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Schistosoma mansoni
cluster # 9021 cluster # 9021       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9021#0 length = 1177 sequences # 8  

consensusID : consensus_9021#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1177
fasta sequence
                              [TCGTCATCTGTTGTTTTTTCCAACCCAAATGATCGTCGTTATTCGTATGAAAGTTCTAAATTTTCAAATACTTCAACTGAGAATAATACAAATAAATCGCCTTATATATTGTTTTATGTACACGGTGGTGGATTTATTGCTTTAACATCTCAGTCACAGGATAACTTTTTACGTATATGGGCTGAACAGTTAAACTGTCCAATTATAGCAGTAGATTATTCACTTTCACCTGAAGCTCCTTATCCACGTGCATTAGAAGAATGTTATTATGCCTATTGTTGGATAACATTAAATCGTGAAAACTTGGGTTGTATATCGGATGCGAAAATTGTTCTTGCTGGTGATTCCGCTGGTGGGAATCTGGCACTAGGTGTTTGTATGCGCGCTGTACGAGATCGCTTAC-TAATAAACCAAGTGCGATATTTTTGGCTTATACACCTGTATTGGTTTCTTTTACACCATCTCCTTCAAGATTATTATCGCTTTGTGATCCCCTACCTTGCC-TATAGGTGTTCTTTCTAAATGTTTATTGGCTTATGCTGGTATAGACGAAGCAAGATTGGATTCCGACAAACTTGGTGATAATTTTGAAGTTGATGAAAATCCTTCAAACTTAACAACTGAACAAAATTCCCCAATATGGTCCCGATTATTTTCAACATTTTGGTCCAATCCACCAAAATTAGATTTAAATAATTCTAAAGAGTTAAAAATTGGACATTTACGTCGATATTCAAACATAACAATGTCTCCTTTATATGATACTTATTTTCAAAATCCAAAAGATCAATCTATGCCCTCTAATTTATATCGGTTAAGTGAAAACTCTCACTTCCTACATAAATCCCCAAAGTGGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGAATGCACACCAATATCTAAACATCCTCGTCGACCCCCAACCGATTTGAACCGTATTCGAAATATTCACTTAATTCAGAATGGATTCATGTCACCATACTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCTTTCTAAACTTGATGTCTCAGTAGATATACGTGTCTTAGATGATTTACCTCATGCATTTCTTAATTTTTGTCTGCCAGGC]

