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Schistosoma mansoni
cluster # 8991 cluster # 8991       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8991#0 length = 801 sequences # 8  

consensusID : consensus_8991#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 801
fasta sequence
                              [AAGACTCTTCATTAACACAGGTTCATTTTATTGAGAGTCTCTTAAATCTCCGAAGTAGATTTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAATGGTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTGTTATGTCGATACATGGATTCCTTATTACGTAAATCCGTCAAAACTATGACCATTTCAGAAATTGAAACTAAGCTGACAGCGTCAATCGCTATTTTCAAGTATATTGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTCGAAGAATCTGTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCTGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCGAATTGTATACATGTACTTACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAGTTATTCAACAGTAGAAATTCAATTGCTTTTCACTGATAAAGCTTATCAAATACAAGCGCCTGCTATTAATGCTGCTATCCTACTATTTTTTG]

[+] EMBL BF936105             [AAGACTCTTCATTAACACAGGTTCATTTTATTGAGAGTCTCTTAAATCTCCACAGTATATTTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAATGGTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTGTTATGTCGATACATGGATTCCTTATTATGTAAATCCGTCAAAACTATGACCATTTCATAAATTGAAACTAATCTGACAGCGTCAATCGCTATTTTCAAGTGTATTGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTCGAAGAATCTGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD150054             [      CTTGATTAACACAGGTTCATTTTATTGAGAGTCTCTTAAATCTCCGAAGTAGATTTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAAT GTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD118532             [            TAACACAGGTTCATTTTATTGAGAGTCTCTTAAATCTCCGAAGTAGATTTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAATGGTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTGTTATGTCGATACATGGATTCCTTATTACGTAAATCCGTCAAAACTATGACCATTTCAGAAACTGAAACTAAGCTGACAGCGTCAATCGCTATTTTCAAGTATATTGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD083421             [                                        CTTAAATCTCCGAAGTAGA TTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATAAAGCCTTTAATTTGGCCGTGAATGGTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACATCTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTGTTATGTCGATACATGGATTCCTTATTACGTAAATCCGTCAAAACTATGACCATTTCAGAAATTGAAACTAAGCTGACAGCGTCAATCGCTATTTTCAAGTATATTGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTCGAAGAATCTGTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCTGAGTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD156128             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGTGCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTCGAAGAATCTGTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCTACTTAGTCCTGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCGAATTGTATACATGTACTCACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAG                                                                                            ]
[+] EMBL CD161869             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCTGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCGAATTGTATACATGTACTTACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAGTTATTCAACAGTAGAAATTCAATTGCTTTTCACTGATAAAGCTTATCAAATACAAGCGCCTGCTATTAATGCTGCTATCCTACTATTTTTTG]
[+] EMBL CD161791             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTGATTAATCAGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCAGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCCAATTGTATACATGTACTTACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAGTTATTCAACAGTAGAAATTCAATTGCTTTTCACTGATAAAGCTTATCAAATACAAGCGCCTGCTATTAATGCTGCTATCCTACTATTTTTTG]
[+] EMBL CD161884             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTGATTAATCAGCTAAAAACTGGGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATGTTCAACTTAGTCCTGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATACGTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTAGTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCGAATTGTATACATGTACTTACCATTTTGAAGAATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAGTTATTCAACAGTAGAAATTCAATTGCTTTTCACTGATAAAGCTTATCAAATACAAGCGCCTGCTATTAATGCTGCTATCCTACTATTTTTTG]


>consensus_8991#0 AAGACTCTTCATTAACACAGGTTCATTTTATTGAGAGTCTCTTAAATCTCCGAAGTAGAT TTTTGGAGTATATTGATGATGTTTTCGATGGGAAAACTGCTTTCCGTAATCAAATGGATA AAGCCTTTAATTTGGCCGTGAATGGTCGTGTACCGTCTTCAAGTATTCTAGCTACAACAT CTAAGCAGACTAATTACAGACCATCTGAACTGTTATGTCGATACATGGATTCCTTATTAC GTAAATCCGTCAAAACTATGACCATTTCAGAAATTGAAACTAAGCTGACAGCGTCAATCG CTATTTTCAAGTATATTGATGATAAAGATCTTTTCCAAAAGTATTATCAACGTATGCTGT GCAAAAGACTGGTGTTCAATTATTCTTCCATACTTGAACTCGAAGAATCTGTGATTAATC AGCTAAAAACTGTGTGTGGATATGAATTTACTTCAAAATTTCAGCGTATGTTTAATGATG TTCAACTTAGTCCTGAGTTAAATCGGAAGTTTACTGAGTACTTACAATCAAAAGATATAC GTTTTACATTTGGTCATCATTTTCATGTTTTAACGCAATGCTCATGGCCAATTTCACTTA GTGGTGTTACTGATTTTTTACTCCCACTCGAATTGTATACATGTACTTACCATTTTGAAG AATTCTATACAGCCGCTCATCAAGGAAGAAAAATGAGATGGGCACATAGTTATTCAACAG TAGAAATTCAATTGCTTTTCACTGATAAAGCTTATCAAATACAAGCGCCTGCTATTAATG CTGCTATCCTACTATTTTTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)