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Schistosoma mansoni
cluster # 8807 cluster # 8807       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8807#0 length = 718 sequences # 7  

consensusID : consensus_8807#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 718
fasta sequence
                              [TGGCACGTTGGATATACGTCTTATAAAAGCTTGAATTTTTCGAGGAGATGGCTGATTTAGAAGCTGTGCTAGCGGATGTCAGCTATTTGATGGCTATGGAGATGAGTAAATCCACTCCAGCGGCTCGTGCGAGCAAAAGAATTACATTACCGGACCCCAGCATCCGTGGTATCATGACCAAGTATTTGGAAAAGAACAACCAAATGACCTTCGATAAAATTTTCAACGAGAAGTTAGGTTACTTGTTGTTTCGGGATTTCGTTCTCAATGTAAGTGAAGAACCTGTTCCTCAGCTTACGTTTTACGAAAATATTAAAAAGTTTGAAAAGTTAGACACAGATGAAGAGCGTATTAAATTTGGCCGAGAAATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]

[+] EMBL CD115551             [TGGCACGTTGGATATACGTCTTATAAAAGCTTGAATTTTTCGAGGAGATGGCTGATTTAGAAGCTGTGCTAGCGGATGTCAGCTATTTGATGGCTATGGAGATGAGTAAATCCACTCCAGCGGCTCGTGCGAGCAAAAGAATTACATTACCGGACCCCAGCATCCGTGGTATCATGACCAAGTATTTGGAAAAGAACAACCAAATGACCTTCGATAAAATTTTCAACGAGAAGTTAGGTTACTTGTTGTTTCGGGATTTCGTTCTCAATGTAAGTGAAGAACCTGTTCCTCAGCTTACGTTTTACGAAAATATTAAAAAGTTTGAAAAGTTAGACACAGATGAAGAGCGTATTAAATTTGGCCGAGAAATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTCTGTCA                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD185121             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTAAAAAGTTTGAAAAGTTAGACACAGATGAAGAGCGTATTAAATTTGGCCGAGAAATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]
[+] EMBL CD133916             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTAAAAAGTTTGAAAAGTTAGACACAGATGAAGAGCGTATTAAATTTGGCCGAGAAATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCCCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]
[+] EMBL CD185525             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]
[+] EMBL CD133872             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]
[+] EMBL CD131515             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAACTCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]
[+] EMBL CD131458             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCTCTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGCTACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATGTATCTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGGAGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTGGTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA]


>consensus_8807#0 TGGCACGTTGGATATACGTCTTATAAAAGCTTGAATTTTTCGAGGAGATGGCTGATTTAG AAGCTGTGCTAGCGGATGTCAGCTATTTGATGGCTATGGAGATGAGTAAATCCACTCCAG CGGCTCGTGCGAGCAAAAGAATTACATTACCGGACCCCAGCATCCGTGGTATCATGACCA AGTATTTGGAAAAGAACAACCAAATGACCTTCGATAAAATTTTCAACGAGAAGTTAGGTT ACTTGTTGTTTCGGGATTTCGTTCTCAATGTAAGTGAAGAACCTGTTCCTCAGCTTACGT TTTACGAAAATATTAAAAAGTTTGAAAAGTTAGACACAGATGAAGAGCGTATTAAATTTG GCCGAGAAATATATGATCAACACATTATGAAAGAACTTTTATCTCATAACCACAAATTCT CTAAATCAACTGTGGATCATGTCCATGAACTACTCACTGTATCTCAAAAGACTAAAAAGC TACCAGCAGATACATTTTCTTTGTATGAAGATGAAATCCTACAGTCCCTTCGTGGTGATG TATTTGACAATTTTCTTAGAAGTAATAAATTCACTCGATTTTGTCAATGGAAGGATTTGG AGTTAAATATTAACTTAACCACAAACGATTTTAGCGTACATCGTATTATTGGCCGTGGTG GTTTTGGGGAGGTTTATGGATGCCGAAAAGCAGACACTGGTAAAATGTATGCTATGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)