cluster # 8889

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8889 cluster # 8889 Sequences # 7 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8889#0 length = 622 sequences # 7
consensusID : consensus_8889#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 622
fasta sequence
                              [AAGAGGTAGTAACACTATTAGT-GGTAATATAAAAGATTAGGCATCAAAGCTTCGATTGAATAAAATATAAATTAGGGAAATAAGTGAATTATGAGGGATTCAAAAGCTTAGAATCTGGAGGAAGTCAGCATAAATGTACCTGCGCCATTGCAAACGATTTTGAGTCATGCCATTCAAAGTCTTTAACCACTAGTTACAATAATAGGGCGAACTCCAATCAGATAGTCTACATCTGTTAACATAGCTCAGTCCAGTTGTCAATGAATATGTGGAATGGTGCTATGTTTTGGTTTGCCGCCCCTAGCATTCTTCCAGCCTACTTTCATGCCGCGGTAGGTGGTGTGCGTGTATGTGTCATATCCAAACCACCTCATTTAATTAAAAAATATACTCCCTGATCAATTGACTGGTCATCTTTACCTAGTGCGTCCTATTCCTAAACCGAGCATTGCTTACTCAGTGGTCCCAAAATGCACGAGAAATGATTCAAAGATACATATG-GTGGAATACT-AGT-ACCTAGAGACACCTACTCTTAGTGGCCATGTTTCACACCCATANGAG-TGAGAGAACTATCTTCAACTACCTGNCTGGATGTTTAATCCTGTCACGATTGCTACTTCTG]

