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Schistosoma mansoni
cluster # 9135 cluster # 9135       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9135#0 length = 718 sequences # 8  

consensusID : consensus_9135#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 718
fasta sequence
                              [CTCGAGGCCCAAAATTCGGCACGAGGGCGAAATTTGAAGTTTACGTTACCGTGCTTGGGATGACGTCTGGAACTGTTAGTATCAAAGAGTTGACCATCCCACAGCTTCAAGATCTTGCACGGCAATTCGAGCAAAAAGTTCAATTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG-AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCTTATGGTTTTTGTGCTTACAGC-GAACGTTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGTGTTTTGTTGTCCGGGACATAGTGTCTCCTAACAATGTCAATATCTGGAAAACTAAAAGCCTTGTAAATACATATTTTTGTT]

[+] EMBL CD079438             [CTCGAGGCCCAAAATTCGGCACGAGGGCGAAATTTGAAGTTTACGTTACCGTGCTTGGGATGACGTCTGGAACTGTTAGTATCAAAGAGTTGACCATCCCACAGCTTCAAGATCTTGCACGGCAATTCGAGCAAAAAGTTCAATTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCTTATGGTTTTTGTGCTTACAGC GAACGTTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGTGTTTTGTTGTCCGGGACATAGTGTCTCCTAACAATGTCAATATCTGGGAAACTAANAGCCTTGTAAATACATATTc     ]
[+] EMBL CD079449             [    AGGCCAANAATTCTGCACGAGGGCCAAATTTGAAGTTTACGTTACCGTGCTTGGGATGACGTCTGGAACTGTTAGTATCAAAGAGTTGACCATCCCACAGCTTCAAGATCTTGCACGGCAATTCGAGCAAAAAGTTCAATTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGAGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCTTATGGTTCTTGTGCTTACAGC GAACGTTCATGCTTGATTGAGTATTCCATTATTGACAACTCANAGTGTGTTTTGTTGTCCGGTACATAGTGTCTCCTAACAATGTCTATATCTGCAATACTAACAGCCTTGTAAATACATATNTCTGT ]
[-] EMBL CD167232             [                                                                                                                               CGAGCAAAAAGTTCAATTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCATGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGGAAAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATca                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD073709             [                                                                                                                                         GTTCAATTTATATCTGCTTTTATACAGCAACTCAAGTCTTTACAGGGTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTTTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTTTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTTGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATTTTATGGTTTTTGTGCTTACAGC GAACGTTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGTGTTTTGTTGTCCGGGACATAGTGTTTCCTAACAATGTCAATATTTGGAGAACTAAAAGCC TGTAAAAACATATTTT    ]
[+] EMBL CD168895             [                                                                                                                                             agTTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCCTGTGGATGTTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD073720             [                                                                                                                                                                                                   CCTCCAAAAAATGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTTTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAAATGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGGAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGCCGTTTTGCATGTTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACACCAGCGTGTCCTTGAATTGTTCACGTATGCTTTTTAGGATCCTTTTCATTAGGATCCATCCCTCTTATGGTTTTTGTGCGTACAACTGAACGTTCACGGTTGATTGTGTATTCCACTATTGTCAACTCAAAGTGTGTTTTGTTGTCCAGGACATAGTGTCTCCTGACAATGTCAAAATTTGGCGATCTAAAAGCC TGTAAAAACCTATTTTGGTT]
[+] EMBL CD189737             [                                                                                                                                                                                                                            TAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCATATGGTTTTTGTGCTTACAGC GAACATTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGT                                                                                 ]
[+] EMBL CD082051             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCTTATGGTTTTTGTGCTTACAGC GAACGTTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGTGTTTTGTTGTCCGGGACATAGTGTCTCCTAACAATGTCAATATCTGGAAAACTAAAAGCC                     ]


>consensus_9135#0 CTCGAGGCCCAAAATTCGGCACGAGGGCGAAATTTGAAGTTTACGTTACCGTGCTTGGGA TGACGTCTGGAACTGTTAGTATCAAAGAGTTGACCATCCCACAGCTTCAAGATCTTGCAC GGCAATTCGAGCAAAAAGTTCAATTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTAC AGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATA CAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTT CGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTG AAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTG TTTTGGAGGAAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTC AAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAG GCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCTTATGGTTTTTGTGCTTACAGCGAACGTTCATG CTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGTGTTTTGTTGTCCGGGACATAGTG TCTCCTAACAATGTCAATATCTGGAAAACTAAAAGCCTTGTAAATACATATTTTTGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)