These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8948#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1549 fasta sequence [AGTATTATTATTATCATTATTATTGTT-ACAATAATTGCCTAAATGCTTGAATGCATCACTAAGACGTGTTTGTATAATAGGATCTTCACAATTATTAATCCATTGATAAACAAGATTTGAATAAGCTTCCGGACTTAAATGAATTAAATTGAGTAGTGCAGATGAAAATGATGCTTCTAAATTGACCGAATAACTTTCTTTGGTTAGTAATGTGAATAAATCAGATAGGAATTGTGTATTCAAACCGATAACATTGATTAAACGAATAGCATTTTGTAGCTCTTCTACATGACGAGAACGAGAACGTGATCTAATCTCCAAAAAATGATCAGTCAATGAAATGATAATATCCAAACACTGCTGAATCACTGAATTGTCAACACATCCTGCTGAACATGATGAAGATCGTGAAGTTGATG-AAGATTTAATGTGATTTGATTGAT-TAAATTCAACACCAAATATTCCAAATCGAAGAAGACGACCAAAAGATGAGAGTTGATTGTCTGTAAGTCGGATCAATCCCTGGGGACGTAATTCACATGCATAAGAGGCTAACGAATAAAATGCTTGGCATAATTCTGGGATTGTTAAATTAGATTCCGTTATTAACGGTAATAAATGTCCTAAGCCAATAACGGCTGCATCAACTGTCGGTATAGCACTAAATGTTGAATCTTGAGAATTGATAGAGTCTGGTTGAATAACTAGTTCATTGTCAACCTGAGACAGAAATACAGCACCACTAAGTCTTAATTCAAATTCATGATAGAGAACGCGATTTAAGAGATTAAGTAAAAGTTGAAGTTCTTGAATTTGATCATCTTCAGCTGTCGCTTCAAAATTTAATTTACCTTGTGTATTTTTAGTATAGTGTTTGCATAAAACAACTGTCCAATTTAAAAATGGACCAGAAGCACATGGAGTAACACAATCATTTCTATTTGCTTTATTTATTTCTAATGATGATTGTACAACTGTAGAATCATTATTTAATAATGATACTGAAGACAATTCTGACAATGATGATGGTAGACTGACCAAATAAATTAGACAAGATTCAGCGACATCAGAGAATAAAGAGAACAATGATTGTAAAGCTTCTGAGTAATTATGACATTTCAACACTAAATAATTTGCACTATGTGACAAGAATGGACCTAAAAGACCATTCCAAACTAATGAAACTAAATCGGTACTTGAGTTACTGTTTGATGCTATTGATCCTATAGCACGTGCAACACCTCTT-AAACAGCTGTACAATTAACCAACATACTAATGGTTGTAGAATCTTGAAGTGAACTGAAAGATGCATCATTTGTAAGAACATTGAGTATACGAAGAACTTGTTCTCGAATCTCGCGAATAAGCTGTAGTAGTAAAGAATCGGAGACTTCTTCATTACTATGATGCTGCTGCTGTACTAATGCCGATGATGATAGATTTTTTTTATCAATTGACCAACTGCCGCACAAACAAGCCTCAACTAATGGAATTAAACTATCTGTCGATAAATTAGACCATGTGTGTTCTGAAGCTTGAGGACCAGCGA] [+] EMBL CD179450 [AGTATTATTATTATCATTATTATTGTT ACAATAATTGCCTAAATGCTTGAATGCATCACTAAGACGTGTTTGTATAATAGGATCTTCACAATTATTAATCCATTGATAAACAAGATTTGAATAAGCTTCCGGACTTAAATGAATTAAATTGAGTAGTGCAGATGAAAATGATGCTTCTAAATTGACCGAATAACTTTCTTTGGTTAGTAATGTGAATAAATCAGATAGGAATTGTGTATTCAAACCGATAACATTGATTAAACGAATAGCATTTTGTAGCTCTTCTACATGACGAGAACGAGAACGTGATCTAATCTCCAAAAAATGATCAGTCAATGAAATGATAATATCCAAACACTGCTGAATCACTGAATTGTCAACACATCCTGCTGAACATGATGAAGGTCGTGAAGTTGATG AAGATTTAATGTGATTTGATTGAT TAAATTCAACACCAAATATTCCAAATCGAAGAAGACGACCAAAAGATGAGAGTTGATTGTCTGTAAGTCGGATCAATCCCTGNGGACGTAATTCACATGCATAAGAGGCTAACGAATAAAATGCTTGGCATAATTCTGGGATTGTTAAATTAGATTCCGTTATTAACGGT ATAAATGTCCTAA ] [-] EMBL AW053273 [ TATCCCTATTTTTTTTCACAA AATGCCCAAAATG TGGAGCCACCACTAAGACG GTTTGTATAATAGGATCTTCACAATTATTAATCCATTGATAAACAAGATTTGAATAAGCTTCCGGACTTAAATGAATTAAATTGAGTAGTGCAGATGAAAATGATGCTTCTAAATTGACCGAATAACTTTCTTTGGTTAGTAATGTGAATAAATCAGATAGGAATTGTGTATTCAAACCGATAACATTGATTAAACGAATAGCATTTTGTAGCTCTTCTACATGACGAGAACGAGAACGTGATCTAATCTCCACAAAATGATCAGT ] [-] EMBL