTCTTTCATTTCTTAAAATAGAATAATTTGTCTAGAATGATGTAT GTATTCTTAATTTCTTTTGTTCAGCGCTTTTTTTAAAAATAAAATGTCAACATGGAAACT AAGTATTTATTGTTCAGAGCATGAATTCTAGTTTTATAATATATACTTTTTGCCATACAT CATGCATTTCATTCCTGTGTATTATATCACACGAATATCCATCTATTCATATGGACTTAT ACATACATATATAGCCGAATGATTACATTACTTTCATAAATAATTACATCATGTTCATAA TATGTATATGCATATGTAATTTCTTCGATTCATAGCTCAATTTCATAAATTCTATTTCAT AGAAAAACAAATTACAATACAAAGAAACAAAATTTCAATCATATTTAAATGATTTGGTAT GTTTTTTTGTTCAGGGTTTCATTGATTTCATTGTATCTATGTATGATTACGTAATGTTCA ATTATTCTCTAAAAAATTTTTATTACTTTTTTTGACATGATTTATGATTGACTAGTAAAT CAGTTGTCTTCCGTGATTAAATTGAATGTTGTTGAAAAGTATTTTATCATGATGATGATA ATGAACACACACACACACACGTACATTTATATACATACATGCATAAATTGTGTGCATGTT TATGTATTTCAAAGAAAAGATCTGGACAAAGTCTGTGATAAGAGAGTTTCTTCCAGTCTT CCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)