These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8991#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 801 fasta sequence [AAGACTCTTCATTAACACAGGTTCATTTTATTGAGAGTCTCTTAAATCTCCGAAGTAGATTTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAATGGTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTGTTATGTCGATACATGGATTCCTTATTACGTAAATCCGTCAAAACTATGACCATTTCAGAAATTGAAACTAAGCTGACAGCGTCAATCGCTATTTTCAAGTATATTGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTCGAAGAATCTGTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCTGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCGAATTGTATACATGTACTTACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAGTTATTCAACAGTAGAAATTCAATTGCTTTTCACTGATAAAGCTTATCAAATACAAGCGCCTGCTATTAATGCTGCTATCCTACTATTTTTTG] [+] EMBL BF936105 [AAGACTCTTCATTAACACAGGTTCATTTTATTGAGAGTCTCTTAAATCTCCACAGTATATTTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAATGGTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTGTTATGTCGATACATGGATTCCTTATTATGTAAATCCGTCAAAACTATGACCATTTCATAAATTGAAACTAATCTGACAGCGTCAATCGCTATTTTCAAGTGTATTGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTCGAAGAATCTGTGA ] [+] EMBL CD150054 [ CTTGATTAACACAGGTTCATTTTATTGAGAGTCTCTTAAATCTCCGAAGTAGATTTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAAT GTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTG ] [+] EMBL CD118532 [ TAACACAGGTTCATTTTATTGAGAGTCTCTTAAATCTCCGAAGTAGATTTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAATGGTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTGTTATGTCGATACATGGATTCCTTATTACGTAAATCCGTCAAAACTATGACCATTTCAGAAACTGAAACTAAGCTGACAGCGTCAATCGCTATTTTCAAGTATATTGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTC ] [+] EMBL CD083421 [ CTTAAATCTCCGAAGTAGA TTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAATGGTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTGTTATGTCGATACATGGATTCCTTATTACGTAAATCCGTCAAAACTATGACCATTTCAGAAATTGAAACTAAGCTGACAGCGTCAATCGCTATTTTCAAGTATATTGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTCGAAGAATCTGTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCTGAGTTAA ] [+] EMBL CD156128 [ TGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTCGAAGAATCTGTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCTACTTAGTCCTGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCGAATTGTATACATGTACTCACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAG ] [+] EMBL CD161869 [ GTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCTGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCGAATTGTATACATGTACTTACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAGTTATTCAACAGTAGAAATTCAATTGCTTTTCACTGATAAAGCTTATCAAATACAAGCGCCTGCTATTAATGCTGCTATCCTACTATTTTTTG] [+] EMBL CD161791 [ GTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCAGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCCAATTGTATACATGTACTTACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAGTTATTCAACAGTAGAAATTCAATTGCTTTTCACTGATAAAGCTTATCAAATACAAGCGCCTGCTATTAATGCTGCTATCCTACTATTTTTTG] [+] EMBL CD161884 [ GTGATTAATCAGCTAAAAACTGGGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCTGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCGAATTGTATACATGTACTTACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAGTTATTCAACAGTAGAAATTCAATTGCTTTTCACTGATAAAGCTTATCAAATACAAGCGCCTGCTATTAATGCTGCTATCCTACTATTTTTTG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||