CD183262 [ GATGAAAATGATGCTTCTAAATTGACCGAATAACTTTCTTTGGTTAGTAATGTGAATAAATCAGATAGGAATTGTGTATTCAAACCGATAACATTGATTAAACGAATAGCATTTTGTAGCTCTTCTACATGACGAGAACGAGAACGTGATCTAATCTCCAAAAAATGATCAGTCAATGAAATGATAATATCCAAACACTGCTGAATCACTGAATTGTCAACACATCCTGCTGAACATGATGAAGATCGTGAAGTTGATG AAGATTTAATGTGATTTGATTGAT TAAATTCAACACCA ] [+] EMBL CD181220 [ ATGATGAAGATCGTGAAGTTGATG AAGATTTAATGTGATTTGATTGAT TAAATTCAACACCAAATATTCCAAATCGAAGAAGACGACCAAAAGATGAGAGTTGATTGTCTGTAAGTCGGATCAATCCCTGGGGACGTAATTCACATGCATAAGAGGCTAACGAATAAAATGCTTGGCATAATTCTGGGATTGTTAAATTAGATTCCGTTATTAACGGTAATAAATGTCCTAAGCCAATAACGGCTGCATCAACTGTCGGTATAGCACTAAATGTT ] [-] EMBL CD181746 [ TGATGAAGATCGTGAAG TGATGAAAGATTTAATGTGANTTGA TGATAAAAATTCANCANCAAATATTCCAAATCGAAGAAGACGACCAAAAGATGAGAGTTGATTGTCTGTAAGTCGGATCAATCCCTGGGGACGTAATTCACATGCATAAGAGGCTAACGAATAAAATGCTTGGCATAATTCTGGGATTGTTAAATTAGATTCCGTTATTAACGGTAATAAATGTCCTAAGCCAATAACGGCTGCATCAACTGTCGGTATAGCACTAAATGTTGAATCTTGAGAATTGATAGAGTCTGGTTGAATAACTAGTTCATTGTCAACCTGAGACAGAAATACAGCACCACTAAGTCTTAATTCAAATTCATGATAGAGAACGCGATTTAAGAGATTAAGTAAAAGTTGAAGTTCTTGAATT ] [+] EMBL CD147307 [ TGTTGAATCTTGAGAATTGATAGAGTCTGGTTGAATAACTAGTTCATTGTCAACCTGAGACAGAAATACAGCACCACTAAGTCTTAATTCAAATTCATGATAGAGAACGCGATTTAAGAGATTAAGTAAAAGTTGAAGTTCTTGAATTTGATCATCTTCAGCTGTCGCTTCAAAATTTAATTTACCTTGTGTATTTTTAGTATAGTGTTTGCATAAAACAACTGTCCAATTTAAAAATGGACCAGAAGCACATGGAGTAACACAATCATTTCTATTTGCTTTATTTATTTCTAATGATGATTGTACAACTGTAGAATCATTATTTAATAATGATACTGAAGACAATTCTGACAATGATGATGGTAGACTGACCAAATAAATTAGACAAGATTCAGCGACATCAGAGAATAAAGAGAACAATGATTGTAAAGCTTCTGAGTAATTATGACATTTCAACA ] [+] EMBL CD201446 [ ACAGCACCACTAAGTCTTAATTCAAATTCATGATAGAGAACGCGATTTAAGAGATTAAGTAAAAGTTGAAGTTCTTGAATTTGATCATCTTCAGCTGTCGCTTCAAAATTTAATTTACCTTGTGTATTTTTAGTATAGTGTTTGCATAAAACAACTGTCCAATTTAAAAATGGACCAGAAGCACATGGAGTAACACAATCATTTCTATTTGCTTTATTTATTTCTAATGATGATTGTACAACTGTAGAATCATTATTTAATAATGATACTGGAGACAATTCTGACAATGATGATGGTAGACTGACCAAATAAATTAGACAAGATTCAGCGACATCAGAGAATAAAGAGAACAATGATTGTAAAGCTTCTGAGTAATTATGACATTTCAACACTAAATAATTTGCACTATGTGACAAGAATGGACCTAAAAGACCATTCCAAACTAATGAAACTAAATCGGTACTTGAGTTACTGTTTGATGCTATTGATCCTATAGCACGTGCAACACCTCTT AAACAGCTGTACAATTAACCAACATACTAATGGTTGTAGAATCTTGAAGTGAACTGAAAGATGCATCATTTGTAAGAACATTGA ] [+] EMBL CD119171 [ AGAGAACAATGATTGTAAAGCTTCTGAGTAATTATGACATTTCAACACTAAATAATTTGCACTATGTGACAAGAATGGACCTAAAGGACCATTCCAAACTAATGAAACTAAATCGGTACTTGAGTTACTGTTTGATGCTATTGATCCTATAGCACGTGCAACACCTCTTAAAACAGCTGTACAATTAACCAACATACTAATGGTTGTAGAATCTTGAAGTGAACTGAAAGATGCATCATTTGTAAGAACATTGAGTATACGAAGAACTTGTTCTCGAATCTCGCGAATAAGCTGTAGTAGTAAAGAATCGGAGACTTCTTCATTACTATGATGCTGCTGCTGTACTAATGCCGATGATGATAGATTTTTTTTATCAATTGACCAACTGCCGCACAAACAAGCCTCAACTAATGGAATTAAACTATCTGTCGATAAATTAGACCATGTGTGTTCTGAAGCTTGAGGACCAGCGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||