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Schistosoma mansoni
cluster # 9190 cluster # 9190       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9190#0 length = 702 sequences # 8  

consensusID : consensus_9190#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 702
fasta sequence
                              [CATACCAGCCCGGGCTGGTGGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGTGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCGGCGGGCGGCTTCGGGGTGTACAGCCTGGGGGTCATGCTGCTGGTGCGTCCGGATTATCCCGTTCGTTATGTTGCCCGGCAGTGTGT-GGCCCTGGTGCGTCGCGTGGGCTTGCTTCGGCTTG]

[+] EMBL CD085910             [ ATACCAGCCCGGGCTGGTGGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGCGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCGGCGGGCGGCTTCGGGGTGTACAGCCTGGGGGTCATGCTGCTGGTGCGTCCGGA TATCCCGTTCGTTATGTTGCCCGGCAGTGTGTGGGCCCTGGTGCGTCGCGTGGGCTTGCTTCGGCTTG]
[+] EMBL CD086083             [ ATACCAGCCCGGGCTGGTGGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGCGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGTGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCNGCGGGCGGCTTCGGGGTGTACAGCCTGGGGGTCATGCTGCTGTTGCGTCCGGATTATCCCCGTCGTTATGTTGCCCGGCAGTGTGT GGCCCTGGTGCGTCGCGTGGGCTTGCTTtcgc   ]
[+] EMBL CD085932             [ ATACCAGCCCGGGCTGGTGGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCTTGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGTGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGTCCCGCTGGTGGNTACCCTGAAATCGGCGATCATGGGCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD085963             [ccTACCAGCCCGGGCTGGTGGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGTGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD085889             [               TGGTGGACATCGGCGTGTGATCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCACCATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGAGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCGGCGGGCGGCTTCGGGGTGTACAGCCTGGGGGTCATGCTGCTGGTGCGTCCGGATTATCCCGTTCGTTATGTTGCCCGGCAGTGTGT GGCCCTGGTGCGTCGCGTGGGCTTGCTTCGGCT  ]
[+] EMBL CD085994             [                  TGGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGCGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCGGCGGGCGGCT                                                                                                                ]
[-] EMBL CD085920             [                   GGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCGACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGTGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGGATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCGGCGGGCGGCTTCGGGGTGTACAGCCTGGGGGTCATGCTGCTGGTGCGTCCGGATTATCCCGTTCGTTATGTTGCCCGGCAGTGTGT GGCCCTGGTGCGTCGCGTGGGCTTGCTTCGGCT  ]
[-] EMBL CD085966             [                                                                                                                                                                                                                                                                                       nGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCAGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCGGCGGGCGGCTTCGGGGTGTACAGCCTGGGGGTCATGCTGCTGGTGCGTCCGGATTATCCCGTTCGTTATGTTGCCCGGCAGTGTGT GGCCCTGGTGCGTCGCGTGGGCTTGCTTCGGCT  ]


>consensus_9190#0 CATACCAGCCCGGGCTGGTGGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGG ACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCAACATCAGAAA CCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCC TGGACATTACCGCGAACGTGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGG ATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGAATACTCGGGC CGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATG AGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTG GCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCT TGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCC TGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCGGCGGGCGGCTTCGGGGTGT ACAGCCTGGGGGTCATGCTGCTGGTGCGTCCGGATTATCCCGTTCGTTATGTTGCCCGGC AGTGTGTGGCCCTGGTGCGTCGCGTGGGCTTGCTTCGGCTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)