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Schistosoma mansoni
cluster # 8931 cluster # 8931       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8931#0 length = 496 sequences # 8  

consensusID : consensus_8931#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 496
fasta sequence
                              [TTCTTTTTGCCAATCAGAAGCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT-GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAACCA]

[+] EMBL CD162295             [TTCTTTTTGCCAATCAGAAGCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTATAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAAC  ]
[+] EMBL CD162307             [TTCTCTTTGCCAATCAGAAGCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACTATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGGTGTTACGGAAGCTTATGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAGATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAA   ]
[+] EMBL CD162174             [                  AGCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAGTTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAAAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTTGGATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAAATGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCAAAAAG TGNGAGATTCATT ANATAGATG AACAAGTGTCAGGAAAg  ]
[+] EMBL CD162234             [                   GCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGATTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTGTTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCATTCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAGATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATGTGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAA   ]
[+] EMBL CD162235             [                   GCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCCATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCATTTTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAA   ]
[+] EMBL CD162299             [                   GCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACAGTTGTCAGGAAA   ]
[+] EMBL CD162273             [                   GCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTT GATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTATGATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGATGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAAATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAG TGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAACCGGTGTCAGGAAACCA]
[+] EMBL CD162277             [                   GCGTTTAAAGAATTTTAAGGTTACGGAGCCTATTTAATTACCTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACTATTAAGTGGCTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACTTGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGGAAG                                                                                                                                                                                                                                                              ]


>consensus_8931#0 TTCTTTTTGCCAATCAGAAGCGTTTAAGGAATTTTAAGGTCACGGAGCCTATTTAATTAC CTGATGCTCACGTAAGATTTGTTTACAGCGGGTTTTAGAGAGGACGTGACAATTAAGTGG CTACAAAAAGCGGGATTAGTAAGAAGATCCTTTATTTGTGATTGTGGTAGTCAAACGACT TGTGGGCCCTGTGCAGGCTACCATGATAATGTTGTCTTTCGACATAATATATGTTGGAGG AAGAAGTCTGCTAGAATGGAAACTTTTCGCTTGATCCAGATTGAGGCTAGGGCAAATTAT GATAATTGTTGCGAACTGGACAATAAAAGCATCCGTAACACTGGATGAAACATTTACGGA TGTTACGGAAGCTTAGGCTATTCAATCATATGAGTATTGTAGAGATATATGTGCATGAAA ATTGACAGGCTTGCATGAGTCGTTTCGAAGAGTTGAGAGAATCATTAAAATAGATGAAAC AGTTGTCAGGAAACCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)