These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8877#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 726 fasta sequence [AACAAAAATTGGTTCCTTATGTTAGGAACCCAAACTATGATAACTTTTTCGATATAAAGCGACCCAAGTTAAAAACTGGTTATACTCTCTTGCATTTGTCTCATGTGCTAAACAGTCGATGCTCACTTTTTCAAACTACCCCAGTGTGGAATAGCCTATCTAAACATGTGGATAGTTTTCGTCTAATGATGAGAATTTTCGGACTTGCTCTTTCTGAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATGTACCACACAAAACTTTTTTAAAGTGGTCGAAGAGTTTGTCTTCAATGGAGTAATTAATAACTCAGACTGTATGAAGCAGGAGTTAGAGGCAGTTTCTGATTTGTATGGTAAATTTGATGAAGAACGGAGAAAAGAATACACTGAAGCTGTCAAAATGCAAAAATCTGAAAAGGTTGTTGAAAAAGCCAAAGAAAAATTAAGACAAATCCTAGATAGAGAGGAACAAATTACATACTTCCAGAATGGTACGAAAATAATAAAGGATGCATGGTTAGCGCCTCGAA] [+] EMBL CD091101 [AACAAAAATTGGTTCCTTATGTTAGGAACCCAAACTATGATAACTTTTTCGATATAAAGCGACCCAAGTTAAAAACTGGTTATACTCTCTTGCATTTGTCTCATGTGCTAAACAGTCGATGCTCACTTTTTCAAACTACCCCAGTGTGGAATAGCCTATCTAAACATGTGGATAGTTTTCGTCTAATGATGAGAATTTTCGGACTTGCTCTTTCTGAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCTGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATGT ] [+] EMBL CD091099 [AACAAAAATTGGTTCCTTATGTTAGGAACCCAAACTATGATAACTTTTTCGATATAAAGCGACCCAAGTTAAAAACTGGTTATACTCTCTTGCATTTGTCTCATGTGCTAAACAGTCGATGCTCACTTTTTCAAACTACCCCAGTGTGGAATAGCCTATCTAAACATGTGGATAGTTTTCGTCTAATGATGAGAATTTTCGGACTTGCTCTTTCTGAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATG ] [+] EMBL CD091081 [AACAAAAATTGGTTCCTTATGTTAGGAACCCAAACTATGATAACTTTTTCGATATAAAGCGACCCAAGTTAAAAACTGGTTATACTCTCTTGCATTTGTCTCATGTGCTAAACAGTCGATGCTCACTTTTTCAAACTACCCCAGTGTGGAATAGCCTATCTAAACATGTGGATAGTTTTCGTCTAATGATGAGAATTTTCGGACTTGCTCTTTCTGAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATT ] [-] EMBL CD091119 [ GAACAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCATACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATGTACCACACGAAACTTTTTTAAAGTGGTCGAAGAGTTTGTCTTCAATGGAGTAATTAATAACTCAGACTGTATGAAGCAGGAGTTAGAGGCAGTTTCTGATTTGTATGGTAAATTTGATGAAGAACGGAGAAAAGAATACATTGAAGCTGTCAAAATGCAAAAATCTGAAAAGGTTGTTGAAGAAacgc ] [-] EMBL CD091096 [ CAGTGTGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTCTCTAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTCTGCGTATTCAGGGCGGACCACAATGTACCACACAAAACTTTTTTAAAGTGGTCGAAGAGTTTGTCTTCAATGGAGTAATTAATAACTCAGACTGTATGAAGCAGGAGTTAGAGGCAGTTTCTGATTTGTATGGTAAATTTGATGAAGAACGGAGAAAAGAATACACTGAAGCTGTCAAAATGCAAAAATCTGAAAAGGTTGTTGAAAAAGCCAAAGAAAAATTAAGACA ] [-] EMBL CD160427 [ TGACAAATTATTAGTTGAAATCAGAAAAGTTGATGAGTCAGCAATACAGTTGGGGGGATTGGACCCTACAGTGGTGAAAAAGCTAATAAGAATTGTTGATACTTGTGAAACCCGATCCGATGACTCGTTTATAAAACCAGGAGAACCGCAGGTTCCAAGTGTATCAGATGTAAAATCAGTGCAGAATGAACTTTTGGGTATTCAGGGCGGACCCCAATGTACCACACAAAACTTTTTT AAGTGGTAGAAGAGTTTGTGTTCAATGGAGTAAATAATAACTCAG ] [+] EMBL CD184357 [ CCACACAAAACTTTTTTAAAGTGGTCGAAGAGTTTGTCTTCAATGGAGTAATTAATAACTCAGACTGTATGAAGCAGGAGTTAGAGGCAGTTTCTGATTTGTATGGTAAATTTGATGAAGAACGGAGAAAAGAATACACTGAAGCTGTCAAAATGCAAAAATCTGAAAAGGTTGTTGAAAAAGCCAAAGAAAAATTAAGACAAATCCTAGATAGAGAGGAACAAATTACATACTTCCAGAATGGTACGAAAATAATAAAGGATGCATGGTTAGCGCCTCGAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||