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Schistosoma mansoni
cluster # 8764 cluster # 8764       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8764#0 length = 954 sequences # 7  

consensusID : consensus_8764#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 954
fasta sequence
                              [CACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTA-CTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTAGCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTTGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCGAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATATACCACCATATAAATTAATAATCTTAGATGAAGCTGATTCTATGACAGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATTGGATAATGAAATTGCACGTTCTCGTTTGCGTCATATTGCAGATGCAGAAAATTTATCTATTACTAATGAGACATTGGATCATTTACTGTCACTTTGTCATGGTGATTTACGGCAAGGCATCACAATGTTACAATGTGTTCATCAGTTAATTCTATCCGTTGATGATTCCGATGTTGGTTGTCGTTCTTCGATTACCTCAAAAGAATTAGATGAGGCTGCAGCTGTTGTTCCTAGTGATTTAATTAAAAGTCTTATTAAAACATCAGAAAATGGTAGTTTCGATGATTTACAAATCATTATCAAAAACTTATTATT]

[+] EMBL AI976205             [CACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTACCTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTATCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTCGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCTAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATATACCACCATATAAATTAATAATCTTAGATGAAGCTGATTCTATGACAGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTNTGTTTAACTTGTAATTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BF936697             [ ACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTA CTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTAGCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTTGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCGAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATATACCACCATATAAATTAATAATCTTAGATGAAGCTGATTCTATGACAGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BF936485             [ ACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTA CTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTAGCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTTGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCGAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATATACCACCATATAAATTAATAATCTTAGATGAAGCTGATTCTATGACAGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAGTTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI976607             [ ACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTA CTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGATTATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCATAAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGTAGCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCCAAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGCTCGTCAACTTTTTGGCCCTTTGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGAACGCGGGATCAGTGTTATTCGAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAGTAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATTTACCACCATATAAATTAATAATCTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD069699             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATTGGATAATGAAATTGCACGTTCTCGTTTGCGTCATATTGCAGATGCAGAAAATTTATCTATTACTAATGAGACATTGGATCATTTACTGTCACTTTGTCATGGTGATTTACGGCAAGGCATCACAATGTTACAATGTGTTCATCAGTTAATTCTATCCGTTGATGATTCCGATGTTGGTTGTCGTTCTTCGATTACCTCAAAAGAATTAGATGAGGCTGCGGCTGTTGCTCCTAGTGATTTAATTAAAAGTCTTATTAAAACATCAGAAAATGGTAGTTTCGATGATTTACAAATCATTATCACAAACTTATTATT]
[+] EMBL CD069653             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATTGGATAATGAAATTGCACGTTCTCGTTTGCGTCATATTGCAGATGCAGAAAATTTATCTATTACTAATGAGACATTGGATCATTTACTGTCACTTTGTCATGGTGATTTACGGCAAGGCATCACAATGTTACAATGTGTTCATCAGTTAATTCTATCCGTTGATGATTCCGATGTTGGTTGTCGTTCTTCGATTACCTCAAAAGAATTAGATGAGGCTGCAGCTGTTGTTCCTAGTGATTTAATTAAAAGTCTTATTAAAACATCAGAAAATGGTAGTTTCGATGATTTACAAATCATTATCAAAACCTTATTATT]
[+] EMBL CD069641             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGACTGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACCAATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATGGGATAATGAAATTGCACGTTCTCGTTTGCGTCATATTGCAGATGCAGAAAATTTATCTATTACTAATGAGACATTGGATCATTTACTGTCACTTTGTCATGGTGATTTACGGCAAGGCATCACAATGTTACAATGTGTTCATCAGTTAATTCTATCCGTTGATGATTCCGATGTTGGTTGTCGTTCTTCGATTACCTCAAAAGAATTAGATGAGGCTGCAGCTGTTGTTCCTAGTGATTTAATTAAAAGTCTTATTAAAACATCAGAAAATGGTAGTTTCGATGATTTACAAATCATTATCAAAAACTTATTATT]


>consensus_8764#0 CACCATTCGAAATTTTAAGGTTATGTACTACTGTTGACTTATCTATAGTAAGGTATCGAT TATAATGGAAGCTTTCCTCACTGGATTCAAACAAAAGCCCCAAGATAGCAAGCGACGCAT AAAAAGTCAGAAGCATATCCCTTGGGTTGAAAAATATCGACCAAAGACAGTAGGTGAAGT AGCTTATCAAACAGAAGTCGTTAGCGTTCTTCAAAGGTGTATTGAAGGATCTGATTTGCC AAATTTATTGTTTTATGGACCGCCGGGAACTGGAAAGACGTCTTTAATTCTGGCTTTAGC TCGTCAACTTTTTGGCCCTTTGTATTCGGAACGTGTTTTAGAATTGAATGCGAGCGATGA ACGCGGGATCAGTGTTATTCGAGAAAAAGTGAAGGCTTTCGCTCACATTGCTGTTAGTAG TAGTACTAATAGCTCTGGTTCAAGTTCAACTAATATACCACCATATAAATTAATAATCTT AGATGAAGCTGATTCTATGACAGCACCTGCACAAGCTGCTCTACGTCGTACAATGGAGAC TGAAATGAGAACTACACGATTTTGTTTAACTTGTAATTATGTTACACGAATTATTGAACC AATCACAAGTCGATGTGCAAAGTTTAGATTTCGTCCATTGGATAATGAAATTGCACGTTC TCGTTTGCGTCATATTGCAGATGCAGAAAATTTATCTATTACTAATGAGACATTGGATCA TTTACTGTCACTTTGTCATGGTGATTTACGGCAAGGCATCACAATGTTACAATGTGTTCA TCAGTTAATTCTATCCGTTGATGATTCCGATGTTGGTTGTCGTTCTTCGATTACCTCAAA AGAATTAGATGAGGCTGCAGCTGTTGTTCCTAGTGATTTAATTAAAAGTCTTATTAAAAC ATCAGAAAATGGTAGTTTCGATGATTTACAAATCATTATCAAAAACTTATTATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)