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Schistosoma mansoni
cluster # 8841 cluster # 8841       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8841#0 length = 899 sequences # 7  

consensusID : consensus_8841#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 899
fasta sequence
                              [TAATTTGAAAGAAATTGTTTTAACCAATTCATGTTATAATCAATATTCGATTTTCGATGAACTGATAATAATTGAATAATATTTGGTTTTATGAAATTATTCATCCATTGGCTCGCCTGATATCATTAATTTGGAATTTTCTGTACAGCCAAGATCAAATGTAACATGAAAAGATTGGTGACTTTGTTGTTCGTTAGTAAGTATTGATTTATTCATTTTTAGTGTCATATCTATATCTTCAGTTTTCGCAGGCTGAAGATCGAAGCCTAATTTAAGAAACTTAAGACCTTGTTCGGTGATATGATCCGGATGACTAGAAAGCCAGCTAGTATAGTTGGATAAATTAGATGTTGATGTTTGTTTATCTAAGAATAA-TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGATCTTTATTATGTATGATGTGAACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATCGGAAATACATAAATTTTCATCAGATATACGATGGATAAAACGTGATGATGAGAGATCCAATCGACCTTTAGATATGTTTTCACTATACAGTGTAAGATCTTTGGTATCTGATAAGCTAAAACGCCGAGTAGATTTGAAACCCCCCATTTTACCTGAAATTGCTCTCATTGCTGAACTATTACCTTGAACCATACTCGCCACACGTCCGGTAT]

[+] EMBL CD195244             [TAATTTGAAAGAAATTGTTTTAACCAATTCATGTTATAATCAATATTCGATTTTCGATGAACTGATAATAATTGAATAATATTTGGTTTTATGAAATTATTCATCCATTGGCTCGCCTGATATCATTAATTTGGAATTTTCTGTACAGCCAAGATCAAATGTAACATGAAAAGATTGGTGACTTTGTTGTTCGTTAGTAAGTATTGATTTATTCATTTTTAGTGTCATATCTATATCTTCAGTTTTCGCAGGCTGAAGATCGAAGCCTAATTTAAGAAACTTAAGACCTTGTTCGGTGATATGATCCGGATGACTAGAAAGCCAGCTAGTATAGTTGGATAAATTAGATGTTGATGTTTGTTTATCTAAGAATAA TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGACCTTTATTATGTATGATGTGAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD159235             [                                                                                                                                ATTTGGAATTTTCTGTACAGCCAAGATCAAATGTAACATGAAAAGATTGGTGACTTTGTTGTTCGTTAGTAAGTATTGATTTATTCATTTTTAGTGTCATATCTATATCTTCAGTTTTCGCAGGCTGAAGATCGAAGCCTAATTTAAGAAACTTAAGACCTTGTTCGGTGATATGATCCGGATGACTAGAAAGCCAGCTAGTATAGTTGGATAAATTAGATGTTGATGTTTGTTTATCTAAGAATAA TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGCCCTGACCTTTATTATGTATGATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD169163             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTTTATCTAAGAATAATTTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGATCTTTATTATGTATGATGTGAACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAGGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATCGGAAATACATAAATTTTCATCAGATATACGATGGATAAAACGTGATGATGAGAGATCCAATCGACCTTTAGATATGTTTTCACTATACAGTGTAAGATCTTTGGTATCTGATAAGCTAAAACGCCGAGTAGATTTGAAACCCCCCATTTT                                                              ]
[+] EMBL CD168927             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTAAGAATAA TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGATCTTTATTATGTATGATGTGAACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGCCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATCGGAAATACATAAATTTTCATCAGATATACGATGGATAAAACGTGATGATGAGAGATCCAATCGACCTTTAGATATGTTTTCACTATACAGTGTAAGATCTTTGGTATCTGATAAGCTAAAACGCCGAGTAGATTTGAAACCCCCCATTTT                                                              ]
[+] EMBL CD169054             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTAAGAATAA TTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATCATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGATCTTTATTATGTATGATGTGAACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCTTTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTA                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD168399             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATCGGAAATACACAAATTTTCATCAGATATACGATGGATAAAACGTGATGATGAGAGATCCAATCGACCTTTACATATGTTTTCACTATACAGTGTAAGATCTTTGGTATCTGAT AGCTAAAACGCCGAGTAGATTTGAAACCCCCCATTTTACCTGAAATTGCTCTCATTGCTGAACTATTACCTTGAACCATACTCGCCACACGTCCGGTAT]
[+] EMBL CD168398             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACATCATGATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGACGGCATTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGAAGTTGATGTAAAAGTAGACCGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAACCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATC                                                                                                                                                                                                                    ]


>consensus_8841#0 TAATTTGAAAGAAATTGTTTTAACCAATTCATGTTATAATCAATATTCGATTTTCGATGA ACTGATAATAATTGAATAATATTTGGTTTTATGAAATTATTCATCCATTGGCTCGCCTGA TATCATTAATTTGGAATTTTCTGTACAGCCAAGATCAAATGTAACATGAAAAGATTGGTG ACTTTGTTGTTCGTTAGTAAGTATTGATTTATTCATTTTTAGTGTCATATCTATATCTTC AGTTTTCGCAGGCTGAAGATCGAAGCCTAATTTAAGAAACTTAAGACCTTGTTCGGTGAT ATGATCCGGATGACTAGAAAGCCAGCTAGTATAGTTGGATAAATTAGATGTTGATGTTTG TTTATCTAAGAATAATTGTCGACAATCTGTAAAAGATGTTCGGAGTAAAGCTAATTCATC ATCTTCAAGTTTATTATAATCATTGTCCTGATCTTTATTATGTATGATGTGAACATCATG ATTATCTCTTTGAAACGATGTATGGTCGTAAGACACTTCATCTTCGTAATCCTTGGACGA CGGCATTCCTGACAAACGACGATAAAGTCTATAACTGATTGCTTCAGCTGAATCTAAGGA AGTTGATGTAAAAGTAGACGGTAACCAGGCAGGAATGCGAGTTAAATATTCAGTCTCTAA CCAACTGGGTTTAGTATTTTCAGAATCGGAAATACATAAATTTTCATCAGATATACGATG GATAAAACGTGATGATGAGAGATCCAATCGACCTTTAGATATGTTTTCACTATACAGTGT AAGATCTTTGGTATCTGATAAGCTAAAACGCCGAGTAGATTTGAAACCCCCCATTTTACC TGAAATTGCTCTCATTGCTGAACTATTACCTTGAACCATACTCGCCACACGTCCGGTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)