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Schistosoma mansoni
cluster # 9101 cluster # 9101       Sequences # 8       consensus # 3


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9101#0 length = 1269 sequences # 5  
consensus_9101#1 length = 736 sequences # 2  
consensus_9101#2 length = 650 sequences # 1  

consensusID : consensus_9101#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1269
fasta sequence
                              [GCGGCCAANAATTTGGCACGAGGCACCTAGTGAAAAACCTCATTCACTAAATACTCAACTTATTGAATCTAATCTACCTGAAATATCTAATCATGAAGAAGAAGAACAGTTACTCACAAAGAAAGCAGAAAATCAAACCAAAAAGATCTCCCCTATGGATGTTATTCATTTTCCAGGAGCTATTTGGCTTATTTGTATCATTTGTGTAGCGTATTACGTAACAGTCTTTCCATTTGTTAGTTTGGGACTAGTATTTTTCGAAAGAAAATTTGGTTTATCTGTTCAAGATGCTAGTGTTGTTAATAGTATTATCTACATTATATCCGCTGTGGCAAGTCCTTTATTTGGAGCAGCAATTGATATTATCGGATATAATTTATATTGGTTATTCAGTGGAATATTAATTACACTTGGTTGTCATCTATGTTTTGCTTTTACGAGTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTCAAAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCT-GGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCTTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAACAGTTTAATTTCTATCTTAGTTTAACGATAAATATTCAATTATGTTCCGTGTTTTTCACTTCATATCTTTTCTAAATCATTAATTCCATGTATTTTTTTTA-TTTTTTTGTGATTCGATTTCAGTATAAGTATTGGATATTCCTTTTGATTATATGAAACGTTTTGTAATTACAGTTTACCCACAGTAAACTGGG]

[+] EMBL CD081073             [GCGGCCAANAATTTGGCACGAGGCACCTAGTGAAAAACCTCATTCACTAAATACTCAACTTATTGAATCTAATCTACCTGAAATATCTAATCATGAAGAAGAAGAACAGTTACTCACAAAGAAAGCAGAAAATCAAACCAAAAAGATCTCCCCTATGGATGTTATTCATTTTCCAGGAGCTATTTGGCTTATTTGTATCATTTGTGTAGCGTATTACGTAACAGTCTTTCCATTTGTTAGTTTGGGACTAGTATTTTTCGAAAGAAAATTTGGTTTATCTGTTCAAGATGCTAGTGTTGTTAATAGTATTATCTACATTATATCCGCTGTGGCAAGTCCTTTATTTGGAGCAGCAATTGATATTATCGGATATAATTTATATTGGTTATTCAGTGGAATATTAATTACACTTGGTTGTCATCTATGTTTTGCTTTTACGAGTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTCAAAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTNTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGGTGT AGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD074895             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tTTTAATTTCATCAATTCANAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATNTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCT GGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCTTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAACAGTTTAATTTCTATCTTAGTTTAACGATAAATATTCAATTATGTTCCGTGTTTTTCACTTCATATCTTTTCTAAATCATTAATTCCATGTATTTTTTTTA TTTTTTTGTGATTCGATTTCAGTATAAGTATTGGATATTCCTTTTGATTATATGAAACGTTTTGTAATTACAGTTT                 ]
[-] EMBL CD074084             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCT GGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCTTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAACAGTTTAATTTCTATCTTAGTTTAACGATAAATATTCAATTATGTTCCGTGTTTTTCACTTCATATCTTTTTTAAATCATTAATTCCATGTATTTTTTTTA TTTTTTTGTGATTCGATTTCAGTATAAGTATTGGATATTCCTTTTGATTATATGAAACGTTTTGTAATTACAGTTTACCCACAGTAAACTGGG]
[-] EMBL CD074653             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAGTGTTTTTCATCTTNTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCT GGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCTTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAACAGTTTAATTTCTATCTTAGTTTAACGATAAATATTCAATTATGTTCCGTGTTTTTCACTTCATATCTTTTCTAAATCATTAATTCCATGTATTTTTTTTATTTTTTTTGTGATTCGATTTCAGTATAAGTATTGGATATTCCTTTTGATTATATGAAACGTTTTGTAATTACAGTTT                 ]
[-] EMBL CD077125             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAATTAAATTTGATTCATGTGTTTTACATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAACAGTTTAATTTCTATCTTAGTTTAACGATAAATATTCAATTATGTTCCGTGTTTTTCACTTCATATCTTTTCTAAATCATTAATTCCATGTATTTTTTTTA TTTTTCTGTGATTCGATTTCAGTATAAGTATTGGATATTC                                                     ]


