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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8913#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1015 fasta sequence
[ACAGCAATTTGTTCAGATAAAACTGGTACATTAACTACAAATCGTATGACAGCTGTTCAATGTTTCATTGGTAATAAACATTATAAACGTATACCGACAGCTTCAGAATTACCAGAATCTATTATCAATCTTATAGTAATGAATATATCCATTAATAGTGGGTATACATCGAAACTTTTGCCTCCAGATAATCCAAATGCTTTACCAAAACAAGTTGGAAATAAAACAGAATGTGCTTTATTAGGTTTTGTTAAATCTATTGGACGTAATTATGAAGATATACGTACACAATGGAGTGAAGAACGTTTATACAAAGTGTATACATTTAATTCAATACGTAAATCAATGAGTACAGTTATTAAAGAGTCAGATAATCCAATGTCATTTTTATTATTTACTAAAGGTGCTTCAGAAATGGTTGTTAAATGTTGTTCATGGATGATGGATGAACAAAATAGACCAAGACCATTCAGTTTACAAGATCAAGAACGTTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGGTGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTAT-AAAAA-AATTACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATTAGGTATTATTGGAATTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGTGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATACACATTAGTCAGTGGAATAATTAACAGTCGTGCAGCGCCGTCACGTCAAGTAGTCGCTG]
[+] EMBL CD153876 [ACAGCAATTTGTTCAGATAAAACTGGTACATTAACTACAAATCGTATGACAGCTGTTCAATGTTTCATTGGTAATAAACATTATAAACGTATACCGACAGCTTCAGAATTACCAGAATCTATTATCAATCTTATAGTAATGAATATATCCATTAATAGTGGGTATACATCGAAACTTTTGCCTCCAGATAATCCAAATGCTTTACCAAAACAAGTTGGAAATAAAACAGAATGTGCTTTATTAGGTTTTGTTAAATCTATTGGACGTAATTATGAAGATATACGTACACAATGGAGTGAAGAACGTTTATACAAAGTGTATACATTTAATTCAATACGTAAATCAATGAGTACAGTTATTAAAGAGTCAGATAATCCAATGTCATTTTTATTATTTACTAAAGGTGCTTCAGAAATGGTTGTTAAATGTTGTTCATGGATGATGGATGAACAAAATAGACCAAGACCATTCAGTTTACAAGATCAAGAACGTTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGGTGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTAT AAAAANAATTAC ATAGCTA ]
[+] EMBL CD117956 [ TGAGTATACATCGAAACTTTTGCCTCCAGATAATCCAAATGCTTTACCAAAACAAGTTGGAAATAAAACAGAATGTGCTTTATTAGGTTTTGTTAAATCTATTGGACGTAATTATGAAGATATACGTACACAATGGAGTGAAGAACGTTTATACAAAGTGTATACATTTAATTCAATACGTAAATCAATGAGTACAGTTATTAAAGAGTCAGATAATCCAATGTCATTTTTATTATTTACTAAAGGTGCTTCAGAAATGGTTGTTAAATGTTGTTCATGGATGATGGATGAACAAA ]
[+] EMBL CD118069 [ TGGGTATACATCGAAACTTTTGCCTCCAGACAATCCAAATGCTTTACCAAAACAAGTTGGAAATAAAACAGAATGTGCTTTATTAGGTTTTGTTAAATCTATTGGACGTAATTATGAAGATATACGTACACAATGGAGTGAAGAACGTTTATACAAAGTGTATACATTTAATTCAATACGTAAATCAATGAGTACAGTTATTAAAGAGTCAGATAATCCAATGTCATTTTTATTATTTACTAAAGGTGCTTCAGAAATGGTTGTTAAATGTTGTTCATGGATGATGGATGAACA ]
[-] EMBL CD155357 [ AGAACGTTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGATGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTAT AAAAA AATTACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATTAGGTATTATTGGAATTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGTGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATAC ]
[+] EMBL CD117907 [ GAACGTTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGGTGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTATAAAAAA AATTACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATTAGGTATTATTGGAATTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGCGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATA ]
[+] EMBL CD066260 [ TTTAACTGAAGCAGTAATTGAACCGATGGCAGGTGAAGGTCTTCGAACTATTGGTATAGCTTAT AAAAA AATTACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATAAGGAATTATTGGAACTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGTGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATACACATTAGTCAGTGGAATAATTAACAGTCGTGCAGCGCCGTCACGTCAAGTAGT ]
[-] EMBL CD064165 [ ACAATAGCTACGAATTCCAAAAGTCCAAATGATATGATTGTACAAAGTGAACCAAATTGGGATGATGAAGAACACTTATTAGAAGGTCTTACTTTATTAGGTATTATTGGAATTGAAGATCCAGTTCGACCAGAAGTACCAGCTGCTATACGTCAATGTCAAAAAGCTGGTATTACTGTACGTATGGTAACTGGTGATAATGTAAATACAGCACGATCAATTGCAATGAAATGTGGTATTATACAACCAGGTGAAAATTTTCTTGTTATTGAAGGTAAAGAATTTAATCGACGTATTCGTGATAAAGCAACTGGTAAAGTTAGACAAGATTTATTTGATCAAGTATGGATTAATTTAAGAGTATTGGCTAGATCTTCACCTCAGGATAAATACACATTAGTCAGTGGAATAATTAACAGTCGTGCAGCGCCGTCACGTCAAGTAGTCGCTG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||