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consensusID : consensus_9101#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1269 fasta sequence
[GCGGCCAANAATTTGGCACGAGGCACCTAGTGAAAAACCTCATTCACTAAATACTCAACTTATTGAATCTAATCTACCTGAAATATCTAATCATGAAGAAGAAGAACAGTTACTCACAAAGAAAGCAGAAAATCAAACCAAAAAGATCTCCCCTATGGATGTTATTCATTTTCCAGGAGCTATTTGGCTTATTTGTATCATTTGTGTAGCGTATTACGTAACAGTCTTTCCATTTGTTAGTTTGGGACTAGTATTTTTCGAAAGAAAATTTGGTTTATCTGTTCAAGATGCTAGTGTTGTTAATAGTATTATCTACATTATATCCGCTGTGGCAAGTCCTTTATTTGGAGCAGCAATTGATATTATCGGATATAATTTATATTGGTTATTCAGTGGAATATTAATTACACTTGGTTGTCATCTATGTTTTGCTTTTACGAGTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTCAAAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCT-GGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCTTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAACAGTTTAATTTCTATCTTAGTTTAACGATAAATATTCAATTATGTTCCGTGTTTTTCACTTCATATCTTTTCTAAATCATTAATTCCATGTATTTTTTTTA-TTTTTTTGTGATTCGATTTCAGTATAAGTATTGGATATTCCTTTTGATTATATGAAACGTTTTGTAATTACAGTTTACCCACAGTAAACTGGG]
[+] EMBL CD081073 [GCGGCCAANAATTTGGCACGAGGCACCTAGTGAAAAACCTCATTCACTAAATACTCAACTTATTGAATCTAATCTACCTGAAATATCTAATCATGAAGAAGAAGAACAGTTACTCACAAAGAAAGCAGAAAATCAAACCAAAAAGATCTCCCCTATGGATGTTATTCATTTTCCAGGAGCTATTTGGCTTATTTGTATCATTTGTGTAGCGTATTACGTAACAGTCTTTCCATTTGTTAGTTTGGGACTAGTATTTTTCGAAAGAAAATTTGGTTTATCTGTTCAAGATGCTAGTGTTGTTAATAGTATTATCTACATTATATCCGCTGTGGCAAGTCCTTTATTTGGAGCAGCAATTGATATTATCGGATATAATTTATATTGGTTATTCAGTGGAATATTAATTACACTTGGTTGTCATCTATGTTTTGCTTTTACGAGTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTCAAAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTNTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGGTGT AGTA ]
[-] EMBL CD074895 [ tTTTAATTTCATCAATTCANAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATNTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCT GGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCTTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAACAGTTTAATTTCTATCTTAGTTTAACGATAAATATTCAATTATGTTCCGTGTTTTTCACTTCATATCTTTTCTAAATCATTAATTCCATGTATTTTTTTTA TTTTTTTGTGATTCGATTTCAGTATAAGTATTGGATATTCCTTTTGATTATATGAAACGTTTTGTAATTACAGTTT ]
[-] EMBL CD074084 [ GTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCT GGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCTTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAACAGTTTAATTTCTATCTTAGTTTAACGATAAATATTCAATTATGTTCCGTGTTTTTCACTTCATATCTTTTTTAAATCATTAATTCCATGTATTTTTTTTA TTTTTTTGTGATTCGATTTCAGTATAAGTATTGGATATTCCTTTTGATTATATGAAACGTTTTGTAATTACAGTTTACCCACAGTAAACTGGG]
[-] EMBL CD074653 [ AAGTGTTTTTCATCTTNTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCT GGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCTTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAACAGTTTAATTTCTATCTTAGTTTAACGATAAATATTCAATTATGTTCCGTGTTTTTCACTTCATATCTTTTCTAAATCATTAATTCCATGTATTTTTTTTATTTTTTTTGTGATTCGATTTCAGTATAAGTATTGGATATTCCTTTTGATTATATGAAACGTTTTGTAATTACAGTTT ]
[-] EMBL CD077125 [ TTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAATTAAATTTGATTCATGTGTTTTACATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAACAGTTTAATTTCTATCTTAGTTTAACGATAAATATTCAATTATGTTCCGTGTTTTTCACTTCATATCTTTTCTAAATCATTAATTCCATGTATTTTTTTTA TTTTTCTGTGATTCGATTTCAGTATAAGTATTGGATATTC ]
consensusID : consensus_9101#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 736 fasta sequence
[CCAGAATTCGGCACGAGGGGAGCTATTTGGCTTATTTGTATCATTTGTGTAGCGTATTACGTAACAGTCTTTCCATTTGTTAGTTTGGGACTAGTATTTTTCGAAAGAAAATTTGGTTTATCTGTTCAAGATGCTAGTGTTGTTAATAGTATTATCTACATTATATCCGCTGTGGCAAGTCCTTTATTTGGAGCAGCAATTGATATTATCGGATATAATTTATATTGGTTATTCAGTGGAATATTAATTACACTTGGTTGTCATCTATGTTTTGCTTTTACGAGTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTAAAAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTNNTAC]
