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Schistosoma mansoni
cluster # 8913 cluster # 8913       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8913#0 length = 1015 sequences # 7  

consensusID : consensus_8913#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1015
fasta sequence
                              [ACAGCAATTTGTTCAGATAAAACTGGTACATTAACTACAAATCGTATGACAGCTGTTCAATGTTTCATTGGTAATAAACATTATAAACGTATACCGACAGCTTCAGAATTACCAGAATCTATTATCAATCTTATAGTAATGAATATATCCATTAATAGTGGGTATACATCGAAACTTTTGCCTCCAGATAATCCAAATGCTTTACCAAAACAAGTTGGAAATAAAACAGAATGTGCTTTATTAGGTTTTGTTAAATCTATTGGACGTAATTATGAAGATATACGTACACAATGGAGTGAAGAACGTTTATACAAAGTGTATACATTTAATTCAATACGTAAATCAATGAGTACAGTTATTAAAGAGTCAGATAATCCAATGTCATTTTTATTATTTACTAAAGGTGCTTCAGAAATGGTTGTTAAATGTTGTTCATGGATGATGGATGAACAAAATAGACCAAGACCATTCAGTTTACAAGATCAAGAACGTTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGGTGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTAT-AAAAA-AATTACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATTAGGTATTATTGGAATTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGTGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATACACATTAGTCAGTGGAATAATTAACAGTCGTGCAGCGCCGTCACGTCAAGTAGTCGCTG]

[+] EMBL CD153876             [ACAGCAATTTGTTCAGATAAAACTGGTACATTAACTACAAATCGTATGACAGCTGTTCAATGTTTCATTGGTAATAAACATTATAAACGTATACCGACAGCTTCAGAATTACCAGAATCTATTATCAATCTTATAGTAATGAATATATCCATTAATAGTGGGTATACATCGAAACTTTTGCCTCCAGATAATCCAAATGCTTTACCAAAACAAGTTGGAAATAAAACAGAATGTGCTTTATTAGGTTTTGTTAAATCTATTGGACGTAATTATGAAGATATACGTACACAATGGAGTGAAGAACGTTTATACAAAGTGTATACATTTAATTCAATACGTAAATCAATGAGTACAGTTATTAAAGAGTCAGATAATCCAATGTCATTTTTATTATTTACTAAAGGTGCTTCAGAAATGGTTGTTAAATGTTGTTCATGGATGATGGATGAACAAAATAGACCAAGACCATTCAGTTTACAAGATCAAGAACGTTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGGTGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTAT AAAAANAATTAC ATAGCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD117956             [                                                                                                                                                              TGAGTATACATCGAAACTTTTGCCTCCAGATAATCCAAATGCTTTACCAAAACAAGTTGGAAATAAAACAGAATGTGCTTTATTAGGTTTTGTTAAATCTATTGGACGTAATTATGAAGATATACGTACACAATGGAGTGAAGAACGTTTATACAAAGTGTATACATTTAATTCAATACGTAAATCAATGAGTACAGTTATTAAAGAGTCAGATAATCCAATGTCATTTTTATTATTTACTAAAGGTGCTTCAGAAATGGTTGTTAAATGTTGTTCATGGATGATGGATGAACAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD118069             [                                                                                                                                                              TGGGTATACATCGAAACTTTTGCCTCCAGACAATCCAAATGCTTTACCAAAACAAGTTGGAAATAAAACAGAATGTGCTTTATTAGGTTTTGTTAAATCTATTGGACGTAATTATGAAGATATACGTACACAATGGAGTGAAGAACGTTTATACAAAGTGTATACATTTAATTCAATACGTAAATCAATGAGTACAGTTATTAAAGAGTCAGATAATCCAATGTCATTTTTATTATTTACTAAAGGTGCTTCAGAAATGGTTGTTAAATGTTGTTCATGGATGATGGATGAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD155357             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGAACGTTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGATGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTAT AAAAA AATTACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATTAGGTATTATTGGAATTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGTGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATAC                                                          ]
[+] EMBL CD117907             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GAACGTTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGGTGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTATAAAAAA AATTACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATTAGGTATTATTGGAATTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGCGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATA                                                           ]
[+] EMBL CD066260             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGGTGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTAT AAAAA AATTACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATAAGGAATTATTGGAACTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGTGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATACACATTAGTCAGTGGAATAATTAACAGTCGTGCAGCGCCGTCACGTCAAGTAGT     ]
[-] EMBL CD064165             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATTAGGTATTATTGGAATTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGTGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATACACATTAGTCAGTGGAATAATTAACAGTCGTGCAGCGCCGTCACGTCAAGTAGTCGCTG]


>consensus_8913#0 ACAGCAATTTGTTCAGATAAAACTGGTACATTAACTACAAATCGTATGACAGCTGTTCAA TGTTTCATTGGTAATAAACATTATAAACGTATACCGACAGCTTCAGAATTACCAGAATCT ATTATCAATCTTATAGTAATGAATATATCCATTAATAGTGGGTATACATCGAAACTTTTG CCTCCAGATAATCCAAATGCTTTACCAAAACAAGTTGGAAATAAAACAGAATGTGCTTTA TTAGGTTTTGTTAAATCTATTGGACGTAATTATGAAGATATACGTACACAATGGAGTGAA GAACGTTTATACAAAGTGTATACATTTAATTCAATACGTAAATCAATGAGTACAGTTATT AAAGAGTCAGATAATCCAATGTCATTTTTATTATTTACTAAAGGTGCTTCAGAAATGGTT GTTAAATGTTGTTCATGGATGATGGATGAACAAAATAGACCAAGACCATTCAGTTTACAA GATCAAGAACGTTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGGTGAAGGTCTTCGAACT ATTGGTATAGCTTATAAAAAAATTACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATG ATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTA TTAGGTATTATTGGAATTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAA TGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGA TCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGT AAAGAATTTAATCGACGTATTCGTGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTT GATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATACACA TTAGTCAGTGGAATAATTAACAGTCGTGCAGCGCCGTCACGTCAAGTAGTCGCTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)