These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8931#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 496 fasta sequence [TTCTTTTTGCCAATCAGAAGCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT-GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAACCA] [+] EMBL CD162295 [TTCTTTTTGCCAATCAGAAGCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTATAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAAC ] [+] EMBL CD162307 [TTCTCTTTGCCAATCAGAAGCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACTATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGGTGTTACGGAAGCTTATGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAGATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAA ] [+] EMBL CD162174 [ AGCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAGTTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAAAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTTGGATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAAATGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCAAAAAG TGNGAGATTCATT ANATAGATG AACAAGTGTCAGGAAAg ] [+] EMBL CD162234 [ GCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGATTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTGTTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCATTCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAGATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATGTGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAA ] [+] EMBL CD162235 [ GCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCCATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCATTTTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAA ] [+] EMBL CD162299 [ GCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAA ] [+] EMBL CD162273 [ GCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAG TGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACCGGTGTCAGGAAACCA] [+] EMBL CD162277 [ GCGTTTAAAGAATTTTAAGGTTACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACTATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||