These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8913#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1015 fasta sequence [ACAGCAATTTGTTCAGATAAAACTGGTACATTAACTACAAATCGTATGACAGCTGTTCAATGTTTCATTGGTAATAAACATTATAAACGTATACCGACAGCTTCAGAATTACCAGAATCTATTATCAATCTTATAGTAATGAATATATCCATTAATAGTGGGTATACATCGAAACTTTTGCCTCCAGATAATCCAAATGCTTTACCAAAACAAGTTGGAAATAAAACAGAATGTGCTTTATTAGGTTTTGTTAAATCTATTGGACGTAATTATGAAGATATACGTACACAATGGAGTGAAGAACGTTTATACAAAGTGTATACATTTAATTCAATACGTAAATCAATGAGTACAGTTATTAAAGAGTCAGATAATCCAATGTCATTTTTATTATTTACTAAAGGTGCTTCAGAAATGGTTGTTAAATGTTGTTCATGGATGATGGATGAACAAAATAGACCAAGACCATTCAGTTTACAAGATCAAGAACGTTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGGTGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTAT-AAAAA-AATTACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATTAGGTATTATTGGAATTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGTGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATACACATTAGTCAGTGGAATAATTAACAGTCGTGCAGCGCCGTCACGTCAAGTAGTCGCTG] [+] EMBL CD153876 [ACAGCAATTTGTTCAGATAAAACTGGTACATTAACTACAAATCGTATGACAGCTGTTCAATGTTTCATTGGTAATAAACATTATAAACGTATACCGACAGCTTCAGAATTACCAGAATCTATTATCAATCTTATAGTAATGAATATATCCATTAATAGTGGGTATACATCGAAACTTTTGCCTCCAGATAATCCAAATGCTTTACCAAAACAAGTTGGAAATAAAACAGAATGTGCTTTATTAGGTTTTGTTAAATCTATTGGACGTAATTATGAAGATATACGTACACAATGGAGTGAAGAACGTTTATACAAAGTGTATACATTTAATTCAATACGTAAATCAATGAGTACAGTTATTAAAGAGTCAGATAATCCAATGTCATTTTTATTATTTACTAAAGGTGCTTCAGAAATGGTTGTTAAATGTTGTTCATGGATGATGGATGAACAAAATAGACCAAGACCATTCAGTTTACAAGATCAAGAACGTTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGGTGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTAT AAAAANAATTAC ATAGCTA ] [+] EMBL CD117956 [ TGAGTATACATCGAAACTTTTGCCTCCAGATAATCCAAATGCTTTACCAAAACAAGTTGGAAATAAAACAGAATGTGCTTTATTAGGTTTTGTTAAATCTATTGGACGTAATTATGAAGATATACGTACACAATGGAGTGAAGAACGTTTATACAAAGTGTATACATTTAATTCAATACGTAAATCAATGAGTACAGTTATTAAAGAGTCAGATAATCCAATGTCATTTTTATTATTTACTAAAGGTGCTTCAGAAATGGTTGTTAAATGTTGTTCATGGATGATGGATGAACAAA ] [+] EMBL CD118069 [ TGGGTATACATCGAAACTTTTGCCTCCAGACAATCCAAATGCTTTACCAAAACAAGTTGGAAATAAAACAGAATGTGCTTTATTAGGTTTTGTTAAATCTATTGGACGTAATTATGAAGATATACGTACACAATGGAGTGAAGAACGTTTATACAAAGTGTATACATTTAATTCAATACGTAAATCAATGAGTACAGTTATTAAAGAGTCAGATAATCCAATGTCATTTTTATTATTTACTAAAGGTGCTTCAGAAATGGTTGTTAAATGTTGTTCATGGATGATGGATGAACA ] [-] EMBL CD155357 [ AGAACGTTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGATGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTAT AAAAA AATTACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATTAGGTATTATTGGAATTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGTGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATAC ] [+] EMBL CD117907 [ GAACGTTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGGTGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTATAAAAAA AATTACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATTAGGTATTATTGGAATTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGCGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATA ] [+] EMBL CD066260 [ TTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGGTGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTAT AAAAA AATTACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATAAGGAATTATTGGAACTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGTGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATACACATTAGTCAGTGGAATAATTAACAGTCGTGCAGCGCCGTCACGTCAAGTAGT ] [-] EMBL CD064165 [ ACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATTAGGTATTATTGGAATTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGTGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATACACATTAGTCAGTGGAATAATTAACAGTCGTGCAGCGCCGTCACGTCAAGTAGTCGCTG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||