[-] EMBL CD062417             [TCGTCATCTGTTGTTTTTTCCAACCCAAATGATCGTCGTTATTCGTATGAAAGTTCTAAATTTTCAAATACTTCAACTGAGAATAATACAAATAAATCGCCTTATATATTGTTTTATGTACACGGTGGTGGATTTATTGCTTTAACATCTCAGTCACAGGATAACTTTTTACGTATATGGGCTGAACAGTTAAACTGTCCAATTATAGCAGTAGATTATTCACTTTCACCTGAAGCTCCTTATCCACGTGCATTAGAAGAATGTTATTATGCCTATTGTTGGATAACATTAAATCGTGAAAACTTGGGTTGTATATCGGATGCGAAAATTGTTCTTGCTGGTGATTCCGCTGGTGGGAATCTGGCACTAGGTGTTTGTATGCGCGCTGTACGAGATCGCTTAC TAATAAACCAAGTGCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD197868             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCTTGCTGGTGATTCCGCTGGTGGGAATCTGGCACTAGGTGTTTGTATGCGCGCTGTACGAGATCGCTTACTTAATAAACCAAGTGGGATATTTTTGGCTTATACACCTGTATTGGTTTCTTTTACACCATCTCCTTCAAGATTATTATCGCTTTGTGATCCCCTA CTT CC TATCGGTGTTCTTTCTAAATGTTTATTGGCTTATGCTGGTATAGACGAAGCAAGATTGGATTCCGACAAACTTGGTGATAATTTTGAAGTTGATGAAAATCCTTCAAACTTAACAACTGAACAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD113751             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCCCTACCTTGCC TATAGGTGTTCTTTCTAAATGTTTATTGGCTTATGCTGGTATAGACGAAGCAAGATTGGATTCCGACAAACTTGGTGATAATTTTGAAGTTGATGAAAATCCTTCAAACTTAACAACTGAACAAAATTCCCCAATATGGTCCCGATTATTTTCAACATTTTGGTCCAATCCACCAAAATTAGATTTAAATAATTCTAAAGAGTTAAAAATTGGACATTTACGTCGATATTCAAACATAACAATGTCTCCTTTATATGATACTTATTTTCAAAATCCAAAAGATCAATCTATGCCCTCTAATTTATATCGGTTAAGTGAAAACTCTCACTTCCTACATAAATCCCCAAAGTGGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGAATGCACACCAATAT                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD113842             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tacTGCCGTATAGGTGTTCTTTCTAAATGTTTATTGGCTTATGCTGGTATAGACGAAGCAAGATTGGATTCCGACAAACTTGGTGATAATTTTGAAGTTGATGAAAATCCTTCAAACTTAACAACTGAACAAAATTCCCCAATATGGTCCCGATTATTTTCAACATTTTGGTCCAATCCACCAAAATTAGATTTAAATAATTCTAAAGAGTTAAAAATTGGACATTTACGTCGATATTCAAACATAACAATGTCTCCTTTATATGATACTTATTTTCAAAATCCAAAAGATCAATCTATGCCCTCTAATTTATATCGGTTAAGTGAAAACTCTCACTTCCTACATAAATCCCCAAAGTGGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGTATGCACACCAATATCTAAACATCCTCGTCG                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD112309             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tCCTCTAATTTATATCGGTTAAGTGAAAACTCTCACTTCCTACATAAATCCCCAAAGTGGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGAATGCACACCAATATCTAAACATCCTCGTCGACCCCCAACCGATTTGAACCGTATTCGAAATATTCACTTAATTCAGAATGGATTCATGTCACCATACTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCTTTCTAAACTTGATGTCTCAGTAGATATACGTGTCTTAGATGATTTACCTCATGCATTTCTTAATTTTT           ]
[+] EMBL CD192385             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGAATGCACACCAATATCTAAACATCCTCGTCGACCCCCAACCGATTTGAACCGTATTCGAAATATTCACTTAATTCAGAATGGATTCATGTCACCATGCTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCT                                                                               ]
[-] EMBL CD063265             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CACCAATATCTAAACATCCTCGTCGACCCCCAACCGATTTGAACCGTATTCGAAATATTCACTTAATTCAGAATGGATTCATGTCACCATACTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCTTTCTAAACTTGATGTCTCAGTAGATATACGTGTCTTAGATGATT                                   ]
[+] EMBL CD193827             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAGAATGGATTCATGTCACCATACTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCTTTCTAAACTTGATGTCTCAGTAGATACACGTGTCTTAGATGATTTACCTCATGCATTTCTTAATTTTTGTCTGCCAGGC]


>consensus_9021#0 TCGTCATCTGTTGTTTTTTCCAACCCAAATGATCGTCGTTATTCGTATGAAAGTTCTAAA TTTTCAAATACTTCAACTGAGAATAATACAAATAAATCGCCTTATATATTGTTTTATGTA CACGGTGGTGGATTTATTGCTTTAACATCTCAGTCACAGGATAACTTTTTACGTATATGG GCTGAACAGTTAAACTGTCCAATTATAGCAGTAGATTATTCACTTTCACCTGAAGCTCCT TATCCACGTGCATTAGAAGAATGTTATTATGCCTATTGTTGGATAACATTAAATCGTGAA AACTTGGGTTGTATATCGGATGCGAAAATTGTTCTTGCTGGTGATTCCGCTGGTGGGAAT CTGGCACTAGGTGTTTGTATGCGCGCTGTACGAGATCGCTTACTAATAAACCAAGTGCGA TATTTTTGGCTTATACACCTGTATTGGTTTCTTTTACACCATCTCCTTCAAGATTATTAT CGCTTTGTGATCCCCTACCTTGCCTATAGGTGTTCTTTCTAAATGTTTATTGGCTTATGC TGGTATAGACGAAGCAAGATTGGATTCCGACAAACTTGGTGATAATTTTGAAGTTGATGA AAATCCTTCAAACTTAACAACTGAACAAAATTCCCCAATATGGTCCCGATTATTTTCAAC ATTTTGGTCCAATCCACCAAAATTAGATTTAAATAATTCTAAAGAGTTAAAAATTGGACA TTTACGTCGATATTCAAACATAACAATGTCTCCTTTATATGATACTTATTTTCAAAATCC AAAAGATCAATCTATGCCCTCTAATTTATATCGGTTAAGTGAAAACTCTCACTTCCTACA TAAATCCCCAAAGTGGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGA ATGCACACCAATATCTAAACATCCTCGTCGACCCCCAACCGATTTGAACCGTATTCGAAA TATTCACTTAATTCAGAATGGATTCATGTCACCATACTTAGCTTCAGATGATATGCTACG TGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACT GGAGTTGGCTAAACGCCTTTCTAAACTTGATGTCTCAGTAGATATACGTGTCTTAGATGA TTTACCTCATGCATTTCTTAATTTTTGTCTGCCAGGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)