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Schistosoma mansoni
cluster # 8771 cluster # 8771       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8771#0 length = 883 sequences # 7  

consensusID : consensus_8771#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 883
fasta sequence
                              [ATTATCAGCTAAATAGTTTAATGATATAGGATTTCCATTAGAATCCATGATATCCCAATTGTATGAAAGTATGACAGAGTTTATACCATCTTTAGCTTCAGCATTACAATCCAGTGTTTTATCATCATTAGCCGCTCCAATCAAATTACCGTCATCGTTTAGACCGTCCACAGTAACAAGAATACGATCATCTGTATCTTCCGTTTCTTTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTACGGTGATAAGATATCTAGGAGTGATCACTGGAATAACTTCTGATCCTTCTTCATCAGATTCAGTAAGTAATCGATAATATGGTGACGAATAGATTGATGTACCATTTGATAAACGACATCTTACATAAGCTTCATCCTTTGGAGTTAAATCATCATTTAATAAAATAGATAAATAACCACCAGGTGATTCTTCTAATTTAGAAACTAATGGACCAAGTGAACCCCGTATAGGCGGTGATGATGATGTATCAGATTGTGTATAATAATAATCCCATCCATAATTTAAA]

[-] EMBL CD191282             [ATTATCAGCTAAATAGTTTAATGATATAGGATTTCCATTAGAATCCATGATATCCCAATTGTATGAAAGTATGACAGAGTTTATACCATCTTTAGCTTCAGCATTACAATCCAGTGTTTTATCATCATTAGCCGCTCCAATCAAATTACCGTCATCGTTTAGACCGTCCACAGTAACAAGAATACGATCATCTGTATCTTCCGTTTCTTTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAAC TTACATC TCCTag                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD126336             [                                                                                                                                                                AGACCGTCCACAGTAACAAGAATACGATCATCTGTATCTTCCGTTTCTTTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTACGGTGATAAGATATCTAGGAGTGATCACTGGAATAACTTCTGATCCTTCTTCATCAGATTCAGTAAGTAATCGATAATATGGTGACGAATAGATTGATGTACCATTTGATAAACGACATCTTACATAAGCTTCATCCTTTGGA                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD063814             [                                                                                                                                                                            GTAACAAGAA A GATCATCTGTATCTTCCGTTTC TTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTACGGTGATAAGATATCTAGGAGTGATCACTGGAATAACTTCTGATCCTTCTTCATCAGATTCAGTAAGTAATCGATAATATGGTGACGAATA                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD190020             [                                                                                                                                                                                      TACGATCATCTGTATCTTCCGTTTCTTTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATATTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD064416             [                                                                                                                                                                                                                                                     TCAATGTGTCTACATCATCCAATGCTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATCTTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATCTGATCCTCTATAAGAAACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTGATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGGTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD063744             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTTCAGGCTCTTTGAAATCCCATACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTGCGGTGATAAGATATCTAGGAGTGATCACTGGAATAACTTCTGATCCTTCTTCATCAGATTCAGTAAGTAATCGATAATATGGTGACGAATAGATTGATGTACCATTTGATAAACGACATCTTACATAAGCTTCATCCTTTGGAGTTAAATCATCATTTAATAAAATAGATAAATAACCACCAGGTGATTCTTCTAATTTAGAAACTAATGGACCAAGTGAACCCCGTATAGGCGGTGATGATGATGTATCAGATTGTGTATAATAATAATCCCATCCATAATTTAAA]
[+] EMBL CD063745             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCTGGTTTTCTAGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAGTGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTACGGTGATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]


>consensus_8771#0 ATTATCAGCTAAATAGTTTAATGATATAGGATTTCCATTAGAATCCATGATATCCCAATT GTATGAAAGTATGACAGAGTTTATACCATCTTTAGCTTCAGCATTACAATCCAGTGTTTT ATCATCATTAGCCGCTCCAATCAAATTACCGTCATCGTTTAGACCGTCCACAGTAACAAG AATACGATCATCTGTATCTTCCGTTTCTTTGATACCTTTCTGTTTGATTGCTTCCTCATA TTCCTTCAATTTTTCTACATCATCCAATGTTGGCGGTTTAGTTTCAGGTTCTGCAGTATC TTTCTCCAAATTAATTAAGAAATCTGGTGAACTATCCCATTTATTTGATCCTCTATAAGA AACTTTACATCGTCCTTTAACATTATCAGATAATGAATCCAAATTAGTAATTGTCAACTG ATTTTGTACAAATTGAAAATCTCCTTTTGGATGATATGCTTCAGGCTCTTTGAAATCCCA TACATAAATGACATCTTCAGCTGGTTTTCTTGTTATAATATCAATAGCAGAACATTCCAG TGATACATTATCTCCTTGTTTAATTTGAAGTTGACCATCTTTATCTAAACCATGTACGGT GATAAGATATCTAGGAGTGATCACTGGAATAACTTCTGATCCTTCTTCATCAGATTCAGT AAGTAATCGATAATATGGTGACGAATAGATTGATGTACCATTTGATAAACGACATCTTAC ATAAGCTTCATCCTTTGGAGTTAAATCATCATTTAATAAAATAGATAAATAACCACCAGG TGATTCTTCTAATTTAGAAACTAATGGACCAAGTGAACCCCGTATAGGCGGTGATGATGA TGTATCAGATTGTGTATAATAATAATCCCATCCATAATTTAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)