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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9058#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1089 fasta sequence
[TAACGAGGAACATAAAAACCAATCATTTAATCCTTACTTAGGTGGTGCATTTTCTGGTGTAAATCAACTAAACACATGTTTAGATTTTAATGGTGAACTTCTGACAAATCCTTCGTTTATTAGTCATGTTTCTTTAGCTTGTAGTGAAGGCTACCTACCAACATTTATTCAGTCTAATGGGCCGCCCCCACAGGACATAACTAATTTTGGAGGTTGCTCAAACTATCCTGTAAATCAAGATTTTTATATGCATGGACCTTATAATAATCTCGGAGGCAACAGGACGGTGGAACATGCTTCGTCTGAACATACTACTAACGGACTAGTTACAAATTCTCCTTATGGTCCCGTACAGTATGGGCCACAAAAGTTTCAGCACACTCTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGTTTTCAGAATTTACCTGTCAGCGGTTTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTCTATACATATCCAGGCTCAAGCTGTTCAACCTGTTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCAGATGTTTGCAGCTGCCGCTGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAGTGGATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTTAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATCCCCATTCAACCTTGGATTTTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCCTGCTCCTTTTCCACCTATCTCATCATCCATTCATTCACAAAATATTTTTCCACAAACTGATGTAATTACTCAGGAGTTTCAGCGTGCTGGTTTAGGTTATACCGGATT]
[+] EMBL CD178758 [TAACGAGGAACATAAAAACCAATCATTTAATCCTTACTTAGGTGGTGCATTTTCTGGTGTAAATCAACTAAACACATGTTTAGATTTTAATGGTGAACTTCTGACAAATCCTTCGTTTATTAGTCATGTTTCTTTAGCTTGTAGTGAAGGCTACCTACCAACATTTATTCAGTCTAATGGGCCGCCCCCACAGGACATAACTAATTTTGGAGGTTGCTCAAACTATCCTGTAAATCAAGATTTTTATATGCATGGACCTTATAATAATCTCGGAGGCAACAGGACGGTGGAACATGCTTCGTCTGAACATACTACTAACGGACTAGTTACAAATTCTCCTTATGGTCCCGTACAGTATGGGCCACAAAAGTTTCAGCACACTCTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATG ]
[-] EMBL CD189048 [ TGACANATCCTTCGTNTATTAGTCATGTTTCTTTAGCTTGTAGTGAAGGCTACCTACCAACATTTATTCAGTCTAATGGGCCGCCCCCACAGGACATAACTAATTTTGGAGGTTGCTCAAACTATCCTGTAAATCAAGATTTTTATATGCATGGACCTTATAATAATCTCGGAGGCAACAGGACGGTGGAACATGCTTCGTCTGAACATACTACTAACGGACTAGTTACAAATTCTCCTTATGGTCCCGTACAGTATGGGCCACAAAAGTTTCAGCACACTCTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGTTTTCAGAATTTACCTGTCAGCGGTTTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTC ]
[+] EMBL CD191165 [ AACTAATTTTGGAGGTTGCTCAAACTATCCTGTAAATCAAGATTTTTATATGCATGGACCTTATAATAATCTCGGAGGCAACAGGACGGTGGAACATGCTTCGTCTGAACATACTACTAACGGACTAGTTACAAATTCTCCTTATGGCCCCGTACAGTATGGGCCACAAAAGTTTCAGCACACT ]
[+] EMBL CD127205 [ CTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGTTTTCAGAATTTGCCTGTCAGCGGTTTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTCTATACATATCCAGGCTCAAGCTGTTCAACCTGTTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCAGATGTTTGCAGCTGCCGCTGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAGTGGATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTTAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATCCCCATTCAACCTTGGATTTTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCCTG ]
[+] EMBL CD127356 [ CTTTACCCCAGAGGTGTATCACCAGCCCCAGGTGACCAACTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTTGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGTTTTCAGAATTTACCTGTCAGCGGTTTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTCTATACATATCCAGGCTCAAGCTGTTCAACCTGTTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCAGATGTTTGCAGCTGCCGCTGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAGTGGATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTTAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATTCCCATTCAACCTCGGATTTTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCCTG ]
[+] EMBL CD127899 [ CTGAATATACAGGTACCTAATTGTGCTGGTGTAAACAATTATCCAATGCACCCAGTGGATACTATGGTAAACACGTTGGTTGGGCCGCAATTTCTCGGACCGTCAGCGAATGGTCATGCACAAAATGGGGCTGGGTTTCACAATTTACCTGTCACCGGGCTATATCAATCTCTTATTCAACCTAAAGATCCTTCTATACATATCCACGCTCAAGCTGTTCAACCTGGTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCACATGTCTGCAGCTGCCGTCGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAATGGATCCGAATTAAATTCTGTGGATTCTGAGTGTTTAATGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATCCCCATTCAACCTTGGATTNTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCCTG ]
[+] EMBL CD190160 [ CCAGGCTCAAGCTGTTCAACCTGTTTCAAACGACCAACAACAATCTGCAGCATTATTTGCACACACTCTTCAGATGTTTGCAGCTGCCGCTGCTAGGAATATGGGTTCTGGAACACACGATCTTCATGTAACTGGTGTCGGGTCAAGTAGCAGTGGATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTTAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGC ]
[-] EMBL BG930971 [ GATCCGTATTAAATTCTGTTGATTTTGAGTGTTAAAGGCCCCCAGGTGTAAGTGCAGAAGTCCCACCTACTGCACCCATACTACCAGATCATTTGCAGGCATATGCGGGTAATTCTTGTGTTCCTGTCAATGCCGTAGAAAGTCCGGGTCCCCGTCATCCCCATTCAACCTTGGATTTTAAGTCGATGTGCTCAACAGTTCATGCTCCTTTTCCACCTATCTCATCATCCATTCATTCACAAAATATTTTTCCACAAACTGATGTAATTACTCAGGAGTTTCAGCGTGCTGGTTTAGGTTATACCGGATT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||