[+] EMBL CD079887 [CCAGAATTCGGCACGAGGGGAGCTATTTGGCTTATTTGTATCATTTGTGTAGCGTATTACGTAACAGTCTTTCCATTTGTTAGTTTGGGACTAGTATTTTTCGAAAGAAAATTTGGTTTATCTGTTCAAGATGCTAGTGTTGTTAATAGTATTATCTACATTATATCCGCTGTGGCAAGTCCTTTATTTGGAGCAGCAATTGATATTATCGGATATAATTTATATTGGTTATTCAGTGGAATATTAATTACACTTGGTTGTCATCTATGTTTTGCTTTTACGAGTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTAAAAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTNNTAC]
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consensusID : consensus_9101#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 650 fasta sequence
[CTTCGGCTCGAGGGCCTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTCAAAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCTTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAN]
[+] EMBL CD080729 [CTTCGGCTCGAGGGCCTGGTCAGATTCCCCCACTAGCTATCATGATTGTGATGGGTTTGTCTTATTCTATTCTGGCTAGTAGTTTATGGCCAATAGTTGCTTTTGTATTGCCATTGCACCAAAGAGCCACAGCTTATGGTTTAATTTCATCAATTCAAAATTTAGGACTTGGATTAATTTCCATATTTGCTGGATATTTAGTTGATACCAAAGGCTATTTGTTCCTTGAAGTGTTTTTCATCTTTTGTCTCAGTATCGCTATCACTGCTACATTTGGTTTACTTATATGGGATCATCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCATGACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTGATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTTACAATTTGCTTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTGTATGTCATACACAATTAGTTAAATTTGATTCATATGTTTTATATAAGTTCAGTCAATCAACTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAN]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_9101#2 ------------------------------------------------------------
consensus_9101#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_9101#2 ------------------------------------------------------------
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consensus_9101#2 ------------------------------------------------------------
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************************************************************
consensus_9101#0 TCGTTTTGGTACAGGATTATTAAATGAATCTGGTGTAAGTAGACGATCGAAAAATCTCAT 780
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consensus_9101#0 GACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTG 840
consensus_9101#2 GACCAAAATTGTTGATGATAGCACTGTAAGCCATACATCACTGGAACCAGTTATTACTTG 415
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consensus_9101#0 ATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTTT-ACAATTTGC 899
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consensus_9101#1 ATGAATAGATACCTGTATGTAGTGATGATAATAATATGATGTTGAACTNNTAC------- 736
************************************************ **
consensus_9101#0 TTTATTTCTTATATTTTATCATAAATGATTTTCAACTAGACTTTTTAACCTTATTTTGTG 959
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consensus_9101#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_9101#1 ------------------------------------------------------------
consensus_9101#0 CTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAACAGT 1079
consensus_9101#2 CTATTGAGGTGAATATTTTTGTACAACAACAGCTGAAGTTCCTCATGGAGGTATAN---- 650
consensus_9101#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_9101#2 ------------------------------------------------------------
consensus_9101#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_9101#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_9101#2 ----------
consensus_9101#1 ----------
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||