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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9160#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1126 fasta sequence
[CCCAGGTACGCTCATCGATTGGGATACAGGAGTGTCACAGAACTTTTCGTCATCGCTATCATGGACACCATCGACCTGTGTTTGTTTAAACTGCCCAAGATCTGAAGCCATGGAATTGTTGGTTGCCACACTTGGATTACCTATGTACTGAGGAACAGCCAGATGAACACCAGGTTGACGGACTGCTGTTAACGGCTGAGGGACGAGATAAGTCTGTTGGCCGATTTGTACAAGATGTCCTGTAAGACCTGAAGGCAGTGTGGCCAGCTGGGGTGTTGTGACCTGTTGAACGTTTGTAGTTGCGGTAGGTCTTGTTTGAGCTCCACTTGGATTGGAAGTAAGCATAGAGGGAAGAACCTTTGAATTCAGAGGATGATGCGAGTGATGAAGAACCTGAAGTGCTATTCGAATCGGATAATGTTGTTGTTTGTCAGTATGATAAGATTCATCGAGCTCGAAATGAATGGCGTTTTCATCTGAAGGACGGGATAATGTCCATAAATGGTCGAGATCATATTTTCCAAAAGGCTGTCGGTGAAGCCGAATGGTAGTTTGAATGGAATGTATTTGATTACTAG-TTTCTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGT--AAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAAATTGACGGGTTGCACGACAAAGATGAATTGTATGACTTGACACCAGTATTCCTCACTAGCTATTCGATCCTAATTATGGTTTAAAAGTTCCTACCTTTATTCTTTCTCCACTCATCCTATCTGTTCACGTTTCATACTATAGAAAAACTTATAGTTATTGGGCATATATTATTCATTACTTTATTACATCCAGTTTTATTGGGATTATCTTTTGTTTGNGTATTTTTTAAAGAANAGAAATTTTATTACTGTC]
[-] EMBL CD112551 [CCCAGGTACGCTCATCGATTGGGATACAGGAGTGTCACAGAACTTTTCGTCATCGCTATCATGGACACCATCGACCTGTGTTTGTTTAAACTGCCCAAGATCTGAAGCCATGGAATTGTTGGTTGCCACACTTGGATTACCTATGTACTGAGGAACAGCCAGATGAACACCAGGTTGACGGACTGCTGTTAACGGCTGAGGGACGAGATAAGTCTGTTGGCCGATTTGTACAAGATGTCCTGTAAGACCTGAAGGCAGTGTGGCCAGCTGGGGTGTTGTGACCTGTTGAACGTTTGTAGTTGCGGTAGGTCTTGTTTGAGCTCCACTTGGATTGGAAGTAAGCATAGAGGGAAGAACCTTTGAATTCAGAGGATGATGCGAGTGATGAAGAACCTGAAGTGCTATTCGAATCGGATAATGTTGTTGTTTGTCAGTATGATAAGATTCATCGAGCTCGAAATAAATGGCGTTTTCATCTGAAGGACGG ]
[+] EMBL CD088540 [ TGATGAAGAACCTGAAGTGCTATTCGAATCGGATAATGTTGTTGTTTGTCAGTATGATAAGATTCATCGAGCTCGAAATGAATGGCGTTTTCATCTGAAGGACGGGATAATGTCCATAAATGGTCGAGATCATATTTTCCAAAAGGCTGTCGGTGAAGCCGAATGGTAGTTTGAATGGAATGTATTTGATTACTAG TTTCTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGT AAAAAAATGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAAATTGACGGGTTGCACGACAAAGATGAATTGTATGACTTG ]
[+] EMBL CD088553 [ TGATGAAGAACCTGAAGTGCTATTCGAATCGGATAATGTTGTTGTTTGTCAGTATGATAAGATTCATCGAGCTCGAAATGAATGGCGTTTTCATCTGAAGGACGGGATAATGTCCATAAATGGTCGAGATCATATTTTCCAAAAGGCTGTCGGTGAAGCCGAATGGTAGTTTGAATGGAATGTATTTGATTACTAG TTTCTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGT AAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACANAATTGACGGGTTGCACGACAAAGATGAATTGTATGACTTG ]
[-] EMBL CD152233 [ GATAATGTCCATAAATGGTCGAGATCATATTTTCCAAAAGGCTGTCGGTGAAGTCGAATGGTAG TTGAATGGAATGTATTTGATTACTAG TTTTTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGT AAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAAATTGACGGGTTGCACGACAAAGATGAATTGTATGACTTGA ]
[+] EMBL CD078523 [ TGAAGCCGAATGGTAGTTTGAATGGAATGTATTTGATTACTAGATTTCTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGGTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGT AAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAAATTGACGGGTTGCACGACAAAGATGAATTGTATGACTTGACACCAGTATTCCTCACTAGCTATTCGATCCTAATTATGGTTTAAAAGTTCCTACCTTTATTCTTTCTCCACTCATCCTATCTGTTCACGTTTCATACTATAGAAAAACTTATAGTTATTGGGCATATATTATTCATTACTTTATTACATCCAGTTTTATTGGGATTATCTTTTGTTTGNGTATTTTTTAAAGAANAGAAATTTTATTACTGT ]
[-] EMBL CD097667 [ TTGAATGGAATGTATTTGATTACTAG TTTCTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTCGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGTAAAAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAA ]
[-] EMBL CD097680 [ TTGAATGGAATGTATTTGATTACTAG TTTCTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGACGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGTA AAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAA ]
[-] EMBL CD072991 [ AGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCCATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGT AAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAAATTGACGGGTTGCACGACAAAGATGAATTGTATGACTTGACACCAGTATTCCTCACTAGCTATTCGATCCTAATTATGGTTTAAAAGTTCCTACCTTTATTCTTTCTCCACTCATCCTATCTGTTCACGTTTCATACTATAGAAAAACTTATAGTTATTGTGCATATATTATTCATTACTTTATTACATCCAGTTTTATTGTGATTATCTTTTGTTTGTGTATTTTTTAAAGAAAAGAAATTTTATTACTGTC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||