These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8834#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 424 fasta sequence [TATTCTACCTACCAAGTGATGTGGAAAGTATATGTAAACG-ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG-TAGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTGTATGCCACAACTCAACAA-CATAATTTACGGATAAACAATTTGTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAA-TTTTTTGGAATTCAAGGAATTATTCGAATTCGAAATCCTACTTTGTTTTTTTTGTAACTGACTGCTTTCCATTGAACATTTGATATGTCCTACTCCTTATTTATAAACCTGTTATGTTTGAAAATAACGATAGCG] [+] EMBL CD178535 [TATTCTACCTACCAAGTGATGTGGAAAGTATATGTAAACG ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG TAGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTGTATGCCACAACTCAACAA CATAATTTACGGATAAACAATTTGTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAATTTTTTTGGAATTCAAGGAATTATTCGAATTCGAAATCCTACTTTGTTTTTTTTG ] [+] EMBL CD139085 [ gCAAGTGATGTGGAAAGTATATGTAAACG ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG TAGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTA ATAATCATGGATACTGTATGCCACAACTCAACAA CATAATTTACGGATAAACAATTTGTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAA TTTTTTGGAATTCAAGGAATTATTCGAATTCGAAATCCTACTTTGTTTTTTTTGTAACTGACTGCTTTCCATTGAACATTTGATATGTCCTACTCCTTATTTAT AACCTGTTATGTTTGAAAATAACGATAGCG] [+] EMBL CD139104 [ GTATATGTAAACG ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG TAGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTATATGCCACAACTCAACAAGCATAATTTACGGATAAACAATTTCTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAA TTTTTTGGAATTCAAGGAATTATTCGAATTCGAAATCCTACTTTGTTTTTTTTGTAACTGACTGCTTTCCATTGAACATTTGATATGTCCTACTCCTTATTTATAAACCTGTTATGTTTGAAAATAACGATAGCG] [+] EMBL CD139180 [ GTATATGTAAACG ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG TAGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTGTATGCCACAACTCAACAA CATAATTTACGGATAAACAATTTGTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAA TTTTTTGGAATTCAAGGAATTATTCGAATTCGAAATCCTACTTTGTTTTTTTTGTAACTGACTGCTTTCCATTGAACATTTGATATGTCCTACTCCTTATTTATAAACCTGNTATGTTTGAAAATAACGATAGC ] [+] EMBL CD139218 [ GTATATGTAAACG ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG TAGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTGTATGCCACAACTCAACAA CATAATTTACGGATAAACAATTTGTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAA TTTTTTGGAATT AAGGAATTATTCGAATTCGAAATCCTACTTTGTTTTTTTTGTAACTGACTGCTTTTCATTTGACATGTGATATGTCCTACTCCTCATTTATAAAGCTGNTATGTATGAAAAT ACGATAGC ] [+] EMBL CD139123 [ GTATATGTTCCCC ACTCGGTGTAAAAACCAGTGGCCCTACAATATACCGGTG TGGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTGTATGCCACAACTCAACAA CATAATTTACGGATGAACGATTTGTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACAGCTGCTTGTAAACAGGAGAATATCTGATGAATTTTTTTGGAATTCAAGGAATTATTCGAATTCAAAATCCTACTTTGTTTTTTTTGTAACTGACTGCTTTCCATTGAACATTTGATATGTCCTACTCCTTATTTATAAACCTGTTATGTTTGAAAATAACGATAGCG] [+] EMBL CD139107 [ GTATAT TTTACGCACTCGGTGAAAAAACCAGTGGCCCTACGATATACCGGNGNNNGCGTGATATTCACGAAAACGTTTTTACATAATCATGGATACTATATGCCACAACTCAACAA CATAATTTACGGATAAACAATTTCTGATAATTGGATGTTAGTTTATATTTTATGCGGAAATAACATGTGACTTCTATTGGTACTATAACCCGGGTATGCAGTATGCATCTCACACA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||