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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8945#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1142 fasta sequence
[ATCATTCTTCAGTATCTTGATAATGTATCTTTCTTTCCAGTCTTTGATATTAGTTTTCCTTCACAAATCTTTGTGAAGAGGACGTGACTCATCTTTGCAGTTACCCCCATATCTGATTTCAACGCTTCGGCTGATATGTCGTTTGATTCTGCTGCTTTGACATTTTTGGTTTTTTTGAATGGCTTTGTTGATTTCCGATATTGGCAAGATATAATCCGTTAGGATGTTTGCTTGTGCGGCTTCGATATCCAATGGATTCAGAGGTCCCGTTCTATTCAAGAACTCTTAAAGTGCTTTACTGATCGGTTCTTCTGATATCAAACCCAAATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTGTTTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTTTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACTTTTGTATTGTTATTGGTCTGATTGTCCAATGCTTCTTTAGTTTCAGTTTCAGTCAGACCACCACCAGTTGGTGATCTGAAGCTATATTAGCTTCTTTGTTTGTTTCTATGACTTCCATGAACCCCATGAATTTTTTATTTATTCAGATGTGATTTATCTGGTTTTCTGTATCGTGGTCCCATGTAGTTTCGTGTTTGTTTTTGTGGAGGGAAGTACTATTACGTTACTACAGTGCTATTAAAAATAAACAGATCTACAAGCCTCTGGTCATCCTCAGTCCTTTTTTAAATTCATGCAGTCAAATTAATTCTTCATACC]
[+] EMBL CD068663 [ATCATTCTTCAGTATCTTGATAATGTATCTTTCTTTCCAGTCTTTGATATTAGTTTTCCTTCACAAATCTTTGTGAAGAGGACGTGACTCATCTTTGCAGTTACCCCCATATCTGATTTCAACGCTTCGGCTGATATGTCGTTTGATTCTGCTGCTTTGACATTTTTGGTTTTTTTGAATGGCTTTGTTGATTTCCGATATTGGCAAGATATAATCCGTTAGGATGTTTGCTTGTGCGGCTTCGATATCCAATGGATTCAGAGGTCCCGTTCTATTCAAGAACTCTTAAAGTGCTTTACTGATCGGTTCTTCTGATATCAAACCCAAATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCT ]
[+] EMBL CD095076 [ ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTGTTTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTGTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACTTTTGTATTGTTAT ]
[+] EMBL CD094615 [ ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTGTTTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTTTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACT ]
[+] EMBL CD094752 [ ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTGTTTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTTTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATC ]
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[+] EMBL CD095136 [ ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTCTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTG TTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAAGGTATCAATAAGGGTTCATGGTTTATTCT ]
[+] EMBL CD169361 [ TTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACTTTTGTATTGTTATTGGTCTGATTGTCCAATGCTTCTTTAGTTTCAGTTTCAGTCAGACCACCACCAGTTGGTGATCTGAAGCTATATTAGCTTCTTTGTTTGTTTCTATGACTTCCATGAACCCCATGAATTTTTTATTTATTCAGATGTGATTTATCTGGTTTTCTGTATCGTGGTCCCATGTAGTTTCGTGTTTGTTTTTGTGGAGGGAAGTACTATTACGTTACTACAGTGCTATTAAAAATAAACAGATCTACAAGCCTCTGGTCATCCTCAGTCCTTTTTTAAATTCATGCAGTCAAATTAATTCTTCATAC ]
[-] EMBL CD169740 [ TATTCAGATGTGATTTATCTGGTTTTCTGTATCGTGGTCCCATGTAGTTTCGTGTTTGTTTTTGTGGAGGGAAGTACTATTACGTTACTACAGTGCTATTAAAAATAAACAGATCTACAAGCCTCTGGTCATCCTCAGTCCTTTTTTAAATTCATGCAGTCAAATTAATTCTTCATACC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||