These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8853#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 555 fasta sequence [CCTGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAATTCTCGTGATACAGAACTATGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAGTAGAAACTGAAATGGATAAAAGAGGCATAACACAAGAAGAAATAGATGATTGGCATCGTGTGCCAGAATGTGAAATGCTTGCAGATATGGAAGCCTTATACAAAGCTGGTGCAGACCTTGATCGACTAGATGCACAAGGAGCATCTATGTTACACATCGCAGCTGCTAGTGGCTTTGAAGAAGTTGTTTTGTTTTTGTTAAAACGTGGAGCGAAAATTGATTTACTTGACAAAGATGGTTGGCAAGC] [+] EMBL CD125458 [CCTGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAATTCTCGTGATACAGAACTATGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAGTAGAAACTGAAATGGATAAAAGAGGCATAACACAAGAAGAAATAGATGATTGGCATCGTGTGCCAGAATGTGAAATGCTTGCAGATATGGAAGCCTTATACAAAGCTGGTGCAGACCTTGATCGACTAGATGCACAAGGAGCATCTATGTTACACATCGCAGCTGCTAGTGGCTTTGAAGAAGTTGTTTTGTTTTCGTTAAAACGTGGAGCGAAAATTGATTTACTTGACAAAGATGGTTGGCAAGC] [+] EMBL CD125455 [CCTGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAATTCTCGTGATACAGAACTATGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAGTAGAAACTGAAATGGATAAAAGAGGCATAACACAAGAAGAAATAGATGATTGGCATCGTGTGCCAGAATGTGAAATGCTTGCAGATATGGAAGCCTTATACAAAGCTGGTGCAGACCTTGATCGACTAGATGCACAAGGAGCATCTATGTTACACATCGCAGCTGCTAGTGGCTTTGAAGAAGTTGTTTTGTTTTTGTTANAACGTGGAGCG AAATTGATTTACTTGAC AAGATGGTT ] [+] EMBL CD164763 [CCTGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAATTCTCGTGATACAGAACTATGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGATATGCGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAGTAGAAACTGAAATGGATAAAAGAGGCATAACACAAGAAGAAATAGATGATTGGCATCGTGTGCCAGAATGTGAAATGCTTGCAGATATGGAAGCCTTATACAAAGCTGGTGCAGACCTTGATCGACTAGATGCACAAGGAGCATCTAT ] [+] EMBL CD139054 [CCTGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAGATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAACTCTCGTGATACAGAACTATGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAATATAAACTGAAATGGATACAAGAc ] [+] EMBL CD182759 [CCTGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTGATTCTCGTGATACAGAACTGTGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCT ] [+] EMBL CD124371 [ TGGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAATTCTCGTGATACAGAACTATGGACTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAGTAGAAACTGAAATGGATAAAAGAGGCCTAACACAAGAAGAAATAGATGATTGGCATCGTGTGCCAGAATGTGAAATGCTTGCAGATATGGAAGCCTTATACAAAGCTGGGGCAGACCTTGATCGACTAGATGCACAAGGAGCATCTATGTTACACATCGCAGCTGCTAGTGGCTTTGAAGAAGTTGTTTTGTTTTTG ] [-] EMBL CD124455 [ GGATGAAGTTCGTGAATTACTTAGCAGTGGAGTCTGTCCAGATGTAGCCAACGAGGATGGATTAACAGCATTACATCAGTGTTGTATTGATAACAATTTGGAAATGTGTCGGTTACTTCTTCGATATGGAGCAAATCCTAATTCTCGTGATACAGAACTATGGATTCCGTTACATGCGTCAGCTACATGTCATCATACAGAGATGTGTAAAATTCTAATTGATCACGGTGCAGATCTACTAGCTATGAATGTTGATGGTAATATGCCTTATGAATGTTGTATGCCTGGACCAACATTGAATTTAGTAGAAACTGAAATGGATAAAAGAGGCATAACACAAGAAGAAATAGATGATTGGCATCGTGTGCCAGAATGTGAAATGCTTGCAGATATGGAAGCCTTATACAAAGCTGGTGCAGACCTTGATCGACTAGATGCACAAGGAGCATCTATGTTACACATCGCAGCTGCTAGTGGCTTTGAAGAAGTTGTTTTGTTTTTGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||