Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8902 cluster # 8902       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8902#0 length = 690 sequences # 7  
consensusID : consensus_8902#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 690
fasta sequence 
                              [TATTTTGACGAAAGGATTAGTTAGTGCTTTTATTTTCACTC-CCGATGGAAATTATATTATCATTGCA-TTCGACAGGGAAATTTATGTGTACCAGACTGTGAGTGGATGCCTTGTGGGTGTTTTAGAAGGATCCCATTCTGCAAGAATATATGAAATGAAACTGTCCAAATGGAATTCAAACGGACCAGCATTTCTTGTTTCCACTGATATAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTCGTGGGTGGATCACAAGGTCTTAAGATATATGCTTTGTATGATGGCTGTGTTCTGGGATCATTACTCACAAACGTTTCTGGTGGGCTGTTAAGCCTTTGTCCCTCACCTGATAACAGTGGAAATCTATTTTGTGGTGGGAACGAAGGTTTACTATACACTGCTAATATACAATCCCAAACGGGTTGTTATTCTGCGGATAGGAAATACACCNGTGTTTCTCTGACTCCAATTTTTCAGCTTCACAAAAAGCAAATACTATGATGGCGATGGATCCNAATTGTGAAAGT]

[+] EMBL CD150338             [TATTTTGACGAAAGGATTAGTTAGTGCTTTTATTTTCACTC CCGATGGAAATTATATTATCATTGCA TTCGACAGGGAAATTTATGTGTACCAGACTGTGAGTGGATGCCTTGTGGGTGTTTTAGAAGGATCCCATTCTGCAAGAATATATGAAATGAAACTGTCCAAATGGAATTCAAACGGACCAGCATTTCTTGTTTCCACTGATATAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTCGTGGGTGGATCACAAGGTCTTAAGATATATGCT                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD144183             [ ATTTTGACGAAAGGATTAGTTAGTGCTTTTA TTTCACTCNNCGATGGAAATTATA TATCATTGCATTTCGACAGGGAAATTTATGTGTACCAGACTGTGAGTGGATGCCTNGTGGGTGTTTTAGAAGGATCCCATTCTGCAAGAATATATGAAATGAAACTGTCCAAATGGAATTCAAACGGGCCAGCATTTCTTGTTTCCACTGATATAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTTGTGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD118014             [               ATTAGTTAGTGCTTTTATTTTCACTC CCGATGGAAATTATATTATCATTGCA TTCGACAGGGAAATTTATGTGTACCAGACTGTGAGTGGATGCCTTGTGGGTGTTTTAGAAGGATCCCATTCTGCAAGAATATATGAAATGAAACTGTCCAAATGGAATTCAAACGGACCAGCATTTCTTGTTTCCACTGATATAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTCGTGGGTGGATCACAAGGTCTTAAGATATATGCTTTGTATGATGGCTGTGTTCTGGGATCATTACTCACAAACGTTTCTGGTGGGCTGTTAAGCCTTTGTCCCTC                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD084088             [                             acgaggTCACTC CCGATGGAAATTATATTATCATTGCA TTCGACAGGGAAATTTATGTGTACCAGACTGTGAGTGGATGCCTTGTGGGTGTTTTAGAAGGATCCCATTCTGCAAGAATATATGAAATGAAACTGTCCAAATGGAATTCAAACGGACCAGCATTTCTTGTTTCCACTGATATAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTCGTGGGTGGATCACAAGGTCTTAAGATATATGCTTTGTATGATGGCTGTG                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD155406             [                                                                                                     GAGTGGATGCCTTGTGGGTGTTTTAGAAGGATCCCATTCTGCAAGAATATATGAAATGAAACTGTCCAAATGGAATTCAAACGGACCAGCATTTCTTGTTTCCACTGATATAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTCGTGGGTGGATCACAAGGTCTTAAGATATATGCTTTGTATGATGGCTGTGTTCTGGGATCATTACTCACAAACGTTTCTGGTGGGCTGTTAAGCCTTTGTCCCTC                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD200367             [                                                                                                                                                                                                                  ggAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGGGAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGctg                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD182207             [                                                                                                                                                                                                                                                                                            TACTGAAGTTGAGCTTCATTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAGTACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTCGTGGGTGGACCACAAGGTCTTAAGATATATGCTTTGTATGATGGCTGTGTTCTGGGATCATTACTCACAAACGTTTCTGGTGGGCTGTTAAGCCTTTGTCCCTCACCTGATAACAGTGGAAATCTATTTTGTGGTGGGAACGAAGGTTTACTATACACTGCTAATATACAATCCCAAACGGGTTGTTATTCTGCGGATAGGAAATACACCNGTGTTTCTCTGACTCCAATTTTTCAGCTTCACAAAAAGCAAATACTATGATGGCGATGGATCCNAATTGTGAAAGT]




>consensus_8902#0
TATTTTGACGAAAGGATTAGTTAGTGCTTTTATTTTCACTCCCGATGGAAATTATATTAT
CATTGCATTCGACAGGGAAATTTATGTGTACCAGACTGTGAGTGGATGCCTTGTGGGTGT
TTTAGAAGGATCCCATTCTGCAAGAATATATGAAATGAAACTGTCCAAATGGAATTCAAA
CGGACCAGCATTTCTTGTTTCCACTGATATAGCCGGGTTTCTAGCTTGTTGGTCCTTGGG
GAGTCTTATCAACGGAGCAAGCAAGATGAGTACACAGAGTGCTACTGAAGTTGAGCTTCA
TTCAAATGTCAATCTATCAAGAGCTAAACATCTTCCGCTCTGGTATGTTATTCAAGCAAG
TACTAGTCATCCTGTGTGCGCAGTTATGGATGATATAGTCGTCGTGGGTGGATCACAAGG
TCTTAAGATATATGCTTTGTATGATGGCTGTGTTCTGGGATCATTACTCACAAACGTTTC
TGGTGGGCTGTTAAGCCTTTGTCCCTCACCTGATAACAGTGGAAATCTATTTTGTGGTGG
GAACGAAGGTTTACTATACACTGCTAATATACAATCCCAAACGGGTTGTTATTCTGCGGA
TAGGAAATACACCNGTGTTTCTCTGACTCCAATTTTTCAGCTTCACAAAAAGCAAATACT
ATGATGGCGATGGATCCNAATTGTGAAAGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)