These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9135#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 718 fasta sequence [CTCGAGGCCCAAAATTCGGCACGAGGGCGAAATTTGAAGTTTACGTTACCGTGCTTGGGATGACGTCTGGAACTGTTAGTATCAAAGAGTTGACCATCCCACAGCTTCAAGATCTTGCACGGCAATTCGAGCAAAAAGTTCAATTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG-AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCTTATGGTTTTTGTGCTTACAGC-GAACGTTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGTGTTTTGTTGTCCGGGACATAGTGTCTCCTAACAATGTCAATATCTGGAAAACTAAAAGCCTTGTAAATACATATTTTTGTT] [+] EMBL CD079438 [CTCGAGGCCCAAAATTCGGCACGAGGGCGAAATTTGAAGTTTACGTTACCGTGCTTGGGATGACGTCTGGAACTGTTAGTATCAAAGAGTTGACCATCCCACAGCTTCAAGATCTTGCACGGCAATTCGAGCAAAAAGTTCAATTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCTTATGGTTTTTGTGCTTACAGC GAACGTTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGTGTTTTGTTGTCCGGGACATAGTGTCTCCTAACAATGTCAATATCTGGGAAACTAANAGCCTTGTAAATACATATTc ] [+] EMBL CD079449 [ AGGCCAANAATTCTGCACGAGGGCCAAATTTGAAGTTTACGTTACCGTGCTTGGGATGACGTCTGGAACTGTTAGTATCAAAGAGTTGACCATCCCACAGCTTCAAGATCTTGCACGGCAATTCGAGCAAAAAGTTCAATTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGAGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCTTATGGTTCTTGTGCTTACAGC GAACGTTCATGCTTGATTGAGTATTCCATTATTGACAACTCANAGTGTGTTTTGTTGTCCGGTACATAGTGTCTCCTAACAATGTCTATATCTGCAATACTAACAGCCTTGTAAATACATATNTCTGT ] [-] EMBL CD167232 [ CGAGCAAAAAGTTCAATTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCATGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGGAAAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATca ] [-] EMBL CD073709 [ GTTCAATTTATATCTGCTTTTATACAGCAACTCAAGTCTTTACAGGGTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTTTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTTTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTTGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATTTTATGGTTTTTGTGCTTACAGC GAACGTTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGTGTTTTGTTGTCCGGGACATAGTGTTTCCTAACAATGTCAATATTTGGAGAACTAAAAGCC TGTAAAAACATATTTT ] [+] EMBL CD168895 [ agTTTATATCTGCTTCTATACAGCAACTCAAGTCTCTACAGGCTCAGTTCGTTGCCTCCAAAAATTGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCCTGTGGATGTTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCG ] [-] EMBL CD073720 [ CCTCCAAAAAATGTCTGGGCGAGCTTAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTTTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAAATGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGGAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGCCGTTTTGCATGTTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACACCAGCGTGTCCTTGAATTGTTCACGTATGCTTTTTAGGATCCTTTTCATTAGGATCCATCCCTCTTATGGTTTTTGTGCGTACAACTGAACGTTCACGGTTGATTGTGTATTCCACTATTGTCAACTCAAAGTGTGTTTTGTTGTCCAGGACATAGTGTCTCCTGACAATGTCAAAATTTGGCGATCTAAAAGCC TGTAAAAACCTATTTTGGTT] [+] EMBL CD189737 [ TAACCCCGAAAGAGAAAATACAAATATTCTTGTCCCTTTAACTTCAACCTTGTGTGTTCCTGGGAAACTTTCTGATGCTTCGCATGTGCTTGTGGATATTGGAACTGGGTACTATGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCATATGGTTTTTGTGCTTACAGC GAACATTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGT ] [+] EMBL CD082051 [ TGTTGAAATGACCGTTCCAGAAGCTGAAAGCCACTTTTGCCGTCGAGTAGAATATATCAATAAACAAATAAGGAAGATTTTGCCTGTTTTGGAGG AAAAAACACAAGCACATAAGTCCATTTCAGACGTTCTGGATGCTAAAATTCAAGAGTTTATTAAAGTTCGAACAGCAGCGTGTCCTTGAATTGTTGACGTATGCTTTTTAGGCTCCTTTTCATTAGGATCCATCCATCTTATGGTTTTTGTGCTTACAGC GAACGTTCATGCTTGATTGTGTATTCCATTATTGACAACTCAGAGTGTGTTTTGTTGTCCGGGACATAGTGTCTCCTAACAATGTCAATATCTGGAAAACTAAAAGCC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||