These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8771#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 883 fasta sequence [ATTATCAGCTAAATAGTTTAATGATATAGGATTTCCATTAGAATCCATGATATCCCAATTGTATGAAAGTATGACAGAGTTTATACCATCTTTAGCTTCAGCATTACAATCCAGTGTTTTATCATCATTAGCCGCTCCAATCAAATTACCGTCATCGTTTAGACCGTCCACAGTAACAAGAATACGATCATCTGTATCTTCCGTTTCTTTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTACGGTGATAAGATATCTAGGAGTGATCACTGGAATAACTTCTGATCCTTCTTCATCAGATTCAGTAAGTAATCGATAATATGGTGACGAATAGATTGATGTACCATTTGATAAACGACATCTTACATAAGCTTCATCCTTTGGAGTTAAATCATCATTTAATAAAATAGATAAATAACCACCAGGTGATTCTTCTAATTTAGAAACTAATGGACCAAGTGAACCCCGTATAGGCGGTGATGATGATGTATCAGATTGTGTATAATAATAATCCCATCCATAATTTAAA] [-] EMBL CD191282 [ATTATCAGCTAAATAGTTTAATGATATAGGATTTCCATTAGAATCCATGATATCCCAATTGTATGAAAGTATGACAGAGTTTATACCATCTTTAGCTTCAGCATTACAATCCAGTGTTTTATCATCATTAGCCGCTCCAATCAAATTACCGTCATCGTTTAGACCGTCCACAGTAACAAGAATACGATCATCTGTATCTTCCGTTTCTTTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAAC TTACATC TCCTag ] [+] EMBL CD126336 [ AGACCGTCCACAGTAACAAGAATACGATCATCTGTATCTTCCGTTTCTTTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTACGGTGATAAGATATCTAGGAGTGATCACTGGAATAACTTCTGATCCTTCTTCATCAGATTCAGTAAGTAATCGATAATATGGTGACGAATAGATTGATGTACCATTTGATAAACGACATCTTACATAAGCTTCATCCTTTGGA ] [+] EMBL CD063814 [ GTAACAAGAA A GATCATCTGTATCTTCCGTTTC TTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTACGGTGATAAGATATCTAGGAGTGATCACTGGAATAACTTCTGATCCTTCTTCATCAGATTCAGTAAGTAATCGATAATATGGTGACGAATA ] [+] EMBL CD190020 [ TACGATCATCTGTATCTTCCGTTTCTTTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACAT ] [+] EMBL CD064416 [ TCAATGTGTCTACATCATCCAATGCTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATCTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGGTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGT ] [-] EMBL CD063744 [ CTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTGCGGTGATAAGATATCTAGGAGTGATCACTGGAATAACTTCTGATCCTTCTTCATCAGATTCAGTAAGTAATCGATAATATGGTGACGAATAGATTGATGTACCATTTGATAAACGACATCTTACATAAGCTTCATCCTTTGGAGTTAAATCATCATTTAATAAAATAGATAAATAACCACCAGGTGATTCTTCTAATTTAGAAACTAATGGACCAAGTGAACCCCGTATAGGCGGTGATGATGATGTATCAGATTGTGTATAATAATAATCCCATCCATAATTTAAA] [+] EMBL CD063745 [ GCTGGTTTTCTAGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTACGGTGATAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||