cluster # 878

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Schistosoma mansoni
cluster # 878 cluster # 878 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_878#0 length = 878 sequences # 2

consensusID : consensus_878#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 878
fasta sequence

                              [GAGCCATATTCGGCACGCAGGAAAAAAGTTGAAAGCGATTGGAGTTTACCATTTACGGTAGTCACTGATATTAATTCAAACACTGATGCAGATTCACATCAACCTCGATGTAAATGCCGAGGAACATGTCAAGCACGGTGTAGTTGTAAACGTTCCGGTCGTCCGTGTGTTCCATCACATTGTCACTGTGTATTAGGTCTATGCAAAAATCGTTCAGATTCATCATCGGAAAACAGTAAAATATTGAGTTCAGTCAATAATTCTGCAACTGTTATGGGACCACCATCTGGATTTCCTGTTATATTACGTCCTAAACGTAAAACTCGTGCACTACATTTAAATTTGAATAAAGAACAACAAAATGAACATGATGCTCATACAATGATGAATGAAACATTCGATTTAAACAAACAACAGTCTCCTACATCCATATCAGAAAGTAATGATAATGATGATTTACAATCTCCAACTAGCAATTCACAACTATCTGATGGTGGGTCACTTCGTTATTTATGGCCTAAAAATCGCTTATCTTATTTTCCCAGTCCACTATTACGTTCAGACAGATAAACGTTTTCTAGCCCACAAAGATCTCCAAGAAATGTACTTCACTATCCTGGCTACGTTGGTTTCCTTTTTTTAGTTTAAAACACTTGTACGTGGTTTCTGTGTGTGTATGTACGCTATCATTCTATCTCTTTTCACTTTTATCCAGTTTATGTATATATTTGTTGCTTACAGTAGGACAAGTAGGATTATTTTAACTTGTGTGTTGTGTTTTGCTTCTTTATTTTTCACATTCCTAGTCCATTTCATTATGAATGTTNTAGCTCCAATATCCTGATTTGTCATTCATAAAATGANTAATACACTTAAAC]

[+] EMBL CD081758             [GAGCCATATTCGGCACGCAGGAAAAAAGTTGAAAGCGATTGGAGTTTACCATTTACGGTAGTCACTGATATTAATTCAAACACTGATGCAGATTCACATCAACCTCGATGTAAATGCCGAGGAACATGTCAAGCACGGTGTAGTTGTAAACGTTCCGGTCGTCCGTGTGTTCCATCACATTGTCACTGTGTATTAGGTCTATGCAAAAATCGTTCAGATTCATCATCGGAAAACAGTAAAATATTGAGTTCAGTCAATAATTCTGCAACTGTTATGGGACCACCATCTGGATTTCCTGTTATATTACGTCCTAAACGTAAAACTCGTGCACTACATTTAAATTTGAATAAAGAACAACAAAATGAACATGATGCTCATACAATGATGAATGAAACATTCGATTTAAACAAACAACAGTCTCCTACATCCATATCAGAAAGTAATGATAATGATGATTTACAATCTCCAACTAGCAATTCACAACTATCTGATGGTGGGTCACTTCGTTATTTATGGCCTAAAAATCGCTTATCTTATTTTCCCAGTCCACTATTACGTTCAGACAGATAAACGTTTTCTAGCCCACAAAGATCTCCAAGAAATGTACTTCACTATCCTGGCTACGTTGGTTTCCTTTTTTTAGTTTAAAACACTTGTACGTGGTTTCTGTGTGTGTATGTACGCTATCATTCTATCTCTTTTCACTTTTATCCAGTTTATGTATATATTTGTTGCTTACAGTAGGACAAGTAGGATTATTTTAACTTGTGTGTTGTGTTTTGCTTCTTTATTTTTCACATTCCTAGTCCATTTCATTATGAATGTTNTAGCTCCAATATCCTGATTTGTCATTCATAAAATGANTAATACACTTAAAC]
[-] EMBL CD075491             [                                                                                                                                                  TAAACGTTCCGGTCGTCCGTGTGTTCCATCACATTGTCACTGTGTATTAGGTCTATGCAAAAATCGTTCAGATTCATCATCGGAAAACAGTAAAATATTGAGTTCAGTCAATAATTTTGCAACTGTTATGGGACCACCATCTGGATTTCCTGTTATATTACGTCCTAAACGTAAAACTCGTGCACTACATTTAAATTTGAATAAAGAACAACAAAATGAACATGATGCTCATACAATGATGAATGAAACATTCGATTTAAACAAACAACAGTTTCCTACATCCATATCAGAAAGTAATGATAATGATGATTTACAATCTCCAACTAGCAATTCACAACTATTTGATGGTGGGTCACTTCGTTATTTATGGCCTAAAAATCGCTTATTTTATTTTCCCAGTCCCCTATTACGTTCAGACAGATAAACGTTTTTTAGCCCCCAAAGATTTCCAAGAAATGTACTTCACTATCCTGGGTACGTTGGTTTCCTTTTTTTAGTTTAAAACACTTGTACGTGGTTTCTGTGTGTGTATGTACGCTATCATTTTATCTCTTTTCACTTTTATCCAGTTTATGTATATATTTGTTGCTTACAGTAGGACAAGTAGGATTATTTTAACTTGTGTGTTGTGTTTTGCTTCTTTATTTTTCACATTCCTAGTCCATTTCATTATGAATGTTTTAGCTCCAATATCCTGATTTGTCATTCATAAAATGATAAATACACGAAAAC]




>consensus_878#0
GAGCCATATTCGGCACGCAGGAAAAAAGTTGAAAGCGATTGGAGTTTACCATTTACGGTA
GTCACTGATATTAATTCAAACACTGATGCAGATTCACATCAACCTCGATGTAAATGCCGA
GGAACATGTCAAGCACGGTGTAGTTGTAAACGTTCCGGTCGTCCGTGTGTTCCATCACAT
TGTCACTGTGTATTAGGTCTATGCAAAAATCGTTCAGATTCATCATCGGAAAACAGTAAA
ATATTGAGTTCAGTCAATAATTCTGCAACTGTTATGGGACCACCATCTGGATTTCCTGTT
ATATTACGTCCTAAACGTAAAACTCGTGCACTACATTTAAATTTGAATAAAGAACAACAA
AATGAACATGATGCTCATACAATGATGAATGAAACATTCGATTTAAACAAACAACAGTCT
CCTACATCCATATCAGAAAGTAATGATAATGATGATTTACAATCTCCAACTAGCAATTCA
CAACTATCTGATGGTGGGTCACTTCGTTATTTATGGCCTAAAAATCGCTTATCTTATTTT
CCCAGTCCACTATTACGTTCAGACAGATAAACGTTTTCTAGCCCACAAAGATCTCCAAGA
AATGTACTTCACTATCCTGGCTACGTTGGTTTCCTTTTTTTAGTTTAAAACACTTGTACG
TGGTTTCTGTGTGTGTATGTACGCTATCATTCTATCTCTTTTCACTTTTATCCAGTTTAT
GTATATATTTGTTGCTTACAGTAGGACAAGTAGGATTATTTTAACTTGTGTGTTGTGTTT
TGCTTCTTTATTTTTCACATTCCTAGTCCATTTCATTATGAATGTTNTAGCTCCAATATC
CTGATTTGTCATTCATAAAATGANTAATACACTTAAAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case