>consensus_9101#0 GCGGCCAANAATTTGGCACGAGGCACCTAGTGAAAAACCTCATTCACTAAATACTCAACT TATTGAATCTAATCTACCTGAAATATCTAATCATGAAGAAGAAGAACAGTTACTCACAAA GAAAGCAGAAAATCAAACCAAAAAGATCTCCCCTATGGATGTTATTCATTTTCCAGGAGC TATTTGGCTTATTTGTATCATTTGTGTAGCGTATTACGTAACAGTCTTTCCATTTGTTAG TTTGGGACTAGTATTTTTCGAAAGAAAATTTGGTTTATCTGTTCAAGATGCTAGTGTTGT TAATAGTATTATCTACATTATATCCGCTGTGGCAAGTCCTTTATTTGGAGCAGCAATTGA TATTATCGGATATAATTTATATTGGTTATTCAGTGGAATATTAATTACACTTGGTTGTCA TCTATGTTTTGCTTTTACGAGTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGG TTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATT GCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTCAAAATTTAGGACTTGGATT AATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTT TTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCA TCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCAT GACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTG ATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCT TTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGT ATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAAC TATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAACAGTT TAATTTCTATCTTAGTTTAACGATAAATATTCAATTATGTTCCGTGTTTTTCACTTCATA TCTTTTCTAAATCATTAATTCCATGTATTTTTTTTATTTTTTTGTGATTCGATTTCAGTA TAAGTATTGGATATTCCTTTTGATTATATGAAACGTTTTGTAATTACAGTTTACCCACAG TAAACTGGG



consensusID : consensus_9101#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 736
fasta sequence
                              [CCAGAATTCGGCACGAGGGGAGCTATTTGGCTTATTTGTATCATTTGTGTAGCGTATTACGTAACAGTCTTTCCATTTGTTAGTTTGGGACTAGTATTTTTCGAAAGAAAATTTGGTTTATCTGTTCAAGATGCTAGTGTTGTTAATAGTATTATCTACATTATATCCGCTGTGGCAAGTCCTTTATTTGGAGCAGCAATTGATATTATCGGATATAATTTATATTGGTTATTCAGTGGAATATTAATTACACTTGGTTGTCATCTATGTTTTGCTTTTACGAGTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTAAAAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTNNTAC]

[+] EMBL CD079887             [CCAGAATTCGGCACGAGGGGAGCTATTTGGCTTATTTGTATCATTTGTGTAGCGTATTACGTAACAGTCTTTCCATTTGTTAGTTTGGGACTAGTATTTTTCGAAAGAAAATTTGGTTTATCTGTTCAAGATGCTAGTGTTGTTAATAGTATTATCTACATTATATCCGCTGTGGCAAGTCCTTTATTTGGAGCAGCAATTGATATTATCGGATATAATTTATATTGGTTATTCAGTGGAATATTAATTACACTTGGTTGTCATCTATGTTTTGCTTTTACGAGTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTAAAAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTNNTAC]
[+] EMBL CD192846             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATG                          ]


>consensus_9101#1 CCAGAATTCGGCACGAGGGGAGCTATTTGGCTTATTTGTATCATTTGTGTAGCGTATTAC GTAACAGTCTTTCCATTTGTTAGTTTGGGACTAGTATTTTTCGAAAGAAAATTTGGTTTA TCTGTTCAAGATGCTAGTGTTGTTAATAGTATTATCTACATTATATCCGCTGTGGCAAGT CCTTTATTTGGAGCAGCAATTGATATTATCGGATATAATTTATATTGGTTATTCAGTGGA ATATTAATTACACTTGGTTGTCATCTATGTTTTGCTTTTACGAGTGGTCAGATTCCCCCA CTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCA ATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCA ATTAAAAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAA GGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACA TTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTA AGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACA TCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATAT GATGTTGAACTNNTAC



consensusID : consensus_9101#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 650
fasta sequence
                              [CTTCGGCTCGAGGGCCTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTCAAAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCTTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAN]

[+] EMBL CD080729             [CTTCGGCTCGAGGGCCTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTCAAAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCTTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAN]


>consensus_9101#2 CTTCGGCTCGAGGGCCTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGT CTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACC AAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTCAAAATTTAGGACTTGGATTAATTT CCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCA TCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTT TTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCA AAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAA TAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCTTTATT TCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGTATGTC ATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAACTATTG AGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAN



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9101#0      GCGGCCAANAATTTGGCACGAGGCACCTAGTGAAAAACCTCATTCACTAAATACTCAACT 60
consensus_9101#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9101#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9101#0      TATTGAATCTAATCTACCTGAAATATCTAATCATGAAGAAGAAGAACAGTTACTCACAAA 120
consensus_9101#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9101#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9101#0      GAAAGCAGAAAATCAAACCAAAAAGATCTCCCCTATGGATGTTATTCATTTTCCAGGAGC 180
consensus_9101#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9101#1      -------------------------------------CCAGAATTCGGCACGAGGGGAGC 23
                                                                                  

consensus_9101#0      TATTTGGCTTATTTGTATCATTTGTGTAGCGTATTACGTAACAGTCTTTCCATTTGTTAG 240
consensus_9101#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9101#1      TATTTGGCTTATTTGTATCATTTGTGTAGCGTATTACGTAACAGTCTTTCCATTTGTTAG 83
                                                                                  

consensus_9101#0      TTTGGGACTAGTATTTTTCGAAAGAAAATTTGGTTTATCTGTTCAAGATGCTAGTGTTGT 300
consensus_9101#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9101#1      TTTGGGACTAGTATTTTTCGAAAGAAAATTTGGTTTATCTGTTCAAGATGCTAGTGTTGT 143
                                                                                  

consensus_9101#0      TAATAGTATTATCTACATTATATCCGCTGTGGCAAGTCCTTTATTTGGAGCAGCAATTGA 360
consensus_9101#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9101#1      TAATAGTATTATCTACATTATATCCGCTGTGGCAAGTCCTTTATTTGGAGCAGCAATTGA 203
                                                                                  

consensus_9101#0      TATTATCGGATATAATTTATATTGGTTATTCAGTGGAATATTAATTACACTTGGTTGTCA 420
consensus_9101#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9101#1      TATTATCGGATATAATTTATATTGGTTATTCAGTGGAATATTAATTACACTTGGTTGTCA 263
                                                                                  

consensus_9101#0      TCTATGTTTTGCTTTTACGAGTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGG 480
consensus_9101#2      -----CTTCGGCTCGAGGGCCTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGG 55
consensus_9101#1      TCTATGTTTTGCTTTTACGAGTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGG 323
                            **  ***     *  ***************************************

consensus_9101#0      TTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATT 540
consensus_9101#2      TTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATT 115
consensus_9101#1      TTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATT 383
                      ************************************************************

consensus_9101#0      GCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTCAAAATTTAGGACTTGGATT 600
consensus_9101#2      GCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTCAAAATTTAGGACTTGGATT 175
consensus_9101#1      GCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTAAAAATTTAGGACTTGGATT 443
                      **************************************** *******************

consensus_9101#0      AATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTT 660
consensus_9101#2      AATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTT 235
consensus_9101#1      AATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTT 503
                      ************************************************************

consensus_9101#0      TTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCA 720
consensus_9101#2      TTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCA 295
consensus_9101#1      TTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCA 563
                      ************************************************************

consensus_9101#0      TCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCAT 780
consensus_9101#2      TCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCAT 355
consensus_9101#1      TCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCAT 623
                      ************************************************************

consensus_9101#0      GACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTG 840
consensus_9101#2      GACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTG 415
consensus_9101#1      GACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTG 683
                      ************************************************************

consensus_9101#0      ATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTT-ACAATTTGC 899
consensus_9101#2      ATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTT-ACAATTTGC 474
consensus_9101#1      ATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTNNTAC------- 736
                      ************************************************   **       

consensus_9101#0      TTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTG 959
consensus_9101#2      TTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTG 534
consensus_9101#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9101#0      TATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAA 1019
consensus_9101#2      TATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAA 594
consensus_9101#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9101#0      CTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAACAGT 1079
consensus_9101#2      CTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAN---- 650
consensus_9101#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9101#0      TTAATTTCTATCTTAGTTTAACGATAAATATTCAATTATGTTCCGTGTTTTTCACTTCAT 1139
consensus_9101#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9101#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9101#0      ATCTTTTCTAAATCATTAATTCCATGTATTTTTTTTATTTTTTTGTGATTCGATTTCAGT 1199
consensus_9101#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9101#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9101#0      ATAAGTATTGGATATTCCTTTTGATTATATGAAACGTTTTGTAATTACAGTTTACCCACA 1259
consensus_9101#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9101#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9101#0      GTAAACTGGG 1269
consensus_9101#2      ----------
consensus_9101#1      ----------
                                




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)