These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9072#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 486 fasta sequence [GATATTGGTCATATTCTTCCTGTAGTTGGTCTAAACTCCTCTTATAAAACATAGCATCAGCCCGTAATTTTGATTTGATTGATTCCCATTCTCTGGTTACTAAATCATCTTCTGGTTCAGTGTATTCACGTAATTCAGCTAATTGTTGTTCCAATTCTTTGTTNTGTTGTTCAAGTTTTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA-TCTAATA-TAGATATTTTATCATA-TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC-AGTTG-TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG] [+] EMBL CD197826 [GATATTGGTCATATTCTTCCTGTAGTTGGTCTAAACTCCTCTTATAAAACATAGCATCAGCCCGTAATTTTGATTTGATTGATTCCCATTCTCTGGTTACTAAATCATCTTCTGGTTCAGTGTATTCACGTAATTCAGCTAATTGTTGTTCCAATTCTTTGTTTTGTTGTTCAAGTTTTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTGTTTTTTTCATTTCAGCTA ] [-] EMBL CD171357 [ TGGTTACTAAATCATCTTCTGGTTCATTGTATTCACGTAATTCAGCTAATTGTTGTTCCAATTCTTTATTNTGTTGTTCAAGTTTTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACCTAGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG] [-] EMBL CD171252 [ tnNTGTGTTTCAAGTTNTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTACCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGTGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG] [-] EMBL CD171269 [ CAAGTTNTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG] [-] EMBL CD171207 [ AACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG] [-] EMBL CD171395 [ ACGCAATTGTCTATTCTAATAGTAGATATTTTTTCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATGTCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTGTTTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG] [-] EMBL CD171268 [ ATAGTAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATGTCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG] [-] EMBL CD171439 [ AACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATTTCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||