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Schistosoma mansoni
cluster # 9092 cluster # 9092       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9092#0 length = 1112 sequences # 8  

consensusID : consensus_9092#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1112
fasta sequence
                              [GTTTGGCTTAAACTTTTCATTCATACAACCTTGACGATAGTGAATACCGGAAGTTAAATCTTTCTATTCAATTATCAATCAACTAATATAACACCCCTTCCATTTTTCTATTCTCATTTGGTATATGATTGTGATTGTTTATTGATCACGTTATACATTTGGTATCAAAAGTTTTAACCAATTTATTGTATTGTATAGTTACCTTATCAGAATATCACTTATACATATCCTCCTATTTTAATTAATCAGTATTATATAGAGACACAGGGAGAACAAGATCAAGGGAAAATAAACGACCGAGTTCATACACCATTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTACAAAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGAAATCAATCAAGTGAAGAGAAATGATGAACCTGAAAGACATCTATTTCAAAAAAAGATTTATACAACTTTTGCTATTCATTCTTTTTAGATTCTAAACTTATTATTATTAATAATTAGATCATTAGTTTGTATTCATTCAAATGTATGTAACTAACTAGTATCTATATTAATTTATTCAATGTACAATGTATTATCTATCATTCAATGGAATTATTCTTTGATCTGTATCTAGTTTATATGTTGTACTCTCTTAGACTTCATTTTCGAAAAAACACATGTTG]

[+] EMBL CD083840             [GTTTGGCTTAAACTTTTCATTCATACAACCTTGACGATAGTGAATACCGGAAGTTAAATCTTTCTATTCAATTATCAATCAACTAATATAACACCCCTTCCATTTTTCTATTCTCATTTGGTATATGATTGTGATTGTTTATTGATCACGTTATACATTTGGTATCAAAAGTTTTAACCAATTTATTGTATTGTATAGTTACCTTATCAGAATATCACTTATACATATCCTCCTATTTTAATTAATCAGTATTATATAGAGACACAGGGAGAACAAGATCAAGGGAAAATAAACGACCGAGTTCATACACCATTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTAC AAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCATGTAATAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD083550             [                                                                                                                                                                                                      TTACCTTATCAGAATATCACTTAT CATATCCTCCTATTTTAATTAATCAGTATTATATAGAGACACAGGGAGAACAAGATCAAGGGAAAATAAACGACCGAGTTCATACACCATTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTACAAAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTTATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD077543             [                                                                                                                                                                                                          CTTATCAGAATATCACTTATACATATCCTCCTATTTTAATTAATCAGTATTATATAGAGACACAGGGAGAACAAGATCAAGGGAAAATAAACGACCGAGTTCATACACCATTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTACAAAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTANATGTTATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD083054             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gacTTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTACAAAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGAAATCAATCAAGTGAAGAGAAATGATGAACCTGAAAG                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD185466             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD185583             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTACCTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGAAATCAATCAAGGGAAGAGAAATGATGAACCTGAAAGAC                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD076629             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGAAATCAATCAAGTGAAGAGAAATGATGAACCTGAAAGACATCTATTTCAAAAAAAGATTTATACAACTTTTGCTATTCATTCTTTTTAGATTCTAAACTTATTATTATTAATAATTAGATCATTAGTTTGTATTCATTCAAATGTATGTAACTAACTAGTATCTATATTAATTTATTCAATGTACAATGTATTATCTATCATTCAATGGAATTATTCTTTGATCTGTATCTAGTTTATATGTTGTACTCTCTTAGACTTCATTTTCGAAAAAACACATGTTG]
[+] EMBL SMRAP163             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTCATTCTTTTTAGATTCTAAACTTATTATTATTAATAATTAGATCATTAGTTTGTATTCATTCAAATGTATGTAACTAACTAGTATCTATATTAATTTATT                                                                                                         ]


>consensus_9092#0 GTTTGGCTTAAACTTTTCATTCATACAACCTTGACGATAGTGAATACCGGAAGTTAAATC TTTCTATTCAATTATCAATCAACTAATATAACACCCCTTCCATTTTTCTATTCTCATTTG GTATATGATTGTGATTGTTTATTGATCACGTTATACATTTGGTATCAAAAGTTTTAACCA ATTTATTGTATTGTATAGTTACCTTATCAGAATATCACTTATACATATCCTCCTATTTTA ATTAATCAGTATTATATAGAGACACAGGGAGAACAAGATCAAGGGAAAATAAACGACCGA GTTCATACACCATTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTACAAAATACTATACAAATAT GCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGT TATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTAC CGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTAT AGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAAT CTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTAC AGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCT AACTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTA TTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGAAATCAATCA AGTGAAGAGAAATGATGAACCTGAAAGACATCTATTTCAAAAAAAGATTTATACAACTTT TGCTATTCATTCTTTTTAGATTCTAAACTTATTATTATTAATAATTAGATCATTAGTTTG TATTCATTCAAATGTATGTAACTAACTAGTATCTATATTAATTTATTCAATGTACAATGT ATTATCTATCATTCAATGGAATTATTCTTTGATCTGTATCTAGTTTATATGTTGTACTCT CTTAGACTTCATTTTCGAAAAAACACATGTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)