[+] EMBL CD202088             [ AGAGGTAGTAACACTATTAGT GGTAATATAAAAGATTAGGCATCAAAGCTTCGATTGAATAAAATATAAATTAGGGAAATAAGTGAATTATGAGGGATTCAAAAGCTTATAATCTGGAGGAAGTCAGCATAAATGTACCTGCGCCATTGCAAACGATTTTGAGTCATGCCATTCAAAGTCTTTAACCACTAGTTACAATAATAGGGCGAACTCCAATCAGATAGTCTACATCTGTTAACACAGCTCAGTCCAGTTGTCAATGAATATGTGGAATGGTGCTATGTTTTGGTTTGCCGCCCCTAGCATTCTTCCAGCCTACTTTCATGCCGCGGTAGGTGGTGTGCGTGTATGCGTCATATCCAAACCACCTCATTTAATTAAAAAATATACTCCCTGATCAATTGACTGGTCATCTTTACCTAGTGCGTCCTATTCCTAAACCGAGCATTGCTTACTCAGTGGTCCCAAAATGCACGAGAAATGATTCAAAGATACATATGNGTGGAATACTNAGT ACCTAGAGACACCTACTCTTAGTGGCCATGTTTCACACCCATANGAG TGAGAGAACTATCTTCAACTACCTGNCTGGATGTTTAATCCTGTCACGATTGCTACTTCTG]
[+] EMBL CD072155             [ AGAGGTAGTAACACTATTAGT GGTAATATAAAAGATTAGGCATCAAAGCTTCGATTGAATAAAATATAAATTAGGGAAATAAGTGAATTATGAGGGATTCAAAAGCTTAGAATCTGGAGGAAGTCAGCATAAATGTACCTGCGCCATTGCAAACGATTTTGAGTCATGCCATTCAAAGTCTTTAACCACTAGTTACAATAATAGGGCGAACTCCAATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD097657             [ AGAGGTAGTAACACTATTAGT GGTAATATAAAAGATTAGGCATCAAAGCTTCGATTGAATAAAATATAAATTAGGGAAATAAGTGAATTATGAGGGATTCAAAAGCTTAGAATCTGGAGGAAGTCAGCATAAATGTACCTGCGCCGTTGCAAACGATTTTGAGTCATGCCATTCAAAGTCTTTAACCACTAGTTACAATAATAGGGCGAACTCCAATCAGATAGTCTACATCTGTTAACATAGCTCAGTCCAGTTGTCAATGAATATGTGGAATGGTGCTATGTTTTGGTTTGCCGCCCCTAGCATTCTTCCAGCCTACTTTCATGCCGCGGTAGGTGGTGTGCGTGTATGTGTCATATCCAAACCACCTCATTTAATTAAAAAATATACTCCCTGATCAATTGACTGGTCATCTTTACCTAGTGCGTCCTATTCCTAAACCGAGCATTGCTTACTCAGTGGTCCCAAAATGCACGAGAAATGATTCGAAGATACATATG GTGGAATACT AGTAACCTAGAGACACCTACTCTTAGTGGCCAT                                                                                ]
[+] EMBL CD097699             [ AGAGGTAGTAACACTATTAGT GGTAATATAAAAGATTAGGCATCAAAGCCTCGATTGAATAAAATATAAATTAGGGAAATAAGTGAATTATGAGGGATTCAAAAGCTTAGAATCTGGAGGAAGTCAGCATAAATGTACCTGCGCCATTGCAAACGATTTTGAGTCATGCCATTCAAAGTCTTTAACCACTAGTTACAATAATAGGGCGAACTCCAATCAGATAGTCTACATCTGTTAACATAGCTCAGTCCAGTTGTCAATGAATATGTGGAATGGTGCTATGTTTTGGTTTGCCGCCCCTAGCATTCTTCCAGCCTACTTTCATGCCGCGGTAGGTGGTGTGCGTGTATGTGTCACATCCAAACCACCTCATTTAATTAAAAAATATACTCCCTGATCAATTGACTGGTCATCTTTACCTAGTGCGTCCTATTCCTAAACCGAGCATTGCTTACTCAGTGGTCCCAAAATGCACGAGAAATGATTCAAAGATACATATG GTGGAATACT AGT A                                                                                                            ]
[+] EMBL CD097688             [ AGAGGTAGTAACACTATTAGT GGTAATATAAAAGATTAGGCATCAAAGCTTCGATTGAATAAAATATAAATTAGGGAAATAAGTGAATTATGAGGGATTCAAAAGCTTAGAATCTGGAGGAAGTCAGCATAAATGTACCTGCGCCATTGCAAACGATTTTGAGTCATGCCATTCAAAGTCTTTAACCACTAGTTACAATAATAGGGCGAACTCCAATCAGATAGTCTACATCTGTTAACATAGCTCAGTCCAGTTGTCAATGAATATGTGGAATGGTGCTATGTTTTGGTTTGCCGCCCCTAGCATTCTTCCAGCCTACTTTCATGCCGCGGTAGGTGGTGTGCGTGTATGTGTCATATCCAAACCACCTCATTTAATTAAAAAATATACTCCCTGATCAATTGACTGGTCATCTTTACCTAGTGCGTCCTATTCCTAAACCGAGCATTGCTTACTCAGTGGTCCCAAAATGCACGAGAAATGATTCAAAGATACATATG GTGGAATACT AGT                                                                                                              ]
[+] EMBL CD097668             [ AGAGGTAGTAACACTATTAGT GGTAATATAAAAGATTAGGCATCAAAGCTTCGATTGAATAAAATATAAATTAGGGAAATAAGTGAATTATGAGGGGTTCAAAAGCTTAGAATCTGGAGGAAGTCGGCATAAATGTACCTGCGCCATTGCAAACGATTTTGAGTCATGCCATTCAAAGTCTTTAACCACTAGTTACAATAATAGGGCGAACTCCAATCAGATAGTCTACATCTGTTAACATAGCTCAGTCCAGTTGTCAATGAATATGTGGAATGGTGCTATGTTTTGGTTTGCCGCCCCTAGCATTCTTCCAGCCTACTTTCATGCCGCGGTAGGTGGTGTGCGTGTATGTGTCATATCCAAACCACCTCATTTAATTAAAAAATATACTCCCTGATCAATTGACTGGTCGTCTTTACCTAGTGCGTCCTATT                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD201961             [agGAGGTAGTACCACTA TAGTGGGTAATATAAAGCATTAGGCATCAAAGCTTCGATTGCATAAAATATAAATTAGGGAAATAAGTGAAATATGAGGGATTCAAAAGCTTAGAATCTGGAGANAGTCAGCATAAATGTACCTGCGCCATTGCAAACGATTTTGAGTCATGCCATTCAAAGTCTTTAACCACTAGTTACAATAATAGGGCGAACTCCAATCAGATAGTCTACATCTGTTAACATAGCTCAGTCCAGTTGTCAATGAATATGTGGAATGGTGCTATGTTTTGGTTTGCCGCCCCTAGCATTCTTCCAGCCTACTTTCATGCCGCGGTAGGTGGTGTGCGTGTATGTGTCATATCCAAACCACCTCATTTAATTAAAAAATATACTCCCTGATCAATTGACTGGTCATCTTTACCTAGTGCGTCCTATTCCTAAACCGAGCATTGCTTACTCAGTGGTCCCAAAATGCACGAGAAATGATTCAAAGATACATATG GTGGAATACT AGTAACCTAGAGACACCTACTCTTAGTGGCCATGTTTCACACCCATA GAGTTGAAAGAACTATCTTCAACTACCTG CGCCAAGGTTTTTCCAGTCACGACTGCTACTTC  ]




>consensus_8889#0
AAGAGGTAGTAACACTATTAGTGGTAATATAAAAGATTAGGCATCAAAGCTTCGATTGAA
TAAAATATAAATTAGGGAAATAAGTGAATTATGAGGGATTCAAAAGCTTAGAATCTGGAG
GAAGTCAGCATAAATGTACCTGCGCCATTGCAAACGATTTTGAGTCATGCCATTCAAAGT
CTTTAACCACTAGTTACAATAATAGGGCGAACTCCAATCAGATAGTCTACATCTGTTAAC
ATAGCTCAGTCCAGTTGTCAATGAATATGTGGAATGGTGCTATGTTTTGGTTTGCCGCCC
CTAGCATTCTTCCAGCCTACTTTCATGCCGCGGTAGGTGGTGTGCGTGTATGTGTCATAT
CCAAACCACCTCATTTAATTAAAAAATATACTCCCTGATCAATTGACTGGTCATCTTTAC
CTAGTGCGTCCTATTCCTAAACCGAGCATTGCTTACTCAGTGGTCCCAAAATGCACGAGA
AATGATTCAAAGATACATATGGTGGAATACTAGTACCTAGAGACACCTACTCTTAGTGGC
CATGTTTCACACCCATANGAGTGAGAGAACTATCTTCAACTACCTGNCTGGATGTTTAAT
CCTGTCACGATTGCTACTTCTG
clustalw multiple alignements is not computed in this case